Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1687
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1687, 718 aa
1>>>pF1KA1687 718 - 718 aa - 718 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9316+/-0.00102; mu= 10.8914+/- 0.061
mean_var=89.1390+/-18.228, 0's: 0 Z-trim(105.6): 168 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.135844
statistics sampled from 8353 (8538) to 8353 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 3.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 4876 966.3 0
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 4751 941.8 0
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 3104 619.0 8.1e-177
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 3102 618.6 1e-176
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 3074 613.1 4.7e-175
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 3003 599.2 5.6e-171
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 2872 573.5 3.6e-163
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 2792 557.8 1.9e-158
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 1592 322.7 1.1e-87
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 1524 309.3 1.1e-83
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 1406 286.2 9.6e-77
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 1401 285.2 1.8e-76
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 1383 281.7 2.2e-75
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 1383 281.7 2.2e-75
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 1383 281.7 2.3e-75
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1367 278.6 1.9e-74
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1367 278.6 1.9e-74
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 1249 255.4 1.5e-67
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 1241 253.9 4.5e-67
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1188 243.5 7.4e-64
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 1173 240.5 4.6e-63
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 1155 237.0 5.7e-62
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 947 196.2 1.1e-49
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 947 196.2 1.1e-49
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 946 196.1 1.5e-49
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 944 195.7 1.9e-49
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 943 195.5 2.1e-49
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 942 195.3 2.3e-49
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 942 195.3 2.4e-49
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 933 193.5 8.1e-49
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 437) 921 191.1 3e-48
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 893 185.7 1.8e-46
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 883 183.7 6.3e-46
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 773 162.1 2.2e-39
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 762 160.0 1e-38
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 752 158.0 3.9e-38
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 746 156.9 8.4e-38
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 742 156.1 1.4e-37
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 732 154.1 5.6e-37
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 727 153.1 1.1e-36
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 688 145.5 2.3e-34
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 656 139.3 2.5e-32
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 640 136.1 1.5e-31
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 640 136.1 1.5e-31
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 613 130.8 5.5e-30
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 608 129.8 1e-29
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 593 126.9 9.2e-29
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 590 126.3 1.3e-28
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 569 122.2 2.3e-27
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 560 120.4 5.8e-27
>>CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX (718 aa)
initn: 4876 init1: 4876 opt: 4876 Z-score: 5165.1 bits: 966.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4876; 100.0% identity (100.0% similar) in 718 aa overlap (1-718:1-718)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA1 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
670 680 690 700 710
>>CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX (720 aa)
initn: 4751 init1: 4751 opt: 4751 Z-score: 5032.7 bits: 941.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4751; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (1-699:1-699)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
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490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
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pF1KA1 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA1 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKESMQELLQNFYTTQKLKETLGH
670 680 690 700 710 720
>>CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (755 aa)
initn: 3003 init1: 3003 opt: 3104 Z-score: 3287.9 bits: 619.0 E(32554): 8.1e-177
Smith-Waterman score: 3110; 63.3% identity (82.9% similar) in 735 aa overlap (1-717:45-755)
10 20
pF1KA1 MSVSG-KKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGS
. .:: .:::::::::..:::::.: :.:
CCDS33 SRAYTSLVLVGCTNLCAVLFARCLDDHLVSLRMSGSRKEFDVKQILKIRWRWFGH--QAS
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 TNTGSCLQQEG-YEHRGTPVQGRLKSHSRDRNGLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAV
. ... .:.: . .:: . :: .: .: .. : . ...:.
CCDS33 SPNSTVDSQQGEFWNRG----------QTGANGGRKFLDPCSLQL----PLASIGYRRSS
80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KA1 QNLQQHNLIVHFQANEDTPKS----VPEKNLFKEAC------EKRAQDLEMMADDNIEDS
: . :: . . : . :: .. : : .. : ..: ::
CCDS33 Q--------LDFQNSPSWPMASTSEVPAFEFTAEDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDS
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 TARLDTQHSEDMNATR------SEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLR
.. .. :. ... . :.: :...::::::..::::::..::::::.:.:: :
CCDS33 SSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRR
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 IPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTI
:::::::::.::::::::::::: ::.:::..::::.::.: ::.:::::: :.::::.:
CCDS33 IPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNI
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFI
: ::..::::::.::...: .::.::::::::::::::.::::::.: .:::.::::::.
