FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1628, 1250 aa
1>>>pF1KA1628 1250 - 1250 aa - 1250 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1916+/-0.000438; mu= -1.3361+/- 0.027
mean_var=304.6949+/-63.822, 0's: 0 Z-trim(119.5): 551 B-trim: 33 in 1/56
Lambda= 0.073475
statistics sampled from 32972 (33656) to 32972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.395), width: 16
Scan time: 18.580
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066013 (OMIM: 616810) immunoglobulin superfamil (1250) 8500 916.2 0
XP_011520148 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobu (1251) 8488 914.9 0
XP_011520147 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobu (1263) 8356 900.9 0
XP_016877937 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobu (1264) 8344 899.7 0
XP_011520149 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobu ( 989) 6762 731.9 5e-210
XP_016877938 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobu ( 664) 4019 441.0 1.3e-122
XP_016877570 (OMIM: 613261) PREDICTED: protogenin (1072) 1561 180.6 4.9e-44
NP_776175 (OMIM: 613261) protogenin precursor [Hom (1150) 1561 180.6 5.2e-44
XP_011519762 (OMIM: 613261) PREDICTED: protogenin ( 683) 1551 179.4 7.3e-44
XP_011519761 (OMIM: 613261) PREDICTED: protogenin ( 701) 1551 179.4 7.5e-44
XP_016877571 (OMIM: 613261) PREDICTED: protogenin ( 927) 1551 179.5 9.2e-44
XP_011520547 (OMIM: 604184) PREDICTED: immunoglobu ( 642) 1321 155.0 1.5e-36
XP_011520543 (OMIM: 604184) PREDICTED: immunoglobu ( 813) 1319 154.8 2.1e-36
NP_004875 (OMIM: 604184) immunoglobulin superfamil ( 814) 1319 154.8 2.1e-36
XP_011520546 (OMIM: 604184) PREDICTED: immunoglobu ( 677) 1169 138.9 1.1e-31
XP_011520545 (OMIM: 604184) PREDICTED: immunoglobu ( 691) 1169 138.9 1.1e-31
XP_016877725 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1397) 934 114.2 6.1e-24
NP_001166094 (OMIM: 601907) neogenin isoform 2 pre (1408) 934 114.2 6.1e-24
NP_001166095 (OMIM: 601907) neogenin isoform 3 pre (1450) 934 114.2 6.3e-24
NP_002490 (OMIM: 601907) neogenin isoform 1 precur (1461) 934 114.3 6.3e-24
XP_016877727 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1381) 910 111.7 3.5e-23
XP_016877720 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1434) 910 111.7 3.6e-23
XP_016877724 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1401) 713 90.8 6.9e-17
XP_016877723 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1412) 713 90.8 6.9e-17
XP_016877721 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1454) 713 90.8 7.1e-17
XP_011519932 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1465) 713 90.8 7.1e-17
XP_011524145 (OMIM: 114500,120470,133239,157600) P (1443) 691 88.5 3.5e-16
XP_016881057 (OMIM: 114500,120470,133239,157600) P (1445) 691 88.5 3.5e-16
NP_005206 (OMIM: 114500,120470,133239,157600) netr (1447) 691 88.5 3.6e-16
XP_016877726 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1394) 662 85.4 2.9e-15
XP_016877722 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1417) 662 85.4 2.9e-15
XP_011519935 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1428) 662 85.4 3e-15
XP_011519934 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1447) 662 85.4 3e-15
XP_011519931 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1470) 662 85.4 3e-15
XP_005254465 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1481) 662 85.4 3e-15
XP_011519930 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1481) 662 85.4 3e-15
XP_016881059 (OMIM: 114500,120470,133239,157600) P (1102) 595 78.2 3.4e-13
XP_011524146 (OMIM: 114500,120470,133239,157600) P (1102) 595 78.2 3.4e-13
XP_016862495 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1379) 538 72.3 2.6e-11
NP_001276968 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1382) 538 72.3 2.6e-11
XP_016862494 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1396) 538 72.3 2.6e-11
XP_016862493 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1398) 538 72.3 2.6e-11
XP_016862491 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1402) 538 72.3 2.6e-11
XP_016862490 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1403) 538 72.3 2.6e-11
XP_011532287 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1405) 538 72.3 2.7e-11
XP_016862488 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1422) 538 72.3 2.7e-11
XP_016862487 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1424) 538 72.3 2.7e-11
XP_016862486 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1438) 538 72.3 2.7e-11
XP_016862485 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1440) 538 72.3 2.7e-11
XP_016862484 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1442) 538 72.3 2.7e-11
>>NP_066013 (OMIM: 616810) immunoglobulin superfamily DC (1250 aa)
initn: 8500 init1: 8500 opt: 8500 Z-score: 4885.9 bits: 916.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8500; 100.0% identity (100.0% similar) in 1250 aa overlap (1-1250:1-1250)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 AAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 CLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 CLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVLGRTNLLIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 GQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVLGRTNLLIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 NAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 AVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 SDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTVKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 VNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVER
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 STLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 STLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLLT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGII
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 VGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELES
