FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1689, 2624 aa 1>>>pF1KA1689 2624 - 2624 aa - 2624 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3107+/-0.000552; mu= 8.5369+/- 0.034 mean_var=231.6225+/-48.054, 0's: 0 Z-trim(114.3): 101 B-trim: 398 in 2/54 Lambda= 0.084272 statistics sampled from 23988 (24085) to 23988 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16 Scan time: 23.750 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060899 (OMIM: 607012) transcription factor TFII (2624) 16826 2061.1 0 XP_011541813 (OMIM: 607012) PREDICTED: transcripti (2622) 16801 2058.1 0 XP_016865120 (OMIM: 607012) PREDICTED: transcripti (2624) 16550 2027.6 0 XP_016865119 (OMIM: 607012) PREDICTED: transcripti (2624) 16550 2027.6 0 XP_016865121 (OMIM: 607012) PREDICTED: transcripti (2584) 16544 2026.8 0 XP_016865122 (OMIM: 607012) 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