Result of FASTA (ccds) for pF1KA1909
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1909, 1271 aa
  1>>>pF1KA1909 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6259+/- 0.001; mu= 8.7828+/- 0.061
 mean_var=197.5471+/-39.797, 0's: 0 Z-trim(111.9): 53  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.091251
 statistics sampled from 12715 (12762) to 12715 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.392), width:  16
 Scan time:  6.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5     (1271) 8578 1142.8       0
CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16      (1110) 1380 195.2 8.1e-49
CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16      (1191) 1380 195.2 8.6e-49
CCDS32041.1 ARHGEF40 gene_id:55701|Hs108|chr14     (1519)  903 132.5 8.4e-30
CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5            (3097)  715 107.9 4.1e-22
CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3          (1654)  675 102.5 9.7e-21
CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3           (1663)  675 102.5 9.7e-21
CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12     ( 580)  664 100.7 1.2e-20
CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12    ( 619)  664 100.7 1.2e-20
CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3           (1289)  640 97.8 1.9e-19
CCDS33467.1 KIAA1755 gene_id:85449|Hs108|chr20     (1200)  607 93.4 3.7e-18
CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13        ( 984)  490 78.0 1.4e-13
CCDS9527.3 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13         (1123)  490 78.0 1.5e-13
CCDS45070.2 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13        (1125)  490 78.0 1.5e-13
CCDS55514.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 821)  462 74.2 1.5e-12
CCDS55515.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 860)  462 74.2 1.6e-12
CCDS14667.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 925)  462 74.3 1.7e-12
CCDS55516.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 941)  462 74.3 1.7e-12
CCDS48175.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           ( 985)  462 74.3 1.8e-12
CCDS55517.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX           (1001)  462 74.3 1.8e-12


>>CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5          (1271 aa)
 initn: 8578 init1: 8578 opt: 8578  Z-score: 6110.3  bits: 1142.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8578; 99.7% identity (99.8% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEALRNPMPLGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDPQQTPSLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEALRNPMPLGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDPQQTPSLEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 ERHTPSRTGPGAAGRTLPRRSRSWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERHTPSRTGPGAAGRTLPRRSRSWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 TPNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 DFPSQVPKQVLDVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DFPSQVPKQVLDVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 PDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 IFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRREE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 LGTEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSCQKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGTEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSCQKGL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 QLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAVVSQAECREGELARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAVVSQAECREGELARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEAC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 PSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLRLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLRLEE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 ALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 LLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQ
       :::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLCGQDGETLRPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 KKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 SRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 PQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 KPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 GQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 HVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS34 HVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRRKSQD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 TYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDC
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 AVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSS
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVISDRAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 SQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270 
pF1KA1 PAVLLSRTRQA
       :::::::::::
CCDS34 PAVLLSRTRQA
             1270 

>>CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16           (1110 aa)
 initn: 1949 init1: 668 opt: 1380  Z-score: 989.9  bits: 195.2 E(32554): 8.1e-49
Smith-Waterman score: 1920; 36.6% identity (60.7% similar) in 1142 aa overlap (152-1256:41-1070)

             130       140       150       160       170           
pF1KA1 PNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQ-EGWP----
                                     .: ..: ::   ::   . :. .: :    
CCDS45 SPDSQGHATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDP-GPPRPPAGATQDEELQGSPLSRK
               20        30        40         50        60         

           180       190           200                  210        
pF1KA1 ---PGTGDFPSQVPKQVLDVSQELLQ----SGVVTL--P---------GTRDRHGRAVVQ
          : ..:  ... . ... :. : .    ::: .:  :         :::: .::::. 
CCDS45 FQLPPAADESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPSGVESLLCPMSSHLSLAQGTRDVQGRAVLL
      70        80        90       100       110       120         

      220       230       240       250       260       270        
pF1KA1 VRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGL
       . ..:  : . . :  :: :::::..:::: ::. :::.::::::    . .. ..:: :
CCDS45 LCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLRSIPRPEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQL
     130       140       150       160       170       180         

      280       290       300       310       320       330        
pF1KA1 QNNTSPIIHSILLLVDKESAFRPDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYS
       :. .   ....::.    :..  .  . .: : . : ...   . .  : ..: :..:: 
CCDS45 QEAAPGAVYQVLLV---GSTLLKEVPSGLQLEQLPS-QSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYC
     190       200          210       220        230       240     

      340       350       360       370       380       390        
pF1KA1 HGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLE
       :  :. ::.::: .  ::. :  .::... :...   :    ::..:..: :..:. ::.
CCDS45 HQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQGAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLD
         250       260       270       280       290       300     

      400       410         420        430       440       450     
pF1KA1 DPLLVSLRLEGGTVLARLRRE--ELG-TEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRL
       .: :. :. .::  :. :..:  :.  . : : ... :  ::::::  .:.:.: ::.:.
CCDS45 SPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVTLSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRI
         310       320       330       340       350       360     

         460       470          480       490       500         510
pF1KA1 QQLEHLRELASLLEGNDQQSC---QKGLQLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAV--VSQAEC
       : :: .. : .   :  :      : :    .:  . . .:. . . ... .  :.: . 
CCDS45 QALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQVGWPALEEAGEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQV
         370       380       390       400       410       420     

              520       530        540       550       560         
pF1KA1 REGELARWTRSSELCETVSSW-MGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGV
       :.::        .. . ...:  . :::   :..     ::.   : . . :.     . 
CCDS45 RQGE--------KFLQPLTGWEAAELDP---PGARFLA-LRAQLTEFSRALAQRCQRLAD
                 430       440          450        460       470   

     570         580        590         600       610       620    
pF1KA1 A--VLKPHALGKPWASQ-QDLWLQYPQTR--LRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERA
       :  ...    .  :: . : .  .  : :  . :..   . .  :.:::       : : 
CCDS45 AERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPGVVLQQLQLHWTRHPDLPP------AHFRK
           480       490       500       510       520             

          630       640       650       660       670       680    
pF1KA1 QEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLL
       . :.             .: :.    :      .:   : ::         :: . :   
CCDS45 MWALA------------TGLGSEAIRQECRWAWAR---C-QDT------WLALDQKLEAS
       530                   540       550                 560     

