Result of FASTA (omim) for
pF1KA1775
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1775, 859 aa
1>>>pF1KA1775 859 - 859 aa - 859 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7549+/-0.000447; mu= 0.6830+/- 0.028
mean_var=222.4171+/-44.982, 0's: 0 Z-trim(118.0): 399 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.085998
statistics sampled from 30062 (30468) to 30062 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 10.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_149091 (OMIM: 609502,613660) cadherin-related f ( 859) 5629 711.9 3.1e-204
XP_011538639 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadh ( 917) 5513 697.6 6.9e-200
NP_001165442 (OMIM: 609502,613660) cadherin-relate ( 745) 4450 565.6 2.9e-160
XP_011538640 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadh ( 803) 4334 551.3 6.7e-156
XP_011538642 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadh ( 656) 3769 481.1 7.2e-135
XP_011538641 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadh ( 710) 3762 480.3 1.4e-134
NP_001165402 (OMIM: 601067,601386,605516) cadherin (1061) 732 104.4 2.9e-21
NP_001165401 (OMIM: 601067,601386,605516) cadherin (1381) 732 104.5 3.6e-21
NP_443068 (OMIM: 601067,601386,605516) cadherin-23 ( 530) 720 102.8 4.5e-21
NP_071407 (OMIM: 601067,601386,605516) cadherin-23 (3354) 732 104.7 7.5e-21
XP_016871988 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3399) 732 104.7 7.6e-21
XP_006718005 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3397) 712 102.2 4.3e-20
XP_011538353 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (2306) 708 101.6 4.3e-20
XP_011538351 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (2330) 708 101.6 4.4e-20
XP_011538350 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (2388) 708 101.6 4.5e-20
XP_011538347 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3313) 708 101.7 5.9e-20
XP_011538346 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3374) 708 101.7 6e-20
XP_016871989 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3377) 708 101.7 6e-20
XP_011538345 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3384) 708 101.7 6e-20
XP_011538344 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3389) 708 101.7 6e-20
XP_011538341 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3418) 708 101.7 6e-20
XP_006718003 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3419) 708 101.7 6e-20
NP_003728 (OMIM: 601390,603057,607829) protocadher (3298) 705 101.3 7.6e-20
NP_001165403 (OMIM: 601067,601386,605516) cadherin ( 406) 658 95.0 7.4e-19
XP_005248223 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1065) 529 79.2 1.1e-13
NP_002580 (OMIM: 602988) protocadherin-7 isoform a (1069) 529 79.2 1.1e-13
NP_115832 (OMIM: 602988) protocadherin-7 isoform b (1072) 529 79.2 1.1e-13
XP_016863761 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1159) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863760 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1171) 529 79.3 1.2e-13
XP_011512146 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1179) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863759 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1179) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863757 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1182) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863758 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1182) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863756 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1190) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863755 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1190) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863754 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1192) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863753 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1200) 529 79.3 1.2e-13
XP_016863752 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1200) 529 79.3 1.2e-13
NP_115833 (OMIM: 602988) protocadherin-7 isoform c (1247) 529 79.3 1.3e-13
NP_001166994 (OMIM: 602988) protocadherin-7 isofor (1255) 529 79.3 1.3e-13
XP_005248221 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1267) 529 79.3 1.3e-13
XP_005248220 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1275) 529 79.3 1.3e-13
XP_011512145 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1276) 529 79.3 1.3e-13
XP_016863751 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1277) 529 79.3 1.3e-13
XP_016863750 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1285) 529 79.3 1.3e-13
XP_016863749 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1286) 529 79.3 1.3e-13
XP_016863748 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1288) 529 79.3 1.3e-13
XP_011512144 (OMIM: 602988) PREDICTED: protocadher (1296) 529 79.3 1.3e-13
XP_011530351 (OMIM: 612486) PREDICTED: protocadher (1706) 517 77.9 4.6e-13
XP_011530348 (OMIM: 612486) PREDICTED: protocadher (2594) 517 78.0 6.5e-13
>>NP_149091 (OMIM: 609502,613660) cadherin-related famil (859 aa)
initn: 5629 init1: 5629 opt: 5629 Z-score: 3787.8 bits: 711.9 E(85289): 3.1e-204
