Result of FASTA (omim) for
pF1KA1662
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1662, 2365 aa
1>>>pF1KA1662 2365 - 2365 aa - 2365 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.1232+/-0.000507; mu= -43.3729+/- 0.032
mean_var=687.1315+/-140.407, 0's: 0 Z-trim(122.4): 146 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.048928
statistics sampled from 40347 (40503) to 40347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16
Scan time: 25.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001034230 (OMIM: 609761,609823) TRIO and F-acti (2365) 16327 1169.4 0
NP_008963 (OMIM: 609761,609823) TRIO and F-actin-b ( 652) 3902 292.2 1.4e-77
NP_619538 (OMIM: 609761,609823) TRIO and F-actin-b ( 431) 2246 175.3 1.5e-42
XP_005256620 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (2339) 621 60.7 2.5e-07
XP_011522067 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (2404) 621 60.7 2.5e-07
XP_011522066 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (2417) 621 60.7 2.5e-07
XP_011522065 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (2419) 621 60.7 2.5e-07
XP_011522064 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (2444) 621 60.7 2.6e-07
XP_011522063 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (2457) 621 60.7 2.6e-07
NP_958431 (OMIM: 612935) myosin phosphatase Rho-in (1025) 591 58.5 4.9e-07
XP_005256621 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (1032) 591 58.5 5e-07
NP_055949 (OMIM: 612935) myosin phosphatase Rho-in (1038) 591 58.5 5e-07
XP_016879882 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (1135) 591 58.5 5.4e-07
XP_011522069 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (1175) 591 58.5 5.6e-07
XP_011522068 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phos (1188) 591 58.6 5.7e-07
NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [H (5654) 597 59.1 1.8e-06
XP_005255283 (OMIM: 606032) PREDICTED: serine/argi (2751) 555 56.1 7.2e-06
NP_057417 (OMIM: 606032) serine/arginine repetitiv (2752) 555 56.1 7.2e-06
XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 820) 456 49.0 0.0003
XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 864) 456 49.0 0.00031
XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 903) 456 49.0 0.00032
XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 447 48.4 0.00046
XP_016855517 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 447 48.4 0.00046
XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 863) 447 48.4 0.00048
XP_005245778 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 902) 447 48.4 0.0005
XP_016855515 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 445 48.2 0.00051
XP_016855514 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 445 48.2 0.00051
XP_016855502 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 865) 445 48.2 0.00053
NP_005830 (OMIM: 605975) serine/arginine repetitiv ( 904) 445 48.2 0.00056
XP_016855508 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 901) 434 47.4 0.00095
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 446 48.4 0.0012
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 446 48.4 0.0012
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 446 48.4 0.0012
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 446 48.4 0.0012
XP_011538781 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 835) 423 46.7 0.0015
XP_011538782 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 835) 423 46.7 0.0015
XP_011538783 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 835) 423 46.7 0.0015
XP_011538780 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 879) 423 46.7 0.0016
XP_005245774 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 918) 423 46.7 0.0017
XP_016855511 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 872) 422 46.6 0.0017
XP_016855522 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 791) 420 46.4 0.0017
XP_016855513 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 832) 409 45.7 0.003
XP_016855501 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 876) 409 45.7 0.0031
XP_005245777 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 915) 409 45.7 0.0033
XP_016855512 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 834) 406 45.5 0.0035
XP_016855500 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 878) 406 45.5 0.0036
XP_005245775 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 917) 406 45.5 0.0038
XP_005247362 (OMIM: 606279) PREDICTED: target of N (1678) 417 46.3 0.0039
XP_011538785 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 805) 392 44.5 0.0067
XP_005245779 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 888) 392 44.5 0.0073
>>NP_001034230 (OMIM: 609761,609823) TRIO and F-actin-bi (2365 aa)
initn: 16327 init1: 16327 opt: 16327 Z-score: 6244.2 bits: 1169.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 16327; 99.7% identity (100.0% similar) in 2365 aa overlap (1-2365:1-2365)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDPLSASTSGCQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDPLSASTSGCQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SLCGSCNEDPGSDPTSSPDSATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLCGSCNEDPGSDPTSSPDSATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKEDTGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKEDTGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASSPHRITQRDTSRASSTQQEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASSPHRITQRDTSRASSTQQEIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQLDNPRTSSTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQLDNPRTSSTQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTS
:::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 CAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 SSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSCAQRDDPRASSPNRTTQQENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSCAQRDDPRASSPNRTTQQENP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 RTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRTSCTRQDNPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRTSCTRQDNPRT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 RDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 NKDIPWASFPLRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKDIPWASFPLRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PQSSFGPTQYNLPSRATSSSHNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQSSFGPTQYNLPSRATSSSHNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESEPPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESEPPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 QFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAPRASSPPRQAPEPSLLFQDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAPRASSPPRQAPEPSLLFQDLP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 RASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQDPPGTSMESLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQDPPGTSMESLA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 TRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTRSPGRAEVERLFGQERRKSEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_001 TRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTHSPGRAEVERLFGQERRKSEA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 AGAFQAQDEGRSQQPSQGQSQLLRRQSSPAPSRQVTMLPAKQAELTRRSQADPPHPRSPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::
