Result of FASTA (omim) for
pF1KA1885
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1885, 1063 aa
1>>>pF1KA1885 1063 - 1063 aa - 1063 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2270+/-0.000332; mu= 18.6083+/- 0.021
mean_var=98.1158+/-19.909, 0's: 0 Z-trim(118.6): 17 B-trim: 713 in 1/52
Lambda= 0.129481
statistics sampled from 31706 (31723) to 31706 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 11.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065175 (OMIM: 612802,615917) valine--tRNA ligas (1063) 7357 1385.1 0
NP_001161206 (OMIM: 612802,615917) valine--tRNA li (1093) 7357 1385.1 0
NP_001161205 (OMIM: 612802,615917) valine--tRNA li ( 923) 6373 1201.2 0
XP_005249419 (OMIM: 192150) PREDICTED: valine--tRN (1265) 3291 625.6 5.4e-178
NP_006286 (OMIM: 192150) valine--tRNA ligase [Homo (1264) 3283 624.1 1.5e-177
XP_016866736 (OMIM: 192150) PREDICTED: valine--tRN ( 682) 2083 399.8 2.8e-110
XP_016866735 (OMIM: 192150) PREDICTED: valine--tRN ( 682) 2083 399.8 2.8e-110
NP_060530 (OMIM: 612801,616007) isoleucine--tRNA l (1012) 293 65.5 1.8e-09
NP_001304893 (OMIM: 151350,615438) leucine--tRNA l (1130) 176 43.7 0.0073
>>NP_065175 (OMIM: 612802,615917) valine--tRNA ligase, m (1063 aa)
initn: 7357 init1: 7357 opt: 7357 Z-score: 7422.4 bits: 1385.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7357; 99.9% identity (100.0% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:1-1063)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPHLPLASFRPPFWGLRHSRGLPRFHSVSTQSEPHGSPISRRNREAKQKRLREKQATLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MPHLPLASFRPPFWGLRHSRGLPRFHSVSTQSEPHGSPISRRNREAKQKRLREKQATLEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIAGESKSPAESIKAWRPKELVLYEIPTKPGEKKDVSGPLPPAYSPRYVEAAWYPWWVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EIAGESKSPAESIKAWRPKELVLYEIPTKPGEKKDVSGPLPPAYSPRYVEAAWYPWWVRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GFFKPEYQARLPQATGETFSMCIPPPNVTGSLHIGHALTVAIQDALVRWHRMRGDQVLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GFFKPEYQARLPQATGETFSMCIPPPNVTGSLHIGHALTVAIQDALVRWHRMRGDQVLWV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PGSDHAGIATQAVVEKQLWKERGVRRHELSREAFLREVWQWKEAKGGEICEQLRALGASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGSDHAGIATQAVVEKQLWKERGVRRHELSREAFLREVWQWKEAKGGEICEQLRALGASL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DWDRECFTMDVGSSVAVTEAFVRLYKAGLLYRNHQLVNWSCALRSAISDIEVENRPLPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DWDRECFTMDVGSSVAVTEAFVRLYKAGLLYRNHQLVNWSCALRSAISDIEVENRPLPGH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TQLRLPGCPTPVSFGLLFSVAFPVDGEPDAEVVVGTTRPETLPGDVAVAVHPDDSRYTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TQLRLPGCPTPVSFGLLFSVAFPVDGEPDAEVVVGTTRPETLPGDVAVAVHPDDSRYTHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 HGRQLRHPLMGQPLPLITDYAVQPHVGTGAVKVTPAHSPADAEMGARHGLSPLNVIAEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HGRQLRHPLMGQPLPLITDYAVQPHVGTGAVKVTPAHSPADAEMGARHGLSPLNVIAEDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TMTSLCGDWLQGLHRFVAREKIMSVLSEWGLFRGLQNHPMVLPICSRSGDVIEYLLKNQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TMTSLCGDWLQGLHRFVAREKIMSVLSEWGLFRGLQNHPMVLPICSRSGDVIEYLLKNQW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FVRCQEMGARAAKAVESGALELSPSFHQKNWQHWFSHIGDWCVSRQLWWGHQIPAYLVVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FVRCQEMGARAAKAVESGALELSPSFHQKNWQHWFSHIGDWCVSRQLWWGHQIPAYLVVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 DHAQGEEDCWVVGRSEAEAREVAAELTGRPGAELTLERDPDVLDTWFSSALFPFSALGWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DHAQGEEDCWVVGRSEAEAREVAAELTGRPGAELTLERDPDVLDTWFSSALFPFSALGWP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 QETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMVMLGTQLTGQLPFSKVLLHPMVRDRQGRKMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMVMLGTQLTGQLPFSKVLLHPMVRDRQGRKMS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNLDPAELAIVAAAQKKDFPHGIPECGTDALRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNLDPAELAIVAAAQKKDFPHGIPECGTDALRF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIWNALRFILNALGEKFVPQPAEELSPSSPMDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIWNALRFILNALGEKFVPQPAEELSPSSPMDA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 WILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALHHFWLHNLCDVYLEAVKPVLWHSPRPLGPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 WILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALHHFWLHNLCDVYLEAVKPVLWHSPRPLGPPQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 VLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPPRPGCPPAPSISVAPYPSACSLEHWRQPELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPPRPGCPPAPSISVAPYPSACSLEHWRQPELE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 RRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRVLLQSSEPGDQGLFEAFLEPLGTLGYCGAVGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRVLLQSSEPGDQGLFEAFLEPLGTLGYCGAVGL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 LPPGAAAPSGWAQAPLSDTAQVYMELQGLVDPQIQLPLLAARRYKLQKQLDSLTARTPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LPPGAAAPSGWAQAPLSDTAQVYMELQGLVDPQIQLPLLAARRYKLQKQLDSLTARTPSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KA1 GEAGTQRQQKLSSLQLELSKLDKAASHLQQLMDEPPAPGSPEL
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_065 GEAGTQRQQKLSSLQLELSKLDKAASHLRQLMDEPPAPGSPEL
1030 1040 1050 1060
>>NP_001161206 (OMIM: 612802,615917) valine--tRNA ligase (1093 aa)
initn: 7357 init1: 7357 opt: 7357 Z-score: 7422.2 bits: 1385.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7357; 99.9% identity (100.0% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:31-1093)
10 20 30
pF1KA1 MPHLPLASFRPPFWGLRHSRGLPRFHSVST
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGGKAWPRRAVGTAGGPCAEQISAPFQTLLMPHLPLASFRPPFWGLRHSRGLPRFHSVST
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 QSEPHGSPISRRNREAKQKRLREKQATLEAEIAGESKSPAESIKAWRPKELVLYEIPTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSEPHGSPISRRNREAKQKRLREKQATLEAEIAGESKSPAESIKAWRPKELVLYEIPTKP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 GEKKDVSGPLPPAYSPRYVEAAWYPWWVREGFFKPEYQARLPQATGETFSMCIPPPNVTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEKKDVSGPLPPAYSPRYVEAAWYPWWVREGFFKPEYQARLPQATGETFSMCIPPPNVTG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SLHIGHALTVAIQDALVRWHRMRGDQVLWVPGSDHAGIATQAVVEKQLWKERGVRRHELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLHIGHALTVAIQDALVRWHRMRGDQVLWVPGSDHAGIATQAVVEKQLWKERGVRRHELS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 REAFLREVWQWKEAKGGEICEQLRALGASLDWDRECFTMDVGSSVAVTEAFVRLYKAGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REAFLREVWQWKEAKGGEICEQLRALGASLDWDRECFTMDVGSSVAVTEAFVRLYKAGLL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 YRNHQLVNWSCALRSAISDIEVENRPLPGHTQLRLPGCPTPVSFGLLFSVAFPVDGEPDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRNHQLVNWSCALRSAISDIEVENRPLPGHTQLRLPGCPTPVSFGLLFSVAFPVDGEPDA
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EVVVGTTRPETLPGDVAVAVHPDDSRYTHLHGRQLRHPLMGQPLPLITDYAVQPHVGTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVVVGTTRPETLPGDVAVAVHPDDSRYTHLHGRQLRHPLMGQPLPLITDYAVQPHVGTGA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 VKVTPAHSPADAEMGARHGLSPLNVIAEDGTMTSLCGDWLQGLHRFVAREKIMSVLSEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKVTPAHSPADAEMGARHGLSPLNVIAEDGTMTSLCGDWLQGLHRFVAREKIMSVLSEWG
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 LFRGLQNHPMVLPICSRSGDVIEYLLKNQWFVRCQEMGARAAKAVESGALELSPSFHQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFRGLQNHPMVLPICSRSGDVIEYLLKNQWFVRCQEMGARAAKAVESGALELSPSFHQKN
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 WQHWFSHIGDWCVSRQLWWGHQIPAYLVVEDHAQGEEDCWVVGRSEAEAREVAAELTGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WQHWFSHIGDWCVSRQLWWGHQIPAYLVVEDHAQGEEDCWVVGRSEAEAREVAAELTGRP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 GAELTLERDPDVLDTWFSSALFPFSALGWPQETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAELTLERDPDVLDTWFSSALFPFSALGWPQETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMV
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 MLGTQLTGQLPFSKVLLHPMVRDRQGRKMSKSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLGTQLTGQLPFSKVLLHPMVRDRQGRKMSKSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNL
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 DPAELAIVAAAQKKDFPHGIPECGTDALRFTLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPAELAIVAAAQKKDFPHGIPECGTDALRFTLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIW
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 NALRFILNALGEKFVPQPAEELSPSSPMDAWILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NALRFILNALGEKFVPQPAEELSPSSPMDAWILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALH
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 HFWLHNLCDVYLEAVKPVLWHSPRPLGPPQVLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HFWLHNLCDVYLEAVKPVLWHSPRPLGPPQVLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPP
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 RPGCPPAPSISVAPYPSACSLEHWRQPELERRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPGCPPAPSISVAPYPSACSLEHWRQPELERRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRVL
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 LQSSEPGDQGLFEAFLEPLGTLGYCGAVGLLPPGAAAPSGWAQAPLSDTAQVYMELQGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQSSEPGDQGLFEAFLEPLGTLGYCGAVGLLPPGAAAPSGWAQAPLSDTAQVYMELQGLV
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 DPQIQLPLLAARRYKLQKQLDSLTARTPSEGEAGTQRQQKLSSLQLELSKLDKAASHLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_001 DPQIQLPLLAARRYKLQKQLDSLTARTPSEGEAGTQRQQKLSSLQLELSKLDKAASHLRQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060
pF1KA1 LMDEPPAPGSPEL
:::::::::::::
NP_001 LMDEPPAPGSPEL
1090
>>NP_001161205 (OMIM: 612802,615917) valine--tRNA ligase (923 aa)
initn: 6373 init1: 6373 opt: 6373 Z-score: 6429.9 bits: 1201.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6373; 99.9% identity (100.0% similar) in 923 aa overlap (141-1063:1-923)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 AAWYPWWVREGFFKPEYQARLPQATGETFSMCIPPPNVTGSLHIGHALTVAIQDALVRWH
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MCIPPPNVTGSLHIGHALTVAIQDALVRWH
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RMRGDQVLWVPGSDHAGIATQAVVEKQLWKERGVRRHELSREAFLREVWQWKEAKGGEIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RMRGDQVLWVPGSDHAGIATQAVVEKQLWKERGVRRHELSREAFLREVWQWKEAKGGEIC
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EQLRALGASLDWDRECFTMDVGSSVAVTEAFVRLYKAGLLYRNHQLVNWSCALRSAISDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQLRALGASLDWDRECFTMDVGSSVAVTEAFVRLYKAGLLYRNHQLVNWSCALRSAISDI
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 EVENRPLPGHTQLRLPGCPTPVSFGLLFSVAFPVDGEPDAEVVVGTTRPETLPGDVAVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVENRPLPGHTQLRLPGCPTPVSFGLLFSVAFPVDGEPDAEVVVGTTRPETLPGDVAVAV
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 HPDDSRYTHLHGRQLRHPLMGQPLPLITDYAVQPHVGTGAVKVTPAHSPADAEMGARHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPDDSRYTHLHGRQLRHPLMGQPLPLITDYAVQPHVGTGAVKVTPAHSPADAEMGARHGL
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SPLNVIAEDGTMTSLCGDWLQGLHRFVAREKIMSVLSEWGLFRGLQNHPMVLPICSRSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPLNVIAEDGTMTSLCGDWLQGLHRFVAREKIMSVLSEWGLFRGLQNHPMVLPICSRSGD
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VIEYLLKNQWFVRCQEMGARAAKAVESGALELSPSFHQKNWQHWFSHIGDWCVSRQLWWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIEYLLKNQWFVRCQEMGARAAKAVESGALELSPSFHQKNWQHWFSHIGDWCVSRQLWWG
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 HQIPAYLVVEDHAQGEEDCWVVGRSEAEAREVAAELTGRPGAELTLERDPDVLDTWFSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQIPAYLVVEDHAQGEEDCWVVGRSEAEAREVAAELTGRPGAELTLERDPDVLDTWFSSA
