Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1628
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1628, 1250 aa
1>>>pF1KA1628 1250 - 1250 aa - 1250 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5924+/-0.000995; mu= 7.7818+/- 0.059
mean_var=206.1782+/-41.995, 0's: 0 Z-trim(111.8): 188 B-trim: 10 in 3/50
Lambda= 0.089321
statistics sampled from 12459 (12674) to 12459 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16
Scan time: 5.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15 (1250) 8500 1109.2 0
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150) 1561 215.0 8.9e-55
CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15 ( 814) 1319 183.7 1.7e-45
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 934 134.3 2.2e-30
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 934 134.3 2.2e-30
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 934 134.3 2.2e-30
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 691 103.0 6e-21
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 502 78.5 9e-14
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1114) 501 78.4 1.1e-13
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1115) 501 78.4 1.1e-13
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 499 78.1 1.3e-13
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 477 75.3 9.2e-13
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 477 75.4 1.1e-12
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 477 75.4 1.2e-12
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 469 74.3 2.1e-12
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 467 74.0 2.3e-12
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 465 73.8 3.4e-12
CCDS73387.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11 ( 726) 450 71.7 7.8e-12
CCDS73386.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11 ( 761) 450 71.7 8.1e-12
CCDS73388.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11 ( 848) 450 71.7 8.8e-12
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 440 70.7 3.6e-11
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 437 70.3 5.5e-11
>>CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15 (1250 aa)
initn: 8500 init1: 8500 opt: 8500 Z-score: 5928.9 bits: 1109.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8500; 100.0% identity (100.0% similar) in 1250 aa overlap (1-1250:1-1250)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLG
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CCDS10 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 CLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVLGRTNLLIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVLGRTNLLIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASG
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CCDS10 NAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASL
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CCDS10 EPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFA
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CCDS10 AVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNP
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CCDS10 VNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
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CCDS10 SDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTVKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 VNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVER
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CCDS10 VNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVER
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 STLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLLT
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CCDS10 STLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLLT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGII
910 920 930 940 950 960
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pF1KA1 VGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELES
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CCDS10 VGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELES
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 LVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCEL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAEVIVHSDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAEVIVHSDFS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 ASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAPGPDRLTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAPGPDRLTCL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 PEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150 aa)
initn: 1693 init1: 756 opt: 1561 Z-score: 1096.9 bits: 215.0 E(32554): 8.9e-55
Smith-Waterman score: 2275; 39.8% identity (67.1% similar) in 993 aa overlap (35-1001:38-991)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 DAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLGAAAA
::: : .: . .. .::.:. : .
CCDS42 LARLRPPGMLLRALLLLLLLSPLPGVWCFSELSFVKEPQDVTVTRKDPVVLDCQ---AHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYSCLAH
: .::: :.: . :. ....: ::::..:. . : . . :: :.:::
CCDS42 EVPIKVTWLKNGAKMSENKRIEVLSNGSLYISEVEGRRGEQSD--------EGFYQCLAM
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQVTLP
. :.. :: : . :.:.. : ..: : :.:.:.::: :.: . : .:::: ...:::
CCDS42 NKYGAILSQKAHLALSTISAFEVQPISTEVHEGGVARFACKISSHPPAVITWEFNRTTLP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EE-PRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTRGQD
:. .::.::::: ::.. :.: :::.:.. :... :.:: :.: . : .
CCDS42 MTMDRITALPTGVLQIYDVSQRDSGNYRCIAATVAHRRKSMEASLTVIP--AKESKSFHT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPIST-DVIVLGRTNLLIANA
.:.:.:.: :. :.::.::.:...: :..:: : : : :.. .. ::: ::.:...
CCDS42 PTIIAGPQNITTSLHQTVVLECMATGNPKPIISWSRLDHKSIDVFNTRVLGNGNLMISDV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASGEP
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CCDS42 RLQHAGVYVCRATTPGTRNFTVAMATLTVLAPPSFVEWPESLTRPRAGTARFVCQAEGIP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASLAV
: . ::.:: .. :::.:. .. .:::.:: .: . :::.:::: : . : :.:
CCDS42 SPKMSWLKNGRKIHSNGRIKMYNS--KLVINQIIPEDDAIYQCMAENSQGSILSRARLTV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFAVN
:. : :::: : : .::::.:.::::: ..:...:..:.::.::.:..: ::: ...
