Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1910
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1910, 696 aa
1>>>pF1KA1910 696 - 696 aa - 696 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8043+/-0.00109; mu= 8.4920+/- 0.066
mean_var=147.1369+/-30.566, 0's: 0 Z-trim(108.1): 181 B-trim: 535 in 1/48
Lambda= 0.105734
statistics sampled from 9810 (10007) to 9810 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13 ( 696) 4676 725.6 5.8e-209
CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX ( 837) 1854 295.2 2.6e-79
CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX ( 845) 1843 293.5 8.4e-79
CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13 ( 958) 961 159.0 3e-38
CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13 ( 841) 931 154.4 6.3e-37
CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3 ( 977) 873 145.6 3.3e-34
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 386 71.4 1.1e-11
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 386 71.4 1.1e-11
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 379 70.3 2.3e-11
>>CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13 (696 aa)
initn: 4676 init1: 4676 opt: 4676 Z-score: 3865.0 bits: 725.6 E(32554): 5.8e-209
Smith-Waterman score: 4676; 100.0% identity (100.0% similar) in 696 aa overlap (1-696:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQF
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CCDS94 MLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 YHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVPIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 CEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQEDHAT
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CCDS94 CEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQEDHAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLPCPGGCSCDHIPGSGLKMNCN
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CCDS94 PGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLPCPGGCSCDHIPGSGLKMNCN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATVENNTFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATVENNTFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILILNN
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CCDS94 NLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILILNN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECSCTIVPF
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CCDS94 NLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECSCTIVPF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHSKNSTGLA
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CCDS94 KQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHSKNSTGLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ETGTHSNSYLDTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNRKRSKRRDANSSASE
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CCDS94 ETGTHSNSYLDTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNRKRSKRRDANSSASE
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KA1 INSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 INSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
670 680 690
>>CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX (837 aa)
initn: 1698 init1: 922 opt: 1854 Z-score: 1537.3 bits: 295.2 E(32554): 2.6e-79
Smith-Waterman score: 1854; 43.0% identity (73.8% similar) in 672 aa overlap (1-665:1-665)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKE--KICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTS
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CCDS14 MFLWLFLILSAL-ISSTNADSDISVEICNVCSCVSVENVLYVNCEKVSVYRPNQLKPPWS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 QFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNNKI
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CCDS14 NFYHLNFQNNFLNILYPNTFLNFSHAVSLHLGNNKLQNIEGGAFLGLSALKQLHLNNNEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQYVP
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CCDS14 KILRADTFLGIENLEYLQADYNLIKYIERGAFNKLHKLKVLILNDNLISFLPDNIFRFAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 ITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNALIGR
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CCDS14 LTHLDIRGNRIQKLPYIGVLEHIGRVVELQLEDNPWNCSCDLLPLKAWLENMPYNIYIGE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPA-PPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQED
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CCDS14 AICETPSDLYGRLLKETNKQELCPMGTGSDFDVRILPPSQLENGYTTPNGHTTQTSLHRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 HATPGSAPNGGTKIPG---NWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLPCPGGCSCDHIPGS-
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CCDS14 VTKPPKTTNP-SKISGIVAGKALSNRNLSQIVSYQTRVPPLT---PCPAPCFCKTHPSDL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 GLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIAT
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CCDS14 GLSVNCQEKNIQSMSELIPKPLNAKKLHVNGNSIKDVDVSDFTDFEGLDLLHLGSNQITV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKL
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CCDS14 IKGDVFHNLTNLRRLYLNGNQIERLYPEIFSGLHNLQYLYLEYNLIKEISAGTFDSMPNL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 RILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWEC
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CCDS14 QLLYLNNNLLKSLPVYIFSGAPLARLNLRNNKFMYLPVSGVLDQLQSLTQIDLEGNPWDC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 SCTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHS
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CCDS14 TCDLVALKLWVEKLSDGIVVKELKCETPVQFANIELKSLKNEILCPKLLNKPSAPFTSPA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 KNSTGLAETGTHSNSYLDTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNRKRSKRRD
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CCDS14 PAITFTTPLGPIRSP--PGGPVPLSILILSILVVLILTVFVAFCLLVFVLRRNKKPTVKH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690
pF1KA1 ANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
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CCDS14 EGLGNPDCGSMQLQLRKHDHKTNKKDGLSTEAFIPQTIEQMSKSHTCGLKESETGFMFSD
660 670 680 690 700 710
>>CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX (845 aa)
initn: 1797 init1: 854 opt: 1843 Z-score: 1528.2 bits: 293.5 E(32554): 8.4e-79
Smith-Waterman score: 1856; 44.1% identity (75.4% similar) in 655 aa overlap (22-665:27-666)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTA
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CCDS14 MLSGVWFLSVLTVAGILQTESRKTAKDICKIR-CLCEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 PTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINN
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CCDS14 PQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLNN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 NKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANVFQ
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CCDS14 NKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVFR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 YVPITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKNAL
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CCDS14 FVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIGGIMEIQLEENPWNCTCDLLPLKAWLDTI--TVF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IGRVVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPFKTNGQ
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CCDS14 VGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASDSSQRGSHADTHVQRLSPTMNP------
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KA1 EDHATPGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNK--PLA-----NSLP--CPGGCS
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CCDS14 --ALNPTRAPKA-SRPP---KMRNRPTPRVTVSKDRQSFGPIMVYQTKSPVPLTCPSSCV
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 C-DHIPGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLD
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CCDS14 CTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLH
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 LGNNNIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPG
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CCDS14 LGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 TFNAMPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQID
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CCDS14 TFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQID
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 LHGNPWECSCTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARI
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CCDS14 LQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGEILKFLGREAICPDSPNLS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 SPTLTSHSKNSTGLAETGTHSNSYLDT-SRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILR
. :. : ..:. .. .:: . ..: .:::. :::.::. :. .:..::.:.