Smith-Waterman score: 5629; 100.0% identity (100.0% similar) in 859 aa overlap (1-859:1-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RGSPSFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 RGSPSFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLIS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 TATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 NSPESSLLPRAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 NSPESSLLPRAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTL
790 800 810 820 830 840
850
pF1KA1 ISELKQKFEKKSVHNKAYF
:::::::::::::::::::
NP_149 ISELKQKFEKKSVHNKAYF
850
>>XP_011538639 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadherin (917 aa)
initn: 5500 init1: 5500 opt: 5513 Z-score: 3709.6 bits: 697.6 E(85289): 6.9e-200
Smith-Waterman score: 5513; 97.9% identity (98.6% similar) in 866 aa overlap (2-859:52-917)
10 20
pF1KA1 MRRCR---W--AALALGLLRLCL---AQANF
: :. : ..: ::. .:. :::::
XP_011 WAAPQWGPSVHLGWGGGAPSCPVAGPDAGPRWCEAPSWCLGVLCLGVRLFCVLFPAQANF
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 APHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSV
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 DPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVAL
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 VPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERS
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGS
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 EVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPAQLQREVYELHVQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPAQLQREVYELHVQVT
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKIT
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 VNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLA
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGP
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 WGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVF
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEPANVFDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEPANVFDIN
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAETLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAETLS
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 RSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKR
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 PSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLPRAPALPPPPSVAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLPRAPALPPPPSVAPS
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850
pF1KA1 TGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTLISELKQKFEKKSVHNKAYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTLISELKQKFEKKSVHNKAYF
870 880 890 900 910
>>NP_001165442 (OMIM: 609502,613660) cadherin-related fa (745 aa)
initn: 4450 init1: 4450 opt: 4450 Z-score: 2998.2 bits: 565.6 E(85289): 2.9e-160
Smith-Waterman score: 4450; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AISITQSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEPNNLVDYSITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RGSPSFSTTALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLIS
::::::::::::::::::::
NP_001 RGSPSFSTTALLKIDITDAEVRRLRYMKNSNFPGTTKSVRKPKFKPKKPHSSQGLFLHPH
670 680 690 700 710 720
>>XP_011538640 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadherin (803 aa)
initn: 4321 init1: 4321 opt: 4334 Z-score: 2919.9 bits: 551.3 E(85289): 6.7e-156
Smith-Waterman score: 4334; 97.4% identity (98.3% similar) in 687 aa overlap (2-680:52-738)
10 20
pF1KA1 MRRCR---W--AALALGLLRLCL---AQANF
: :. : ..: ::. .:. :::::
XP_011 WAAPQWGPSVHLGWGGGAPSCPVAGPDAGPRWCEAPSWCLGVLCLGVRLFCVLFPAQANF
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 APHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSV
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 DPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVAL
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 VPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERS
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGS
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 EVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPAQLQREVYELHVQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPAQLQREVYELHVQVT
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKIT
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 VNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLA
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGP
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 WGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVF
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEPANVFDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEPANVFDIN
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAETLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAEVRR
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 RSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKR
XP_011 LRYMKNSNFPGTTKSVRKPKFKPKKPHSSQGLFLHPHCEIALFNLSNVNLYSRVFQGAAQ
750 760 770 780 790 800
>>XP_011538642 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadherin (656 aa)
initn: 3939 init1: 3756 opt: 3769 Z-score: 2542.4 bits: 481.1 E(85289): 7.2e-135
Smith-Waterman score: 3769; 96.8% identity (97.8% similar) in 603 aa overlap (2-596:52-654)
10 20
pF1KA1 MRRCR---W--AALALGLLRLCL---AQANF
: :. : ..: ::. .:. :::::
XP_011 WAAPQWGPSVHLGWGGGAPSCPVAGPDAGPRWCEAPSWCLGVLCLGVRLFCVLFPAQANF
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 APHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVYTLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSV
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 DPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLNLVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVAL
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 VPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQNLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERS
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVNVEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGS
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 EVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPAQLQREVYELHVQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPAQLQREVYELHVQVT
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKIT
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 VNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLA
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGP
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 WGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVF
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEPANVFDIN
::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_011 ITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIERIKL
630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 SHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAETLS
>>XP_011538641 (OMIM: 609502,613660) PREDICTED: cadherin (710 aa)
initn: 3760 init1: 3760 opt: 3762 Z-score: 2537.1 bits: 480.3 E(85289): 1.4e-134
Smith-Waterman score: 3762; 99.3% identity (99.5% similar) in 580 aa overlap (280-859:131-710)
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPA
: . :::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPPPRSRSMWRMFRTWPLSSWAHPTMAMCTRTPFRLVNGNDGAFEINETSGAISITQSPA
110 120 130 140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLQREVYELHVQVTEMSPAGSPAAQATVPVTIRIVDLNNHPPTFYGESGPQNRFELSMNE
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 HPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPPQGEILRGLKITVNDSDQGANAKFNLQLVGPRGIFRVVPQTVLNEAQVTIIVENSAAI
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTNDNVPKFDSLYYVARIPENAPGGS
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGLIYTQPWASLDAEATARYNFYVK
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVLGTPVKIEAIDEDAEEPNNLVDY
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 SITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SITHAEPANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDALHNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTT
470 480 490 500 510 520
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALLKIDITDAETLSRSPMAAFLIQTKDNPMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKK
530 540 550 560 570 580
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLP
590 600 610 620 630 640
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTLISELKQKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RAPALPPPPSVAPSTGAAQWTVPTVSGSLTPQPTQPPPKPKTMGSPVQSTLISELKQKFE
650 660 670 680 690 700
850
pF1KA1 KKSVHNKAYF
::::::::::
XP_011 KKSVHNKAYF
710
>>NP_001165402 (OMIM: 601067,601386,605516) cadherin-23 (1061 aa)
initn: 732 init1: 261 opt: 732 Z-score: 502.8 bits: 104.4 E(85289): 2.9e-21
Smith-Waterman score: 1062; 33.1% identity (61.1% similar) in 720 aa overlap (4-705:9-691)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MRRCRWAALALGLLRLCLAQANFAPHFFDNGVGSTNGNMALFSLPEDTPVGSHVY
:. : : : :. : .:.: : :: : .: . . ::::::: :
NP_001 MGRHVATSCHVAWL-LVLISGCWGQVNRLP-FFTNHFFDT-----YLLISEDTPVGSSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 TLNGTDPEGDPISYHISFDPSTRSVFSVDPTFGNITLVEELDREREDEIEAIISISDGLN
: . : ..::. . .: . ..: :.:.: : . : . :::: ..:. . .:.:: .
NP_001 QLLAQDMDNDPLVFGVSGEEASR-FFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQ
....:: : : :.::.:: : ..:: . .::. :.:. :: :.:.: : :.:::: : .:
NP_001 VITRKVNIQVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVN
. ::.: :.. . :::: .... .:: : : . .:. .....
NP_001 PPSQFFAIDSARGIVTVIR--ELDYETTQAYQLTVNATD-----QDKTRPLSTLANLAII
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VEDVQDMAPVFVGTPYYGYVYEDTLPGSEVLKVVAMDGDRGKPNRILYSLVNGN-DGAFE
. ::::: :.:.. :: .:: . ::. : ..:.: :.:.: : :..:.:: .. :
NP_001 ITDVQDMDPIFINLPYSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 INETSGAISIT---QSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPA-AQATVPVTIRIVDLNNHP
.. ::..... . : . . : :. ::.. .:. : .:. .: ..:.:..
NP_001 LDYISGVLTLNGLLDRENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA1 PTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQ--GANAKFNLQLVGPRGI-FR
: : .... ....: : : : : : :.:. : :. :.. ::: . :
NP_001 PEFN-----SSEYSVAITELAQVGFAL-PLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFI
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 VVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTND
. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
NP_001 ISPTSVQGKADIRIRV--AIPLDYETVDRYDFDLFANE-SVPDHVGY-AKVKITLINEND
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 NVPKFDSLYYVARIPENAPGGSSVVAVTAVDPDTGPWGEVKYSTYGTGADLFLIHPSTGL
: : :.. : . ::. :.::..: :.: :.: .:::.: .. : : . .:::
NP_001 NRPIFSQPLYNISLYENVTVGTSVLTVLATDNDAGTFGEVSY-FFSDDPDRFSLDKDTGL
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 IYTQPWASLDAEATARYNFYVKAEDMEGKYSVAEVFITLLDVNDHPPQFGKSVQKKTMVL
:. : :: : :... . :.: :. ....: :..:::::. : : :.. ..