          690       700       710       720       730       740    
pF1KA1 RGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQ
         :: .:.:      .: : :.    . . :  ::    ..:. ::.    .:  . .:.
CCDS45 LKLPPVGST------ASLCVSQ----VPAAP-AHPP---LRKAYSFDRNLGQSLSEPACH
         570             580            590          600       610 

          750       760       770       780       790       800    
pF1KA1 PDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSS
         :..          :.:. .. :   .: .  . :    .::.   :.  : :.    .
CCDS45 CHHAA----------TIAACRR-P---EAGGGALPQ----ASPTVPPPGSSDPRSL---N
                       620           630           640          650

          810       820       830       840       850       860    
pF1KA1 RLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQ
       ::. ..:::.::::::.: : :...:::::..: :.::::::..  .:::::::.::: .
CCDS45 RLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCH
              660       670       680       690       700       710

          870       880       890       900       910       920    
pF1KA1 HFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELG
        :::::: : . :  :. .::::. :::::..::::::.::::.::.:..::::::. ::
CCDS45 FFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALG
              720       730       740       750       760       770

          930       940       950       960       970       980    
pF1KA1 DKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDL
       :..:::::::.:.::..:::::::.: .  .:: .  :::. :: :. .: :::::::::
CCDS45 DHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELAR--ACG-GPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDL
              780       790         800        810       820       

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KA1 LAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVY
       ::::::.::::::::::::  .:::.:  ::.: .:..::::.:.:::: ..   . :..
CCDS45 LAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFVVRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTF
       830       840       850       860       870       880       

         1050      1060      1070      1080      1090      1100    
pF1KA1 LYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILW
        ::.::: :..:.::  :.:.:::::::::: :..::..:::::  .:.:::  :...::
CCDS45 AYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEIWFRRR-KARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLLW
       890       900       910        920       930       940      

         1110      1120      1130      1140      1150      1160    
pF1KA1 RQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKG
       :::....:.:. ::.:::.::. : :.               ::.  ...::. . ..: 
CCDS45 RQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRDI---------------APSEEAINDRTVNYVLKC
        950       960       970                      980       990 

         1170      1180      1190      1200      1210      1220    
pF1KA1 TESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLW
        : . :.: ::      ::: .    .. :..  ..  : :.::::.: .  .::  :: 
CCDS45 REVRSRASIAV------APFDHDSLYLGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLR
            1000            1010      1020      1030      1040     

         1230      1240      1250      1260      1270              
pF1KA1 SPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGAPAVLLSRTRQA             
        : .  .        ::   : : : : : ..                            
CCDS45 CPLYPSFP-------EEAALEAEAELGGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQ
        1050             1060      1070      1080      1090        

CCDS45 ALGRGLEDLPCV
     1100      1110

>>CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16           (1191 aa)
 initn: 2005 init1: 668 opt: 1380  Z-score: 989.4  bits: 195.2 E(32554): 8.6e-49
Smith-Waterman score: 2011; 36.0% identity (59.5% similar) in 1236 aa overlap (40-1256:47-1151)

      10        20        30        40        50          60       
pF1KA1 LGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGPRGDP--QQTPSLEKERHTPSR
                                     :  .  .:   :   : .:  .: .  :. 
CCDS32 HATDWRFAVCSFRDAWEEEEPASQMHVKDPGPPRPPAGATQDEELQGSPLSRKFQLPPAA
         20        30        40        50        60        70      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KA1 TGPGAAGRTLPRRSRSWERAPRSSRGAQAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQAVGTPNCVPV
          : : :   . :    ..:  : :...  :  : : . ..      :..  ::.   :
CCDS32 DESGDAQRGTVESSSVLSEGPGPS-GVESLLCPMSSHLSLAQ------GES-DTPGVGLV
         80        90       100        110             120         

       130       140       150       160       170       180       
pF1KA1 EGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGSLHCHNPSGPSDVPARQPHPEQEGWPPGTGDFPSQVP
         :: ..      : . ...:        : : .: :  .     :. : :.: .:.  :
CCDS32 GDPGPSRAMPSGLSPGALDSD--------PVGLGD-PLSEISKLLEAAPSGSG-LPK--P
      130       140               150        160       170         

       190          200       210       220       230       240    
pF1KA1 KQVL---DVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAVVQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFH
        . :   :.  ::: ::..::::::: .::::. . ..:  : . . :  :: :::::..
CCDS32 ADCLLAQDLCWELLASGMATLPGTRDVQGRAVLLLCAHSPAWLQSECSSQELIRLLLYLR
        180       190       200       210       220       230      

          250       260       270       280       290       300    
pF1KA1 SIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPAAPAVSQALSGLQNNTSPIIHSILLLVDKESAFRPDKD
       :::: ::. :::.::::::    . .. ..:: ::. .   ....::.    :..  .  
CCDS32 SIPRPEVQALGLTVLVDARICAPSSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLV---GSTLLKEVP
        240       250       260       270       280          290   

          310       320       330       340       350       360    
pF1KA1 AIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGSFPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQ
       . .: : . : ...   . .  : ..: :..:: :  :. ::.::: .  ::. :  .::
CCDS32 SGLQLEQLPS-QSLLTHIPTAGLPTSLGGGLPYCHQAWLDFRRRLEALLQNCQAACALLQ
           300        310       320       330       340       350  

          370       380       390       400       410         420  
pF1KA1 NSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMKLVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRRE--ELG
       ... :...   :    ::..:..: :..:. ::..: :. :. .::  :. :..:  :. 
CCDS32 GAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEVPEVT
            360       370       380       390       400       410  

             430       440       450       460       470           
pF1KA1 -TEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNRLQQLEHLRELASLLEGNDQQSC---QK
        . : : ... :  ::::::  .:.:.: ::.:.: :: .. : .   :  :      : 
CCDS32 LSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVWLQQV
            420       430       440       450       460       470  

      480       490       500         510       520       530      
pF1KA1 GLQLAKENPQRTEEMVQDFRRGLSAV--VSQAECREGELARWTRSSELCETVSSW-MGPL
       :    .:  . . .:. . . ... .  :.: . :.::        .. . ...:  . :
CCDS32 GWPALEEAGEPSLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGE--------KFLQPLTGWEAAEL
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         540       550       560       570         580        590  
pF1KA1 DPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAAEAFPGAGVA--VLKPHALGKPWASQ-QDLWLQYP
       ::   :..     ::.   : . . :.     . :  ...    .  :: . : .  .  
CCDS32 DP---PGARFLA-LRAQLTEFSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELE
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pF1KA1 QTR--LRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPA
       : :  . :..   . .  :.::      : : : . :.             .: :.    
CCDS32 QERPGVVLQQLQLHWTRHPDLP------PAHFRKMWALA------------TGLGSEAIR
              590       600             610                   620  