CCDS42 VMSEDRPSAPYNVHAETMSSSAILLAWERPLYNSDKVIAYSVHYMKAEGLNNEEYQVVIG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNPSD
::::. . :::: ..: ::.::: .:::. : . .::.::: :..::.: .:.:
CCDS42 NDTTHYIIDDLEPASNYTFYIVAYMPMGASQMSDHVTQNTLEDVPLRPPEISLTSRSPTD
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 IRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVRIS
: ..:::.: . :::: :.. . :. :..: :. :. . .:..:.:..:: :::.
CCDS42 ILISWLPIPAKYRRGQVVLYRLSFRLSTENSIQVLELPGTTHEYLLEGLKPDSVYLVRIT
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQA-KMESLVVSWQPPPHPTQ-ISG
:.: .:.: : : ::::. .. ..: .: ::... . .. : :: . : :.:
CCDS42 AATRVGLGESSVWTSHRTPKA-TSVKAPKSP-ELHLEPLNCTTISVRWQQDVEDTAAIQG
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
::::..: : .:. ::. : : : :. : : : :.:.:.:.
CCDS42 YKLYYKEEGQQEN-----------------GPIFLDTKDLLYTLSGLDPRRKYHVRLLAY
660 670 680 690
730 740 750 760 770
pF1KA1 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQR--GPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTV
:. .::: : .: ..:. .: :: :: :..:..:.:.::.:.:..: ::..
CCDS42 NNIDDGYQA---DQTVSTPGCVSVRDRMVPPPPPPHHLYAKANTSSSIFLHWRRPAFTAA
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 KIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVV
.:.:::.: .: ::.::::: : .: .:. ::.: :::::::. : ....:.. ::
CCDS42 QIINYTIRCNPVGLQNASLVLYLQTSETHMLVQGLEPNTKYEFAVRLHVDQLSSPWSPVV
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 ERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTL
.::::. :. :: .... . .:. . : :: :. ...: :::.: .. .: .
CCDS42 YHSTLPEAPAGPPVGVKVTLIEDDTALVSWKPPDGPETVVTRYTILYASRKAWIAGEWQV
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 LTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDS--------
: .: : : ...: . . :. :..: .::: :::: .. .: .. :.:
CCDS42 LHREGAITMALLENLVAGNVYIVKISASNEVGEGPFSNSVELAVLPKETSESNQRPKRLD
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990
pF1KA1 ------------LDMHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGN
::..:.::: ::: ..: :.: :. . :: :.: . :.:: :.
CCDS42 SADAKVYSGYYHLDQKSMTGIAVGVGIALTCILICVLILIYRSKARKS--SASKTAQNGT
940 950 960 970 980
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 PALYSRARLGPPSPPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSK
:
CCDS42 QQLPRTSASLASGNEVGKNLEGAVGNEESLMPMIMPNSFIDAKGGTDLIINSYGPIIKNN
990 1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15 (814 aa)
initn: 1397 init1: 689 opt: 1319 Z-score: 930.4 bits: 183.7 E(32554): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 1376; 40.4% identity (68.6% similar) in 606 aa overlap (10-610:19-603)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQ
: :: : . :: : .: : ..::. .: : . . : :
CCDS10 MAVQRAASPRRPPAPLWPRLLLPLLLLLLPAPSEGL---GHSAELAFAVEPSDDVAVPGQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 AAVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQ-PLAPNGSDESVPE
::.: . .. ::.:.:: :.: : : : :: :::: . . : :.:: .
CCDS10 PIVLDCRVEGT---PPVRITWRKNGVELPESTHSTLLANGSLMIRHFRLEPGGSPSD---
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 AVGVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLP
::.: :.:.. .:...:. : .. ::..:: .::.. . ::.:.:::.:.:.:::
CCDS10 -----EGDYECVAQNRFGLVVSRKARIQAATMSDFHVHPQATVGEEGGVARFQCQIHGLP
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KA1 APIITWEKDQVTLP-EEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLS
:.:::::..: . .. : .::.::::: .. :.: ..:::.: : ..:. : :.
