Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1775
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1775, 859 aa
1>>>pF1KA1775 859 - 859 aa - 859 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2852+/-0.0011; mu= 3.2893+/- 0.067
mean_var=205.1716+/-41.152, 0's: 0 Z-trim(110.4): 189 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.089540
statistics sampled from 11364 (11555) to 11364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7372.1 CDHR1 gene_id:92211|Hs108|chr10 ( 859) 5629 740.4 3.1e-213
CCDS53548.1 CDHR1 gene_id:92211|Hs108|chr10 ( 745) 4450 588.1 1.9e-167
CCDS81473.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1061) 732 107.9 9.8e-23
CCDS81472.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1381) 732 108.0 1.2e-22
CCDS44429.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 ( 530) 720 106.2 1.6e-22
CCDS7771.1 DCHS1 gene_id:8642|Hs108|chr11 (3298) 705 104.7 2.8e-21
CCDS33971.1 PCDH7 gene_id:5099|Hs108|chr4 (1069) 529 81.7 7.7e-15
CCDS75116.1 PCDH7 gene_id:5099|Hs108|chr4 (1072) 529 81.7 7.7e-15
CCDS3785.1 DCHS2 gene_id:54798|Hs108|chr4 (2916) 517 80.4 5.2e-14
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 501 78.3 2.2e-13
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 480 75.2 4.3e-13
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 480 75.3 4.9e-13
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 481 75.7 1.3e-12
CCDS34297.1 CDHR2 gene_id:54825|Hs108|chr5 (1310) 466 73.6 2.6e-12
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 458 72.4 3.5e-12
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4 (4981) 471 74.6 5e-12
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 446 70.9 1e-11
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 459 72.9 1e-11
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 445 70.8 1.1e-11
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 444 70.6 1.2e-11
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 445 70.8 1.3e-11
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 440 70.1 1.8e-11
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 437 69.7 2e-11
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 440 70.2 2e-11
CCDS54918.1 PCDHA7 gene_id:56141|Hs108|chr5 ( 937) 432 69.1 4.1e-11
>>CCDS7372.1 CDHR1 gene_id:92211|Hs108|chr10 (859 aa)
initn: 5629 init1: 5629 opt: 5629 Z-score: 3941.8 bits: 740.4 E(32554): 3.1e-213
Smith-Waterman score: 5629; 100.0% identity (100.0% similar) in 859 aa overlap (1-859:1-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RGSPSFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RGSPSFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLIS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 NSPESSLLPRAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NSPESSLLPRAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTL
790 800 810 820 830 840
850
pF1KA1 ISELKQKFEKKSVHNKAYF
:::::::::::::::::::
CCDS73 ISELKQKFEKKSVHNKAYF
850
>>CCDS53548.1 CDHR1 gene_id:92211|Hs108|chr10 (745 aa)
initn: 4450 init1: 4450 opt: 4450 Z-score: 3119.6 bits: 588.1 E(32554): 1.9e-167
Smith-Waterman score: 4450; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RGSPSFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLIS
::::::::::::::::::::
CCDS53 RGSPSFSTTALLKIDITDAEVRRLRYMKNSNFPGTTKSVRKPKFKPKKPHSSQGLFLHPH
670 680 690 700 710 720
>>CCDS81473.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1061 aa)
initn: 732 init1: 261 opt: 732 Z-score: 521.7 bits: 107.9 E(32554): 9.8e-23
Smith-Waterman score: 1062; 33.1% identity (61.1% similar) in 720 aa overlap (4-705:9-691)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVY
:. : : : :. : .:.: : :: : .: . . ::::::: :
CCDS81 MGRHVATSCHVAWL-LVLISGCWGQVNRLP-FFTNHFFDT-----YLLISEDTPVGSSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 TLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLN
: . : ..::. . .: . ..: :.:.: : . : . :::: ..:. . .:.:: .
CCDS81 QLLAQDMDNDPLVFGVSGEEASR-FFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQ
....:: : : :.::.:: : ..:: . .::. :.:. :: :.:.: : :.:::: : .:
CCDS81 VITRKVNIQVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVN
. ::.: :.. . :::: .... .:: : : . .:. .....
CCDS81 PPSQFFAIDSARGIVTVIR--ELDYETTQAYQLTVNATD-----QDKTRPLSTLANLAII
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGN-DGAFE
. ::::: :.:.. :: .:: . ::. : ..:.: :.:.: : :..:.:: .. :
CCDS81 ITDVQDMDPIFINLPYSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 INETSGAISIT---QSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPA-AQATVPVTIRIVDLNNHP
.. ::..... . : . . : :. ::.. .:. : .:. .: ..:.:..
