FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1687, 718 aa
1>>>pF1KA1687 718 - 718 aa - 718 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6946+/-0.000445; mu= 12.3661+/- 0.027
mean_var=100.7614+/-21.690, 0's: 0 Z-trim(112.6): 334 B-trim: 686 in 1/52
Lambda= 0.127769
statistics sampled from 21159 (21583) to 21159 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 11.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 4876 910.2 0
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 4751 887.2 0
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 3104 583.6 9.8e-166
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 3104 583.6 1e-165
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 3104 583.6 1e-165
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 3102 583.2 1.2e-165
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 3073 577.8 4.1e-164
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 3074 578.0 4.5e-164
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 3025 569.0 2.5e-161
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 3025 569.0 2.5e-161
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 3025 569.0 2.5e-161
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 3024 568.8 2.8e-161
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 3024 568.8 2.8e-161
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 3024 568.8 2.8e-161
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 3003 564.9 3.1e-160
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 2872 540.8 6.8e-153
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 2863 539.1 1.7e-152
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 2792 526.0 1.9e-148
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 1406 270.5 1.3e-71
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 1401 269.6 2.4e-71
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 1383 266.3 2.5e-70
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 1383 266.3 2.5e-70
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 1383 266.3 2.6e-70
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 1383 266.3 2.6e-70
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 1373 264.4 8.5e-70
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 1367 263.3 1.9e-69
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 1367 263.3 2e-69
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 1367 263.3 2e-69
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 1366 263.2 2.3e-69
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 1249 241.6 6e-63
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 1241 240.1 1.7e-62
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 1241 240.1 1.7e-62
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 1190 230.7 1e-59
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 1190 230.7 1.2e-59
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1188 230.4 1.7e-59
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1188 230.4 1.7e-59
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1188 230.4 1.7e-59
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1188 230.4 1.7e-59
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1188 230.4 1.7e-59
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 1173 227.5 9.7e-59
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 1173 227.5 9.7e-59
NP_001278935 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 544) 1155 224.2 1e-57
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 1126 218.9 3.8e-56
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 1126 218.9 4.1e-56
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 1010 197.5 9.2e-50
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 946 185.8 4.9e-46
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 946 185.8 4.9e-46
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 946 185.8 4.9e-46
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 944 185.4 6.3e-46
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 944 185.4 6.3e-46
>>NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isoform (718 aa)
initn: 4876 init1: 4876 opt: 4876 Z-score: 4862.1 bits: 910.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4876; 100.0% identity (100.0% similar) in 718 aa overlap (1-718:1-718)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA1 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
670 680 690 700 710
>>NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isoform (720 aa)
initn: 4751 init1: 4751 opt: 4751 Z-score: 4737.5 bits: 887.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4751; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (1-699:1-699)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGSTNTGSCLQQEGYEHRGTPVQGRLKSHSRDRN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 GLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAVQNLQQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 EKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 LCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 YTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 NVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 QGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 TKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 VGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 ERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 APMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA1 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_476 DAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKESMQELLQNFYTTQKLKETLGH
670 680 690 700 710 720
>>NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isoform (755 aa)
initn: 3003 init1: 3003 opt: 3104 Z-score: 3096.4 bits: 583.6 E(85289): 9.8e-166
Smith-Waterman score: 3110; 63.3% identity (82.9% similar) in 735 aa overlap (1-717:45-755)
10 20
pF1KA1 MSVSG-KKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGS
. .:: .:::::::::..:::::.: :.:
NP_057 SRAYTSLVLVGCTNLCAVLFARCLDDHLVSLRMSGSRKEFDVKQILKIRWRWFGH--QAS
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 TNTGSCLQQEG-YEHRGTPVQGRLKSHSRDRNGLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAV
. ... .:.: . .:: . :: .: .: .. : . ...:.
