Result of FASTA (ccds) for pF1KA1700
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1700, 665 aa
  1>>>pF1KA1700 665 - 665 aa - 665 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9087+/-0.00104; mu= 7.9610+/- 0.063
 mean_var=144.3870+/-28.866, 0's: 0 Z-trim(109.1): 48  B-trim: 103 in 1/51
 Lambda= 0.106736
 statistics sampled from 10591 (10636) to 10591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time:  4.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12        ( 665) 4372 685.3 7.3e-197
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11          ( 625) 1483 240.4 5.8e-63
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2           ( 314)  473 84.7 2.1e-16
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3          ( 419)  462 83.1 8.8e-16
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12          ( 381)  446 80.6 4.5e-15
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX          ( 384)  439 79.5 9.5e-15
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5           ( 367)  433 78.6 1.7e-14
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1         ( 482)  422 77.0 7.1e-14
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8           ( 303)  404 74.1 3.3e-13
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8           ( 394)  402 73.8   5e-13
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10          ( 384)  365 68.1 2.6e-11


>>CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12             (665 aa)
 initn: 4372 init1: 4372 opt: 4372  Z-score: 3647.8  bits: 685.3 E(32554): 7.3e-197
Smith-Waterman score: 4372; 100.0% identity (100.0% similar) in 665 aa overlap (1-665:1-665)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 DKVLITELIQHSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTVLLGKLEKSFNSVHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DKVLITELIQHSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTVLLGKLEKSFNSVHL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 LAGGFAEFSRCFPGLCEGKSTLVPTCISQPCLPVANIGPTRILPNLYLGCQRDVLNKELM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LAGGFAEFSRCFPGLCEGKSTLVPTCISQPCLPVANIGPTRILPNLYLGCQRDVLNKELM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 QTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 PSVPSVQPSLLEDSPLVQALSGLHLSADRLEDSNKLKRSFSLDIKSVSYSASMAASLHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PSVPSVQPSLLEDSPLVQALSGLHLSADRLEDSNKLKRSFSLDIKSVSYSASMAASLHGF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 SSSEDALEYYKPSTTLDGTNKLCQFSPVQELSEQTPETSPDKEEASIPKKLQTARPSDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SSSEDALEYYKPSTTLDGTNKLCQFSPVQELSEQTPETSPDKEEASIPKKLQTARPSDSQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 SKRLHSVRTSSSGTAQRSLLSPLHRSGSVEDNYHTSFLFGLSTSQQHLTKSAGLGLKGWH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SKRLHSVRTSSSGTAQRSLLSPLHRSGSVEDNYHTSFLFGLSTSQQHLTKSAGLGLKGWH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SDILAPQTSTPSLTSSWYFATESSHFYSASAIYGGSASYSAYSCSQLPTCGDQVYSVRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SDILAPQTSTPSLTSSWYFATESSHFYSASAIYGGSASYSAYSCSQLPTCGDQVYSVRRR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 QKPSDRADSRRSWHEESPFEKQFKRRSCQMEFGESIMSENRSREELGKVGSQSSFSGSME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 QKPSDRADSRRSWHEESPFEKQFKRRSCQMEFGESIMSENRSREELGKVGSQSSFSGSME
              610       620       630       640       650       660

            
pF1KA1 IIEVS
       :::::
CCDS86 IIEVS
            

>>CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11               (625 aa)
 initn: 1673 init1: 829 opt: 1483  Z-score: 1243.9  bits: 240.4 E(32554): 5.8e-63
Smith-Waterman score: 1732; 47.0% identity (68.1% similar) in 675 aa overlap (1-665:1-625)

               10         20        30        40        50         
pF1KA1 MAHEMIGTQIV-TERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQ
       :: . .  ... ...:..::..:    :.:::: :::::. :.: ..:: ::::.:::::
CCDS77 MAGDRLPRKVMDAKKLASLLRGGPGGPLVIDSRSFVEYNSWHVLSSVNICCSKLVKRRLQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 QDKVLITELIQHSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTVLLGKLEKSFNSVH
       : :: :.:::: .:. .:.    : :::::::..:.. :..: ::..::.::.  :.:: 
CCDS77 QGKVTIAELIQPAARSQVEATEPQDVVVYDQSTRDASVLAADSFLSILLSKLDGCFDSVA
               70        80        90       100       110       120