CCDS81 LDYISGVLTLNGLLDRENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA1 PTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQ--GANAKFNLQLVGPRGI-FR
: : .... ....: : : : : : :.:. : :. :.. ::: . :
CCDS81 PEFN-----SSEYSVAITELAQVGFAL-PLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFI
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 VVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTND
. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
CCDS81 ISPTSVQGKADIRIRV--AIPLDYETVDRYDFDLFANE-SVPDHVGY-AKVKITLINEND
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 NVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGL
: : :.. : . ::. :.::..: :.: :.: .:::.: .. : : . .:::
CCDS81 NRPIFSQPLYNISLYENVTVGTSVLTVLATDNDAGTFGEVSY-FFSDDPDRFSLDKDTGL
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 IYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVL
:. : :: : :... . :.: :. ....: :..:::::. : : :.. ..
CCDS81 IMLI--ARLDYELIQRFTLTIIARDGGGEETTGRVRINVLDVNDNVPTFQKDAYVGALRE
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 GTP-----VKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEP-ANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDAL
. : :...: :::. ::: . :::. : .. :::. . : .. : : ::
CCDS81 NEPSVTQLVRLRATDEDSP-PNNQITYSIVSASAFGSYFDISLYEGYGVISVS-RPLD-Y
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KA1 HNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAE----TLSRSPMAAFLIQTKDN
..:. : : : :.: : :.: ...:. . :.. : . :.:. : :..... .:
CCDS81 EQISNG---LIYLTVMAMDAGNPPLNSTVPVTIEVFDENDNPPTFSK-P--AYFVSVVEN
630 640 650 660 670 680
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 PMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLK
: .. ::
CCDS81 IMAGATVLFLNATDLDRSREYGQESIIYSLEGSTQFRINARSGEITTTSLLDRETKSEYI
690 700 710 720 730 740
>>CCDS81472.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 (1381 aa)
initn: 732 init1: 261 opt: 732 Z-score: 519.9 bits: 108.0 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 1062; 33.1% identity (61.1% similar) in 720 aa overlap (4-705:9-691)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVY
:. : : : :. : .:.: : :: : .: . . ::::::: :
CCDS81 MGRHVATSCHVAWL-LVLISGCWGQVNRLP-FFTNHFFDT-----YLLISEDTPVGSSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 TLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLN
: . : ..::. . .: . ..: :.:.: : . : . :::: ..:. . .:.:: .
CCDS81 QLLAQDMDNDPLVFGVSGEEASR-FFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQ
....:: : : :.::.:: : ..:: . .::. :.:. :: :.:.: : :.:::: : .:
CCDS81 VITRKVNIQVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVN
. ::.: :.. . :::: .... .:: : : . .:. .....
CCDS81 PPSQFFAIDSARGIVTVIR--ELDYETTQAYQLTVNATD-----QDKTRPLSTLANLAII
180 190 200 210 220
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pF1KA1 VEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGN-DGAFE
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CCDS81 ITDVQDMDPIFINLPYSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 INETSGAISIT---QSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPA-AQATVPVTIRIVDLNNHP
.. ::..... . : . . : :. ::.. .:. : .:. .: ..:.:..
CCDS81 LDYISGVLTLNGLLDRENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA1 PTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQ--GANAKFNLQLVGPRGI-FR
: : .... ....: : : : : : :.:. : :. :.. ::: . :
CCDS81 PEFN-----SSEYSVAITELAQVGFAL-PLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFI
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pF1KA1 VVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTND
. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
CCDS81 ISPTSVQGKADIRIRV--AIPLDYETVDRYDFDLFANE-SVPDHVGY-AKVKITLINEND
400 410 420 430 440 450
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pF1KA1 NVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGL
: : :.. : . ::. :.::..: :.: :.: .:::.: .. : : . .:::
CCDS81 NRPIFSQPLYNISLYENVTVGTSVLTVLATDNDAGTFGEVSY-FFSDDPDRFSLDKDTGL
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pF1KA1 IYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVL
:. : :: : :... . :.: :. ....: :..:::::. : : :.. ..
