FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1883, 1460 aa 1>>>pF1KA1883 1460 - 1460 aa - 1460 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.5209+/-0.00122; mu= -13.5300+/- 0.074 mean_var=784.7330+/-163.612, 0's: 0 Z-trim(118.2): 200 B-trim: 124 in 1/54 Lambda= 0.045784 statistics sampled from 18859 (19060) to 18859 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.819), E-opt: 0.2 (0.585), width: 16 Scan time: 6.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19 (1489) 10365 701.2 6e-201 CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17 (1374) 1775 133.7 3.6e-30 CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7 (1503) 1579 120.8 3e-26 CCDS58607.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17 (1271) 1491 115.0 1.5e-24 >>CCDS46136.1 LMTK3 gene_id:114783|Hs108|chr19 (1489 aa) initn: 10365 init1: 10365 opt: 10365 Z-score: 3721.2 bits: 701.2 E(32554): 6e-201 Smith-Waterman score: 10365; 100.0% identity (100.0% similar) in 1460 aa overlap (1-1460:30-1489) 10 20 30 pF1KA1 MPAPGALILLAAVSASGCLASPAHPDGFALG ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MRQVLWLCNVCVTARETRHHLHLPAILDKMPAPGALILLAAVSASGCLASPAHPDGFALG 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 RAPLAPPYAVVLISCSGLLAFIFLLLTCLCCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 RAPLAPPYAVVLISCSGLLAFIFLLLTCLCCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEET 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 SSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAPQPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SSSQSLPDVYILPLAEVSLPMPAPQPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 IFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIME :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 IFSDYTPAQVVVKELRASAGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIME 190 200 210 220 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::::::.:::. : . ::::::::.:::. :: .:. CCDS45 VQLLKSTDVGRHSLLYLKEIGRGWFGKVFLGEVNSGISSAQVVVKELQASASVQEQMQFL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 SEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIMEFCQLGDLKRYLRAQRPPEGLSPELPPRD :.::::.:.: :.::::. :.:. :.::.:::: ::::: :::. : :...: : CCDS45 EEVQPYRALKHSNLLQCLAQCAEVTPYLLVMEFCPLGDLKGYLRSCRVAESMAP-----D 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 LRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNYVHSDLALRNCLLTSDLTVRIGDYGLAHSNYKEDYYLT ::::::. :.: :. ::: .:.:::::::::::::.::::.:::::::: .:.:::..: CCDS45 PRTLQRMACEVACGVLHLHRNNFVHSDLALRNCLLTADLTVKIGDYGLAHCKYREDYFVT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 PERLWIPLRWAAPELLGELHGTFMVVDQSRESNIWSLGVTLWELFEFGAQPYRHLSDEEV ..::.:::: ::::. :.:....::::.. .:.::::::.:::::.:.::: . ::..: CCDS45 ADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNLLVVDQTKSGNVWSLGVTIWELFELGTQPYPQHSDQQV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 LAFVVRQQHVKLARPRLKLPYADYWYDILQSCWRPPAQRPSASDLQLQLTYLLS------ ::..::.:..:: .:.:.: .: ::...: :: : :::.: ...: :.:: . CCDS45 LAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSDRWYEVMQFCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGATEA 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KA1 ----ERPPRPPPPPPPPRDGPFPWPWPPAHSAPRPGTLSSPFPLLDGFPG----ADPDDV :: : : :: : : .. . .: ::::. : : :: ::: CCDS45 EEEFERRWRSLRPGGGGV-GPGPGAAGPMLGGVVELAAASSFPLLEQFAGDGFHADGDDV 