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 LVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCEL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAEVIVHSDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 PQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAEVIVHSDFS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 ASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAPGPDRLTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 ASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAPGPDRLTCL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 PEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 PEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
1210 1220 1230 1240 1250
>>XP_011520148 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobulin (1251 aa)
initn: 5421 init1: 5388 opt: 8488 Z-score: 4879.0 bits: 914.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8488; 99.9% identity (99.9% similar) in 1251 aa overlap (1-1250:1-1251)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 CLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAHRGSLASTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVLGRTNLLIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVLGRTNLLIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRLYEVKLVAF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKKPDFTTVKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KA1 VNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSS-GEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVE
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVVE
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 RSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQPEHQWTLL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 TTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLDMHSVTGI
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 IVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELE
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 SLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWAGSWAGCE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 LPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAEVIVHSDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAEVIVHSDF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 SASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAPGPDRLTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAPGPDRLTC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 LPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
1210 1220 1230 1240 1250
>>XP_011520147 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobulin (1263 aa)
initn: 8356 init1: 8356 opt: 8356 Z-score: 4803.3 bits: 900.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8356; 100.0% identity (100.0% similar) in 1228 aa overlap (23-1250:36-1263)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRPHPPGTDQGSVDEVSRASSSPQPSAEWVRGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 AVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAV
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120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 IITWEKDQVTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IITWEKDQVTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTA
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360 370 380 390 400 410
pF1KA1 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
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pF1KA1 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
430 440 450 460 470 480
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pF1KA1 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
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pF1KA1 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
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pF1KA1 PNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPP
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pF1KA1 PHPTQISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHPTQISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRL
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 YEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKK
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pF1KA1 PDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDG
790 800 810 820 830 840
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pF1KA1 PFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQP
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pF1KA1 EHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSLD
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 MHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSP
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 PAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSWA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 GSWAGCELPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSWAGCELPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEAE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 VIVHSDFSASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIVHSDFSASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAAP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KA1 GPDRLTCLPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPDRLTCLPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
>>XP_016877937 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobulin (1264 aa)
initn: 5277 init1: 5244 opt: 8344 Z-score: 4796.5 bits: 899.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8344; 99.9% identity (99.9% similar) in 1229 aa overlap (23-1250:36-1264)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRPHPPGTDQGSVDEVSRASSSPQPSAEWVRGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 AVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 IITWEKDQVTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IITWEKDQVTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
550 560 570 580 590 600
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pF1KA1 PNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPP
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PHPTQISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PHPTQISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRL
670 680 690 700 710 720
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pF1KA1 YEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKK
730 740 750 760 770 780
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pF1KA1 PDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSS-GEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMD
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMD
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 GPFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQ
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 PEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSL
910 920 930 940 950 960
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pF1KA1 DMHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPS
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 PPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSW
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 AGSWAGCELPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGSWAGCELPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 EVIVHSDFSASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVIVHSDFSASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 PGPDRLTCLPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGPDRLTCLPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
>>XP_011520149 (OMIM: 616810) PREDICTED: immunoglobulin (989 aa)
initn: 3695 init1: 3662 opt: 6762 Z-score: 3891.6 bits: 731.9 E(85289): 5e-210
Smith-Waterman score: 6762; 99.9% identity (99.9% similar) in 989 aa overlap (263-1250:1-989)
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MECVASADPTPFVSWVRQDGKPISTDVIVL
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTA
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 PNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQWMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPP
340 350 360 370 380 390
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PHPTQISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHPTQISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQLVPGRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQRGPPLPPAHVHAESNSSTSIWLRWKK
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pF1KA1 PDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSS-GEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMD
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPFGSVVERSTLPDRPSTPPSDLRLSPLTPSTVRLHWCPPTEPNGEIVEYLILYSSNHTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQEKLSDSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DMHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHRESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPS
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pF1KA1 PPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHSLMGGGVSEGRSHSKRKISWAQPSGLSW
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pF1KA1 AGSWAGCELPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGSWAGCELPQAGPRPALTRALLPPAGTGQTLLLQALVYDAIKGNGRKKSPPACRNQVEA
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pF1KA1 EVIVHSDFSASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVIVHSDFSASNGNPDLHLQDLEPEDPLPPEAPDLISGVGDPGQGAAWLDRELGGCELAA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGPDRLTCLPEAASASCSYPDLQPGEVLEETPGDSCQLKSPCPLGASPGLPRSPVSSSA
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MARGDAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRPHPPGTDQGSVDEVSRASSSPQPSAEWVRGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IITWEKDQVTLPEEPRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLSVAH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 QAAVLNCSLGAAAAGPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPE
:. ....: ::::..:. . : . .
XP_016 MSENKRIEVLSNGSLYISEVEGRRGEQSD---
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pF1KA1 AVGVIEGNYSCLAHGPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLP
:: :.::: . :.. :: : . :.:.. : ..: : :.:.:.::: :.: . :
XP_016 -----EGFYQCLAMNKYGAILSQKAHLALSTISAFEVQPISTEVHEGGVARFACKISSHP
30 40 50 60 70 80
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pF1KA1 APIITWEKDQVTLPEE-PRLIVLPNGVLQILDVQESDAGPYRCVATNSARQHFSQEALLS
.:::: ...::: :. .::.::::: ::.. :.: :::.:.. :... :.:: :.
XP_016 PAVITWEFNRTTLPMTMDRITALPTGVLQIYDVSQRDSGNYRCIAATVAHRRKSMEASLT
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pF1KA1 VAHRGSLASTRGQDVVIVAAPENTTVVSGQSVVMECVASADPTPFVSWVRQDGKPIST-D
: . : . .:.:.:.: :. :.::.::.:...: :..:: : : : :.. .
XP_016 VI--PAKESKSFHTPTIIAGPQNITTSLHQTVVLECMATGNPKPIISWSRLDHKSIDVFN
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pF1KA1 VIVLGRTNLLIANAQPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTR
. ::: ::.:.... :.:::::::. : ::.:..: : : ::: :.... ::.:.: :
XP_016 TRVLGNGNLMISDVRLQHAGVYVCRATTPGTRNFTVAMATLTVLAPPSFVEWPESLTRPR
210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 ASTARFVCRASGEPRPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAE
:.::::::.: : : : . ::.:: .. :::.:. .. .:::.:: .: . :::.::
XP_016 AGTARFVCQAEGIPSPKMSWLKNGRKIHSNGRIKMYNS--KLVINQIIPEDDAIYQCMAE
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pF1KA1 NSAGMACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQK
:: : . : :.::. : :::: : : .::::.:.::::: ..:...:..:.::.:
XP_016 NSQGSILSRARLTVVMSEDRPSAPYNVHAETMSSSAILLAWERPLYNSDKVIAYSVHYMK
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pF1KA1 ARGMDNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPS
:.:..: ::: ...::::. . :::: ..: ::.::: .:::. : . .::.:::
XP_016 AEGLNNEEYQVVIGNDTTHYIIDDLEPASNYTFYIVAYMPMGASQMSDHVTQNTLEDVPL
390 400 410 420 430 440
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pF1KA1 AAPQLSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLML
:..::.: .:.:: ..:::.: . :::: :.. . :. :..: :. :. . .:
XP_016 RPPEISLTSRSPTDILISWLPIPAKYRRGQVVLYRLSFRLSTENSIQVLELPGTTHEYLL
450 460 470 480 490 500
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..:.:..:: :::.:.: .:.: : : ::::. .. ..: .: ::... . .. :
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pF1KA1 SWQPPPHPTQ-ISGYKLYWREVGAEEEANGDRLPGGRGDQAWDVGPVRLKKKVKQYELTQ
:: . : :.:::::..: : .:. ::. : : : :.