CCDS81 IMLI--ARLDYELIQRFTLTIIARDGGGEETTGRVRINVLDVNDNVPTFQKDAYVGALRE
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pF1KA1 GTP-----VKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEP-ANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDAL
. : :...: :::. ::: . :::. : .. :::. . : .. : : ::
CCDS81 NEPSVTQLVRLRATDEDSP-PNNQITYSIVSASAFGSYFDISLYEGYGVISVS-RPLD-Y
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pF1KA1 HNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAE----TLSRSPMAAFLIQTKDN
..:. : : : :.: : :.: ...:. . :.. : . :.:. : :..... .:
CCDS81 EQISNG---LIYLTVMAMDAGNPPLNSTVPVTIEVFDENDNPPTFSK-P--AYFVSVVEN
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pF1KA1 PMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLK
: .. ::
CCDS81 IMAGATVLFLNATDLDRSREYGQESIIYSLEGSTQFRINARSGEITTTSLLDRETKSEYI
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>--
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:.. ::. : .. :.:: . :::: .
CCDS81 ENIMAGATVLFLNATDLDRSREYGQESIIYSLEGSTQ--FRINARSGEITTTSLLDRETK
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.: :. :: .: : : . : ::. : . . :: . : : : .
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: ::: : : .:...: .: .. .... .: .: . : :: : : ::
CCDS81 VVAVDPDLGENGTLVYSIQPPNKFYSLNSTTGKIRT-THAMLDRENPDPHEAELMRKIVV
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. :: . ....:: ::. :..: :.: . :. . : : : . .:::.
CCDS81 SVTDCGR---PPLKATSSATVFVNLLDLNDNDPTFQNLPFVAEVLEGIPAGVSIYQVVAI
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: :.: . . : . : : :: .::.. : ..:.:: . : ...:. : ::
CCDS81 DLDEGLNGLVSYRMPVGMPRMDFLINSSSGVVVTT---TELDRERIAEYQLRVVA-SDAG
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.:. ..: .::...:.:.. :::. : ...:..: :. .: . .. .:.:
CCDS81 TPTKSSTSTLTIHVLDVNDETPTFF----PAV-YNVSVSEDVPRE--FRVVWLNCTDNDV
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: ::... ..: : : : . .:.. ...: : . . . : :.. :
CCDS81 GLNAELSYFITGGNVDGKFSV--------GYRDAVVRTVVGLDRETTAAYMLILEAID-N
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CCDS81 GPVGKRHTGTATVFVTVLDVNDNRPIFLQSSYEASVPEDIPEGHSILQLKATDADEGEFG
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pF1KA1 EVKYST-YGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKA--EDMEGKYSVAEV
.: : .:. .. : :: :.::.. : :: : .. . . :.: .:. : ..:
CCDS81 RVWYRILHGNHGNNFRIHVSNGLLMRGP-RPLDRERNSSHVLIVEAYNHDLGPMRSSVRV
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pF1KA1 FITLLDVNDHPP-----QFGKSVQKKTMVLGTPVKI-EAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEP
.. . :.::. : :... ..: .:: : . .: :.:. . ..::.: : .
CCDS81 IVYVEDINDEAPVFTQQQYSRLGLRETAGIGTSVIVVQATDRDSGD-GGLVNYRILSGAE
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pF1KA1 ANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSP---SFSTTAL-L
.. :.:. :: : .. :: . . . ..:.: :.. : .: .. . :
CCDS81 GK-FEIDESTGLII---TVNYLDYETKTS------YMMNVSATDQAPPFNQGFCSVYITL
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pF1KA1 KIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNK
.. .: .: . . : .... . : : : .. .. :: ... : . : :
CCDS81 LNELDEAVQFSNASYEAAILENLALGTEIVRVQAYSIDNLNQITYRFNAYTSTQAKALFK
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pF1KA1 VLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLPRAP
.
CCDS81 IDAITVRGWGQGAPFLPI
1370 1380
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CCDS44 QLLAQDMDNDPLVFGVSGEEASR-FFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQG
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....:: : : :.::.:: : ..:: . .::. :.:. :: :.:.: : :.:::: : .:
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. ::.: :.. . :::: .... .:: : : . .:. .....
CCDS44 PPSQFFAIDSARGIVTVI--RELDYETTQAYQLTVNATD-----QDKTRPLSTLANLAII
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. ::::: :.:.. :: .:: . ::. : ..:.: :.:.: : :..:.:: .. :
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.. ::..... . : . . : :. ::.. .:. : .:. .: ..:.:..