              660       670       680       690       700       710
pF1KA1 QPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQT
       :      .:   : ::         :: . :     :: .:.:      .: : :.    
CCDS32 QECRWAWAR---C-QDT------WLALDQKLEASLKLPPVGST------ASLCVSQ----
            630                 640       650             660      

              720       730       740       750       760       770
pF1KA1 LASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLW
       . . :  ::    ..:. ::.    .:  . .:.  :..          :.:. .. :  
CCDS32 VPAAP-AHPP---LRKAYSFDRNLGQSLSEPACHCHHAA----------TIAACRR-P--
             670          680       690                 700        

              780       790       800       810       820       830
pF1KA1 QHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDN
        .: .  . :    .::.   :.  : :.    .::. ..:::.::::::.: : :...:
CCDS32 -EAGGGALPQ----ASPTVPPPGSSDPRSL---NRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMEN
          710           720       730          740       750       

              840       850       860       870       880       890
pF1KA1 YFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQ
       ::::..: :.::::::..  .:::::::.::: . :::::: : . :  :. .::::. :
CCDS32 YFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEKLRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQ
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              900       910       920       930       940       950
pF1KA1 FGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDL
       ::::..::::::.::::.::.:..::::::. :::..:::::::.:.::..:::::::.:
CCDS32 FGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFKDKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQEL
       820       830       840       850       860       870       

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KA1 LKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFI
        .  .:: .  :::. :: :. .: :::::::::::::::.::::::::::::  .:::.
CCDS32 AR--ACG-GPTQELSALREAQSLVHFQLRHGNDLLAMDAIQGCDVNLKEQGQLVRQDEFV
         880        890       900       910       920       930    

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KA1 VCCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEI
       :  ::.: .:..::::.:.:::: ..   . :.. ::.::: :..:.::  :.:.:::::
CCDS32 VRTGRHKSVRRIFLFEELLLFSKPRHGPTGVDTFAYKRSFKMADLGLTECCGNSNLRFEI
          940       950       960       970       980       990    

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KA1 WFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMD
       ::::: :..::..:::::  .:.:::  :...:::::....:.:. ::.:::.::. : :
CCDS32 WFRRR-KARDTFVLQASSLAIKQAWTADISHLLWRQAVHNKEVRMAEMVSMGVGNKAFRD
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

             1140      1150      1160      1170      1180      1190
pF1KA1 VKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHST
       .               ::.  ...::. . ..:  : . :.: ::      ::: .    
CCDS32 I---------------APSEEAINDRTVNYVLKCREVRSRASIAV------APFDHDSLY
                         1060      1070      1080            1090  

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KA1 ISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELET
       .. :..  ..  : :.::::.: .  .::  ::  : .  .        ::   : : : 
CCDS32 LGASNSLPGDPASCSVLGSLNLHLYRDPALLGLRCPLYPSFP-------EEAALEAEAEL
           1100      1110      1120      1130             1140     

             1260      1270                          
pF1KA1 GTQAAVCEGAPAVLLSRTRQA                         
       : : ..                                        
CCDS32 GGQPSLTAEDSEISSQCPSASGSSGSDSSCVSGQALGRGLEDLPCV
        1150      1160      1170      1180      1190 

>>CCDS32041.1 ARHGEF40 gene_id:55701|Hs108|chr14          (1519 aa)
 initn: 1092 init1: 454 opt: 903  Z-score: 648.6  bits: 132.5 E(32554): 8.4e-30
Smith-Waterman score: 1370; 30.7% identity (55.0% similar) in 1193 aa overlap (38-1183:344-1432)

        10        20        30        40         50        60      
pF1KA1 MPLGSSEEALGDLACSSLTGASRDLGTGAVASGTQEETSGP-RGDPQQTPSLEKERHTPS
                                     :::.     :  ::      . :    :: 
CCDS32 ASPESPPGAEAVPEAAVLEVSEPPAEAVGEASGSCPLRPGELRGGGGGGQGAEGPPGTPR
           320       330       340       350       360       370   

         70               80        90         100       110       
pF1KA1 RTGPG------AAGR-TLPRRSRSWERAPRSSRGA--QAAACHTSHHSAGSRPGGHLGGQ
       ::: :      :::: .: : . :   .: ... :  : :  .    :  . :  ::  .
CCDS32 RTGKGNRRKKRAAGRGALSRGGDSAPLSPGDKEDASHQEALGNLPSPSEHKLPECHLVKE
           380       390       400       410       420       430   

          120       130       140       150                 160    
pF1KA1 AV---GTPNCVPVEGPGCTKEEDVLASSACVSTDGGS---------LHCH-NPSGPSDVP
            : :.  : :     ..:  : : ::  :. :.         : :  . .::    
CCDS32 EYEGSGKPESEPKELKTAGEKEPQL-SEACGPTEEGAGERELEGPGLLCMAGHTGPEGPL
           440       450        460       470       480       490  

          170       180       190               200       210      
pF1KA1 ARQPHPEQEGWPPGTGDFPSQVPKQVL--------DVSQELLQSGVVTLPGTRDRHGRAV
       .  : :  :    : ::   ..:...:        ::. .:. :: . : :  :. :::.
CCDS32 SDTPTPPLETVQEGKGD---NIPEEALAVSVSDHPDVAWDLMASGFLILTGGVDQSGRAL
            500          510       520       530       540         

        220       230       240       250       260        270     
pF1KA1 VQVRTRSLLWTREHSSCAELTRLLLYFHSIPRKEVRDLGLVVLVDARRSPA-APAVSQAL
       . . :      .   :   :.  : :.::. : ... ::: ::.: :..:   ::.  ::
CCDS32 LTI-TPPCPPEEPPPSRDTLNTTLHYLHSLLRPDLQTLGLSVLLDLRQAPPLPPALIPAL
     550        560       570       580       590       600        