NP_057 SPNSTVDSQQGEFWNRG----------QTGANGGRKFLDPCSLQL----PLASIGYRRSS
80 90 100 110
90 100 110 120 130
pF1KA1 QNLQQHNLIVHFQANEDTPKS----VPEKNLFKEAC------EKRAQDLEMMADDNIEDS
: . :: . . : . :: .. : : .. : ..: ::
NP_057 Q--------LDFQNSPSWPMASTSEVPAFEFTAEDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDS
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 TARLDTQHSEDMNATR------SEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLR
.. .. :. ... . :.: :...::::::..::::::..::::::.:.:: :
NP_057 SSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRR
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 IPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTI
:::::::::.::::::::::::: ::.:::..::::.::.: ::.:::::: :.::::.:
NP_057 IPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNI
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFI
: ::..::::::.::...: .::.::::::::::::::.::::::.: .:::.::::::.
NP_057 ECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFM
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 EVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIR
:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.::::..::. :: ::...:. .:. ::.:::
NP_057 EVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIR
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 LPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALY
:::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::::::::::::: :.:::::::::::::.:.
NP_057 LPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLF
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 AVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNT
::::::. ::.:.::::::::: : ...::::::::::::.:.::::::::::::::::
NP_057 AVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNT
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNY
:::.:: : :.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::::.
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560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGV
::.::::::::::..:..::::.:::::::::::.: ::::::::.::: ::::::::::
NP_057 VATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGV
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620 630 640 650 660 670
pF1KA1 ATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKL
.:.::.::..::::::::: ::::::::::::: : :..:: .:. ::::.:: :::::
NP_057 TTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKL
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680 690 700 710
pF1KA1 YVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:.::::::..::::::.:: : ::: . .:. .::::::::.:::
NP_057 YAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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>>XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like prot (788 aa)
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10 20
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. .:: .:::::::::..:::::.: :.:
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. ... .:.: . .:: . :: .: .: .. : . ...:.
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: . :: . . : . :: .. : : .. : ..: ::
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.. .. :. ... . :.: :...::::::..::::::..::::::.:.:: :
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:::::::::.::::::::::::: ::.:::..::::.::.: ::.:::::: :.::::.:
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: ::..::::::.::...: .::.::::::::::::::.::::::.: .:::.::::::.
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:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.::::..::. :: ::...:. .:. ::.:::
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380 390 400 410 420 430
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:::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::::::::::::: :.:::::::::::::.:.
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::::::. ::.:.::::::::: : ...::::::::::::.:.::::::::::::::::
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pF1KA1 VECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNY
:::.:: : :.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::::.
XP_016 VECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNF
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pF1KA1 VASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGV
::.::::::::::..:..::::.:::::::::::.: ::::::::.::: ::::::::::
XP_016 VATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGV
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pF1KA1 ATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKL
.:.::.::..::::::::: ::::::::::::: : :..:: .:. ::::.:: :::::
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pF1KA1 YVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:.::::::..::::::.:: : ::: . .:. .::::::::.:::
XP_016 YAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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>>XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like prot (789 aa)
initn: 3003 init1: 3003 opt: 3104 Z-score: 3096.2 bits: 583.6 E(85289): 1e-165
Smith-Waterman score: 3110; 63.3% identity (82.9% similar) in 735 aa overlap (1-717:79-789)
10 20
pF1KA1 MSVSG-KKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGS
. .:: .:::::::::..:::::.: :.:
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pF1KA1 TNTGSCLQQEG-YEHRGTPVQGRLKSHSRDRNGLKKSNSPVHHNILAPVPGPAPAHQRAV
. ... .:.: . .:: . :: .: .: .. : . ...:.