CCDS44 LDYISGVLTLNGLLDRENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNA
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: : . ... ....: : : : : : :.:. : :. :.. ::: . :
CCDS44 PEFNS-----SEYSVAITELAQVGFAL-PLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFI
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. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
CCDS44 ISPTSVQGKADIRIRV--AIPLDYETVDRYDFDLFANE-SVPDHVGY-AKVKITLINEND
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pF1KA1 NVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDP--DTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPST
: : :.. : . ::. :.::..: :.: .::
CCDS44 NRPIFSQPLYNISLYENVTVGTSVLTVL-VSPRFTAGPLSSPGPTVVRHPEGFCPRDLSN
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pF1KA1 GLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTM
CCDS44 QGRRHPQIPELCLLVY
520 530
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CCDS77 LVGSATLTVMVIDTNDNRPTIPQPWELRVSEDALLGSEIAQVTGNDVDSGPVLWYV-LSP
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: .. ::: : ..:. :: :. :. . . :: . ....:: :.::.::
CCDS77 SGPQDPFSVGRYGGRVSLTGPLDFEQCDRYQLQLLAHDGPHEGRANLTVLVEDVNDNAPA
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: : : ... : : :: :..: :.:::.:..: ..: : . . :.:: ..:.: .
CCDS77 FSQSLYQVMLLEHTPPGSAILSVSATDRDSGANGHISYHLASPADGFSVDPNNGTLFTIV
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:.. : .. : . ... :.: ::: .: .:: :...: .: :: :. . :
CCDS77 GTVALGHDGSGAVDVVLEARD-----HGAPGR-AARATVHVQLQDQNDHAPSFTLSHYRV
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: :: ::: .: . : :.: .. . . ::...:: : .: : .:..:
CCDS77 AVTEDLPPGSTLLTLEATDADGSRSHAAVDYSIISGNWGRVFQLEPRLAEAGESAGPGPR
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:.. :. : . .. . :.: ...::::. ..:.:..::.: :
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..... : : : : :.. ..:.: : .. .:... : :.:. :.:..
CCDS77 --YRVTVPEDTPVGAEL--LHVEASDADPGPHGLVRFTVSSGDPSGLFE------LDESS
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pF1KA1 VTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPE-KFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYY
:. . . :.: : . . . :.:.. : . : :.:.. :.::. : :
CCDS77 GTLRLAH--ALDCETQ---ARHQLVVQAADPAGAHFALAPVTIEVQDVNDHGPAFPLNLL
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pF1KA1 VARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTY--GTGAD---LFLIHPSTGLIYTQP
. . :: : :. :... :.: :.: .:...:: : : . : .. ::: . ..
CCDS77 STSVAENQPPGTLVTTLHAIDGDAGAFGRLRYSLLEAGPGPEGREAFALNSSTGELRAR-
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. .: : : . . : : : :. :.. :..: : : : : .: . .
CCDS77 -VPFDYEHTESFRLLVGAADA-GNLSASVTVSVLVTGEDEYDPVFLAPAFHFQVPEGARR
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. ...: :::. ..:: ::.. . : : ::. :: ..:. . :. . .
CCDS77 GHSLGHVQATDEDGGA-DGLVLYSLATSSP--YFGINQTTGALYLRVDSRAPGSGTATSG
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: :. :.... :: : : :.:. . .::: . .:. .: .:.
CCDS77 GGGRTRREAPRELRLEVIARGPLPGSRSATVPVTVDITHT-ALGLAPDLNLLL-------
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pF1KA1 KAVGVLAGTMATVV--AITVLISTATFWRNKKS-------NKVLPM-----RRVLRKRPS
::..:.....:: :...:. . :..:. ... :. ... :. ::
CCDS77 --VGAVAASLGVVVVLALAALVLGLVRARSRKAEAAPGPMSQAAPLASDSLQKLGREPPS
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pF1KA1 PAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLPRAPALPPPPSVAPSTG
: :
CCDS77 PPPSEHLYHQTLPSYGGPGAGGPYPRGGSLDPSHSSGRGSAEAAEDDEIRMINEFPRVAS
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pF1KA1 NGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTR--SVFSVDPTFGNITLV
:. : :: . .. . ...: : . .
CCDS77 GSLDLQIDEEQPAGTLIGDISAGLPAGTAAPLMYFISAQEGSGVGTDLAIDEHSGVVRTA
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. ::::..:. . :: .. .:.. :.: ::.:: : : . ::: :.