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 LTVTESSRGLNLECLWEKARRGAGRGGGAPAWQPASAPPAPHANPSNPFYEALSTPSVLP :::::.:::::.: :: :::: : :. ::. :. : .. . :.:.: CCDS45 LTVTETSRGLNFEYKWE-----AGRG--AEAF-PATLSPGRTARLQELCAPDGAPPGVVP 470 480 490 500 510 530 540 550 560 pF1KA1 VISARSPSVSSEYYIRLEE------H-----GSPPEPLFPNDWDPLDPGVPA------PQ :.::.:::..:::.::::: : : : : : : . : : : CCDS45 VLSAHSPSLGSEYFIRLEEAAPAAGHDPDCAGCAPSPPATADQDDDSDGSTAASLAMEPL 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 pF1KA1 APQAPS-EVPQLVSETWA------SPLFPAPRPFPAQ---SSASGSFLLSGWDPEGRGA- ..: .:: .. . .:: :. : :. : : :. . : : .: CCDS45 LGHGPPVDVPWGRGDHYPRRSLARDPLCPSRSPSPSAGPLSLAEGGAEDADW---GVAAF 580 590 600 610 620 630 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 GETLAGDP--AEVLGERGTAPW--VEEEEEEEEGSSPGEDSSSLGGGPSRRGPLPCPLCS .. :: . :: :. : . :.: :: :. . ..:: . . CCDS45 CPAFFEDPLGTSPLGSSGAPPLPLTGEDELEEVGARRA----------AQRGHWRSNVSA 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 REGACSCLPLERGDAVAGWGGHPALGCPHPPEDDSSLRAERGSLADLPMAPPASAPPEFL ... : : : : :.. ::: : ::: : . : : : . : CCDS45 NNNSGSRCP-ESWDPVSA-GGH-AEGCPSPKQT--------------PRASPEPGYPG-- 690 700 710 720 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 DPLMG--AAAPQYPGRGPPPAPPPPPPPPRAPADPAASPDPPSAVASPGSGLSSPGPKPG .::.: ::. : :: : : ::: .. :: . . .:: . : .: CCDS45 EPLLGLQAASAQEPGCCPG-LPHLCSAQGLAPAPCLVT---PSWTETASSGGDHPQAEP- 730 740 750 760 770 780 800 810 820 830 840 850 pF1KA1 DSGYETETPFSPEGAFPGGGAAEEEGVPRPRAPPEPPDPGAPRPPPDPGPLPLPGPREKP . :.: .:. .:. . .::.: : :: :: :: .: : : CCDS45 KLATEAEGTTGPRLPLPSVPSPSQEGAPLPSEEASAPD--APDALPD-SPTPATGG---- 790 800 810 820 830 860 870 880 890 900 910 pF1KA1 TFVVQVSTEQLLMSLREDVTRNLLGEKGATARETGPRKAGRGPGNREKVPGLN-RDPTVL .::. .: .: . . . .. .... .: : . . ::. : : :. CCDS45 ----EVSAIKLASALNGSSSSPEV--EAPSSEDEDTAEATSGIFTDTSSDGLQARRPDVV 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 970 pF1KA1 GNGKQAPSLSLPVNGVTVLENGDQRAPGIEEKAAENGALGSPEREEKVLENGELTPPRRE . ::. :. :.. : : .:...: .:. . : . CCDS45 PAFR---SLQKQVGTPDSLDSLD-----IPSSASDGGY--------EVFSPSATGPSGGQ 890 900 910 920 930 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 EKALENG-ELRSPEAGEKVLVNG--GLTPPKSEDKVSENGGLRFPRNTERPPETG-PWRA .::..: . .. :. : :: .. : : . .::. : : ::: CCDS45 PRALDSGYDTENYESPEFVLKEAQEGCEPQAFAELASEGEG---P-----GPETRLSTSL 940 950 960 970 980 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 PGPWEKTPESWGPAPTIGEPAPETSLERAPAPSAVVSSRNGGETAPGPLGPAPKNGTLEP : ::.: . : ..:: .. .. ::. :::: :..: .: CCDS45 SGLNEKNPYR--------DSAYFSDLEAEAEATSGPEKKCGGDRAPGPELGLPSTG--QP 990 1000 1010 1020 1030 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA1 GTERRAPETGGAPRAPGAGRLDLGSGGRAPVGTGTAPGGGPGSGVDAKAGWVDNTRPQPP . . . ::. .: : :.::: : .... :.: CCDS45 SEQ--------VCLRPGV--------------SGEAQGSGPGE-VLPPLLQLEGSSPEPS 1040 1050 1060 1070 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 PPP---LPPPPEAQPRRLEPAPPRARPEVAPEGEPGAPDSRAGGDTALSGDGDPPKPERK : .: ::: : .: ..:: .: :. . . : ..:. . : . CCDS45 TCPSGLVPEPPEPQ------GPAKVRP--GPS--PSCSQFFLLTPVPLRSEGN--SSEFQ 1080 1090 1100 1110 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 GPEMPRLFLDLGP-PQGNSEQIKARLSRLSLALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAG :: : :. :: :: .:.. ::: : : . : : CCDS45 GP--PGLL--SGPAPQ----------KRMG------------GPGTPRAPLRLALPGLP- 1120 1130 1140 1150 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 GEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEEDEEAAAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADA :. : : :::.:: ::..:: . .. : .. .: ::::: :.... CCDS45 --AALEGRPEEEEEDSEDSDESDEELRCYSVQE----PSEDSEEEAPAVPVVV--AESQS 1160 1170 1180 1190 1200 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 ARPLRGLLKSPRGADEPEDSELERKRKMVSFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDTD :: ::.::: : .: .::::.: ::: ::::::::::.:: ::. : .. CCDS45 ARNLRSLLKMPSLLSETFCEDLERKKKAVSFFDDVTVYLFDQESPTRELGEPFPGAKESP 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1390 1400 1410 1420 pF1KA1 PST---PPAPPTPPHPATPGDGFPSNDSGF-GGSFEWAEDFPL----------LPP--PG :. :. :. :. .:: :..... ::.: : .:::: : : :. CCDS45 PTFLRGSPGSPSAPNRPQQADGSPNGSTAEEGGGFAWDDDFPLMTAKAAFAMALDPAAPA 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1430 1440 1450 1460 pF1KA1 P------PLCFSRFSVSPALETPGPPARAPDARPAGPVEN : : ::::.:::: CCDS45 PAAPTPTPAPFSRFTVSPAPTSRFSITHVSDSDAESKRGPEAGAGGESKEA 1330 1340 1350 1360 1370 >>CCDS5654.1 LMTK2 gene_id:22853|Hs108|chr7 (1503 aa) initn: 1588 init1: 668 opt: 1579 Z-score: 584.7 bits: 120.8 E(32554): 3e-26 Smith-Waterman score: 1744; 30.8% identity (53.3% similar) in 1553 aa overlap (1-1451:1-1459) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MPAPGAL------ILLAAVSASGCLASPAHPDGFALGRAPLAPPYA---VVLISCSGLLA ::.: :: .::. . :.. :.: : :.:: : . :.: :: :. CCDS56 MPGPPALRRRLLLLLLVLLIAGSAGAAPLPQTG--AGEAPPAAEVSSSFVILCVCS-LII 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 FIFLLLTCL-CCKRGDVGFKEFENPEGEDCSGEYTPPAEETSSSQSLPDVYILPLAEVSL .: :. .:. ::: .. ::::: .. : ..:::::.: : :: .:. : . ..:: CCDS56 LIVLIANCVSCCKDPEIDFKEFE--DNFDDEIDFTPPAEDTPSVQSPAEVFTLSVPNISL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 PMPAP-QPSHSDMTTPLGLSRQHLSYLQEIGSGWFGKVILGEIFSDYTPAQVVVKELRAS : :. ::: . . . .:. :.:.::::.::::::.::::.. . :.:.::::.:: CCDS56 PAPSQFQPSVEGLKSQV--ARHSLNYIQEIGNGWFGKVLLGEIYTGTSVARVIVKELKAS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 AGPLEQRKFISEAQPYRSLQHPNVLQCLGLCVETLPFLLIMEFCQLGDLKRYLRA-QRPP :.: :: :.....:: :::::.:::.: :::..:.::..:::.::::: :::. :. CCDS56 ANPKEQDTFLKNGEPYYILQHPNILQCVGQCVEAIPYLLVFEFCDLGDLKAYLRSEQEHM 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 EGLSPELPPRDLRTLQRMGLEIARGLAHLHSHNYVHSDLALRNCLLTSDLTVRIGDYGLA .: : . ::::. :.: ::: .:. ...:::::::::.:::::.:..::::.. 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CCDS56 PAQTGVPQQVHPTEDEASSPWSVLNAELSSGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA1 ALPPLTLTPFPGPGPRRPPWEGADAGAAGGEAGGAGAPGPAEEDGEDEDEDEEE----DE :: . :: ..: :: : : ..: ::: : ::..:. :: CCDS56 ALDKSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLG--VSGML---DLSEDGMDADEEDENSDDSDE 1250 1260 1270 1280 1290 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KA1 EAAAPGAAAGPRGPGRARAAPVPVVVSSADADAARPLRGLLKSPRGADEPED--SELERK . : . . :::...:. : .: ::.::: : .:. :. . ... CCDS56 DLRAFNLHSLSSESEDETEHPVPIILSNED---GRHLRSLLK-PTAANAPDPLPEDWKKE 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA1 RKMVSFHGDVTVYLFDQETPTNELSVQAPPEGDT-DPS-TPPAPPT-PPHPATPGDGFPS .: :.: :::::::::::::.::. : :.. :. . ::: . :. . .. : CCDS56 KKAVTFFDDVTVYLFDQETPTKELG---PCGGEACGPDLSGPAPASGSPYLSRCINSESS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA1 NDSGFGGSFEWAEDFPLLPPPGPPLCFSRF-SVSPALET-----PGPPARAPDARPAGPV .: ::.::: .:: : : : . : .:.:.: : ::::. . 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