XP_016 RWQQDVEDTAAIQGYKLYYKEEGQQEN-----------------GPIFLDTKDLLYTLSG
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pF1KA1 LVPGRLYEVKLVAFNKHEDGYAAVWKGKTEKAPAPDMPIQR--GPPLPPAHVHAESNSST
: : : :.:.:.:.:. .::: : .: ..:. .: :: :: :..:..:.:.
XP_016 LDPRRKYHVRLLAYNNIDDGYQA---DQTVSTPGCVSVRDRMVPPPPPPHHLYAKANTSS
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pF1KA1 SIWLRWKKPDFTTVKIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQ
::.:.:..: ::...:.:::.: .: ::.::::: : .: .:. ::.: :::::::.
XP_016 SIFLHWRRPAFTAAQIINYTIRCNPVGLQNASLVLYLQTSETHMLVQGLEPNTKYEFAVR
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: ....:.. :: .::::. :. :: .... . .:. . : :: :. ...: ::
XP_016 LHVDQLSSPWSPVVYHSTLPEAPAGPPVGVKVTLIEDDTALVSWKPPDGPETVVTRYTIL
720 730 740 750 760 770
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pF1KA1 YSSNHTQPEHQWTLLTTQGNIFSAEVHGLESDTRYFFKMGARTEVGPGPFSRLQDVITLQ
:.: .. .: .: .: : : ...: . . :. :..: .::: :::: .. .:
XP_016 YASRKAWIAGEWQVLHREGAITMALLENLVAGNVYIVKISASNEVGEGPFSNSVELAVLP
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pF1KA1 EKLSDS--------------------LDMHSVTGIIVGVCLGLLCLLACMCAGLRRSPHR
.. :.: ::..:.::: ::: ..: :.: :. . :: :
XP_016 KETSESNQRPKRLDSADAKVYSGYYHLDQKSMTGIAVGVGIALTCILICVLILIYRSKAR
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pF1KA1 ESLPGLSSTATPGNPALYSRARLGPPSPPAAHELESLVHPHPQDWSPPPSDVEDRAEVHS
.: . :.:: :. :
XP_016 KS--SASKTAQNGTQQLPRTSASLASGNEVGKNLEGAVGNEESLMPMIMPNSFIDAKGGT
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>>NP_776175 (OMIM: 613261) protogenin precursor [Homo sa (1150 aa)
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pF1KA1 DAGRGRGLLALTFCLLAARGELLLPQETTVELSCGVGPLQVILGPEQAAVLNCSLGAAAA
::: : .: . .. .::.:. : .