         280        290       300       310       320       330    
pF1KA1 SGLQNNTSP-IIHSILLLVDKESAFRPDKDAIIQCEVVSSLKAVHKFVDSCQLTADLDGS
       : ::.. .: ... .:.:.  .    : .   .:   : : . ... .   .:  .: : 
CCDS32 SQLQDSGDPPLVQRLLILIHDDL---PTELCGFQGAEVLSENDLKRVAKPEELQWELGGH
      610       620       630          640       650       660     

          340       350       360       370       380       390    
pF1KA1 FPYSHGDWICFRQRLEHFAANCEEAIIFLQNSFCSLNTHRTPRTAQEVAELIDQHETMMK
          : . :. ..:.. ..   :. ..  .....  :.    :    :  : . . . ..:
CCDS32 RDPSPSHWVEIHQEVVRLCRLCQGVLGSVRQAIEELEGAAEP----EEEEAVGMPKPLQK
         670       680       690       700           710       720 

          400       410       420       430       440       450    
pF1KA1 LVLEDPLLVSLRLEGGTVLARLRREELGTEDSRDTLEAATSLYDRVDEEVHRLVLTSNNR
        :: :: :..:. .::..: :::    .: .:.   .. ..::..::: .:.::  :: .
CCDS32 -VLADPRLTALQRDGGAILMRLR----STPSSKLEGQGPATLYQEVDEAIHQLVRLSNLH
              730       740           750       760       770      

          460       470       480        490          500          
pF1KA1 LQQLEHLRELASLLEGNDQQSCQKGLQLAK-ENPQRTEEMVQDFR---RGLSAVVSQ--A
       .:: :. . :  : .  .  :     :::.   :  :   .:. .   :..:: :..  :
CCDS32 VQQQEQRQCLRRLQQVLQWLSGPGEEQLASFAMPGDTLSALQETELRFRAFSAEVQERLA
        780       790       800       810       820       830      

      510        520       530       540       550          560    
pF1KA1 ECREG-ELARWTRSSELCETVSSWMGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQ---EATSVAAEAF
       . ::.  : . . :... .   . .  ..     .  . . ... :.   :. .  : : 
CCDS32 QAREALALEENATSQKVLDIFEQRLEQVESGLHRALRLQRFFQQAHEWVDEGFARLAGAG
        840       850       860       870       880       890      

          570       580       590         600        610       620 
pF1KA1 PGAGVAVLKPHALGKPWASQQDLWLQYPQTRLRL--EEALSEAAP-DPSLPPLAQSPPKH
       ::   :::   :: .    .   . ..    : :    :: : .  .     : .   .:
CCDS32 PGRE-AVLAALALRRAPEPSAGTFQEMRALALDLGSPAALREWGRCQARCQELERRIQQH
        900        910       920       930       940       950     

             630       640       650       660       670       680 
pF1KA1 ERAQEAMRRHQKPPSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPL
         ..::  :  .     ...:::. : : .:                  .:.: .:  : 
CCDS32 V-GEEASPRGYRRRRADGASSGGAQWGPRSP------------------SPSLSSLLLPS
          960       970       980                         990      

             690       700       710       720       730       740 
pF1KA1 SLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRD
       :     ::   . .:      ::  :                    ...:   :. .:. 
CCDS32 S-----PGPRPAPSH------CSLAPCG------------------EDYEEEGPELAPEA
            1000            1010                        1020       

             750       760       770       780       790        800
pF1KA1 SCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLH-PAEEDGRQQ
         .: . .:. .::::::: ....     .:.    . ..:. ..: :.  :  :  :. 
CCDS32 EGRPPR-AVLIRGLEVTSTEVVDRTCSPREHVL---LGRARGPDGPWGVGTPRMERKRSI
      1030       1040      1050         1060      1070      1080   

              810       820       830       840       850       860
pF1KA1 VGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHD
        ...::   ..:.:: :..:.  :.  .    ::.     :. :::   . ..  :.:..
CCDS32 SAQQRL---VSELIACEQDYVATLSEPVPPPGPELT----PE-LRGTWAAALSARERLRS
             1090      1100      1110           1120      1130     

              870       880       890       900       910       920
pF1KA1 FHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQ
       ::. ::::::. :   :: .:  :::: .::..:. : :.. . .  :.. .   ..  .
CCDS32 FHRTHFLRELQGCATHPLRIGACFLRHGDQFSLYAQYVKHRHKLENGLAALSP--LSKGS
        1140      1150      1160      1170      1180        1190   

              930       940       950       960       970       980
pF1KA1 RELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRH
        : :  .  :  : .:......:. ::..::.::  :   ..:   : ::  ..  :  .
CCDS32 MEAGPYLPRA--LQQPLEQLTRYGRLLEELLREA--GPELSSECRALGAAVQLLREQEAR
          1200        1210      1220        1230      1240         

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KA1 GNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGS
       : ::::..:.:::...:::::::  :: : : ::::: :::::::: :.:::: .  ::.
CCDS32 GRDLLAVEAVRGCEIDLKEQGQLLHRDPFTVICGRKKCLRHVFLFEHLLLFSKLKGPEGG
    1250      1260      1270      1280      1290      1300         

             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KA1 HDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIG
        ....:::.::::..:.:::.::::: ::.::::: .....: :::.: :.:  ::. :.
CCDS32 SEMFVYKQAFKTADMGLTENIGDSGLCFELWFRRR-RAREAYTLQATSPEIKLKWTSSIA
    1310      1320      1330      1340       1350      1360        

             1110      1120      1130      1140      1150      1160
pF1KA1 RILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDS
       ..::::: ...:::.:.:.::::::.::.:.:                   ....:. ..
CCDS32 QLLWRQAAHNKELRVQQMVSMGIGNKPFLDIK-------------------ALGERTLSA
     1370      1380      1390      1400                            

             1170      1180      1190      1200      1210      1220
pF1KA1 IVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAH
       .. :  .. :.:.:::: .::.:                                     
CCDS32 LLTGRAARTRASVAVSSFEHAGPSLPGLSPGACSLPARVEEEAWDLDVKQISLAPETLDS
    1410      1420      1430      1440      1450      1460         

>>CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5                 (3097 aa)
 initn: 689 init1: 464 opt: 715  Z-score: 510.4  bits: 107.9 E(32554): 4.1e-22
Smith-Waterman score: 776; 28.7% identity (56.3% similar) in 726 aa overlap (553-1249:1733-2413)