NP_001 AGAFQAQDEGRSQQPSQGQSQLLRRQSSPAPSRQVTMLPAKQAELTRRSQAEPPHPWSPE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 KRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGPH
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 RHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTH
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 ELPRELGKRSPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELPRELGKRSPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 DLLGLLRAPGEGVWARVPSLDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLGLLRAPGEGVWARVPSLDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTND
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 VPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAG
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pF1KA1 LEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGS
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1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 PLKGRLVTSWRMPGDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLKGRLVTSWRMPGDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLT
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 TTSTSQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTSTSQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 KDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 QRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 QRSEERRKWFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRSEERRKWFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRE
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA1 NKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGH
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA1 IPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA1 AMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
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pF1KA1 RQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSC
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pF1KA1 ELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIE
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2350 2360
pF1KA1 QLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
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:.. : .: :: .:. : : . : :
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. .: . .:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRE
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pF1KA1 LSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRC
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pF1KA1 QQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENEL
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pF1KA1 QYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAAL
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2360
pF1KA1 QEKESMRNSLAE
::::::::::::
NP_008 QEKESMRNSLAE
650
>>NP_619538 (OMIM: 609761,609823) TRIO and F-actin-bindi (431 aa)
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pF1KA1 KGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGSPLKGRLVTSWRMP
:.. : .: :: .:. : : . : :
NP_619 MGGWKGPGQRRGKEGPEARRRAAERGGGGGGGG--VPAPRSP
10 20 30 40
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 GDRPTLFNPFLLSLGVLRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFV
. .: . .:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_619 AREPRPRSCLLLPPPWGAAMTPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFV
50 60 70 80 90 100
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pF1KA1 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_619 LTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSG
110 120 130 140 150 160
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA1 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_619 IRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGP
170 180 190 200 210 220
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KA1 RKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_619 RKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEAT
230 240 250 260 270 280
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA1 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_619 DSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQS
290 300 310 320 330 340
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KA1 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACER
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_619 RGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQLVGVI
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pF1KA1 SLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRE
NP_619 TVPVLQTRPLSSERLCDLPKVTPPAGLKGGI
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pF1KA1 LPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTNDVPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPV
:.....::.: .. ::: :::
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pF1KA1 QLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLE-------QTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQP
: :: .: . : .. . .. . .. ..: .. ..: . . : :. :
XP_005 QSQPPAASSLREPGLESKEEESAMSSDRMDCGRKVRVESGYFSLEKTKQDLKAEEQQLPP
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pF1KA1 E--EPEESEPSRGQDPLTDQKQA-----------------DSADKRPAEGKAGSPLKGRL
: : :.. .. . .. .: :.: : .... . . :
XP_005 PLSPPSPSTPNHRRSQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRD
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pF1KA1 VTSWRMPGDRP----TLFNPFLLSLGVLRWRR-----PDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSP
:. :. : . ..: . .. : ::::::::::.. : :
XP_005 FTNEAPPAPLPDASASPLSPHRRAKSLDRRSTEPSVTPDLLNFKKGWLTKQYEDG-----
380 390 400 410 420 430
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pF1KA1 SLTTTSTSQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQ
:::::::::.:.::.:::::.:::: .::::::: .: ::::: ::::::::
XP_005 --------QWKKHWFVLADQSLRYYRDSVAEEAADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQ
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pF1KA1 IHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLK
::::.. .::::::::::::::... : :.::.:::::. .:... :. : : .
XP_005 IHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMKHVHPTTAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTE
490 500 510 520 530 540
1920 1930 1940 1950 1960
pF1KA1 AGEQRAGS----EVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQR---ARTPARTPDRL-
: . : . ::. :. .:. ...:..:. :. :: :. . :: : . :
XP_005 KQEAELGEPDPEQKRSRARERRREGRSKTFDWAEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLR
550 560 570 580 590 600
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pF1KA1 --AKQEELERDLAQRSEERRKWF---EATDSRTPEVPAGEGP-RRGLGAPLTEDQQNRLS
:. ::::. :.: ::::: : .:::. : : . :. : :... . . .