     120       130        140       150       160       170        
pF1KA1 LLAGGFAEFSRCFPGLCEGK-STLVPTCISQPCLPVANIGPTRILPNLYLGCQRDVLNKE
       .:.:::: :: ::::::::: ..:.:  .::::::: ..: :::::.:::: :.:::::.
CCDS77 ILTGGFATFSSCFPGLCEGKPAALLPMSLSQPCLPVPSVGLTRILPHLYLGSQKDVLNKD
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 LMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNG
       :: ::::.:::::::.::::::: ::.:.:::.::..:::.:::::::..::.::: :. 
CCDS77 LMTQNGISYVLNASNSCPKPDFICESRFMRVPINDNYCEKLLPWLDKSIEFIDKAKLSSC
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA1 CVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKI
        :.:::::::::::::::::::: : :: :.::::::..::.::::::::::::.::...
CCDS77 QVIVHCLAGISRSATIAIAYIMKTMGMSSDDAYRFVKDRRPSISPNFNFLGQLLEYERSL
              250       260       270       280       290       300

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA1 KNQTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRP--VH
       :  .. .:  .  .      : :: :. . :.   . :  :: ..::..  :. :   . 
CCDS77 KLLAALQGDPGTPS----GTP-EPPPSPAAGAPLPRLP--PPTSESAATGNAAAREGGLS
              310            320       330         340       350   

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA1 PASVPSVPSVQPSLLEDSPLVQALSGLHLSADRLEDSNKLKRSFSLDIKSVSYSASMAAS
        .. : .: . :.    : : :.: :::::.:::.:.:.::::::::::: .:. :   .
CCDS77 AGGEPPAPPTPPAT---SALQQGLRGLHLSSDRLQDTNRLKRSFSLDIKS-AYAPSRRPD
           360          370       380       390       400          

        420       430       440         450       460       470    
pF1KA1 LHGFSSSEDALEYYKPSTTLDGTNKLCQF-SPV-QELSEQTPETSPDKEEASIPKKLQTA
         :  .  .:     :        :::.. ::    :. ..:  :::. .:. :.    :
CCDS77 GPGPPDPGEA-----P--------KLCKLDSPSGAALGLSSP--SPDSPDAA-PE----A
     410            420               430         440              

          480       490       500        510       520       530   
pF1KA1 RPSDSQSKRLHSVRTSSSGTAQRSLLSPLHRSG-SVEDNYHTSFLFGLSTSQQHLTKSAG
       ::   .  :        .:.  ::   : :  : .  :  . .   :::. .     . :
CCDS77 RPRPRRRPR------PPAGSPARS---PAHSLGLNFGDAARQTPRHGLSALSAPGLPGPG
     450             460          470       480       490       500

             540       550       560       570       580       590 
pF1KA1 L--GLKGWHSDILAPQTSTPSLTSSWYFATESSHFYSASAIYGGSASYSAYSCSQLPTCG
          :  .:   . .:  .:::  . : :. :.       :  .:.. .. .. .  :  :
CCDS77 QPAGPGAWAPPLDSP--GTPSPDGPWCFSPEG-------AQGAGGVLFAPFGRAGAPGPG
              510         520       530              540       550 

             600       610       620       630       640        650
pF1KA1 DQVYSVRRRQKPSDRADSRRSWHEESPFEKQFKRRSCQMEFGESIMSENRSR-EELGKVG
             ::.   ..  :.: .: ::   : ::::::::::: :. : :.:.: :::. .:
CCDS77 GGSDLRRREAARAEPRDARTGWPEEPAPETQFKRRSCQMEFEEG-MVEGRARGEELAALG
             560       570       580       590        600       610

              660     
pF1KA1 SQSSFSGSMEIIEVS
       .:.:::::.:.::::
CCDS77 KQASFSGSVEVIEVS
              620     

>>CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2                (314 aa)
 initn: 543 init1: 312 opt: 473  Z-score: 407.9  bits: 84.7 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 555; 36.8% identity (62.8% similar) in 288 aa overlap (24-298:25-311)