XP_005 SPNSTVDSQQGEFWNRG----------QTGANGGRKFLDPCSLQL----PLASIGYRRSS
110 120 130 140 150
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pF1KA1 QNLQQHNLIVHFQANEDTPKS----VPEKNLFKEAC------EKRAQDLEMMADDNIEDS
: . :: . . : . :: .. : : .. : ..: ::
XP_005 Q--------LDFQNSPSWPMASTSEVPAFEFTAEDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDS
160 170 180 190 200
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pF1KA1 TARLDTQHSEDMNATR------SEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLR
.. .. :. ... . :.: :...::::::..::::::..::::::.:.:: :
XP_005 SSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRR
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200 210 220 230 240 250
pF1KA1 IPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTI
:::::::::.::::::::::::: ::.:::..::::.::.: ::.:::::: :.::::.:
XP_005 IPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNI
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pF1KA1 ESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFI
: ::..::::::.::...: .::.::::::::::::::.::::::.: .:::.::::::.
XP_005 ECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFM
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pF1KA1 EVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIR
:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.::::..::. :: ::...:. .:. ::.:::
XP_005 EVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIR
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pF1KA1 LPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALY
:::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::::::::::::: :.:::::::::::::.:.
XP_005 LPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLF
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pF1KA1 AVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNT
::::::. ::.:.::::::::: : ...::::::::::::.:.::::::::::::::::
XP_005 AVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNT
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500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNY
:::.:: : :.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::::.
XP_005 VECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNF
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560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGV
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XP_005 VATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGV
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620 630 640 650 660 670
pF1KA1 ATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKL
.:.::.::..::::::::: ::::::::::::: : :..:: .:. ::::.:: :::::
XP_005 TTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKL
690 700 710 720 730 740
680 690 700 710
pF1KA1 YVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
:.::::::..::::::.:: : ::: . .:. .::::::::.:::
XP_005 YAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
750 760 770 780
>>NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (709 aa)
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.:: .:::::::::..:::::.: :.:. ... .:.: . .:: .
NP_001 MSGSRKEFDVKQILKIRWRWFGH--QASSPNSTVDSQQGEFWNRG----------QTG
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. : : .. : ..: ::.. .. :. ... . :.: :...
NP_001 FTAEDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDSSSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQAL
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pF1KA1 NHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEE
::::::..::::::..::::::.:.:: ::::::::::.::::::::::::: ::.:::
NP_001 NHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEE
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pF1KA1 VRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPS
..::::.::.: ::.:::::: :.::::.:: ::..::::::.::...: .::.::::::
NP_001 IKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPS
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pF1KA1 NCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDE
::::::::.::::::.: .:::.::::::.:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.:
NP_001 NCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNE
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pF1KA1 ETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLME
:::..::. :: ::...:. .:. ::.::::::: ::.:::.:.. .: :.:::::.::
NP_001 ETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIME
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pF1KA1 AMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTM
::::::::::: :.:::::::::::::.:.::::::. ::.:.::::::::: : ...:
NP_001 AMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANM
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pF1KA1 NGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLE
:::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:: : :.:::::::::::::::.::
NP_001 NGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLE
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pF1KA1 GPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSS
:::::::::::::::::::::::..::::.::.::::::::::..:..::::.:::::::
NP_001 GPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSS
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pF1KA1 CLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVER
::::.: ::::::::.::: ::::::::::.:.::.::..::::::::: :::::::::
NP_001 CLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVER
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pF1KA1 YDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVP
:::: : :..:: .:. ::::.:: ::::::.::::::..::::::.:: : ::: . .:
NP_001 YDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAP
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pF1KA1 VNIGRAGACVVVVKLP
. .::::::::.:::
NP_001 LCLGRAGACVVTVKL
700
>>XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like prot (575 aa)
initn: 3629 init1: 3058 opt: 3073 Z-score: 3067.4 bits: 577.8 E(85289): 4.1e-164
Smith-Waterman score: 3073; 75.8% identity (93.2% similar) in 570 aa overlap (149-718:6-575)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 ACEKRAQDLEMMADDNIEDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKE
:.... ::: .....:::::.::::.:::.
