FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1773, 3298 aa 1>>>pF1KA1773 3298 - 3298 aa - 3298 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3933+/-0.000433; mu= 14.0850+/- 0.027 mean_var=202.3598+/-41.259, 0's: 0 Z-trim(117.4): 406 B-trim: 555 in 1/58 Lambda= 0.090160 statistics sampled from 28907 (29330) to 28907 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 27.880 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003728 (OMIM: 601390,603057,607829) protocadher (3298) 21809 2851.8 0 XP_011530347 (OMIM: 612486) PREDICTED: protocadher (3371) 3918 524.7 1.1e-146 XP_011530348 (OMIM: 612486) PREDICTED: protocadher (2594) 3257 438.6 6.6e-121 NP_060109 (OMIM: 612486) protocadherin-23 isoform (2916) 2612 354.8 1.3e-95 XP_011538344 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3389) 2314 316.1 6.8e-84 XP_011538349 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