            530       540       550       560        570           
pF1KA1 ELCETVSSWMGPLDPEACPSSPVAECLRSCHQEATSVAA-EAFPGAGVAVLKPHALGK--
                                     :... ::.. .: : :.:: :.:: .:   
CCDS38 RSPAAEGLVPCGSLCIAHSRSSMEMEGIFNHKDSLSVSSNDASPPASVASLQPHMIGAQS
           1710      1720      1730      1740      1750      1760  

        580         590       600       610       620       630    
pF1KA1 ---PWASQQDL--WLQYPQTRLRLEEALSEAAPDPSLPPLAQSPPKHERAQEAMRRHQKP
          :    . :  ::  :  ::      : .  :  .  ::.   ::....: .:.    
CCDS38 SPGPKRPGNTLRKWLTSPVRRL------SSGKADGHVKKLAH---KHKKSRE-VRKSADA
           1770      1780            1790         1800       1810  

          640       650       660       670       680       690    
pF1KA1 PSFPSTDSGGGAWEPAQPLSGLPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATT
        :  . ::  .:  : .      ::       .: :. :  .     :   :. . :   
CCDS38 GS--QKDSDDSAATPQDETVEERGR-------NEGLSSGTLSK----SSSSGMQSCGEEE
             1820      1830             1840          1850         

          700       710       720       730       740       750    
pF1KA1 AHLEDSSACSSEPTQTLASRPRKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKG
       .. : ..:    : ... ..   .:...  : .. . .      : .:  :. . . :  
CCDS38 GE-EGADAVPLPPPMAIQQHSLLQPDSQDDKASSRLLVR-----PTSSETPSAAELVSAI
    1860       1870      1880      1890           1900      1910   

           760          770       780       790       800          
pF1KA1 LE-VTSTVATEKK---LPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRH-I
        : : : .: : .   : . :   : :  .  . :  :.  : .:  ... .: . :: .
CCDS38 EELVKSKMALEDRPSSLLVDQGDSSSPSFNPSDNSLLSSSSPIDEMEERKSSSLKRRHYV
          1920      1930      1940      1950      1960      1970   

     810       820       830       840       850       860         
pF1KA1 MAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRE
       . :.. :::.:.: ::::...:.  :..  .:. ..:: ...:::.....:.:.. :: :
CCDS38 LQELVETERDYVRDLGYVVEGYMALMKEDGVPDDMKGKDKIVFGNIHQIYDWHRDFFLGE
          1980      1990      2000      2010      2020      2030   

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA1 LERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDL
       ::.: . :  .:  :..::... ::. : .:::.:. ..: . ..::.: ...:: ...:
CCDS38 LEKCLEDPEKLGSLFVKHERRLHMYIAYCQNKPKSEHIVSEYIDTFFEDLKQRLGHRLQL
          2040      2050      2060      2070      2080      2090   

     930       940       950       960       970       980         
pF1KA1 ASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDA
       .. :..::::. :: :::.:.:: .. .  . .::   ::.::. :.  :. ::.. .  
CCDS38 TDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFLKYSKKASLDTSELE--RAVEVM-CIVPRRCNDMMNVGR
          2100      2110      2120        2130       2140      2150

     990      1000      1010           1020      1030        1040  
pF1KA1 IRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGRKKYL-----RHVFLFEDLILFSKT-QKVEG-SHD
       ..: : ..  ::.:  .: :.:       :     :..::::....::.  .: .: :  
CCDS38 LQGFDGKIVAQGKLLLQDTFLVTDQDAGLLPRCRERRIFLFEQIVIFSEPLDKKKGFSMP
             2160      2170      2180      2190      2200      2210

           1050      1060      1070      1080      1090      1100  
pF1KA1 VYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRI
        .:.:.:.:.. . . ::: ..  .: .   :     .:.::..::  :...:   :..:
CCDS38 GFLFKNSIKVSCLCLEENVENDPCKFAL-TSRTGDVVETFILHSSSPSVRQTWIHEINQI
             2220      2230       2240      2250      2260         

                1110      1120      1130      1140      1150       
pF1KA1 LWRQ-----ALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRV
       :  :     :: :  .. :.  : : :.               .  . :::. .   .  
CCDS38 LENQRNFLNALTS-PIEYQRNHSGGGGGGG-----SGGSGGGGGSGGGGAPSGGSGHSGG
    2270      2280       2290           2300      2310      2320   

      1160      1170      1180      1190      1200      1210       
pF1KA1 PDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSS
       :.:   :. :  :.      :    :  : :  .  ::..::....... :.     :  
CCDS38 PSS-CGGAPSTSRSRP----SRIPQPV-RHHPPVLVSSAASSQAEADKMSGTSTPGPSLP
           2330          2340       2350      2360      2370       

        1220        1230      1240      1250      1260      1270   
pF1KA1 P--AHP--GLWSPAHSPWSSDIRACVEEDEPEPELETGTQAAVCEGAPAVLLSRTRQA  
       :  : :  :  .:.. : ..: ..  .: :: :...                        
CCDS38 PPGAAPEAGPSAPSRRPPGADAEGSEREAEPIPKMKVLESPRKGAANASGSSPDAPAKDA
      2380      2390      2400      2410      2420      2430       

CCDS38 RASLGTLPLGKPRAGAASPLNSPLSSAVPSLGKEPFPPSSPLQKGGSFWSSIPASPASRP
      2440      2450      2460      2470      2480      2490       

>--
 initn: 721 init1: 335 opt: 644  Z-score: 459.9  bits: 98.6 E(32554): 2.7e-19
Smith-Waterman score: 644; 35.2% identity (66.4% similar) in 324 aa overlap (791-1108:1280-1595)

              770       780       790       800       810       820
pF1KA1 VATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREY
                                     :  .:. :.  .. : . ::::.: ::. :
CCDS38 SDSNKSSKSLQLDIIPASIPGSEVKLRDAAHELNEEKRK--SARRKEFIMAELIQTEKAY
    1250      1260      1270      1280        1290      1300       

              830         840       850       860       870        
pF1KA1 IRCLGYVIDNYFPEMER--MDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPL
       .: :   .:.:. ::     ..: :. .:. .::::......::.. ::.:::. .. : 
CCDS38 VRDLRECMDTYLWEMTSGVEEIPPGIVNKELIIFGNMQEIYEFHNNIFLKELEKYEQLPE
      1310      1320      1330      1340      1350      1360       

