FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1780, 1140 aa
1>>>pF1KA1780 1140 - 1140 aa - 1140 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1704+/-0.000607; mu= 15.7545+/- 0.038
mean_var=341.5615+/-67.558, 0's: 0 Z-trim(115.9): 566 B-trim: 36 in 1/53
Lambda= 0.069397
statistics sampled from 26017 (26669) to 26017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 12.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_115822 (OMIM: 612453,614399) multiple epidermal (1140) 8809 898.1 0
NP_001243474 (OMIM: 612453,614399) multiple epider (1140) 8809 898.1 0
XP_011541996 (OMIM: 612453,614399) PREDICTED: mult (1140) 8809 898.1 0
XP_016865476 (OMIM: 612453,614399) PREDICTED: mult (1195) 8809 898.2 0
XP_016865477 (OMIM: 612453,614399) PREDICTED: mult ( 760) 5752 591.8 5.3e-168
XP_016878160 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1092) 5273 544.1 1.7e-153
XP_016878162 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1021) 5271 543.8 1.9e-153
NP_115821 (OMIM: 612454) multiple epidermal growth (1044) 5224 539.1 5.1e-152
XP_016878161 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1044) 5224 539.1 5.1e-152
NP_001295048 (OMIM: 612453,614399) multiple epider ( 567) 4568 473.0 2.2e-132
NP_001295050 (OMIM: 612453,614399) multiple epider ( 567) 4568 473.0 2.2e-132
XP_016878159 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1097) 4503 467.0 2.8e-130
XP_016856725 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1037) 3159 332.4 8.8e-90
NP_001073940 (OMIM: 610278) platelet endothelial a (1037) 3159 332.4 8.8e-90
XP_011507812 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1037) 3159 332.4 8.8e-90
XP_005245198 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1037) 3159 332.4 8.8e-90
XP_011507813 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1002) 3040 320.5 3.3e-86
XP_016856728 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 973) 3033 319.7 5.3e-86
XP_016856726 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 973) 3033 319.7 5.3e-86
XP_016856727 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 973) 3033 319.7 5.3e-86
XP_016856723 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1125) 3033 319.8 5.7e-86
XP_016856730 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 909) 2569 273.2 5e-72
XP_016856729 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 909) 2569 273.2 5e-72
XP_016856731 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 909) 2569 273.2 5e-72
XP_016856724 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1081) 2409 257.3 3.6e-67
XP_011507814 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 868) 2398 256.1 6.9e-67
XP_011539188 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1560) 2350 251.7 2.6e-65
XP_016878164 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep ( 854) 2287 245.0 1.5e-63
XP_016878163 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep ( 854) 2287 245.0 1.5e-63
XP_011539189 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1395) 2276 244.2 4.2e-63
XP_006710469 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1436) 2276 244.2 4.2e-63
NP_001400 (OMIM: 604266) multiple epidermal growth (1541) 2276 244.3 4.4e-63
XP_016856022 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1559) 2276 244.3 4.4e-63
XP_011539187 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1603) 2276 244.3 4.5e-63
XP_011539190 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1364) 2242 240.8 4.4e-62
NP_663325 (OMIM: 607873) scavenger receptor class ( 569) 950 110.8 2.5e-23
NP_003684 (OMIM: 607873) scavenger receptor class ( 830) 950 111.1 3e-23
XP_005270958 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 880 104.8 6.5e-21
XP_011539822 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 880 104.8 6.5e-21
XP_016856862 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 880 104.8 6.5e-21
XP_016856861 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2455) 880 104.8 6.5e-21
XP_011539821 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2467) 880 104.9 6.5e-21
NP_077719 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogenic (2471) 880 104.9 6.6e-21
XP_016884554 (OMIM: 600920,613619) PREDICTED: scav ( 617) 838 99.6 6.1e-20
NP_878315 (OMIM: 600920,613619) scavenger receptor ( 866) 838 99.9 7.2e-20
NP_699165 (OMIM: 600920,613619) scavenger receptor ( 871) 838 99.9 7.2e-20
NP_002217 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform (1238) 830 99.3 1.5e-19
NP_001186930 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogen (1235) 826 98.9 2e-19
NP_061978 (OMIM: 600985,606408,615963) tenascin-X (4242) 806 97.8 1.5e-18
NP_660142 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform (1200) 754 91.7 2.9e-17
>>NP_115822 (OMIM: 612453,614399) multiple epidermal gro (1140 aa)
initn: 8809 init1: 8809 opt: 8809 Z-score: 4789.6 bits: 898.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8809; 100.0% identity (100.0% similar) in 1140 aa overlap (1-1140:1-1140)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