NP_001 IMLI--ARLDYELIQRFTLTIIARDGGGEETTGRVRINVLDVNDNVPTFQKDAYVGALRE
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 GTP-----VKIEAIDEDAEEPNNLVDYSITHAEP-ANVFDINSHTGEIWLKNSIRSLDAL
. : :...: :::. ::: . :::. : .. :::. . : .. : : ::
NP_001 NEPSVTQLVRLRATDEDSP-PNNQITYSIVSASAFGSYFDISLYEGYGVISVS-RPLD-Y
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KA1 HNITPGRDCLWSLEVQAKDRGSPSFSTTALLKIDITDAE----TLSRSPMAAFLIQTKDN
..:. : : : :.: : :.: ...:. . :.. : . :.:. : :..... .:
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: .. ::
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.: .. .... .: .: . : :: : : ::. :: . .
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.. ::..... . : . . : :. ::.. .:. : .:. .: ..:.:..
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. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
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pF1KA1 PMKAVGVLAGTMATVVAITVLISTATFWRNKKSNKVLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLK
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.. . :.::. : :... ..: .:: : . .: :.:. . ..::.: : .
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.. :.:. :: : .. :: . . . ..:.: :.. : .: .. . :
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.. .: .: . . : .... . : : : .. .. :: ... : . : :
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pF1KA1 VLPMRRVLRKRPSPAPRTIRIEWLKSKSTKAATKFMLKEKPPNENCNNNSPESSLLPRAP
.
NP_001 IDAITVRGWGQGAPFLPI
1370 1380
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NP_443 VITRKVNIQVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQ
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pF1KA1 NLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVN
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NP_443 PPSQFFAIDSARGIVTVI--RELDYETTQAYQLTVNATD-----QDKTRPLSTLANLAII
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NP_443 ITDVQDMDPIFINLPYSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFA
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: : . ... ....: : : : : : :.:. : :. :.. ::: . :
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. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
NP_443 ISPTSVQGKADIRIRV--AIPLDYETVDRYDFDLFANE-SVPDHVGY-AKVKITLINEND
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: : :.. : . ::. :.::..: :.: .::
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NP_443 QGRRHPQIPELCLLVY
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NP_071 MGRHVATSCHVAWL-LVLISGCWGQVNRLP-FFTNHFFDT-----YLLISEDTPVGSSVT
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NP_071 QLLAQDMDNDPLVFGVSGEEASR-FFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQG
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pF1KA1 LVAEKVVILVTDANDEAPRFIQEPYVALVPEDIPAGSIIFKVHAVDRDTGSGGSVTYFLQ
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NP_071 VITRKVNIQVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 NLHSPFAVDRHSGVLRLQAGATLDYERSRTHYITVVAKDGGGRLHGADVVFSATTTVTVN
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NP_071 PPSQFFAIDSARGIVTVIR--ELDYETTQAYQLTVNATD-----QDKTRPLSTLANLAII
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NP_071 ITDVQDMDPIFINLPYSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFA
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pF1KA1 INETSGAISIT---QSPAQLQREVYELHVQVTEMSPAGSPA-AQATVPVTIRIVDLNNHP
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NP_071 LDYISGVLTLNGLLDRENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNA
290 300 310 320 330 340
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pF1KA1 PTFYGESGPQNRFELSMNEHPPQGEILRGLKITVNDSDQ--GANAKFNLQLVGPRGI-FR
: : .... ....: : : : : : :.:. : :. :.. ::: . :
NP_071 PEFN-----SSEYSVAITELAQVGFAL-PLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFI
350 360 370 380 390
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pF1KA1 VVPQTVLNEAQVTIIVENSAAIDFEKSKVLTFKLLAVEVNTPEKFSSTADVVIQLLDTND
. : .: ..:.. : : . .:.: : :.: : ..:.. . : : : :.. ::
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: : :.. : . ::. :.::..: :.: :.: .:::.: .. : : . .:::
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:. : :: : :... . :.: :. ....: :..:::::. : : :.. ..
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..:. : : : :.: : :.: ...:. . :.. : . :.:. : :..... .:
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859 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]