CCDS33 ECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFM
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 EVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIR
:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.::::..::. :: ::...:. .:. ::.:::
CCDS33 EVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIR
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 LPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALY
:::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::::::::::::: :.:::::::::::::.:.
CCDS33 LPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLF
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 AVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNT
::::::. ::.:.::::::::: : ...::::::::::::.:.::::::::::::::::
CCDS33 AVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNT
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNY
:::.:: : :.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::::.
CCDS33 VECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNF
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGV
::.::::::::::..:..::::.:::::::::::.: ::::::::.::: ::::::::::
CCDS33 VATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGV
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620 630 640 650 660 670
pF1KA1 ATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKL
.:.::.::..::::::::: ::::::::::::: : :..:: .:. ::::.:: :::::
CCDS33 TTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKL
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710
pF1KA1 YVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:.::::::..::::::.:: : ::: . .:. .::::::::.:::
CCDS33 YAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
720 730 740 750
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10 20 30 40 50
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.:: .:::::::::..:::::.: :.:. ... .:.: . .:: .
CCDS33 MSGSRKEFDVKQILKIRWRWFGH--QASSPNSTVDSQQGEFWNRG----------QTG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 RNGLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKS----VPEKN
:: .: .: .. : . ...:. : . :: . . : . :: .
CCDS33 ANGGRKFLDPCSLQL----PLASIGYRRSSQ--------LDFQNSPSWPMASTSEVPAFE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KA1 LFKEAC------EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATR------SEEQFHVI
. : : .. : ..: ::.. .. :. ... . :.: :...
CCDS33 FTAEDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDSSSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQAL
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEE
::::::..::::::..::::::.:.:: ::::::::::.::::::::::::: ::.:::
CCDS33 NHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEE
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 VRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPS
..::::.::.: ::.:::::: :.::::.:: ::..::::::.::...: .::.::::::
CCDS33 IKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPS
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 NCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDE
::::::::.::::::.: .:::.::::::.:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.:
CCDS33 NCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNE
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pF1KA1 ETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLME
:::..::. :: ::...:. .:. ::.::::::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::
CCDS33 ETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIME
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 AMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTM
::::::::::: :.:::::::::::::.:.::::::. ::.:.::::::::: : ...:
CCDS33 AMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANM
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pF1KA1 NGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLE
:::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:: : :.:::::::::::::::.::
CCDS33 NGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLE
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pF1KA1 GPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSS
:::::::::::::::::::::::..::::.::.::::::::::..:..::::.:::::::
CCDS33 GPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSS
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590 600 610 620 630 640
pF1KA1 CLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVER
::::.: ::::::::.::: ::::::::::.:.::.::..::::::::: :::::::::
CCDS33 CLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVER
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pF1KA1 YDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVP
:::: : :..:: .:. ::::.:: ::::::.::::::..::::::.:: : ::: . .:
CCDS33 YDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAP
640 650 660 670 680 690
710
pF1KA1 VNIGRAGACVVVVKLP
. .::::::::.:::
CCDS33 LCLGRAGACVVTVKL
700
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10 20 30 40 50
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:: ::.:.::::.::::::. :::: :. :.::::.: .:: : : :.:: .
CCDS94 MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWG-PSQSRLLK-
10 20 30 40 50
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:..:.:. :: :.:: . . :. : :. : :. :. .
CCDS94 SQERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPART
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100 110 120 130 140
pF1KA1 HFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKRA--QDLEMMADDNI----EDSTARLD-TQHS----
: .. . :: . : :: :.:.. :.. : ::. : ::
CCDS94 LFYVESLEEEVVPGMD-FPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQ
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150 160 170 180 190 200
pF1KA1 EDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYF
:.... ::: .....:::::.::::.:::..:::::.::.:. .:::::::::.:::::
CCDS94 SDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYF
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210 220 230 240 250 260
pF1KA1 AAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQV
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CCDS94 AAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQV
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270 280 290 300 310 320
pF1KA1 IDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANE
..:: .::.: ::::::::::.:.::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.:
CCDS94 VEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEE
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330 340 350 360 370 380
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. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::.