CCDS77 RVLDREQRDRYRFTAVTPDGATV---EVTVRVADINDHAPAFPQARAALQVPEHTAFGTR
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pF1KA1 IFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHS--PFAVDRHSG-----VLRLQAGATLDYERSRTH
: : :.: :. : :.. . : .. . : : .: . . :: : .:.:
CCDS77 YPLEPARDADAGRLGTQGYALSGDGAGETFRLETRPGPDGTPVPELVVTGELDRE-NRSH
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:. . : :::. . :......: :..: ::.: . :.. : :. ::: :
CCDS77 YMLQLEAYDGGSPPRRAQALLDVTLL------DINDHAPAFNQSRYHAVVSESLAPGSPV
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pF1KA1 LKVVAMDGDRGKPNRILYSLV---NGNDGAFEINETSGAISITQSPAQL-QREVYELHVQ
:.: : :.: : . . : . . .:: : :. .: ... . : .. ::.:.:: ::
CCDS77 LQVFASDADAGVNGAVTYEINRRQSEGDGPFSIDAHTGLLQL-ERPLDFEQRRVHELVVQ
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 VTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPT----FYGESG-PQNRFELSMNEHPPQGEI
. . .:. ... ::... : :.. :. : . .: :: ..: : :..
CCDS77 ARD---GGAHPELGSAFVTVHVRDANDNQPSMTVIFLSADGSPQ------VSEAAPPGQL
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pF1KA1 LRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKV
. .:.:.: :.: :. :..: : .: : . : .: .: . .: :. .
CCDS77 VA--RISVSDPDDGDFAHVNVSLEGGEGHFALSTQD-----SVIYLVCVARRLDREERDA
390 400 410 420 430
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pF1KA1 LTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFD-SLYYVARIPENAPGGSSVVAVT
.... :.. ..: . . : :... :.:::.: :: .:: .:: : :: :: ::
CCDS77 YNLRVTATDSGSPP-LRAEAAFVLHVTDVNDNAPAFDRQLYRPEPLPEVALPGSFVVRVT
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pF1KA1 AVDPDTGPWGEVKYSTY-GTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAED--
: ::: : :.: :: :. . : : :..:.: : :::: : . .. : : :
CCDS77 ARDPDQGTNGQVTYSLAPGAHTHWFSIDPTSGIITTA--ASLDYELEPQPQLIVVATDGG
500 510 520 530 540 550
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pF1KA1 MEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGT-P----VKIEAIDEDAEEPNNLV
. : : : ..: ::::. ::: .. . .. :: : ... : : :. : .:.
CCDS77 LPPLASSATVSVALQDVNDNEPQFQRTFYNASLPEGTQPGTCFLQVTATDADSG-PFGLL
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pF1KA1 DYSI---THAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSP
.::. . . : :..:.:.. . :.:: .. :. ... : : : :.
CCDS77 SYSLGAGLGSSGSPPFRIDAHSGDV---CTTRTLD--RDQGPSS---FDFTVTAVDGGG-
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pF1KA1 SFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATF
... . .:. ..:
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CCDS33 -----KATVVLNIKDENDNVPSIEIRKIGRIPLKDGVANVAEDVLVDTPIALVQVSDRDQ
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pF1KA1 NTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGE
. : .::. :..:. : ::: ::: . .. . :: .: : ::..: : : .:
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. ..: ::. : . :... . .. :. . : : : . : ..:::. ..:
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..:.:. .: . : . ..: . : : ::..: :.:: :::.:...
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....: ... . .. : :.: .: ..::.:: : ::. : ...
CCDS33 NESVSNATAIDSQIARSLHIPLTQDIAGDPSYEISKQRLSIVIGVVAGIM-TVILIILIV
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pF1KA1 STATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCN
: . :.:..:
CCDS33 VMARYCRSKNKNGYEAGKKDHEDFFTPQQHDKSKKPKKDKKNKKSKQPLYSSIVTVEASK
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pF1KA1 SDGLN--LVAEKVV-ILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSG
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CCDS75 -----KATVVLNIKDENDNVPSIEIRKIGRIPLKDGVANVAEDVLVDTPIALVQVSDRDQ
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. : : . ..: :. .:: ::. :.: : . :.: ::: : . ..: :
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. ..: ::. : . :... . .. :. . : : : . : ..:::. ..:
CCDS75 LFVMDENDNAPTVTLPKNISYTLLPPSSNVRTVVATVLATDSD-DGINADLNYSIVGGNP
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pF1KA1 ANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKI--
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CCDS75 FKLFEIDPTSGVVSL---------VGKLTQKHYGLHRLVVQVNDSGQPSQSTTTLVHVFV
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....: ... . .. : :.: .: ..::.:: : ::. : ...
