Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1938
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1938, 1343 aa
1>>>pF1KA1938 1343 - 1343 aa - 1343 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2504+/-0.00101; mu= 4.3900+/- 0.062
mean_var=357.2318+/-71.914, 0's: 0 Z-trim(115.1): 30 B-trim: 81 in 1/53
Lambda= 0.067858
statistics sampled from 15668 (15693) to 15668 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 4.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs108|chr6 (1343) 9089 904.8 0
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1065) 1727 184.0 1.9e-45
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1132) 1727 184.0 2e-45
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1280) 1705 181.9 9.7e-45
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1139) 1683 179.7 4e-44
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs108|chr19 (1011) 1080 120.6 2.2e-26
>>CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs108|chr6 (1343 aa)
initn: 9089 init1: 9089 opt: 9089 Z-score: 4823.2 bits: 904.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9089; 100.0% identity (100.0% similar) in 1343 aa overlap (1-1343:1-1343)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPYDRPGWNPRFCIISGNQLLMLD
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CCDS34 MSRSRASIHRGSIPAMSYAPFRDVRGPSMHRTQYVHSPYDRPGWNPRFCIISGNQLLMLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDEIHPLLIRDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGGKQYSMEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDEIHPLLIRDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGGKQYSMEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 APAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 APAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMERE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 HLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLND
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ISTALRNPNIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ISTALRNPNIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 MDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 VSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VSMLDLQGDGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSIT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 AAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAGMRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 HHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HHHHHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 QLSLQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLSLQDNLQHMLSPPQITIGPQRPAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 AQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPARPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 PSTLNPTMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSTLNPTMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 EIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIK
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 SIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340
pF1KA1 PAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
:::::::::::::::::::::::
CCDS34 PAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
1330 1340
>>CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1065 aa)
initn: 3031 init1: 1706 opt: 1727 Z-score: 929.3 bits: 184.0 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 3441; 49.4% identity (71.4% similar) in 1192 aa overlap (174-1342:1-1064)
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 TKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDED
: .:::.:::::::::::.:::.:...:.
CCDS68 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 SIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNV
.:::::::::::..:::::::::.:::.::::::::::.:::.:::.:::::::::...
CCDS68 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRAL
::::.:::..:: ::.: :::::::.::::::.: .. :.:::::::::.::: .:..
CCDS68 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKT---DNVFWGEHFEFHNLPPLRTV
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 RLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGG
.::::..:::.::.. .:.:::..:.:..:::.:.:.::::. :. .::
CCDS68 TVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGG----------
150 160 170 180 190
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 GSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKG
:: : : .:.::::::..:::::.::::::..:::: :::.::: :..:
CCDS68 --------KGPG--PMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKT
200 210 220 230 240
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 KEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQ
:::.:::::::::::::.::::.:. :::::: . ::::::::::::::::::..:.::
CCDS68 KEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQ
250 260 270 280 290 300
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 KYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPR
:::.::.::::.:::::.::::::: ::.:..: :::.::.::::::.::..::.:::::
CCDS68 KYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPR
310 320 330 340 350 360
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTL
:::::::::: .:. ::: ::..::::::::::::::::::::::.:.:::::..:.:::
CCDS68 ELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTL
370 380 390 400 410 420
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 TLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYI
:::::: ::::::.:: :::....:::.::: :: .::.:: :::: .::.:...:::::
CCDS68 TLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYI
430 440 450 460 470 480
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 DLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPNIQRQPSRQSERPRP
:::::::.::.::::.. :: . . :::::::.: :. ::: .:. . :. .. :
CCDS68 DLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTP
490 500 510 520 530 540
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 QPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGK
: :. : .. . ::. :: .:..:::::: :. :
CCDS68 GS----GSSSISAG--LQKMVIENDLS-----GL---IDFTRLPSPTPEN---------K
550 560 570 580
810 820 830 840 850
pF1KA1 DLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQG----DGPGGRLNSSS
:::.:.: .. ::: .: :. .::. .: . .::.::.::: :: .: . .
CCDS68 DLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPD
590 600 610 620 630 640
860 870 880 890 900 910
pF1KA1 VSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQ
: : . : ... :.:.:. :: : .. .. ... ::. . : :..:.:..
