FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1901, 1258 aa 1>>>pF1KA1901 1258 - 1258 aa - 1258 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9281+/-0.00152; mu= -3.6524+/- 0.089 mean_var=368.4039+/-79.922, 0's: 0 Z-trim(108.6): 669 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.066821 statistics sampled from 9539 (10293) to 9539 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16 Scan time: 4.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258) 8239 810.2 0 CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 4788 477.5 9e-134 CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 4788 477.5 9.1e-134 CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242) 4624 461.7 5.3e-129 CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286) 4583 457.7 8.5e-128 CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 1266 137.7 9.9e-32 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MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH :.:: .. ::.:.:::: :.:. :... ::::::. .: .:.: :..:: .: .::: CCDS31 MDKYDVIKAIGQGAFGKAYLAKGKSDSKHCVIKEINFEKMPIQEKEASKKEVILLEKMKH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH :::: . .::.::: :.:::.::.::::.:::: :.::::.::::: ::::: :.:::.: CCDS31 PNIVAFFNSFQENGRLFIVMEYCDGGDLMKRINRQRGVLFSEDQILGWFVQISLGLKHIH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 DRKILHRDIKSQNIFLTKDGTV-QLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP ::::::::::.:::::.:.: : .:::::::::::...::::::::::::::::::.::: CCDS31 DRKILHRDIKAQNIFLSKNGMVAKLGDFGIARVLNNSMELARTCIGTPYYLSPEICQNKP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF ::::.:::.::::::::::::: ::......::::: .. : :.: .: .:.::.:::: CCDS31 YNNKTDIWSLGCVLYELCTLKHPFEGNNLQQLVLKICQAHFAPISPGFSRELHSLISQLF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 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CCDS31 QVSPRDRPSINSILKRPFLENLIPKYLTPEVIQEEFSHMLICRAGA---PASRHAGKVVQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 QNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHEKKP---LQKHKQAHQTPEKRVNT-- . .:. . : : .. ..:. :. . . .: .: :: .. .. . .. . CCDS31 KCKIQKVRFQGKCPPRSRISVPI--KRNAILHRNEWRPPAGAQKARSIKMIERPKIAAVC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 GEERRKISEEAARKRR-----LEFIEKE---------KKQKDQIISLMKAEQMKRQEKER :. .. .:: . : .: . .. : :: ..:. . . CCDS31 GHYDYYYAQLDMLRRRAHKPSYHPIPQENTGVEDYGQETRHGPSPSQWPAEYLQRKFEAQ 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 LERINRAREQGWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYEHYHAIFDQMQQQR ... .. : : :: . . . . ..: . . : . . . . :... : CCDS31 QYKLKVEKQLGLRPS-SAEPNYNQRQELRSNGEEPRFQELPFRKNEMKEQEYWKQLEEIR 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 AE-DNEAKWKREIYGRGLPERGILPGVRPGFPYGAAGHHHFPDADDIRKTLKRLKAVSKQ . :. : :. .:: ::.. . .:. . : . . . . CCDS31 QQYHNDMKEIRKKMGRE-PEEN-----------SKISHKTY---------LVKKSNLPVH 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 ANANRQKGQLAVERAKQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHMVYLARLRQIRLQNFNE----R .:.. .. . .: . . : . . .. :.:.:::: .: . CCDS31 QDASEGEAPVQMEFRSCCPGWSAMARSWLTATSASQD---IEKDLKQMRLQNTKESKNPE 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KA1 QQIKAKLRGEKKEANHSEGQEGSEEADMRRKKIESLKAHANARAAVLKEQLERKRKEAYE :. ::: .: : : : .. :.: ..... .. .. . .: . . :: . CCDS31 QKYKAK-KGVKFEINLDKCI--SDENILQEEEAMDIPNETLTFEDGMKFKEYECVKEHGD 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 pF1KA1 REKKVWEE-HLVAKGVKSSDVSPPLGQHE-TGGSPSKQ-QMRSVISVTSALKEVGVDSSL :..:. : : ... :. .... ::.:. :: .: ..::. .: :: CCDS31 YTDKAFEKLHCPEAGFSTQTVAAVGNRRQWDGGAPQTLLQMMAVADITSTCP-TGPDSES 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 TDTRETSEEMQKTNNAISSKREILRRLNENLKAQEDEKGKQNLSDTFEINVHEDAKEHEK CCDS31 VLSVSRQEGKTKDPYSPVLILM 690 700 >>CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 (506 aa) initn: 1103 init1: 985 opt: 1088 Z-score: 592.3 bits: 120.5 E(32554): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 1088; 55.3% identity (84.6% similar) in 273 aa overlap (1-273:1-272) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH :. :. :. :::::::.:.::. .......::: . . : .. ..::.:...::.::: CCDS73 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPK-SFSNTQNSRKEAVLLAKMKH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH :::: ..:::: .: :::::.::.::::...:. ::: :: ::.::.::.:.::...:.: CCDS73 PNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIH 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 DRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPY ...:::::::.:::::..: :.::::: ::.:.. . .: : .:::::. ::: :: :: CCDS73 KKRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPY 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KA1 NNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFK :::::::.:::.::::::::: :.:.: :::.::. .: . :. ::::.:. ::.:.:: CCDS73 NNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KA1 RNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSI ::: :::....: .:..:. ..: : :..: : CCDS73 RNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEIKNSKHNTPRKKTNPSRIR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 SVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERRKISE CCDS73 IALGNEASTVQEEEQDRKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLH 300 310 320 330 340 350 >>CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 (841 aa) initn: 797 init1: 756 opt: 979 Z-score: 532.6 bits: 110.1 E(32554): 2.4e-23 Smith-Waterman score: 981; 28.6% identity (60.4% similar) in 782 aa overlap (1-751:3-743) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANM . : :. .:.::.:.. ::: .::.:::::..:. ::.::. ...:. .:... CCDS28 MPLAAYCYLRVVGKGSYGEVTLVKHRRDGKQYVIKKLNLRNASSRERRAAEQEAQLLSQL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 KHPNIVQYRESFEE-NGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALK :::::: :.::.: .: ::::: .::::::..... ::: :. :.:...::::: .::. CCDS28 KHPNIVTYKESWEGGDGLLYIVMGFCEGGDLYRKLKEQKGQLLPENQVVEWFVQIAMALQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 HVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICEN ..:...:::::.:.::.:::. . ...::.::::::.. ..: : ::::::.:::. : CCDS28 YLHEKHILHRDLKTQNVFLTRTNIIKVGDLGIARVLENHCDMASTLIGTPYYMSPELFSN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 KPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQ :::: :::.::::: .::. ::::::.: .:..:: .:: :..::. :: .: :. CCDS28 KPYNYKSDVWALGCCVYEMATLKHAFNAKDMNSLVYRIIEGKLPPMPRDYSPELAELIRT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 LFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFG-SQPIPAKRPASG .... :..:::: :::.. .: ..: :: : :. : : :: : .:: CCDS28 MLSKRPEERPSVRSILRQPYIKRQISFFLEATKIKTS---KNNIKNGDSQSKPFATVVSG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 Q--NSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKK-LHEKKPLQKHKQAHQTPEK-RVNTG . .. :. : ... ... : .:. : : ..:: . . ..: . ...: CCDS28 EAESNHEVIHPQPLSSEGSQTYI------MGEGKCLSQEKP--RASGLLKSPASLKAHTC 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KA1 EERRKISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQMKR-----QEKERLERINRAREQ .. . . : : ... : .:.. . . :.. : .: . :....:. CCDS28 KQDLSNTTELATISSVNIDILPAKGRDSVSDGFVQENQPRYLDASNELGGICSISQVEEE 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 GWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYEHYHAIFDQMQQQRAEDNEAKW-- .. ..... : : . :.. . . : . . ...:. .:. CCDS28 MLQDNTKSSAQPENLIP-------MWSSDIVTGEKNEPVKPLQPLIKEQKPKDQSLALSP 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 KREIYGRGLPERGI-LPGVR--PGFPYGAAG----HHHFPDADDIRKTLKRLKAVSKQAN : : : : . .. : : :. .:: :: : . ... . . . CCDS28 