CCDS14 DGTVLSMNHNTDTPRSLSVSPSSYPELHTEVPLSVLILGLLVVFILSVCFGAGLFVFVLK
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KA1 NRKRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
:: :.. ...:.:
CCDS14 RRKGVPSVPRNTNNLDVSSFQLQYGSYNTETHDKTDGHVYNYIPPPVGQMCQNPIYMQKE
650 660 670 680 690 700
>>CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13 (958 aa)
initn: 1646 init1: 907 opt: 961 Z-score: 800.3 bits: 159.0 E(32554): 3e-38
Smith-Waterman score: 1786; 41.5% identity (70.8% similar) in 699 aa overlap (1-664:22-710)
10 20 30
pF1KA1 MLLWILLLETSL---CFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEG
:: . . ::: : . . :..: .. : :.: .:
CCDS94 MHTCCPPVTLEQDLHRKMHSWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEIC-DNACPCEEKDG
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 DLHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHE
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CCDS94 ILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQD
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 IVPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKL
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CCDS94 IETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHLL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 EVLILNDNLISTLPANVFQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDC
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CCDS94 QVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKVVELQLEENPWNC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 TCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPA
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CCDS94 SCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCP--RRLISDYEMRP-
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KA1 QEETFAPGPL-PTPFKTNGQEDHAT----PGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIAT---G
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CCDS94 QTPLSTTGYLHTTPASVNSVATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPN--KPRVRPTSRQPSKDLG
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 SSRNKP-LANS------LPCPGGCSCD-HIPGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQEL
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CCDS94 YSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKM
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 FLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSR
.: .: : .:.. :.. .: :: :::: :. ... .: .: .:: ::...: .. ::
CCDS94 YLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIERLSP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 EKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLS
: : :::.:.:: ..:: :. : :::. .:.:..:.::::::...: ::.:..: .:.
CCDS94 ELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGLTLLRLN
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGNPWECSCTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCET
:..:.: :::.:::::: :.:::::: :::.:.: :: .: :.:.: ::.... :..
CCDS94 LRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKA
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600
pF1KA1 PVNFFRKDFMLLSNDEICP---------------QLYARISPTLTSHSKNSTGL-AETGT
: .: . :. .... .:: :. :: : . . :::: : :.
CCDS94 PKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGA
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 HSNSYLDTSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNRKRSKRRDANSSASEINSL
... : : .:::. .:::::. :.:...:..:.... ::... .... :...:.
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670 680 690
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CCDS94 NMQYSVYGGGGGTGGHPHAHVHHRGPALPKVKTPAGHVYEYIPHPLGHMCKNPIYRSREG
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50
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..: :. ..: : .:.:: : :.:... ::.:.:. :.. .: ::: :: :.:.:::
CCDS41 SVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHI
60 70 80 90 100 110
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:.:... ....:: ::..::.:::: :.. :.:.::. ::.:.::::::: : .:: :.
CCDS41 NHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNI
120 130 140 150 160 170
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:..::.::::::::.:.:::: ::.: : .. :::: : :.::::.:: ::::.: .
CCDS41 FRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQ
180 190 200 210 220 230
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..:: :::..: ..:. :.. ....:: .::. :: : : :
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: . :. : . . .: :: : . .:: ...:: :: :.:
CCDS41 -----HLAATSSINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIPYITKP-STQLPGPYCPIPCNCKV
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. ::: ..:..::. ::.::.: .: ..:.: : :::. :: .:.: .: .: ::::
CCDS41 LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNN
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pF1KA1 NIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNA
: ..:...: :: :. ::...:.: ::. : ::.::::: .:::::. :::::::
CCDS41 RIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNP
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::::..: ::::::. :: .:.:: :.:..:..: : .:::...::.: . ::::. :
CCDS41 MPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDN
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::.::: .: ..:: ..:..... .:. : .: .. .:.. :... .:: : : ::
CCDS41 PWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPT
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pF1KA1 LTSHSKNSTGLAETGTHSNSYLD--TSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNR
::. .: . :.: ... : :. : .:::. :::..:.: .: ..:..:..:. :
CCDS41 QTSYLMVTTPATTTNT-ADTILRSLTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRR
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.: :..... . . :: . : : :
CCDS41 RRYKKKQVDEQMRD-NSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSF
640 650 660 670 680 690
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10 20 30 40
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CCDS31 MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDP-CYCEVKESLFHI
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CCDS31 HCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTG
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CCDS31 AFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLI
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CCDS31 LNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCE
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220 230 240 250 260 270
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...:: ::: :: .::.: ..::.: ...:::: : . .:::: ..:..:: :
CCDS31 IVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSS
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..:... : : . : .. .. . .. :. :: : . :... : .