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 LFPFSALGWPQETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMVMLGTQLTGQLPFSKVLLHPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFPFSALGWPQETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMVMLGTQLTGQLPFSKVLLHPM
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VRDRQGRKMSKSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNLDPAELAIVAAAQKKDFPHGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRDRQGRKMSKSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNLDPAELAIVAAAQKKDFPHGI
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 PECGTDALRFTLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIWNALRFILNALGEKFVPQPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PECGTDALRFTLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIWNALRFILNALGEKFVPQPAE
580 590 600 610 620 630
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 ELSPSSPMDAWILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALHHFWLHNLCDVYLEAVKPVLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELSPSSPMDAWILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALHHFWLHNLCDVYLEAVKPVLW
640 650 660 670 680 690
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 HSPRPLGPPQVLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPPRPGCPPAPSISVAPYPSACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSPRPLGPPQVLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPPRPGCPPAPSISVAPYPSACS
700 710 720 730 740 750
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 LEHWRQPELERRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRVLLQSSEPGDQGLFEAFLEPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEHWRQPELERRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRVLLQSSEPGDQGLFEAFLEPLG
760 770 780 790 800 810
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 TLGYCGAVGLLPPGAAAPSGWAQAPLSDTAQVYMELQGLVDPQIQLPLLAARRYKLQKQL
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pF1KA1 R-PGCPPAPSISVAPYPSACSLEHWRQPELERRFSRVQEVVQVLRALRATYQLTKARPRV
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NP_006 LEVADEATGALASAVSGYVQALASAGVVAVLALGAPAPQGCAVALASDRCSIHLQLQGLV
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pF1KA1 AASHLQQLMDEPPAPGSPEL
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NP_006 AIALFQKML
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XP_016 RPQWYVRCGEMAQAASAAVTRGDLRILPEAHQRTWHAWMDNIREWCISRQLWWGHRIPAY
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XP_016 FVTVSDPAVPPGEDPDGRYWVSGRNEAEAREKAAKEFGVSPDKISLQQDEDVLDTWFSSG
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pF1KA1 LFPFSALGWPQETPDLARFYPLSLLETGSDLLLFWVGRMVMLGTQLTGQLPFSKVLLHPM
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XP_016 LFPLSILGWPNQSEDLSVFYPGTLLETGHDILFFWVARMVMLGLKLTGRLPFREVYLHAI
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pF1KA1 VRDRQGRKMSKSLGNVLDPRDIISGVEMQVLQEKLRSGNLDPAELAIVAAAQKKDFPHGI
::: .:::::::::::.:: :.: :. .: :...: ..::::.:. . .:: ::: ::
XP_016 VRDAHGRKMSKSLGNVIDPLDVIYGISLQGLHNQLLNSNLDPSEVEKAKEGQKADFPAGI
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pF1KA1 PECGTDALRFTLCSHGVQAGDLHLSVSEVQSCRHFCNKIWNALRFILNALGEKFVPQP-A
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XP_016 PECGTDALRFGLCAYMSQGRDINLDVNRILGYRHFCNKLWNATKFALRGLGKGFVPSPTS
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pF1KA1 EELSPSSPMDAWILSRLALAAQECERGFLTRELSLVTHALHHFWLHNLCDVYLEAVKPVL
. . : .: :: :::. :.. ..:: . .. :: : . :::..::::::: .::::
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pF1KA1 WHSPRPLGP--PQVLFSCADLGLRLLAPLMPFLAEELWQRLPPR-PGCPPAPSISVAPYP
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. .:. :.:..: :: ::.: : : :: .....::::::: .: : :.: .
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pF1KA1 SPEL
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: :: :..:: : . . .....:.::: :.::. :: .:. .. . .: :
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1060
pF1KA1 SPEL
>>NP_060530 (OMIM: 612801,616007) isoleucine--tRNA ligas (1012 aa)
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]