Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1662
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1662, 2365 aa
1>>>pF1KA1662 2365 - 2365 aa - 2365 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.0483+/-0.00125; mu= -19.1171+/- 0.075
mean_var=540.7171+/-110.438, 0's: 0 Z-trim(114.4): 80 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.055156
statistics sampled from 14875 (14938) to 14875 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16
Scan time: 8.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43015.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (2365) 16327 1315.8 0
CCDS43016.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 ( 652) 3902 326.8 2.2e-88
CCDS33644.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 ( 431) 2246 194.9 7.1e-49
>>CCDS43015.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (2365 aa)
initn: 16327 init1: 16327 opt: 16327 Z-score: 7035.4 bits: 1315.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16327; 99.7% identity (100.0% similar) in 2365 aa overlap (1-2365:1-2365)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDPLSASTSGCQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDPLSASTSGCQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SLCGSCNEDPGSDPTSSPDSATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLCGSCNEDPGSDPTSSPDSATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKEDTGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKEDTGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASSPHRITQRDTSRASSTQQEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASSPHRITQRDTSRASSTQQEIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQLDNPRTSSTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQLDNPRTSSTQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTS
:::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 CAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 SSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSCAQRDDPRASSPNRTTQQENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSCAQRDDPRASSPNRTTQQENP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRTSCTRQDNPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRTSCTRQDNPRT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 RDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 NKDIPWASFPLRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKDIPWASFPLRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PQSSFGPTQYNLPSRATSSSHNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQSSFGPTQYNLPSRATSSSHNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESEPPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESEPPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 QFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAPRASSPPRQAPEPSLLFQDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAPRASSPPRQAPEPSLLFQDLP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 RASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQDPPGTSMESLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQDPPGTSMESLA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 TRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTRSPGRAEVERLFGQERRKSEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS43 TRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTHSPGRAEVERLFGQERRKSEA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 AGAFQAQDEGRSQQPSQGQSQLLRRQSSPAPSRQVTMLPAKQAELTRRSQADPPHPRSPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::
CCDS43 AGAFQAQDEGRSQQPSQGQSQLLRRQSSPAPSRQVTMLPAKQAELTRRSQAEPPHPWSPE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 KRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGPH
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 RHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTH
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 ELPRELGKRSPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELPRELGKRSPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 DLLGLLRAPGEGVWARVPSLDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLLGLLRAPGEGVWARVPSLDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTND
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 VPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAG
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 LEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 PLKGRLVTSWRMPGDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLKGRLVTSWRMPGDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLT
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 TTSTSQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTSTSQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 KDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 QRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 QRSEERRKWFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRSEERRKWFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRE
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 NKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGH
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA1 IPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA1 AMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA1 RQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSC
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA1 ELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIE
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360
pF1KA1 QLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
2350 2360
>>CCDS43016.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (652 aa)
initn: 3926 init1: 3882 opt: 3902 Z-score: 1700.4 bits: 326.8 E(32554): 2.2e-88
Smith-Waterman score: 3902; 94.1% identity (95.6% similar) in 642 aa overlap (1724-2365:13-652)
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KA1 KGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGSPLKGRLVTSWRMP
:.. : .: :: .:. : : . : :
CCDS43 MGGWKGPGQRRGKEGPEARRRAAERGGGGGGGG--VPAPRSP
10 20 30 40
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 GDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFV
. .: . .:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AREPRPRSCLLLPPPWGAAMTPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFV
50 60 70 80 90 100
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KA1 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
110 120 130 140 150 160
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA1 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
170 180 190 200 210 220
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KA1 RKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEAT
230 240 250 260 270 280
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA1 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
290 300 310 320 330 340
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KA1 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACER
350 360 370 380 390 400
2120 2130 2140 2150 2160 2170
pF1KA1 SLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRE
410 420 430 440 450 460
2180 2190 2200 2210 2220 2230
pF1KA1 LSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRC
470 480 490 500 510 520
2240 2250 2260 2270 2280 2290
pF1KA1 QQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENEL
530 540 550 560 570 580
2300 2310 2320 2330 2340 2350
pF1KA1 QYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAAL
590 600 610 620 630 640
2360
pF1KA1 QEKESMRNSLAE
::::::::::::
CCDS43 QEKESMRNSLAE
650
>>CCDS33644.1 TRIOBP gene_id:11078|Hs108|chr22 (431 aa)
initn: 2270 init1: 2226 opt: 2246 Z-score: 990.9 bits: 194.9 E(32554): 7.1e-49
Smith-Waterman score: 2246; 90.1% identity (92.7% similar) in 385 aa overlap (1724-2108:13-395)
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KA1 KGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGSPLKGRLVTSWRMP
:.. : .: :: .:. : : . : :
CCDS33 MGGWKGPGQRRGKEGPEARRRAAERGGGGGGGG--VPAPRSP
10 20 30 40
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 GDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFV
. .: . .:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AREPRPRSCLLLPPPWGAAMTPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFV
50 60 70 80 90 100
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KA1 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
110 120 130 140 150 160
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA1 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
170 180 190 200 210 220
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KA1 RKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEAT
230 240 250 260 270 280
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA1 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
290 300 310 320 330 340
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KA1 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACER
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQLVGVI
350 360 370 380 390 400
2120 2130 2140 2150 2160 2170
pF1KA1 SLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRE
CCDS33 TVPVLQTRPLSSERLCDLPKVTPPAGLKGGI
410 420 430
2365 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 23:24:33 2016 done: Sat Nov 5 23:24:35 2016
Total Scan time: 8.850 Total Display time: 0.390
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]