CCDS31 SSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKP-TKQP---RTPRPPSTSQALYPGP
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340 350 360 370 380
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CCDS31 NQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYL
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390 400 410 420 430 440
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CCDS31 SSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGM
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450 460 470 480 490 500
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CCDS31 KNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPE
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570 580 590 600 610
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:. ..: . . .::.. ...:. : .. ... : . : .. : . . : .:
CCDS31 NLTHRDVRTIELEVLCPEML-HVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLS
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::. .::..: ...:...:.....:: :... :. . . .....: : . .:
CCDS31 VLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGG
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CCDS31 GGGGSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGS
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CCDS43 FRALRDLEILTLNNNNISRI-LVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLR---Q
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.:. ..: ::..:.: .. .. ... .:: ::
CCDS43 RRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCP-------------------AP-------
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CCDS43 -------HSEP-------------------PSCN-----------ANSISCPSPCTC---
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CCDS43 --SNNIVDCRGKGLMEIPANLPE--GIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQ
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:. . ..:..: .: : . .: . . . : :: .:. : .. : :. . .::. .
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CCDS43 QNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPF-------VCDCHLKWLADYLQDN
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: : : :. : . .:. :.. . ..: .. . : .::. :
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CCDS43 GTIVDCSNQK--LVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIK
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pF1KA1 RNRKRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
CCDS43 EVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSS
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MLLWILLLETSLCFAAGNVTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRF
: : :.:. :::. :. .. :
CCDS64 GWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVACPTK-CTCSAAS----VDCHGLGLRAVPR-
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pF1KA1 TAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHI
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CCDS64 GIPRNA-ERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQLERLRL
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pF1KA1 NNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANV
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CCDS64 NKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGA
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 FQYV-PITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPK
:. . . : : .: .. . ....: : . :..: : : : :..::. .
CCDS64 FRALRDLEILTLNNNNISRI-LVTSFNHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDWLR---Q
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NALIGR-VVCEAPTRLQGKDLNETTEQD-LCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAPGPLPTPF
.:. ..: ::..:.: .. .. ... .:: ::
CCDS64 RRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCP-------------------AP-------
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KTNGQEDHATPGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLPCPGGCSCDHI
:. : :. :::. ::. :.:
CCDS64 -------HSEP-------------------PSCN-----------ANSISCPSPCTC---
270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 PGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNN
:. ..: .... . :. .. :. :..:.:..: . :..::.: .:...:.
CCDS64 --SNNIVDCRGKGLMEIPANLPE--GIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KA1 IATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAM
:. . ..:..: .: : . .: . . . : :: .:. : .. : :. . .::. .
CCDS64 ISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDL
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pF1KA1 PKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGV-SLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGN
.: .: : .: :... .:: . :.. : : .: : : : . . :. :
CCDS64 QNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNPF-------VCDCHLKWLADYLQDN
410 420 430 440 450
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pF1KA1 PWECS---CTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARIS
: : : :. : . .:. :.. . ..: .. . : .::. :
CCDS64 PIETSGARCS-SPRRLANKRI-SQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCPE-KCRCE
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 PTLTSHSKNSTGLAETGTHSNSYLDTSRVS---ISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFIL
:... :... :.. .: :. :.. .:::
CCDS64 GTIVDCSNQK--LVRIPSHLPEYVTDLRLNDNEVSVLEATGIFKKLPNLRKINLSNNKIK
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690
pF1KA1 RNRKRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
CCDS64 EVREGAFDGAASVQELMLTGNQLETVHGRVFRGLSGLKTLMLRSNLIGCVSNDTFAGLSS
580 590 600 610 620 630
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pF1KA1 MLLWILL-LETSLCFAAGN-VTGDVCKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRFTAP
: .: : .: .: : :. ..: . :::. :. :::. .. :. : . :
CCDS75 MRGVGWQMLSLSLGLVLAILNKVAPQACPAQ-CSCS---GST-VDCHGLALRSVPR-NIP
10 20 30 40 50
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pF1KA1 TSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHINNN
. .: :.::..::. ..::.. . :.. .: . : ::: :. ..::..: :
CCDS75 RNT-ERLDLNGNNITRITKTDFAGLRHLRVLQLMENKISTIERGAFQDLKELERLRLNRN
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