CCDS10 KPLITWEKNRVPIDTDNERYTLLPKGVLQITGLRAEDGGIFHCVASNIASIRISHGARLT
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 VAHRGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDV
:. :: : .. .:...::: :.. :..:.::::...: :.::: : ::.::...
CCDS10 VSGSGSGAY---KEPAILVGPENLTLTVHQTAVLECVATGNPRPIVSWSRLDGRPIGVEG
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CCDS10 NSAGSSQASARLTVLWAEGLPGPPRNVRAVSVSSTEVRVSWSEPLANTKEIIGYVLHIRK
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CCDS58 IEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKASGSGGKGSRLPD
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CCDS58 LGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCT--RRTTSHQ
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CCDS58 KKKRAACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLEL---KPIDKSPDPNPIMTDTPIPR
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CCDS10 EHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLT-YSVFYTKEGIARERV
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480 490
pF1KA1 DNV----EYQFAVNN-----------------------------DTTELQVRDLEPN---
.:. :.: ...: :.:. ::
CCDS10 ENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLRA
490 500 510 520 530 540
500
pF1KA1 -------------------------------------------------------TDYEF
:.: :
CCDS10 YAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKGTDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYSF
550 560 570 580 590 600
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 YVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ-LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVV
::::.. : . .. . :.::.:::::::: ::: : ..: . : : :. .:::..
CCDS10 RVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQIT
610 620 630 640 650 660
570 580 590 600 610
pF1KA1 KYKIEY-GLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHR
:::.: ...... : : :.. . ....:. . : :..: : : : ..:. .
CCDS10 GYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSAE
670 680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 T-PSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQI-SGYKLYWREVGAEEEANGD
: : ....:: .:. :.:. . :.:::: :: . . . :: .
CCDS10 TFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTPPENQNIVVRGYAI--------------
730 740 750 760 770
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 RLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAFNKHEDGY----AAVWKG
: : . . ... : . : . .: :. : . : :::. .: .:: .
CCDS10 ----GYGIGSPHAQTIKVDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAVTRP
780 790 800 810 820
740 750 760 770 780
pF1KA1 KTEKAP-------APDMPIQRGPPL-PPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTT-VKIVN--
.:. . :: :. :. ::. :.: : .: . : .. ::..
CCDS10 HTDTSEVDLFVINAPYTPVPDPTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQKITDSR
830 840 850 860 870 880
790 800 810 820 830
pF1KA1 -YTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDI--LIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVE
:::: : . . : .... . :. :::: : :::.:. .. .. ...
CCDS10 YYTVR---WKTNIPANTKYKNANATTLSYLVTGLKPNTLYEFSVMVTKGRRSSTWSMTAH
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pF1KA1 RSTLPDRPSTPPSDLRL--SPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWT
.:. :..::.:. . . :.:. ..: ::.: ::.:. :.: ::.. . :.:.
CCDS10 GTTFELVPTSPPKDVTVVSKEGKPKTIIVNWQPPSEANGKITGYIIYYSTDVNAEIHDWV
950 960 970 980 990 1000
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 LLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVT
. . :: .. ... : :: :.::. ::. : ::.:. . : . ::.. ...
CCDS10 IEPVVGNRLTHQIQELTLDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKADSSDKMPNDQAS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 GIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHE
:
CCDS10 GSGGKGSRLPDLGSDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA1 ELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTL-LEHDHL-HLLPNGS
: :. . :.::: : : :. . : :::
CCDS11 TALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLDCSAESDRGVPV-IKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGS
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 LWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYSCLAH-GPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPES
: ... : : . :. :: :.: : : : . :.:: : .: : . ::
CCDS11 LLIQNILH---SRHHKPD-----EGLYQCEASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTES
100 110 120 130 140
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pF1KA1 QTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQVTL---PEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAG
:. . :. ..:.. : : : : :.:.: : : . :..:::.:.::: .: .: :
CCDS11 VTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDLTPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIG
150 160 170 180 190 200
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::: : : : .. ..:: . . .: ... .. : :.... :...:.:: .:
CCDS11 IYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLH----RQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVS
210 220 230 240 250 260
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. : : .:.: :. . : .:: .::::.:. ::.:.: .. . .