XP_005 PEAEPGELERERARRREERRKRFGMLDATDGPGTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVH
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pF1KA1 EEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTAL-LNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQ----
:::..:...: ::::.:.::.. . :.. : : . ::::.. . .
XP_005 VEIEQRWHQVETTPLREEKQVPIAPVHLSSEDGGDRLSTHELTSLLEKELEQSQKEASDL
670 680 690 700 710 720
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pF1KA1 LEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQ
:: :: . . :: ..... ::. : : . . ..: ..:: . : . :
XP_005 LEQNRLLQDQLRVALGREQSAR--EGYVLQTEVAASPSGAWQRLHRVNQDLQSELEAQCQ
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pF1KA1 RLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEE---LSRELSKTRSLQQ------GPDGLRK
: :: :.... :...:..: : . .. .. :::: . ....
XP_005 R--QE---LITHQ-------IQTLKRSYGEAKDTIRHHEAEIRSLQARLSNAAAELAIKE
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pF1KA1 QHQSDVEA-LKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQ----QEGQEL--LR
: . ... :::: . :: .. .:: : . :. :. . .. ::: :.
XP_005 QALAKLKGDLKREQGRVREQLEERQHSEAALSSQLRASEQKLKSAEALLLEKTQELRGLE
840 850 860 870 880 890
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pF1KA1 HNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCE-----LEVLLRVKENELQYLK
.: :. ..:...:. ::. .. : ... .: : :.::. :.: : :
XP_005 TQQALQRDRQKEVQRLQERIADLSQQLGASEQAQRLMEEKLQRNYELLLESCEKEKQALL
900 910 920 930 940 950
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pF1KA1 KEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKE
.... ..:. . .. . . . . . . : .. ....::.:.:. :....
XP_005 QNLKEVEDKASAYEDQLQGQAQQVETLQKEKLSATFEGSEQVHQLEEQLEAREASVRRLA
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2360
pF1KA1 SMRNSLAE
.:: .
XP_005 EHVQSLCDERDLLRQRFQELTERVATSDEDVAELREKLRRREADNQSLEHSYQRVSSQLQ
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>--
initn: 856 init1: 281 opt: 816 Z-score: 327.1 bits: 74.5 E(85289): 1.8e-11
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pF1KA1 ELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWR-------L
.:. .:....: :.::... : :
XP_005 CLQDTLCLHQGPHPKALPAPAPNWQATQGEADSMTGLRERIQELEAQMDVMREELGHKDL
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pF1KA1 QGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEA-CERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQE
.:.: . :.: . : .: :::..: :: .::. .:.:::.:.:::..:..:
XP_005 EGDAATLREKYQRDLE------SLKATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREE
2010 2020 2030 2040 2050
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pF1KA1 KEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTR-----SLQQGPDGLRKQHQSDVEAL
:. ::::::::: :::::::.:..::. ::: :.. :... ..::.:. .....
XP_005 KDRLLAEETAATISAIEAMKNAHREEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSV
2060 2070 2080 2090 2100 2110
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pF1KA1 KRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQL
.:::.:::::::::::: . : . : ....::.::.:.::: :::::..::. :: .:
XP_005 QRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQALEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRL
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pF1KA1 RGFIASQGMGNGCGR--SNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRF
: .....: :.. : .. ... ::::::::::.:.::::.:.. :.:::: .::..
XP_005 RTLLTGDGGGEATGSPLAQGKDAYELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKY
2180 2190 2200 2210 2220 2230
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pF1KA1 TSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
.: ::.:.:.::: :.... .: .:::.:. : :: ::
XP_005 ASDKYKDIYTELSIAKAKADCDISRLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPD
2240 2250 2260 2270 2280 2290
XP_005 FLKKDRSCVTRQLRNIRSKSLKEGLTVQERLKLFESRDLKKD
2300 2310 2320 2330
>>XP_011522067 (OMIM: 612935) PREDICTED: myosin phosphat (2404 aa)
initn: 1398 init1: 481 opt: 621 Z-score: 252.5 bits: 60.7 E(85289): 2.5e-07
Smith-Waterman score: 881; 31.4% identity (56.7% similar) in 726 aa overlap (1685-2365:474-1137)
1660 1670 1680 1690 1700
pF1KA1 PSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLEQTGPLGSRSTAKGPS----LPELQ-FQPEEPE
:: : .: .: : .:. . : : :
XP_011 FGNERRRSQVIEKFEALDIEKAEHMETNAVGPSPSSDTRQGRSEKRAFPRKRDFTNEAPP
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pF1KA1 ESEPSRGQDPLTDQKQADSADKRPAEGKAGSPLKGRLVTSWRMPGDRPTLFNPFLLSLGV
:. . .::. ...: : :.: .: :..