CCDS75 NESVSNATAIDSQIARSLHIPLTQDIAGDPSYEISKQRLSIVIGVVAGIM-TVILIILIV
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pF1KA1 STATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCN
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CCDS75 VMARYCRSKNKNGYEAGKKDHEDFFTPQQHDKSKKPKKDKKNKKSKQPLYSSIVTVEASK
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CCDS37 AKESNPGTK--FAIDQNTGVVVLVKTLDFEEMTEYELLIQISDSVHYTEGALVVRVLDVN
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CCDS37 DNPPVFSQDFYQVTVPESIPVGYSVLTLSATDLE--SNENISYRILSSSKEFSIDPKNGT
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. . . : : :... : :.:::. :. : : : ...::....:: :.
CCDS37 IFTISPVLLLDTISTTQFL-VEASDGGN----PDL--RALTLVEIGIEDMNNYAPEFTVK
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pF1KA1 PYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNR-ILYSLVNGND-GAFEIN----------E
: . ::.: :: .. .: : . : . ::...::. . :... .
CCDS37 SYNLSLSEDALVGSTLVTFSNIDHDWTRENTYVEYSIISGNSQNNFHVETKFFHSEYPYK
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: . . .: :.::. : : : .: : ..:. ..:...:.:..::.: . :
CCDS37 QVGYLVLLHS---LDREASASHELVILASDSGCPPLSSTAVISIQVLDVNDNPPNFSSLS
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.. ..: : : . ...:: : :..:. .:. . .: : . .:
CCDS37 -----YHTHVKESTPLGSHI--TVVSANDRDTGSHAEIIYNIISGNEKGHFYLEENT---
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pF1KA1 EAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSL
: ... .:.: :. : : . .. .: : : : ...:: ::..:.:
CCDS37 --GVLYLIK---PLDYE--KMTKFTLTVQASDAEKKHFSFAVVFVSVLDDNDHAPQFMFS
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. .::: : .:.. ...:.: :.::.::. :: :.: . : :::: : ::
CCDS37 SFSCIVPENLPISSTICSINALDFDAGPYGELTYSIVSPCFLTHGMSYDHDLFLIDPLTG
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pF1KA1 LIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGK-----SVQ
:... :: : .: . :.:.: . :.. . ... : : . ..
CCDS37 DIHAKQ--ILDYENGNKYCLTVQAKDKGDATASLVVWVDIEGIDEFEPIFTQDQYFFTLP
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pF1KA1 KKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDAL
.:. ..:: : :: .... ::. . : :..:. .:.:.: ::.: .
CCDS37 EKNKDRQLIGRVEASDADAG-IDGVILYSLGTSSP--FFSVNKTNGNIYL---IRALPLI
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pF1KA1 HNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSF-STTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMK
.. .: : . . ... .: : :......... : :.:.: .
CCDS37 KSQLNKEDTLEMKIIAHSPKSDSKFASCTVFVNVSFSSEGT----PLAVFASSF------
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pF1KA1 AVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKS
....... .. .. : .:: . . :.:... . ... :. : .:.
CCDS37 SISLVVSFLVFLILICILI--VMILRHKQKDTINNYEE---KKTSSLDADLRV-------
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pF1KA1 TKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLPRAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTP
:. :. .:: ...:.:
CCDS37 TRDAS--VLKAFQKTDDCSNEVVPVDATPEWLSLISIMEKDIVNLYRHSNSSGHCSVEGE
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CCDS14 REEVEHYSFGVEAVDHGSPPMSSSTSVSITVLDVNDNDPVFTQPTYELRLNEDAAVGSSV
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pF1KA1 YTLNGTDPEGDP-ISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGN--ITLVEELDREREDEIEAIISIS
::.. : ... :.:... .::. :... :. :::. :: ..:.. .. :
CCDS14 LTLQARDRDANSVITYQLT-GGNTRNRFALSSQRGGGLITLALPLDYKQEQQYVLAVTAS
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pF1KA1 DGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVT
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CCDS14 DGTRSHTAHVLINVTDANTHRPVFQSSHYTVSVSEDRPVGTSIATLSANDEDTGENARIT
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pF1KA1 YFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTT
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CCDS14 YVIQDPVPQFRIDPDSGTMYTMM--ELDYENQVAYTLTIMAQDNGIPQK------SDTTT
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