      880       890       900       910       920       930        
pF1KA1 AVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQ
        ::. :.   ..: ::: : ::::.:  :.  :....: . :.. :   ...:::..:::
CCDS38 DVGHCFVTWADKFQMYVTYCKNKPDSTQLILEHAGSYFDEIQQRHGLANSISSYLIKPVQ
      1370      1380      1390      1400      1410      1420       

      940       950       960       970       980       990        
pF1KA1 RVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLK
       :..:: :::..::   .:   .:.  ::.. .  :.    ...:: . .. ..: : :..
CCDS38 RITKYQLLLKELL---TC-CEEGK--GEIKDGLEVMLSVPKRANDAMHLSMLEGFDENIE
      1430      1440            1450      1460      1470      1480 

     1000      1010          1020      1030      1040      1050    
pF1KA1 EQGQLRCRDEFIV----CCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVEGSHDVYLYKQSFKTAE
        ::.:  .. : :       ::   ::.::::  ..:::  :  .... ::::... :.:
CCDS38 SQGELILQESFQVWDPKTLIRKGRERHLFLFEMSLVFSKEVKDSSGRSKYLYKSKLFTSE
            1490      1500      1510      1520      1530      1540 

         1060      1070      1080      1090      1100      1110    
pF1KA1 IGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQALKSRELR
       .:.::.:  .  .: .:  :   :..  .:.::: : :. :   : ... ....      
CCDS38 LGVTEHVEGDPCKFALWVGRTPTSDNKIVLKASSIENKQDWIKHIREVIQERTIHLKGAL
            1550      1560      1570      1580      1590      1600 

         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KA1 IQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTA
                                                                   
CCDS38 KEPIHIPKTAPATRQKGRRDGEDLDSQGDGSSQPDTISIASRTSQNTLDSDKLSGGCELT
            1610      1620      1630      1640      1650      1660 

>>CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3               (1654 aa)
 initn: 746 init1: 359 opt: 675  Z-score: 485.8  bits: 102.5 E(32554): 9.7e-21
Smith-Waterman score: 675; 32.6% identity (63.6% similar) in 396 aa overlap (776-1162:1245-1630)

         750       760       770       780       790       800     
pF1KA1 DHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSR
                                     :   ..: ..  .. : ..:. :.   :.:
CCDS82 SLRMGKYRYSLEKALGVNTEDNKDLELDIIPASLSDREVKLRDANHEVNEEKRK---SAR
         1220      1230      1240      1250      1260         1270 

          810       820       830         840       850       860  
pF1KA1 LRH-IMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMER--MDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFH
        .. ::::.. ::. :.: :   ...:. ::     ..: :. .:.:.::::.....:::
CCDS82 KKEFIMAELLQTEKAYVRDLHECLETYLWEMTSGVEEIPPGILNKEHIIFGNIQEIYDFH
            1280      1290      1300      1310      1320      1330 

            870       880       890       900       910       920  
pF1KA1 QQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRE
       .. ::.:::. .. :  ::. :.   ..: ::: : ::::.:. :.  :...:: . :..
CCDS82 NNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWADKFQMYVTYCKNKPDSNQLILEHAGTFFDEIQQR
            1340      1350      1360      1370      1380      1390 

            930       940       950       960       970       980  
pF1KA1 LGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGN
        :   ...:::..::::..:: :::..::   .:   .:.  :::. .  :.    ...:
CCDS82 HGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLKELL---TC-CEEGK--GELKDGLEVMLSVPKKAN
            1400      1410      1420            1430      1440     

            990      1000      1010          1020      1030        
pF1KA1 DLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIV----CCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVE
       : . .. ..: : ::  ::.:  .: : :       ::   ::.::::  ..:::  :  
CCDS82 DAMHVSMLEGFDENLDVQGELILQDAFQVWDPKSLIRKGRERHLFLFEISLVFSKEIKDS
        1450      1460      1470      1480      1490      1500     

     1040      1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KA1 GSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDV
       ..:  :.::... :.:.:.::.:  .  .: .:  :  .:..  .:.::. :.:. :   
CCDS82 SGHTKYVYKNKLLTSELGVTEHVEGDPCKFALWSGRTPSSDNKTVLKASNIETKQEWIKN
        1510      1520      1530      1540      1550      1560     

     1100      1110      1120      1130      1140        1150      
pF1KA1 IGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGA--PKCAVMSDR
       : ... .. .. .   ..:  ..        . . :: . :    .::.  :    ...:
CCDS82 IREVIQERIIHLKGA-LKEPLQLPKTPAKQRNNSKRDGVEDIDSQGDGSSQPDTISIASR
        1570      1580       1590      1600      1610      1620    

       1160      1170      1180      1190      1200      1210      
pF1KA1 VPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSS
       . .. :                                                      
CCDS82 TSQNTVDSDKDGNLVPRWHLGPGDPFSTYV                              
         1630      1640      1650                                  

>>CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3                (1663 aa)
 initn: 746 init1: 359 opt: 675  Z-score: 485.8  bits: 102.5 E(32554): 9.7e-21
Smith-Waterman score: 675; 32.6% identity (63.6% similar) in 396 aa overlap (776-1162:1254-1639)

         750       760       770       780       790       800     
pF1KA1 DHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSR
                                     :   ..: ..  .. : ..:. :.   :.:
CCDS30 SLRMGKYRYSLEKALGVNTEDNKDLELDIIPASLSDREVKLRDANHEVNEEKRK---SAR
          1230      1240      1250      1260      1270         1280

          810       820       830         840       850       860  
pF1KA1 LRH-IMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMER--MDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFH
        .. ::::.. ::. :.: :   ...:. ::     ..: :. .:.:.::::.....:::
CCDS30 KKEFIMAELLQTEKAYVRDLHECLETYLWEMTSGVEEIPPGILNKEHIIFGNIQEIYDFH
             1290      1300      1310      1320      1330      1340

            870       880       890       900       910       920  
pF1KA1 QQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRE
       .. ::.:::. .. :  ::. :.   ..: ::: : ::::.:. :.  :...:: . :..
CCDS30 NNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWADKFQMYVTYCKNKPDSNQLILEHAGTFFDEIQQR
             1350      1360      1370      1380      1390      1400