CCDS94 LHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENH
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390 400 410 420 430 440
pF1KA1 SMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIE
..: .:::::::..::::::::::::..::::::::::::::.:::::::: ::.::::
CCDS94 ALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIE
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 KYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMP
::::::: :.. : ::::::::::::::.::.:.::::::::::::::.:: : :::.:
CCDS94 KYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLP
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pF1KA1 PMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVA
:::::::::::..::::.::::::::::::::::::::...::..::::: ::::::.:
CCDS94 PMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAA
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570 580 590 600 610 620
pF1KA1 LNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDA
::.:::..:::::::::.::::.:::::::..:::: :::::::::: .::::.::::::
CCDS94 LNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDA
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pF1KA1 PASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTV
::::::::: : ::::::: :.:. :::::.:::::.:: :::.::.::::::.:::::.
CCDS94 PASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTM
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690 700 710
pF1KA1 ESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:::: : ::: . . .:::::::::::.: :
CCDS94 ESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
720 730 740
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pF1KA1 CEKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEK
:. :.: :...::::::..::::::..:
CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHK
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 QLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQY
:::::.:.:: ::::::::::.::::::::::::: ::.:::..::::.::.: ::.::
CCDS54 QLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQY
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 AYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTEL
:::: :.::::.:: ::..::::::.::...: .::.::::::::::::::.::::::.:
CCDS54 AYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDL
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pF1KA1 LNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQN
.:::.::::::.:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.::::..::. :: ::...
CCDS54 HKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQ
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pF1KA1 RQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSP
:. .:. ::.::::::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::::::::::::: :.:::
CCDS54 RRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSP
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pF1KA1 RTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLY
::::::::::.:.::::::. ::.:.::::::::: : ...::::::::::::.:.:::
CCDS54 RTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLY
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pF1KA1 VVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNT
::::::::::::::::.:: : :.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 VVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNT
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 VERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSL
::::::..::::.::.::::::::::..:..::::.:::::::::::.: ::::::::.:
CCDS54 VERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTL
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pF1KA1 CAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVP
:: ::::::::::.:.::.::..::::::::: ::::::::::::: : :..:: .:.
CCDS54 CAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSIS
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 RDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
::::.:: ::::::.::::::..::::::.:: : ::: . .:. .::::::::.:::
CCDS54 RDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQ--GSTNTGSCLQQEG---YEHRGTPVQGRLKSH
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CCDS73 MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWG-PSQSRLLK-
10 20 30 40 50
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pF1KA1 SRDRNGLKKS-NSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTP---KSVP
:..:.:.. ..: . . :. . . . . :. : : . .. .: . :
CCDS73 SQERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSS---SFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQP
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 EKNLFKEACEKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRK
..:: ...:: :. . .: .. . . .: . . : .. :
CCDS73 ARTLF------YVESLE-------EEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQAT---
120 130 140 150
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pF1KA1 MENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPN
. : .::::::.::::::::::.:: ::::::..:::.:::
CCDS73 -------GEGC------------GHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPN
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 ALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFG
:: .:::.:::: :.:::::::.:::::::::: ::..:: .::.: ::::::::::.:.
CCDS73 ALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFA
210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 DAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQ
::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.:. ::: :::.:::::::::::::.
CCDS73 DAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMM
270 280 290 300 310 320
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pF1KA1 WVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPE
:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::. ..: .:::::::..::::::::::
CCDS73 WVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGV
::..::::::::::::::.:::::::: ::.::::::::::: :.. : ::::::::::
CCDS73 RRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGV
390 400 410 420 430 440
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pF1KA1 AVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGH
::::.::.:.::::::::::::::.:: : :::.::::::::::::..::::.::::::
CCDS73 AVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGH
450 460 470 480 490 500
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pF1KA1 DGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFD
::::::::::::::...::..::::: ::::::.:::.:::..:::::::::.::::.:
CCDS73 DGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYD
510 520 530 540 550 560
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pF1KA1 PHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWS
::::::..:::: :::::::::: .::::.::::::::::::::: : ::::::: :.:.
CCDS73 PHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWT
570 580 590 600 610 620
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pF1KA1 TVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGAC
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CCDS73 MVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGAC
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 VVVVKLP
:::.: :
CCDS73 VVVIKQP
>>CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (694 aa)
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10 20
pF1KA1 MSVSG-KKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGS
. .:: .:::::::::..:::::.: :.:
CCDS34 SRAYTSLVLVGCTNLCAVLFARCLDDHLVSLRMSGSRKEFDVKQILKIRWRWFGH--QAS
20 30 40 50 60 70
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CCDS34 MSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVL
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CCDS34 SGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAP
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CCDS34 AYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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CCDS13 GQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
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CCDS30 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
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CCDS30 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
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640
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]