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730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
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pF1KA1 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
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850 860 870 880 890 900
pF1KA1 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMR
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910 920 930 940 950 960
pF1KA1 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 NLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 NLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 CSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 CSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 VSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>>NP_001243474 (OMIM: 612453,614399) multiple epidermal (1140 aa)
initn: 8809 init1: 8809 opt: 8809 Z-score: 4789.6 bits: 898.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8809; 100.0% identity (100.0% similar) in 1140 aa overlap (1-1140:1-1140)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNTCQCEPGWGGTNCSSACDGDHWGPHCTSRCQCKNGALCNPITGACHCAAGFRGWRCED
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pF1KA1 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
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NP_001 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
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pF1KA1 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
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NP_001 QNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPEGRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSP
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310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
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pF1KA1 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
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NP_001 CDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGV
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pF1KA1 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
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NP_001 DCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQDGTYGLNCAE
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pF1KA1 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGIC
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pF1KA1 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
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NP_001 ECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPGFTGALCNEVC
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pF1KA1 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGPNCIHTCNCHN
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pF1KA1 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHISGQCTCRTGF
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pF1KA1 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLN
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850 860 870 880 890 900
pF1KA1 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMR
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pF1KA1 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 GYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGGKCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLY
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XP_011 GIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPGWSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFV
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pF1KA1 NLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSN
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XP_011 CSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 RCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPCQNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPCQNGGVCHHVTGECSCPSGWMGTVCGQPCPE
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pF1KA1 GRFGKNCSQECQCHNGGTCDAATGQCHCSPGYTGERCQDECPVGTYGVLCAETCQCVNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KCYHVSGACLCEAGFAGERCEARLCPEGLYGIKCDKRCPCHLENTHSCHPMSGECACKPG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WSGLYCNETCSPGFYGEACQQICSCQNGADCDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NCSSRCGCKNDAVCSPVDGSCTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VCAEGRWGPNCSLPCYCKNGASCSPDDGICECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 DHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHITGTCYCSPGWKGARCDQAGVIIVGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVL
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pF1KA1 FLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMRVVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLLALFIIYRHKQKGKESSMPAVTYTPAMRVVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSY
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pF1KA1 HTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFVNLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTLTQCATSPHVNNRDRMTVTKSKNNQLFVNLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYL
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pF1KA1 NELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSNCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NELGAFGLDRSYMGKSLKDLGKNSEYNSSNCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVE
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pF1KA1 MKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPTVSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEPTVSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCH
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pF1KA1 YDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YDLLPVRDSSSSPKQEDSGGSSSNSSSSSE
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::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 QICSCQNGADCDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QICSCQNGADCDSVTGKCTCAPGFKGIDCSTPCPLGTYGINCSSRCGCKNDAVCSPVDGS
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pF1KA1 CTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CTCKAGWHGVDCSIRCPSGTWGFGCNLTCQCLNGGACNTLDGTCTCAPGWRGEKCELPCQ
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pF1KA1 DGTYGLNCAERCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGTYGLNCAERCDCSHADGCHPTTGHCRCLPGWSGVHCDSVCAEGRWGPNCSLPCYCKNG
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pF1KA1 ASCSPDDGICECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASCSPDDGICECAPGFRGTTCQRICSPGFYGHRCSQTCPQCVHSSGPCHHITGLCDCLPG
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pF1KA1 FTGALCNEVCPSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FTGALCNEVCPSGRFGKNCAGICTCTNNGTCNPIDRSCQCYPGWIGSDCSQPCPPAHWGP
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pF1KA1 NCIHTCNCHNGAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NCIHTCNCHNGAFCSAYDGECKCTPGWTGLYCTQRCPLGFYGKDCALICQCQNGADCDHI
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pF1KA1 SGQCTCRTGFMGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGQCTCRTGFMGRHCEQKCPSGTYGYGCRQICDCLNNSTCDHITGTCYCSPGWKGARCDQ
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pF1KA1 AGVIIVGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGVIIVGNLNSLSRTSTALPADSYQIGAIAGIIILVLVVLFLLALFIIYRHKQKGKESSM
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pF1KA1 PAVTYTPAMRVVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PAVTYTPAMRVVNADYTISGTLPHSNGGNANSHYFTNPSYHTLTQCATSPHVNNRDRMTV
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pF1KA1 TKSKNNQLFVNLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKSKNNQLFVNLKNVNPGKRGPVGDCTGTLPADWKHGGYLNELGAFGLDRSYMGKSLKDL
580 590 600 610 620 630
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 GKNSEYNSSNCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKNSEYNSSNCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSA
640 650 660 670 680 690
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 NRNVYEVEPTVSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRNVYEVEPTVSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDSSSSPKQEDSGG
700 710 720 730 740 750
1140
pF1KA1 SSSNSSSSSE
::::::::::
XP_016 SSSNSSSSSE
760
>>XP_016878160 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple epider (1092 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
::.::.. ..: .. .. :: ::::::::::::.::::::: ::::::::: :
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XP_016 NTYIMDKGFKDAN
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>>NP_115821 (OMIM: 612454) multiple epidermal growth fac (1044 aa)
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NP_115 PYTKISPALGAERHSVGAVTGIMLLLFLIVVLLGLFAWHRRRQKEKGRDLAPRVSYTPAM
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NP_115 RMTSTDYSLSGA------------------------CGM-------DR------------
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.:::.:::::::::::::.: : : .:::::::.. :::... . ...:.:.:::::
NP_115 TCSLNSSENPYATIKDPPILTCKLPESSYVEMKSPVHMGSPYTDVPSLSTSNKNIYEVEP
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:::::: ..:. :. ::::.::::: ::::::::.: ...:.:.
NP_115 TVSVVQEGCGHNSSYIQNAYDLPRNSHIPGHYDLLPVRQSPANGPSQDKQS
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1140
pF1KA1 SE
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: : ::: .:: ::::..: :.:.::::: .:::.: :.::..:: :.::::::
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pF1KA1 NCSLSSSENPYATIKDPPVLIPKSSECGYVEMKSPARRDSPYAEINNSTSANRNVYEVEP
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XP_016 TCSLNSSENPYATIKDPPILTCKLPESSYVEMKSPVHMGSPYTDVPSLSTSNKNIYEVEP
940 950 960 970 980 990
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pF1KA1 TVSVVQGVFSNNGRLSQDPYDLPKNSHIPCHYDLLPVRDS-SSSPKQEDSGGSSSNSSSS
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XP_016 TVSVVQEGCGHNSSYIQNAYDLPRNSHIPGHYDLLPVRQSPANGPSQDKQS
1000 1010 1020 1030 1040
1140
pF1KA1 SE
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NP_001 MVISLNSCLSFICLLLCHWIGTASPLNLEDPNVCSHWESYSVTVQESYPHPFDQIYYTSC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDILNWFKCTRHRVSYRTAYRHGEKTMYRRKSQCCPGFYESGEMCVPHCADKCVHGRCIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 RCEQGTYGNDCHQRCQCQNGATCDHVTGECRCPPGYTGAFCEDLCPPGKHGPQCEQRCPC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]