XP_011 APLPDASASPLSPHRRAKSLDRRSTE---------------------PSV----------
510 520 530
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pF1KA1 LRWRRPDLLNFKKGWMSILDEPGEPPSPSLTTTSTSQWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEE
::::::::::.. : : :::::::::.:.::.:::::.:::
XP_011 ----TPDLLNFKKGWLTKQYEDG-------------QWKKHWFVLADQSLRYYRDSVAEE
540 550 560 570
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pF1KA1 ADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPT
: .::::::: .: ::::: ::::::::::::.. .::::::::::::::... : :.::
XP_011 AADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMKHVHPT
580 590 600 610 620 630
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KA1 SAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGS----EVISRGGPRKADGQRQALDY
.:::::. .:... :. : : . : . : . ::. :. .:. ...:.
XP_011 TAPDVTSSLPEEKNKSSCSFETCPRPTEKQEAELGEPDPEQKRSRARERRREGRSKTFDW
640 650 660 670 680 690
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pF1KA1 VELSPLTQASPQR---ARTPARTPDRL---AKQEELERDLAQRSEERRKWF---EATDSR
.:. :. :: :. . :: : . : :. ::::. :.: ::::: : .:::.
XP_011 AEFRPIQQALAQERVGGVGPADTHEPLRPEAEPGELERERARRREERRKRFGMLDATDGP
700 710 720 730 740 750
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA1 TPEVPAGEGP-RRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTAL-LNQSR
: : . :. : :... . . . :::..:...: ::::.:.::.. . :..
XP_011 GTEDAALRMEVDRSPGLPMSDLKTHNVHVEIEQRWHQVETTPLREEKQVPIAPVHLSSED
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: : . ::::.. . . :: :: . . :: ..... ::. :
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pF1KA1 CERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEE-
: . . ..: ..:: . : . :: :: :.... :...:..: :
XP_011 VAASPSGAWQRLHRVNQDLQSELEAQCQR--QE---LITHQ-------IQTLKRSYGEAK
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pF1KA1 --LSRELSKTRSLQQ------GPDGLRKQHQSDVEA-LKRELQVLSEQYSQKCLEIGALM
. .. .. :::: . ....: . ... :::: . :: .. .::
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pF1KA1 RQAEEREHTLRRCQ----QEGQEL--LRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRS
: . :. :. . .. ::: :. .: :. ..:...:. ::. .. : ...
XP_011 SQLRASEQKLKSAEALLLEKTQELRGLETQQALQRDRQKEVQRLQERIADLSQQLGASEQ
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.: : :.::. :.: : : .... ..:. . .. . . . . . . :
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.. ....::.:.:. :.... .:: .
XP_011 SATFEGSEQVHQLEEQLEAREASVRRLAEHVQSLCDERDLLRQRFQELTERVATSDEDVA
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: .::::::: .: ::::: ::::::::::::.. .::::::::::::::... : :.::
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pF1KA1 QGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEA-CERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQE
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XP_011 EGDAATLREKYQRDLE------SLKATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREE
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XP_011 QRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQALEAERQALRQCQRENQELNAHNQ-------------
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XP_011 -------------------------VLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKYAS
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XP_011 DKYKDIYTELSIAKAKADCDISRLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPDFL
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XP_011 KKDRSCVTRQLRNIRSKSLKEGLTVQERLKLFESRDLKKD
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. .::::::::::::::... : :.::.:::::. .:... :. : : . : .
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:.... :...:..: : . .. .. :::: . ....: .
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... :::: . :: .. .:: : . :. :. . .. ::: :. .: :
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..:. . .. . . . . . . : .. ....::.:.:. :.... .:
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XP_011 EGDAATLREKYQRDLE------SLKATCERGFAAMEETHQKKIEDLQRQHQRELEKLREE
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XP_011 KDRLLAEETAATISAIEAMKNAHREEMERELEKSQRSQISSVNSDVEALRRQYLEELQSV
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XP_011 QRELEVLSEQYSQKCLENAHLAQALEAERQALRQCQRENQELNAHNQELNNRLAAEITRL
2200 2210 2220 2230 2240 2250
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pF1KA1 RGFIASQGMGNGCGR--SNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRF
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XP_011 RTLLTGDGGGEATGSPLAQGKDAYELEVLLRVKESEIQYLKQEISSLKDELQTALRDKKY
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pF1KA1 TSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE
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XP_011 ASDKYKDIYTELSIAKAKADCDISRLKEQLKAATEALGEKSPDSATVSGYDIMKSKSNPD
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XP_011 AADLDGEIDLSACYDVTEYPVQRNYGFQIHTKEGEFTLSAMTSGIRRNWIQTIMKHVHPT
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