            930       940       950       960       970       980  
pF1KA1 LGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGN
        :   ...:::..::::..:: :::..::   .:   .:.  :::. .  :.    ...:
CCDS30 HGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLKELL---TC-CEEGK--GELKDGLEVMLSVPKKAN
             1410      1420         1430         1440      1450    

            990      1000      1010          1020      1030        
pF1KA1 DLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIV----CCGRKKYLRHVFLFEDLILFSKTQKVE
       : . .. ..: : ::  ::.:  .: : :       ::   ::.::::  ..:::  :  
CCDS30 DAMHVSMLEGFDENLDVQGELILQDAFQVWDPKSLIRKGRERHLFLFEISLVFSKEIKDS
         1460      1470      1480      1490      1500      1510    

     1040      1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KA1 GSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDV
       ..:  :.::... :.:.:.::.:  .  .: .:  :  .:..  .:.::. :.:. :   
CCDS30 SGHTKYVYKNKLLTSELGVTEHVEGDPCKFALWSGRTPSSDNKTVLKASNIETKQEWIKN
         1520      1530      1540      1550      1560      1570    

     1100      1110      1120      1130      1140        1150      
pF1KA1 IGRILWRQALKSRELRIQEMASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGA--PKCAVMSDR
       : ... .. .. .   ..:  ..        . . :: . :    .::.  :    ...:
CCDS30 IREVIQERIIHLKGA-LKEPLQLPKTPAKQRNNSKRDGVEDIDSQGDGSSQPDTISIASR
         1580       1590      1600      1610      1620      1630   

       1160      1170      1180      1190      1200      1210      
pF1KA1 VPDSIVKGTESQMRGSTAVSSSDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSS
       . .. :                                                      
CCDS30 TSQNTVDSDKDGNLVPRWHLGPGDPFSTYV                              
          1640      1650      1660                                 

>>CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12          (580 aa)
 initn: 648 init1: 443 opt: 664  Z-score: 484.4  bits: 100.7 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 683; 28.1% identity (62.2% similar) in 481 aa overlap (686-1148:51-518)

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA1 LPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRP
                                     :: . .. .. : .:. ::  :   ...  
CCDS89 AKCGCCFARGGRESYSIAGSEGSISASAASGLAAPSGPSSGL-SSGPCSPGPPGPVSGLR
               30        40        50        60         70         

         720       730       740       750       760       770     
pF1KA1 RKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARS
       :   ..:   .... :  . ..:: .. . . . . .. :   . ..:  . :      .
CCDS89 RWLDHSKHCLSVET-EADSGQAGPYENWMLEPALATGEELPELTLLTTLLEGP--GDKTQ
      80        90        100       110       120       130        

         780       790       800       810       820       830     
pF1KA1 PPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEM
       ::  . ..::.     :  :. ... .  :  ....:.. ::. :.  :: ....:.  :
CCDS89 PP--EEETLSQA----PESEEEQKKKALERSMYVLSELVETEKMYVDDLGQIVEGYMATM
          140           150       160       170       180       190

         840       850       860       870       880       890     
pF1KA1 ERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYV
         . .:..:::. ...:::.......:...::.::.:: . :  ... :..::... :::
CCDS89 AAQGVPESLRGRDRIVFGNIQQIYEWHRDYFLQELQRCLKDPDWLAQLFIKHERRLHMYV
              200       210       220       230       240       250

         900       910       920       930       940       950     
pF1KA1 IYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEAS
       .: .:::.:. ..:  :...:.. ...:: ...: . :..::::. :: :::.:.::  .
CCDS89 VYCQNKPKSEHVVSEFGDSYFEELRQQLGHRLQLNDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFLKYYN
              260       270       280       290       300       310

         960       970       980       990      1000      1010     
pF1KA1 CGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGR
            :.. ..:. :  :.::  .. ::....  .:: . .:  ::.:  .: : :   .
CCDS89 ---RAGMDTADLEQAVEVMCFVPKRCNDMMTLGRLRGFEGKLTAQGKLLGQDTFWVTEPE
                 320       330       340       350       360       

               1020      1030         1040      1050      1060     
pF1KA1 KKYL-------RHVFLFEDLILFSKTQK--VEG-SHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSG
          :       :.:::::..:.::..    :.: ..  :.::.:.:.. .:.  :.  . 
CCDS89 AGGLLSSRGRERRVFLFEQIIIFSEALGGGVRGGTQPGYVYKNSIKVSCLGLEGNLQGDP
       370       380       390       400       410       420       

        1070      1080      1090      1100           1110          
pF1KA1 LRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQ-----ALKS---RELRIQE
        :: .  :  . . . :.:::..  ...::   ...::  :     ::.:    . : ..
CCDS89 CRFALTSRGPEGGIQRYVLQAADPAISQAWIKHVAQILESQRDFLNALQSPIEYQRRESQ
       430       440       450       460       470       480       

      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KA1 MASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSS
         :.:    : .    : .  : :  :  .:                             
CCDS89 TNSLGRPRGPGVGSPGRIQLGDQAQGSTHTPINGSLPSLLLSPKGEVARALLPLDKQALG
       490       500       510       520       530       540       

      1180      1190      1200      1210      1220      1230       
pF1KA1 SDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRA
                                                                   
CCDS89 DIPQAPHDSPPVSPTPKTPPCQARLAKLDEDEL                           
       550       560       570       580                           

>>CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12         (619 aa)
 initn: 648 init1: 443 opt: 664  Z-score: 484.0  bits: 100.7 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 683; 28.1% identity (62.2% similar) in 481 aa overlap (686-1148:90-557)

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA1 LPGRALLCGQDGEPLGPGLCALWDPLSLLRGLPGAGATTAHLEDSSACSSEPTQTLASRP
                                     :: . .. .. : .:. ::  :   ...  
CCDS44 REHEVLAGALQPESYSIAGSEGSISASAASGLAAPSGPSSGL-SSGPCSPGPPGPVSGLR
      60        70        80        90       100        110        

         720       730       740       750       760       770     
pF1KA1 RKHPQKKMIKKTQSFEIPQPDSGPRDSCQPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARS
       :   ..:   .... :  . ..:: .. . . . . .. :   . ..:  . :      .
CCDS44 RWLDHSKHCLSVET-EADSGQAGPYENWMLEPALATGEELPELTLLTTLLEGP--GDKTQ
      120       130        140       150       160       170       