                10        20        30        40        50         
pF1KA1  MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQ
                               :..::.: :::. .   :.  :  .  . :..:: .
CCDS20 MGLEAARELECAALGTLLRDPREAERTLLLDCRPFLAFCRRHVRAARPVPWNALLRRRAR
               10        20        30        40        50        60

      60          70        80        90       100           110   
pF1KA1 QDK--VLITELIQHSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDC----FLTVLLGKLEK
            ::   : ... . ..      ..:: :..: .:: :  :     .:..:: . . 
CCDS20 GPPAAVLACLLPDRALRTRLVRGELARAVVLDEGSASVAELRPDSPAHVLLAALLHETRA
               70        80        90       100       110       120

           120       130        140            150        160      
pF1KA1 SFNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLC-EGKSTLVP-----TCISQPCLPVANIG-PTRILPNL
       . ..:..: :::  :. : : :: :. .  .:     :  :.   :: . : :..::: :
CCDS20 GPTAVYFLRGGFDGFQGCCPDLCSEAPAPALPPTGDKTSRSDSRAPVYDQGGPVEILPYL
              130       140       150       160       170       180

        170       180       190       200       210       220      
pF1KA1 YLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKS
       .::      . . .:  ::  :::.: .::.  :    ..  .::.:.   .:  :....
CCDS20 FLGSCSHSSDLQGLQACGITAVLNVSASCPN-HFEGLFRYKSIPVEDNQMVEISAWFQEA
              190       200       210        220       230         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KA1 VDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFN
       . ::. .: :.: ::::: ::::::::: .::.:.   . ::::. :::..: .:::::.
CCDS20 IGFIDWVKNSGGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMQSRRVRLDEAFDFVKQRRGVISPNFS
     240       250       260       270       280       290         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KA1 FLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSAT
       :.::::..: ..                                                
CCDS20 FMGQLLQFETQVLCH                                             
     300       310                                                 

>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3               (419 aa)
 initn: 600 init1: 301 opt: 462  Z-score: 396.8  bits: 83.1 E(32554): 8.8e-16
Smith-Waterman score: 558; 33.8% identity (60.8% similar) in 337 aa overlap (13-307:58-390)

                                 10        20         30        40 
pF1KA1                   MAHEMIGTQIVTERLVALLES-GTEKVLLIDSRPFVEYNTSH
                                     : :   ::. :  ..::.: ::   ...::
CCDS33 GSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSH
        30        40        50        60        70        80       

              50        60         70        80         90         
pF1KA1 ILEAININCSKLMKRRLQQDKVLITELI-QHSAKHKVDIDC-SQKVVVYDQSSQDVASL-
       :  :::.    :: :::.. .. :  .: .:. :..    : .  :..::... .     
CCDS33 IETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQPEP
        90       100       110       120       130       140       

       100       110       120       130              140          
pF1KA1 -SSDCFLTVLLGKLEKSFNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCE-------GKSTLVPTC----
        .    : .:: ::. .  ... : ::: .:.  .   ::       . :.  ::     
CCDS33 GAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGL
       150       160       170       180       190       200       

            150                            160       170       180 
pF1KA1 ----ISQPC--------LPVANI---G----------PTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQ
           ::. :        :: .     :          :..::: ::::: .:  : ... 
CCDS33 GGLRISSDCSDGESDRELPSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLG
       210       220       230       240       250       260       

             190        200       210       220       230       240
pF1KA1 QNGIGYVLNASNTCPKP-DFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCV
       . :: :.::.. . :.  .   :  . ..:..: . ...  .. ....::..:....  :
CCDS33 KYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGV
       270       280       290       300       310       320       

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKN
       :::::::::::.:...::.:..:..::..:: :::.:. .:::::::.:::::.:. .  
CCDS33 LVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERTL--
       330       340       350       360       370       380       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 QTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASV
         : :.:                                                     
CCDS33 --GLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST                        
           390       400       410                                 

>>CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12               (381 aa)
 initn: 598 init1: 291 opt: 446  Z-score: 384.2  bits: 80.6 E(32554): 4.5e-15
Smith-Waterman score: 587; 34.0% identity (62.3% similar) in 332 aa overlap (19-307:27-352)

