FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1726, 884 aa
1>>>pF1KA1726 884 - 884 aa - 884 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4276+/-0.000391; mu= 6.6608+/- 0.024
mean_var=174.7397+/-35.085, 0's: 0 Z-trim(117.7): 21 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.097024
statistics sampled from 29967 (29987) to 29967 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 10.200
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005271772 (OMIM: 615001) PREDICTED: probable ri ( 884) 6027 856.6 0
NP_203748 (OMIM: 615001) probable ribonuclease ZC3 ( 883) 5984 850.6 0
XP_016873966 (OMIM: 615001) PREDICTED: probable ri ( 884) 5977 849.6 0
XP_011541357 (OMIM: 615001) PREDICTED: probable ri ( 852) 5820 827.6 0
XP_016884967 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_016884971 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_016884968 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_016884973 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_016884972 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_011529241 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
NP_001010888 (OMIM: 300889) probable ribonuclease ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_016884969 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
XP_016884970 (OMIM: 300889) PREDICTED: probable ri ( 836) 2373 345.1 8e-94
NP_079355 (OMIM: 610562) endoribonuclease ZC3H12A ( 599) 1395 208.1 9.9e-53
NP_001310479 (OMIM: 610562) endoribonuclease ZC3H1 ( 599) 1395 208.1 9.9e-53
NP_997243 (OMIM: 611106) probable ribonuclease ZC3 ( 527) 1240 186.4 3e-46
XP_011540500 (OMIM: 610562) PREDICTED: bifunctiona ( 394) 952 146.0 3.3e-34
NP_001310480 (OMIM: 610562) endoribonuclease ZC3H1 ( 325) 436 73.7 1.5e-12
>>XP_005271772 (OMIM: 615001) PREDICTED: probable ribonu (884 aa)
initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027 Z-score: 4569.2 bits: 856.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6027; 100.0% identity (100.0% similar) in 884 aa overlap (1-884:1-884)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAAEKRMQEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAAEKRMQEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WSTVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSTVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DALITDQEILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DALITDQEILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ANEKPEWKKFIDERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ANEKPEWKKFIDERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRSVADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRSVADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQDLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQDLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 NGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPSMMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPSMMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SLSGPRSPERRFSLDTDYRISSVASDCSSEGSMSCGSSDSYVGYNDRSYVSSPDPQLEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLSGPRSPERRFSLDTDYRISSVASDCSSEGSMSCGSSDSYVGYNDRSYVSSPDPQLEEN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LKCQHMHPHSRLNPQPFLQNFHDPLTRGQSYSHEEPKFHHKPPLPHLALHLPHSAVGARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKCQHMHPHSRLNPQPFLQNFHDPLTRGQSYSHEEPKFHHKPPLPHLALHLPHSAVGARS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SCPGDYPSPPSSAHSKAPHLGRSLVATRIDSISDSRLYDSSPSRQRKPYSRQEGLGSWER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SCPGDYPSPPSSAHSKAPHLGRSLVATRIDSISDSRLYDSSPSRQRKPYSRQEGLGSWER
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PGYGIDAYGYRQTYSLPDNSTQPCYEQFTFQSLPEQQEPAWRIPYCGMPQDPPRYQDNRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PGYGIDAYGYRQTYSLPDNSTQPCYEQFTFQSLPEQQEPAWRIPYCGMPQDPPRYQDNRE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KA1 KIYINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KIYINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
850 860 870 880
>>NP_203748 (OMIM: 615001) probable ribonuclease ZC3H12C (883 aa)
initn: 5984 init1: 5984 opt: 5984 Z-score: 4536.7 bits: 850.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5984; 100.0% identity (100.0% similar) in 877 aa overlap (8-884:7-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAAEKRMQEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 MPGGGSQEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WSTVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 WSTVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 LCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 QLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 DDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DALITDQEILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 DALITDQEILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ANEKPEWKKFIDERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 ANEKPEWKKFIDERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRSVADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 KKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRSVADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADST
