FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1757, 1331 aa 1>>>pF1KA1757 1331 - 1331 aa - 1331 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6442+/-0.000956; mu= -0.2356+/- 0.058 mean_var=270.4455+/-54.851, 0's: 0 Z-trim(114.2): 31 B-trim: 76 in 1/51 Lambda= 0.077989 statistics sampled from 14717 (14745) to 14717 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.453), width: 16 Scan time: 5.420 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46741.1 SETD5 gene_id:55209|Hs108|chr3 (1442) 8855 1010.5 0 CCDS74892.1 SETD5 gene_id:55209|Hs108|chr3 (1344) 8394 958.6 0 CCDS34723.1 KMT2E gene_id:55904|Hs108|chr7 (1858) 998 126.5 6.6e-28 >>CCDS46741.1 SETD5 gene_id:55209|Hs108|chr3 (1442 aa) initn: 8855 init1: 8855 opt: 8855 Z-score: 5393.8 bits: 1010.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8855; 100.0% identity (100.0% similar) in 1331 aa overlap 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CCDS34 ---NINS-GYETRRKKGKKDKDISKEKDTQNQNITLDCEGTTNKMKSPETKQRKLSPLRL 480 490 500 510 520 530 370 380 390 400 410 pF1KA1 TVSSDHEE--VDNPEEKPEEEKEEVIDDQENLAHSRR--TREDRKVEAIMHAFENLEKRK .::...: .:. ::: .: ....:..:. .: :::.::.:::..:: ::::. CCDS34 SVSNNQEPDFIDDIEEKTPISNEVEMESEEQIAERKRKMTREERKMEAILQAFARLEKRE 540 550 560 570 580 590 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 KRRDQPLEQSNSDVEITTTTSETPVGEETKTEAPESEVSNSVSNVTIPSTPQSVGVNTRR :::.: ::. :.:. .:. ::: .... ::.. . . CCDS34 KRREQALER------ISTAKTEV------KTECKDTQI---VSDAEVIQ----------- 600 610 620 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 SSQAGDIAAEKLVPKPPPAKPSRPRPKSRISRYRTSSAQRLKRQKQANAQQAELSQAALE . : :. . :: ::: .: . .. .:: :: .:. .:.. .:. . CCDS34 -----EQAKEENASKPTPAKVNRTKQRKSFSRSRTHIGQQRRRHRT-------VSMCSDI 630 640 650 660 670 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 EGGSNSLVTPTEAGSLDSSGENRPLTGSDPTVVS----ITGSHV---NRAASKYPKTKKY . .: .. :. : ... :: :: : .. :: ..: :. .:::::::. 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