                       10        20        30        40        50  
pF1KA1         MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSK
                                 :: :.:..::.: ::   :..:::  :::.    
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
               10        20        30        40        50        60

             60        70         80         90        100         
pF1KA1 LMKRRLQQDKVLITELIQHSA-KHKVDIDC-SQKVVVYDQSSQDVA-SLSSDCFLTVLLG
       .: ::::. .. .  :. ..  . .    : .. ::.::.::.:   . ...  : .:: 
CCDS90 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLK
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140        150                  
pF1KA1 KLEKSFNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGKSTLVPTCISQ-PCLPVANIG----------
       ::.     .  : :::..:.  :   ::  ..:  .: :. : ::: ..:          
CCDS90 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCE--TNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSS
              130       140         150       160       170        

                                  160       170       180       190
pF1KA1 ----------------------------PTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLN
                                   :..::: ::::: .:  : ..... :: :.::
CCDS90 DIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILN
      180       190       200       210       220       230        

               200       210       220       230       240         
pF1KA1 ASNTCPKP-DFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGIS
       .. . :.  .   : .. ..:..: . ...  .. ....::..:...:  ::::::::::
CCDS90 VTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGIS
      240       250       260       270       280       290        

     250       260       270       280       290       300         
pF1KA1 RSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKS
       ::.:...::.:.....:...:: .:: :. .:::::::.:::::.:. .    : :.:  
CCDS90 RSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTL----GLSSPCD
      300       310       320       330       340           350    

     310       320       330       340       350       360         
pF1KA1 KLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASVPSVPSVQPS
                                                                   
CCDS90 NRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST                                 
          360       370       380                                  

>>CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX               (384 aa)
 initn: 451 init1: 291 opt: 439  Z-score: 378.3  bits: 79.5 E(32554): 9.5e-15
Smith-Waterman score: 481; 29.7% identity (59.7% similar) in 330 aa overlap (25-299:21-345)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQQ
                               ..::.: :    :....:  :...    :. :::..
CCDS14     MEGLGRSCLWLRRELSPPRPRLLLLDCRSRELYESARIGGALSVALPALLLRRLRR
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90                100       110 
pF1KA1 DKVLITELIQHSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSS---------QDVASLSSDCFLTVLLGKL
        .. .  :.       ..      :..:::..          ..    ..  : .:: ::
CCDS14 GSLSVRALLPGP---PLQPPPPAPVLLYDQGGGRRRRGEAEAEAEEWEAESVLGTLLQKL
         60           70        80        90       100       110   

             120       130             140                   150   
pF1KA1 EKSFNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCE----GK--STLVPT------------CISQPCLP
       ..    .. : :::..:.   : :::    :.  :...:.            :... :  
CCDS14 REEGYLAYYLQGGFSRFQAECPHLCETSLAGRAGSSMAPVPGPVPVVGLGSLCLGSDCSD
           120       130       140       150       160       170   

                                    160       170       180        
pF1KA1 VAN--------------------IG-----PTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYV
       . .                    .:     :..::::::::  ::  : : . . :: :.
CCDS14 AESEADRDSMSCGLDSEGATPPPVGLRASFPVQILPNLYLGSARDSANLESLAKLGIRYI
           180       190       200       210       220       230   

      190       200          210       220       230       240     
pF1KA1 LNASNTCPKPDFIPES---HFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCL
       ::.. .   :.:. ..   :. ..:..: . ...  .. ....::..: ..:  ::::::
CCDS14 LNVTPNL--PNFFEKNGDFHYKQIPISDHWSQNLSRFFPEAIEFIDEALSQNCGVLVHCL
           240         250       260       270       280       290 

         250       260       270       280       290       300     
pF1KA1 AGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGAS
       ::.:::.:...::.:... .::..:: .::.:. .:::::::.:::::.:....      
CCDS14 AGVSRSVTVTVAYLMQKLHLSLNDAYDLVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERSLRLEERHS
             300       310       320       330       340       350 

         310       320       330       340       350       360     
pF1KA1 GPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASVPSVPS
                                                                   