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQDLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 SDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQDLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 NGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPSMMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 NGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPSMMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SLSGPRSPERRFSLDTDYRISSVASDCSSEGSMSCGSSDSYVGYNDRSYVSSPDPQLEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 SLSGPRSPERRFSLDTDYRISSVASDCSSEGSMSCGSSDSYVGYNDRSYVSSPDPQLEEN
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LKCQHMHPHSRLNPQPFLQNFHDPLTRGQSYSHEEPKFHHKPPLPHLALHLPHSAVGARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 LKCQHMHPHSRLNPQPFLQNFHDPLTRGQSYSHEEPKFHHKPPLPHLALHLPHSAVGARS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SCPGDYPSPPSSAHSKAPHLGRSLVATRIDSISDSRLYDSSPSRQRKPYSRQEGLGSWER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 SCPGDYPSPPSSAHSKAPHLGRSLVATRIDSISDSRLYDSSPSRQRKPYSRQEGLGSWER
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PGYGIDAYGYRQTYSLPDNSTQPCYEQFTFQSLPEQQEPAWRIPYCGMPQDPPRYQDNRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 PGYGIDAYGYRQTYSLPDNSTQPCYEQFTFQSLPEQQEPAWRIPYCGMPQDPPRYQDNRE
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880
pF1KA1 KIYINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 KIYINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
840 850 860 870 880
>>XP_016873966 (OMIM: 615001) PREDICTED: probable ribonu (884 aa)
initn: 5977 init1: 5977 opt: 5977 Z-score: 4531.4 bits: 849.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5977; 100.0% identity (100.0% similar) in 876 aa overlap (9-884:9-884)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAAEKRMQEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSLYFPANEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WSTVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSTVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DALITDQEILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DALITDQEILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ANEKPEWKKFIDERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ANEKPEWKKFIDERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRSVADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRSVADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQDLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQDLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 NGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPSMMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPSMMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SLSGPRSPERRFSLDTDYRISSVASDCSSEGSMSCGSSDSYVGYNDRSYVSSPDPQLEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLSGPRSPERRFSLDTDYRISSVASDCSSEGSMSCGSSDSYVGYNDRSYVSSPDPQLEEN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LKCQHMHPHSRLNPQPFLQNFHDPLTRGQSYSHEEPKFHHKPPLPHLALHLPHSAVGARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKCQHMHPHSRLNPQPFLQNFHDPLTRGQSYSHEEPKFHHKPPLPHLALHLPHSAVGARS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SCPGDYPSPPSSAHSKAPHLGRSLVATRIDSISDSRLYDSSPSRQRKPYSRQEGLGSWER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SCPGDYPSPPSSAHSKAPHLGRSLVATRIDSISDSRLYDSSPSRQRKPYSRQEGLGSWER
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 PGYGIDAYGYRQTYSLPDNSTQPCYEQFTFQSLPEQQEPAWRIPYCGMPQDPPRYQDNRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGYGIDAYGYRQTYSLPDNSTQPCYEQFTFQSLPEQQEPAWRIPYCGMPQDPPRYQDNRE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KA1 KIYINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIYINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
850 860 870 880
>>XP_011541357 (OMIM: 615001) PREDICTED: probable ribonu (852 aa)
initn: 5820 init1: 5820 opt: 5820 Z-score: 4412.9 bits: 827.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5820; 100.0% identity (100.0% similar) in 852 aa overlap (33-884:1-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 AEKRMQEYGVLCIQEYRKNSKVESSTRNNFMGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVPWS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLKDHLGHDLGHLYVESTDPQLSPAVPWS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVENPSMDTVNVGKDEKEASEENASSGDSEENTNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQLC
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAKKPPDVVREYQTKLEFALKLGYSEEQVQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSEADQTVSTINTITRETSSLESQRSESPMQEIVTDD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 YINLCNIFPPDLVRIVMKRNPHMTDAQQLAAAILVEKSQLGY
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.. ..:: ::: ...:. ::: :::. :. : :: .:::::: : ..:.::::
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..::::::::::: .. ...:: .:: :.: .. :.:.. ::.::: ::::::::::
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XP_016 ANQPQRSVADELRISAKLSTVKTMSEGTLAKCGTGMSSAKGEITSEVKRVAPKRQSDPSI
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XP_016 HRSASQNRL--QPFPHGYHEALTRVQSYGPEDSKQGPHKQSVPHLALHAQHPSTGTRSSC
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XP_016 PADYPMPPNIHPGATPQPGRALVMTRMDSISDSRLYESNPVRQRRPPLCREQHASWDPLP
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XP_011 QTYKNLCNIFPSNIVLAVMEKNPHTADAQQLAALIVAKLRAAR
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884 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:54:49 2016 done: Wed Nov 2 21:54:50 2016
Total Scan time: 10.200 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]