CCDS11 GYPPPSFTWLR--GEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNVTDDDSGMYTCVVT--YKNENIS
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pF1KA1 AAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQ
:.::: ::. : . . : : .. .: : .::.: :.. :..:: . :. ..
CCDS11 ASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIV
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::. .: : . .: :.::::::: :: : ..:.: :. ::::: :. .
CCDS11 GGS-NLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVL
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pF1KA1 LSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFAVNND-TTELQVRDLEPNTD
.:: : ..:. : . .: :.. . .: :: : . ... . .: : .:.:..
CCDS11 VSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFF--SREGDNRERALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAM
440 450 460 470 480 490
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pF1KA1 YEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHT------------------------------------
: : ::::.. : ...: : : :
CCDS11 YTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTSILITWEPPAYANGP
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 ------------------------------------------------------------
CCDS11 VQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLAYNRYGPGVSTDDITVVT
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:.::::: :: .:: : .:.:.::: : . .:: .. :::.. .. .. . :
CCDS11 LSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHRKTTRRGEMETLE--
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pF1KA1 GNETQLMLNSLQPNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMH-NQSHVPFAPAELKVQ
:. ....:. .. : ..:: :. : : ::.:. .:: ..:.:: :. :.:.
CCDS11 PNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDLDESQVPDQPSSLHVR
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pF1KA1 AKMESLVVSWQPPPHPTQI-SGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKK
. . ...:: :: .:. . :: . : : . . ::. .:
CCDS11 PQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYII------------------GYGVGSPYAETVRVDSK
740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 VKQYELTQLVPGRLYEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGP-----P---
. : . .: . : ..: :::. .: .. :.. : :.. : :
CCDS11 QRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSV
780 790 800 810 820 830
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pF1KA1 -------LPPAHVHAESNSSTSIWLRWKK---P-DFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVT
:::. :.: . . .. . : : . : .. :::: : .. .
CCDS11 PDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVR---WRTSFSASAK
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 YYT--SSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRL-
: . ... . :::: : :::.:. .. .. ... .: :.. :.:: .
CCDS11 YKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVI
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pF1KA1 -SPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLES
: .: . : :: : ::.:. :...:. ... : .: . : .:. .. .. :.
CCDS11 TREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNL
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pF1KA1 DTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMC
:: :.:.. ::. : ::.:
CCDS11 DTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRST
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CCDS58 DLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDS------------GHYQCLATNTVGSILSREATLQ
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.: :..:: . .: .:.:. . . : : : .: : . . . :.:
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200 210 220 230 240 250
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.: : : :: ::.: : :.. :.. . .: . :.. . : .. . . . : :
CCDS58 TGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTVTNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPK--IEVHFPF
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260 270 280 290 300 310
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..:...: .: ::: : ..:.: ..:.. .: : . ... : : :.: .:.:
CCDS58 TVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDAGIYE
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:::.. : .. . ..:.: . : .. . . .: :. :.:.:.:::. :::.:
CCDS58 CRAENSRGKN--SFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWLKN
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:.:: :..::.. .: :.: ... .:::.:::.:::. : :.: : . : ::
CCDS58 GVPLSPQSRVEMVNG--VLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKI-----LASA
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440 450 460 470 480
pF1KA1 PT----RVTATPLSSSAVLVAWE-RPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFAVNNDTT
:: .. : . .. :. : .:. . :... . .: .: ..:. : .
CCDS58 PTFALNQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVR--EN--KRIAILPDGS
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pF1KA1 ELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVH--TLDDVPSAAPQLSLSSP---NPS
:.. . . . .. . . .:... . :. : .. .:... : .
CCDS58 -LRILNASKSDEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCK
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pF1KA1 DIRVAWLPLPPSLS-NGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
:. : : . . .:: . .. : : .. : ..... ..::. .. .. :
CCDS58 AIHDASLDVTFYWTLKGQPIDFEEEGG-----HFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYG
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pF1KA1 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLV-VSWQPPP-HPTQI
. :.: . . : : : :. . :. :: . .::.: . . :
CCDS58 CRVQTTADSVSDEAELLVRGP--------PGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPI
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pF1KA1 SGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLV
:.:.: : : . : :. . : . ... ..: : :: ..:
CCDS58 SSYNLQARS------------PFSLGWQTVKTVPEIITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVV
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pF1KA1 AFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLP---PAHVHAESNSSTSIWLRWK--KP
: : : . .:. :. . .: :..: ..:. . . :. .