CCDS14 QEQGSGGQASAASNPPSFFTTPTSDGAFELAPT                           
             360       370       380                               

>>CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5                (367 aa)
 initn: 557 init1: 324 opt: 433  Z-score: 373.6  bits: 78.6 E(32554): 1.7e-14
Smith-Waterman score: 558; 31.4% identity (58.4% similar) in 370 aa overlap (15-362:13-366)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCSKLMKRRLQQ
                     : :::   . . ::.: : :  .:..::  ..:.  : ...::  .
CCDS43   MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRRR-AK
                 10        20        30        40        50        

               70         80        90       100       110         
pF1KA1 DKVLITELIQHSA-KHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTVLLGKL--EKSFNS
         . . ... ..  . ..     . ::. :. :  . . . :  :..  : :  :    .
CCDS43 GAMGLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCREARAAQ
        60        70        80        90       100       110       

       120       130       140           150                  160  
pF1KA1 VHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGKST----LVPTCISQP------C----LPVANIG-PTRI
       : .: ::.  ::   : ::  .::     .:   : :      :     :. . : :..:
CCDS43 VFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSCSTPLYDQGGPVEI
       120       130       140       150       160       170       

            170       180       190       200       210       220  
pF1KA1 LPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPW
       :: ::::    .  :....  ::  ..:.: .::.  :  . ..  .::.:.    :  :
CCDS43 LPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPN-HFEGHYQYKSIPVEDNHKADISSW
       180       190       200       210        220       230      

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA1 LDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTIS
       .....:::.. : ..: :.::: ::::::::: .::.:.   ..::::..:::..:  ::
CCDS43 FNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIIS
        240       250       260       270       280       290      

            290       300       310       320       330            
pF1KA1 PNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSET----PLS
       :::.:.::::..:...       .:. .       . . :. :: . : .. :    :.:
CCDS43 PNFSFMGQLLQFESQVL------APHCS------AEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVS
        300       310                   320       330       340    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KA1 PPCADSATSEAAGQRPVHPASVPSVPSVQPSLLEDSPLVQALSGLHLSADRLEDSNKLKR
        :  .. .. .  : :.  .. ::                                    
CCDS43 IPVHSTNSALSYLQSPI--TTSPSC                                   
          350       360                                            

>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1              (482 aa)
 initn: 573 init1: 321 opt: 422  Z-score: 362.6  bits: 77.0 E(32554): 7.1e-14
Smith-Waterman score: 602; 36.1% identity (67.3% similar) in 294 aa overlap (27-300:173-464)

                   10        20        30        40        50      
pF1KA1     MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCS-KLMK
                                     ..:: :::.::: :::  :..:::. :. .
CCDS15 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
            150       160       170       180       190       200  

          60        70         80        90       100       110    
pF1KA1 RRLQQDKVLITELIQ-HSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTVLLGKLEKS
       ::::: :. . .::. . .: .     :....:::..... . .  .  : ..: .:.. 
CCDS15 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKRE
            210       220       230       240       250       260  

          120       130                       140       150        
pF1KA1 FNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGK----------------STLVPTCISQPCLP-VANI
        .   .: ::.. :..   .::...                :.:.:  :  :  : . : 
CCDS15 GKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPI--PTTPDIENA
            270       280       290       300       310         320

       160       170       180       190       200        210      
pF1KA1 GPTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPES-HFLRVPVNDSFC
         : ::: :.:: ..:. . . ::. .::::.:...  :   .     .. :.:..::  
CCDS15 ELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNK
              330       340       350       360       370       380

        220       230       240       250       260       270      
pF1KA1 EKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKE
       ...  ..... .:::.:.  .  .:.:: ::.::::::.:::.::.  :.. .::.::: 
CCDS15 QNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKG
              390       400       410       420       430       440

        280       290       300       310       320       330      
pF1KA1 KRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETP
       ::: ::::.::.::::..:. ..:                                    
CCDS15 KRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV                  
              450       460       470       480                    

>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8                (303 aa)
 initn: 417 init1: 300 opt: 404  Z-score: 350.7  bits: 74.1 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 442; 33.6% identity (59.1% similar) in 274 aa overlap (123-381:54-302)

            100       110       120       130       140            
pF1KA1 QDVASLSSDCFLTVLLGKLEKSFNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGKSTL------VPTC
                                     ::. .::  .: .:   ..:      ::  
CCDS60 RDCKPVRAPSMALGVSQLAGRSRCLCSESQGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPS
            30        40        50        60        70        80   