NP_776 LARLRPPGMLLRALLLLLLLSPLPGVWCFSELSFVKEPQDVTVTRKDPVVLDCQ---AHG
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 GPPTRVTWSKDGDTLLEHDHLHLLPNGSLWLSQPLAPNGSDESVPEAVGVIEGNYSCLAH
: .::: :.: . :. ....: ::::..:. . : . . :: :.:::
NP_776 EVPIKVTWLKNGAKMSENKRIEVLSNGSLYISEVEGRRGEQSD--------EGFYQCLAM
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pF1KA1 GPLGVLASQTAVVKLATLADFSLHPESQTVEENGTARFECHIEGLPAPIITWEKDQVTLP
. :.. :: : . :.:.. : ..: : :.:.:.::: :.: . : .:::: ...:::
NP_776 NKYGAILSQKAHLALSTISAFEVQPISTEVHEGGVARFACKISSHPPAVITWEFNRTTLP
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:. .::.::::: ::.. :.: :::.:.. :... :.:: :.: . : .
NP_776 MTMDRITALPTGVLQIYDVSQRDSGNYRCIAATVAHRRKSMEASLTVIP--AKESKSFHT
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.:.:.:.: :. :.::.::.:...: :..:: : : : :.. .. ::: ::.:...
NP_776 PTIIAGPQNITTSLHQTVVLECMATGNPKPIISWSRLDHKSIDVFNTRVLGNGNLMISDV
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pF1KA1 QPWHSGVYVCRANKPRTRDFATAAAELRVLAAPAITQAPEALSRTRASTARFVCRASGEP
. :.:::::::. : ::.:..: : : ::: :.... ::.:.: ::.::::::.: : :
NP_776 RLQHAGVYVCRATTPGTRNFTVAMATLTVLAPPSFVEWPESLTRPRAGTARFVCQAEGIP
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pF1KA1 RPALRWLHNGAPLRPNGRVKVQGGGGSLVITQIGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASLAV
: . ::.:: .. :::.:. .. .:::.:: .: . :::.:::: : . : :.:
NP_776 SPKMSWLKNGRKIHSNGRIKMYNS--KLVINQIIPEDDAIYQCMAENSQGSILSRARLTV
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pF1KA1 VVREGLPSAPTRVTATPLSSSAVLVAWERPEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFAVN
:. : :::: : : .::::.:.::::: ..:...:..:.::.::.:..: ::: ...
NP_776 VMSEDRPSAPYNVHAETMSSSAILLAWERPLYNSDKVIAYSVHYMKAEGLNNEEYQVVIG
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pF1KA1 NDTTELQVRDLEPNTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNPSD
::::. . :::: ..: ::.::: .:::. : . .::.::: :..::.: .:.:
NP_776 NDTTHYIIDDLEPASNYTFYIVAYMPMGASQMSDHVTQNTLEDVPLRPPEISLTSRSPTD
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pF1KA1 IRVAWLPLPPSLSNGQVVKYKIEYGLGKEDQIFSTEVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVRIS
: ..:::.: . :::: :.. . :. :..: :. :. . .:..:.:..:: :::.
NP_776 ILISWLPIPAKYRRGQVVLYRLSFRLSTENSIQVLELPGTTHEYLLEGLKPDSVYLVRIT
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:.: .:.: : : ::::. .. ..: .: ::... . .. : :: . : :.:
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::::..: : .:. ::. : : : :. : : : :.:.:.:.
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:. .::: : .: ..:. .: :: :: :..:..:.:.::.:.:..: ::..
NP_776 NNIDDGYQA---DQTVSTPGCVSVRDRMVPPPPPPHHLYAKANTSSSIFLHWRRPAFTAA
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pF1KA1 KIVNYTVRFSPWGLRNASLVTYYTSSGEDILIGGLKPFTKYEFAVQSHGVDMDGPFGSVV
.:.:::.: .: ::.::::: : .: .:. ::.: :::::::. : ....:.. ::
NP_776 QIINYTIRCNPVGLQNASLVLYLQTSETHMLVQGLEPNTKYEFAVRLHVDQLSSPWSPVV
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.::::. :. :: .... . .:. . : :: :. ...: :::.: .. .: .
NP_776 YHSTLPEAPAGPPVGVKVTLIEDDTALVSWKPPDGPETVVTRYTILYASRKAWIAGEWQV
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: .: : : ...: . . :. :..: .::: :::: .. .: .. :.:
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:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]