KLECSGTILAHSNLRLLGSSDSPASASRVAGITGVCHHAQDQVAGECIIEKQGRIHPDLQ 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 ANRQKGQLAVERAKQVEEFLQRKREAMQNKARAEGHMVYLARLRQIRLQNFNERQQIKAK . . .. .. : .. :..:: :.. :.: ::.: . : :. . CCDS28 PHNSGSEPSLSRQRR-----QKRRE--QTEHRGEK--------RQVRRDLFAF-QESPPR 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KA1 LRGEKKEANHSEGQEGSEEADMRRKKIESLKAHANARAAVLKEQLERKRKEAYEREKKVW . . ... . ..::. .:. . . . ...:.. .. . .: . .:. : CCDS28 FLPSHPIVGKVDVTSTQKEAENQRRVVTG--SVSSSRSSEMSSSKDRPLSARERRRLKQS 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 pF1KA1 EEHLVAKG--VKSSDVS---PPLGQHETGGSPSKQQMRSVISVTSALKEVG------VDS .:.. ..: :.....: : :.: :... . : :::. :.. ..: CCDS28 QEEMSSSGPSVRKASLSVAGPGKPQEEDQPLPARR-LSSDCSVTQERKQIHCLSEDELSS 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 SLTDTRETSEEMQKTNNAISSKREILRRLNENLKAQEDEKGKQNLSDTFEINVHEDAKEH : ..: ... .. . .. . ... ....:: . .:.. :. : . : : CCDS28 STSSTDKSDGDYGEGKGQTNEINALVQLMTQTLKLD----SKESCEDVPVANPVSEFKLH 690 700 710 720 730 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 EKEKSVSSDRKKWEAGGQLVIPLDELTLDTSFSTTERHTVGEVIKLGPNGSPRRAWGKSP .: . CCDS28 RKYRDTLILHGKVAEEAEEIHFKELPSAIMPGSEKIRRLVEVLRTDVIRGLGVQLLEQVY 740 750 760 770 780 790 >>CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 (692 aa) initn: 742 init1: 742 opt: 808 Z-score: 444.6 bits: 93.6 E(32554): 1.9e-18 Smith-Waterman score: 808; 48.4% identity (77.3% similar) in 256 aa overlap (1-255:1-255) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH :::: :.. .:.:.:: . : : . .::.: . .:...::. .. : :: ..: CCDS32 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH ::...: :.: :. .:.:.:.: :: : . :. . . :..:. :: .:::: :::.::: CCDS32 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 DRKILHRDIKSQNIFLTKDG-TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP . :::::.:.:::.: : .:..:::::...:.: . : : .::: :.:::.::.:: CCDS32 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF ::.:::::::::::::: .::.::::... :::::.::.: :.: .:: .::.:: .:. CCDS32 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 KRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNS . .: .:: .. :. . CCDS32 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP 240 250 260 270 280 290 >>CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 (979 aa) initn: 695 init1: 695 opt: 754 Z-score: 414.5 bits: 88.5 E(32554): 9.1e-17 Smith-Waterman score: 754; 42.3% identity (75.0% similar) in 260 aa overlap (4-261:52-311) 10 20 30 pF1KA1 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIK :. .. .:.:.::.: : . ::: : : CCDS98 SGGCGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWK 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 EINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRIN :....:.: :::... :...:: ..: ::. : . : .: .: : ..::.::.:. .: CCDS98 EVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKIL 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL :: ::.:.... .. :: :.. .: :::::::. :::::: . ..:::.:.:. : CCDS98 RQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVL :: .:.: .:::::.:::.:.. :: ::::::.:::..:: :::..:.: . :: . CCDS98 NSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCV 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 KIISG--SFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLI ::..: .. : .:: .: ..: . . ..:..::... .:.. .. :: CCDS98 KIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTL 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 AEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHE CCDS98 LNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNTHF 330 340 350 360 370 380 1258 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 11:24:12 2016 done: Thu Nov 3 11:24:13 2016 Total Scan time: 4.560 Total Display time: 0.450 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]