CCDS58 ATNPIGTGDPS----------TPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRSGRRHELVIAWEPVSE
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pF1KA1 DFTTVKIVNYTVRFSPWGLRN--ASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMD
.: . . .: : : : : :. ..:: .: .. :.: .: : .. :
CCDS58 EFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPLTPFEVKVGVYNNKGD
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pF1KA1 GPFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQ
:::...: . .::. :.:.. . .. : . . :
CCDS58 GPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIKESLGRPQGFEV
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pF1KA1 PEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSL
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pF1KA1 MARGDAGRGRGLLA-LTF-CLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCS
: :: ::. .:. ::: : . . . . ... : : ... : ...:.:
CCDS29 MLRGTMTAWRGMRPEVTLACLLLATAGCFADLNEVPQVT--VQPASTVQKPGGTVILGC-
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pF1KA1 LGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLH--LLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIE
.. : ::: .: : : :. .:.: .. : : ...:
CCDS29 ---VVEPPRMNVTWRLNGKELNGSDDALGVLITHGTLVIT---ALN--NHTV--------
60 70 80 90 100
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pF1KA1 GNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQT-VEENGTARFECHI-EGLPAPII
: :.:.:. : :..:: :.: ::.: ::.: . :.:..:: . ::. :. : .
CCDS29 GRYQCVARMPAGAVASVPATVTLANLQDFKLDVQHVIEVDEGNTAVIACHLPESHPKAQV
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pF1KA1 TWEKDQVTLPEEPR--LIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAH
. : : : : ...:.: :::..... : : :.:.: : . :. . . .
CCDS29 RYSVKQEWL-EASRGNYLIMPSGNLQIVNASQEDEGMYKCAAYNPVTQEVKTS---GSSD
170 180 190 200 210
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pF1KA1 RGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVV--SGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPIST-DV
: . . .. . :. :: :.. .:::...:::::. : : :.:.. ::. .. .
CCDS29 RLRVRRSTAEAARIIYPPEAQTIIVTKGQSLILECVASGIPPPRVTWAK-DGSSVTGYNK
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pF1KA1 IVLGRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAA-ELRVLAAPAITQAPEALSRTR
. .:::: ... ::.: : :.. . :.. ...:. : .:. :
CCDS29 TRFLLSNLLIDTTSEEDSGTYRCMADNGVGQPGAAVILYNVQVFEPPEVTMELSQLVIPW
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 ASTARFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAE
...:...:.. :.: :.. ::.:..:: . :.... .: . ..: .: : :::.::
CCDS29 GQSAKLTCEVRGNPPPSVLWLRNAVPLISSQRLRLSR--RALRVLSMGPEDEGVYQCMAE
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 NSAGMACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQK
: .: : :...: : . :: :. :. :.
CCDS29 NEVGSAHAVVQL----RTSRPSITPRL-------------WQDAEL--------------
400 410 420
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pF1KA1 ARGMDNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPS
: : : . ..: :. . : ...: . . :. . . .:.
CCDS29 ATGTPPVSPS-KLGNPEQMLRGQPALPRPP--------TSVGPASPQCPG--EKGQGAPA
430 440 450 460 470
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pF1KA1 AAPQLSLSSPNPS---DIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYG--LGKEDQIFSTEVRGNE
:: . :::: : . ...: : . . . .. : ... .. :. . . .:.
CCDS29 EAP-IILSSPRTSKTDSYELVWRPRHEGSGRAPILYYVVKHRKVTNSSDDWTISGIPANQ
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pF1KA1 TQLMLNSLQPNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHH--RTPS--------MHNQSHVPFAP
.: :. :.:...:.:...: . :: : .. . : :. .. : : :
CCDS29 HRLTLTRLDPGSLYEVEMAAYNCAGEGQTAMVTFRTGRRPKPEIMASKEQQIQRDDPGAS
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