        150                160       170       180       190       
pF1KA1 ISQP----C----LPVANIG-PTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPK
        ..:    :     :. . : :..::: ::::    .  .....  ::  .::.:. ::.
CCDS60 ATEPLDLGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPN
            90       100       110       120       130       140   

       200       210       220       230       240       250       
pF1KA1 PDFIPESHFLRVPVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIA
         :  . ..  .::.:.    :  :. .....:. .:   : ::::: ::::::::: .:
CCDS60 -HFEGHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLA
            150       160       170       180       190       200  

       260       270       280       290       300       310       
pF1KA1 YIMKRMDMSLDEAYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKSKLKLLHLE
       :.: .  . :.::..:::..:  :::::.:.::::..:...   . :.   :        
CCDS60 YLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAAS--------
            210       220       230       240       250            

       320       330       340       350       360       370       
pF1KA1 KPNEPVPAVSEGGQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASVPSVPSVQPSLLEDSPLV
        :. :.       ....:: .:      ::. . . ::  ..: :.::  : :   ::..
CCDS60 -PSGPLR------ERGKTPATP------TSQFVFSFPVS-VGVHSAPSSLPYL--HSPIT
           260                   270       280        290          

       380       390       400       410       420       430       
pF1KA1 QALSGLHLSADRLEDSNKLKRSFSLDIKSVSYSASMAASLHGFSSSEDALEYYKPSTTLD
        . :                                                        
CCDS60 TSPSC                                                       
      300                                                          

>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8                (394 aa)
 initn: 539 init1: 300 opt: 402  Z-score: 347.3  bits: 73.8 E(32554): 5e-13
Smith-Waterman score: 582; 31.4% identity (60.5% similar) in 382 aa overlap (19-381:39-393)

                           10        20        30        40        
pF1KA1             MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAINI
                                     : ::  : ::.: :::. .....:: ..:.
CCDS60 EMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGG-KCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNV
       10        20        30        40         50        60       

       50        60          70        80        90       100      
pF1KA1 NCSKLMKRRLQQDKVLITELI--QHSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTV
        :. ...::  . .: . ...  .. .. ..     . :.:::. :  . ::  :  ...
CCDS60 RCNTIVRRR-AKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLREDSTVSL
        70         80        90       100       110       120      

        110         120       130       140             150        
pF1KA1 LLGKLEKSFN--SVHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGKSTL------VPTCISQP----C---
       ..  :... .  .. :: ::. .::  .: .:   ..:      ::   ..:    :   
CCDS60 VVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSSC
        130       140       150       160       170       180      

               160       170       180       190       200         
pF1KA1 -LPVANIG-PTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPESHFLRV
         :. . : :..::: ::::    .  .....  ::  .::.:. ::.  :  . ..  .
CCDS60 GTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPN-HFEGHYQYKCI
        190       200       210       220       230        240     

     210       220       230       240       250       260         
pF1KA1 PVNDSFCEKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDE
       ::.:.    :  :. .....:. .:   : ::::: ::::::::: .::.: .  . :.:
CCDS60 PVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLEE
         250       260       270       280       290       300     

     270       280       290       300       310       320         
pF1KA1 AYRFVKEKRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEG
       :..:::..:  :::::.:.::::..:...   . :.   :         :. :.      
CCDS60 AFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAAS---------PSGPLR-----
         310       320       330       340                350      

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA1 GQKSETPLSPPCADSATSEAAGQRPVHPASVPSVPSVQPSLLEDSPLVQALSGLHLSADR
        ....:: .:      ::. . . ::  ..: :.::  : :   ::.. . :        
CCDS60 -ERGKTPATP------TSQFVFSFPVS-VGVHSAPSSLPYL--HSPITTSPSC       
              360             370        380         390           

     390       400       410       420       430       440         
pF1KA1 LEDSNKLKRSFSLDIKSVSYSASMAASLHGFSSSEDALEYYKPSTTLDGTNKLCQFSPVQ




665 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 01:45:04 2016 done: Fri Nov  4 01:45:05 2016
 Total Scan time:  4.010 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com