         780       790       800       810       820       830     
pF1KA1 PPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGSSRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEM
       ::  . ..::.     :  :. ... .  :  ....:.. ::. :.  :: ....:.  :
CCDS44 PP--EEETLSQA----PESEEEQKKKALERSMYVLSELVETEKMYVDDLGQIVEGYMATM
           180           190       200       210       220         

         840       850       860       870       880       890     
pF1KA1 ERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQQHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYV
         . .:..:::. ...:::.......:...::.::.:: . :  ... :..::... :::
CCDS44 AAQGVPESLRGRDRIVFGNIQQIYEWHRDYFLQELQRCLKDPDWLAQLFIKHERRLHMYV
     230       240       250       260       270       280         

         900       910       920       930       940       950     
pF1KA1 IYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQRELGDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEAS
       .: .:::.:. ..:  :...:.. ...:: ...: . :..::::. :: :::.:.::  .
CCDS44 VYCQNKPKSEHVVSEFGDSYFEELRQQLGHRLQLNDLLIKPVQRIMKYQLLLKDFLKYYN
     290       300       310       320       330       340         

         960       970       980       990      1000      1010     
pF1KA1 CGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGNDLLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVCCGR
            :.. ..:. :  :.::  .. ::....  .:: . .:  ::.:  .: : :   .
CCDS44 ---RAGMDTADLEQAVEVMCFVPKRCNDMMTLGRLRGFEGKLTAQGKLLGQDTFWVTEPE
        350       360       370       380       390       400      

               1020      1030         1040      1050      1060     
pF1KA1 KKYL-------RHVFLFEDLILFSKTQK--VEG-SHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSG
          :       :.:::::..:.::..    :.: ..  :.::.:.:.. .:.  :.  . 
CCDS44 AGGLLSSRGRERRVFLFEQIIIFSEALGGGVRGGTQPGYVYKNSIKVSCLGLEGNLQGDP
        410       420       430       440       450       460      

        1070      1080      1090      1100           1110          
pF1KA1 LRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDVIGRILWRQ-----ALKS---RELRIQE
        :: .  :  . . . :.:::..  ...::   ...::  :     ::.:    . : ..
CCDS44 CRFALTSRGPEGGIQRYVLQAADPAISQAWIKHVAQILESQRDFLNALQSPIEYQRRESQ
        470       480       490       500       510       520      

      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KA1 MASMGIGNQPFMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKCAVMSDRVPDSIVKGTESQMRGSTAVSS
         :.:    : .    : .  : :  :  .:                             
CCDS44 TNSLGRPRGPGVGSPGRIQLGDQAQGSTHTPINGSLPSLLLSPKGEVARALLPLDKQALG
        530       540       550       560       570       580      

      1180      1190      1200      1210      1220      1230       
pF1KA1 SDHAAPFKRPHSTISDSSTSSSSSQSSSILGSLGLLVSSSPAHPGLWSPAHSPWSSDIRA
                                                                   
CCDS44 DIPQAPHDSPPVSPTPKTPPCQARLAKLDEDEL                           
        590       600       610                                    

>>CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3                (1289 aa)
 initn: 471 init1: 297 opt: 640  Z-score: 462.4  bits: 97.8 E(32554): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 640; 26.9% identity (66.8% similar) in 398 aa overlap (774-1158:202-590)

           750       760       770       780       790       800   
pF1KA1 QPDHTSVFSKGLEVTSTVATEKKLPLWQHARSPPVTQSRSLSSPSGLHPAEEDGRQQVGS
                                     ..:    ..... :.  .  ::. . ..  
CCDS30 VPTAADLVNAIEKLVKNKLSLEGSSYRGSLKDPAGCLNEGMAPPTPPKNPEEEQKAKALR
             180       190       200       210       220       230 

           810       820       830       840       850       860   
pF1KA1 SRLRHIMAEMIATEREYIRCLGYVIDNYFPEMERMDLPQGLRGKHHVIFGNLEKLHDFHQ
       .:.  .. :.. ::..:.. :: :..... ..:.  .:. .::: ...:::.....:.:.
CCDS30 GRM-FVLNELVQTEKDYVKDLGIVVEGFMKRIEEKGVPEDMRGKDKIVFGNIHQIYDWHK
              240       250       260       270       280       290

           870       880       890       900       910       920   
pF1KA1 QHFLRELERCQHCPLAVGRSFLRHEEQFGMYVIYSKNKPQSDALLSSHGNAFFKDKQREL
       . :: :::.: .    ... :..::... .:: : .:::.:. ... . .:.:.. ..:.
CCDS30 DFFLAELEKCIQEQDRLAQLFIKHERKLHIYVWYCQNKPRSEYIVAEY-DAYFEEVKQEI
              300       310       320       330        340         

           930       940       950       960       970       980   
pF1KA1 GDKMDLASYLLRPVQRVAKYALLLQDLLKEASCGLAQGQELGELRAAEVVVCFQLRHGND
       .... :...:..:.::..:: :::.:.:. .      : : .... :  ..:.  .. ::
CCDS30 NQRLTLSDFLIKPIQRITKYQLLLKDFLRYSE---KAGLECSDIEKAVELMCLVPKRCND
     350       360       370       380          390       400      

           990      1000      1010           1020      1030        
pF1KA1 LLAMDAIRGCDVNLKEQGQLRCRDEFIVC---CGRKKYL--RHVFLFEDLILFSKTQKVE
       .. .  ..: . .:  ::.:  .: : :     : ..    :.:::::....::.  .  
CCDS30 MMNLGRLQGFEGTLTAQGKLLQQDTFYVIELDAGMQSRTKERRVFLFEQIVIFSELLRKG
        410       420       430       440       450       460      

     1040      1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KA1 GSHDVYLYKQSFKTAEIGMTENVGDSGLRFEIWFRRRQKSQDTYILQASSAEVKSAWTDV
       .    :..:.:.:   . . ::: ..  .: .  :   ....  .:::..:....::.. 
CCDS30 SLTPGYMFKRSIKMNYLVLEENVDNDPCKFALMNR---ETSERVVLQAANADIQQAWVQD
        470       480       490       500          510       520   

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pF1KA1 IGRILWRQ-----ALKSR-ELRIQEMASMGIGNQP--FMDVKPRDRTPDCAVISDGAPKC
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