FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1824, 942 aa 1>>>pF1KA1824 942 - 942 aa - 942 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3970+/-0.000379; mu= 2.4676+/- 0.024 mean_var=232.7768+/-48.629, 0's: 0 Z-trim(120.0): 75 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.084063 statistics sampled from 34720 (34805) to 34720 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16 Scan time: 16.540 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003852 (OMIM: 603812) DDB1- and CUL4-associated ( 942) 6387 788.4 0 NP_001271135 (OMIM: 603812) DDB1- and CUL4-associa ( 941) 6370 786.3 0 XP_016877224 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 860) 5806 717.9 5.4e-206 NP_001271136 (OMIM: 603812) DDB1- and CUL4-associa ( 860) 5806 717.9 5.4e-206 XP_016877223 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 860) 5806 717.9 5.4e-206 XP_016877225 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 859) 5789 715.8 2.3e-205 XP_016877226 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 725) 4857 602.7 2.1e-171 XP_016877227 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 663) 4368 543.4 1.4e-153 XP_016877228 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 663) 4368 543.4 1.4e-153 XP_011535582 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 760) 4368 543.5 1.5e-153 XP_006720363 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 894) 4368 543.5 1.8e-153 XP_011535581 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 895) 4368 543.5 1.8e-153 XP_016877222 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 895) 4368 543.5 1.8e-153 XP_011535580 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 895) 4368 543.5 1.8e-153 XP_006720362 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 895) 4368 543.5 1.8e-153 XP_006720361 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 976) 4368 543.5 1.9e-153 XP_006720360 (OMIM: 603812) PREDICTED: DDB1- and C ( 977) 4368 543.5 1.9e-153 NP_001271137 (OMIM: 603812) DDB1- and CUL4-associa ( 326) 2022 258.7 3.5e-68 NP_001188493 (OMIM: 605961) pleiotropic regulator ( 505) 241 42.8 0.0052 NP_002660 (OMIM: 605961) pleiotropic regulator 1 i ( 514) 241 42.8 0.0053 >>NP_003852 (OMIM: 603812) DDB1- and CUL4-associated fac (942 aa) initn: 6387 init1: 6387 opt: 6387 Z-score: 4199.5 bits: 788.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6387; 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