XP_016 MTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQ
10 20 30
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pF1KA1 KQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQ
.:::::.::.:. .:::::::::.::::::::::.:: ::::::..:::.::::: .:::
XP_016 QQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQ
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 YAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTE
.:::: :.:::::::.:::::::::: ::..:: .::.: ::::::::::.:.::::: :
XP_016 FAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIE
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 LLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQ
:..:::.::::...:::.:::::::::.:. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:
XP_016 LMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQ
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 NRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQS
.: ..:.:::..:::::::::.:::::. ..: .:::::::..::::::::::::..:::
XP_016 SRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQS
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 PRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTIEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKL
:::::::::::.:::::::: ::.::::::::::: :.. : ::::::::::::::.::
XP_016 PRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKL
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 YVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLN
.:.::::::::::::::.:: : :::.::::::::::::..::::.:::::::::::::
XP_016 FVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLN
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 TVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWS
:::::::...::..::::: ::::::.:::.:::..:::::::::.::::.:::::::.
XP_016 TVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWN
400 410 420 430 440 450
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pF1KA1 LCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSV
.:::: :::::::::: .::::.::::::::::::::: : ::::::: :.:. :::::.
XP_016 MCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSM
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 PRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
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XP_016 PRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
520 530 540 550 560 570
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50
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:..:.:. :: :.:: . . :. : :. : :. :. .
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: .. . :: . : :: :.:.. :.. : ::. : ::
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:.... ::: .....:::::.::::.:::..:::::.::.:. .:::::::::.:::::
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..:: .::.: ::::::::::.:.::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.:
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. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::.
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..: .:::::::..::::::::::::..::::::::::::::.:::::::: ::.::::
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:::::::::::..::::.::::::::::::::::::::...::..::::: ::::::.:
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pF1KA1 LNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDA
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690 700 710
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:::: : ::: . . .:::::::::::.: :
NP_065 ESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
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10 20
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pF1KA1 QNLQQHNLIVHFQANEDTPKS----VPEKNLFKEAC------EKRAQDLEMMADDNIEDS
: . :: . . : . :: .. : : .. : ..: ::
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pF1KA1 TARLDTQHSEDMNATR------SEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLR
.. .. :. ... . :.: :...::::::..::::::..::::::.:.:: :
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200 210 220 230 240 250
pF1KA1 IPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTI
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XP_011 IPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNI
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pF1KA1 ESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFI
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pF1KA1 EVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIR
:::.::::.::::.::.::: :::.:.:.::::..::. :: ::...:. .:. ::.:::
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::::::. ::.:.::::::::: : ...::::::::::::.:.::::::::::::::::
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pF1KA1 ATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKL
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pF1KA1 YVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
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XP_011 YAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQKTFPTCAWGIILPSPRI
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10 20
pF1KA1 MSVSG-KKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQGS
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XP_011 RRAYTSLVLVGCTNLCAVLFARCLDDHLVSLRMSGSRKEFDVKQILKIRWRWFGH--QAS
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XP_011 SPNSTVDSQQGEFWNRG----------QTGANGGRKFLDPCSLQL----PLASIGYRRSS
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pF1KA1 QNLQQHNLIVHFQANEDTPKS----VPEKNLFKEAC------EKRAQDLEMMADDNIEDS
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XP_011 Q--------LDFQNSPSWPMASTSEVPAFEFTAEDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDS
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XP_011 SSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRR
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200 210 220 230 240 250
pF1KA1 IPAHRLVLSAVSDYFAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTI
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XP_011 IPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNI
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260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ESLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFI
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XP_011 ECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFM
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 EVIKNQEFLLLPANEISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIR
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XP_011 EVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIR
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 LPLLPPQLLADLETSSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALY
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XP_011 LPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLF
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XP_011 AVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNT
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pF1KA1 ATYNGFLYVVGGHDAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKL
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XP_011 YAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQKTFPTCAWGIILPSPRI
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718 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 11:19:35 2016 done: Thu Nov 3 11:19:36 2016
Total Scan time: 11.740 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]