CCDS68 V--LPTDG---QAAAAQLVAGW---PARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPG-TSEGAPGR
650 660 670 680 690
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 -QLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGG--GHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTF
:: :::::::...::: : : : : .: ::. :::
CCDS68 PQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSH-------------------
700 710 720 730
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 APFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLSLQDNLQHMLSPPQ
:.::.:.. ::.. . ..:.. ...:::.:: .. . : :
CCDS68 ------SNSEELAA------AAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQ
740 750 760 770 780
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 ITIGPQR----PAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLL
. :::: : : : ::: ::.. .:. : ::::::.:
CCDS68 NSAGPQRRIDQPPPPPP--------------PPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLA
790 800 810 820 830
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA1 QSPEPSYGPA-RPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQTPSTLNPTMPAS
.. ::. : :::: :..:. . ::: . :.: :: ..:. :
CCDS68 SASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGD-----------SPELKPRAV--HKQGPSPVSPN--AL
840 850 860 870
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA1 ERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRL-DRVKEYEEEIHSLKERLH
.::.::. .: .:.. ..: : :. : :.... :... :...:.
CCDS68 DRTAAWLLTM--------NAQLLEDE-GLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLR
880 890 900 910 920
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA1 MSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVE
.:..:::::: . ::: :.:....::::::..:.:::.:: .:: :.:.::.::: ::
CCDS68 ISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVE
930 940 950 960 970 980
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 EELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLA----------PPWNGLAP
:::..:: : . . :....::::... : .: :. : ::..:
CCDS68 EELKKDHAEMQAAV-DSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKERYSMQARNGISP
990 1000 1010 1020 1030 1040
1330 1340
pF1KA1 PAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
: .:::::::::::...
CCDS68 TNPT---KLQITENGEFRNSSNC
1050 1060
>>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1132 aa)
initn: 2999 init1: 1706 opt: 1727 Z-score: 929.0 bits: 184.0 E(32554): 2e-45
Smith-Waterman score: 3631; 50.4% identity (72.8% similar) in 1225 aa overlap (107-1312:23-1123)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 SRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGG---KQYSMEGAPAAPFRPSQGFL
:.:.::. :. ::: . :.::: . :::
CCDS68 MEPDSLLDQDDSYESPQERPGSRRSLPGSLSEKSPSMEPSAATPFRVT-GFL
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180
pF1KA1 SRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSA-----DHDRARLMQSFKESHSHESLLS
:::::.:::::::::::::. :::.::: :::: :..:..:: .:::.:::::::
CCDS68 SRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKESRSHESLLS
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQR
::::.:::.:...:. .:::::::::::..:::::::::.:::.::::::::::.:::.:
CCDS68 PSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRR
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 AVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFW
::.:::::::::...::::.:::..:: ::.: :::::::.::::::.: .. :.:::
CCDS68 AVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKT---DNVFW
180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLP
::::::.::: .:.. .::::..:::.::.. .:.:::..:.:..:::.:.:.::::. :
CCDS68 GEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTP
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 TGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHY
. .:::: : : .:.::::::..:::::.::::::..::::
CCDS68 NP------------------KGGKGPG--PMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHY
290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RMLCAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENT
:::.::: :..: :::.:::::::::::::.::::.:. :::::: . :::::::::
CCDS68 LGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENT
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCE
:::::::::..:.:::::.::.::::.:::::.::::::: ::.:..: :::.::.::::
CCDS68 LATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCE
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LALCKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLF
::.::..::.::::::::::::::: .:. ::: ::..::::::::::::::::::::::
CCDS68 LAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLF
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEIS
.:.:::::..:.::::::::: ::::::.:: :::....:::.::: :: .::.:: :::
CCDS68 NLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEIS
510 520 530 540 550 560
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 NLDTLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNP
: .::.:...::::::::::::.::.::::.. :: . . :::::::.: :. ::: .:
CCDS68 NPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTP
570 580 590 600 610 620
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pF1KA1 NIQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPS
. . :. .. : . :: .: ..... ::. :: .:..::::
CCDS68 GSGQLPGTNDLASTPGSGS-SSISAGLQKMVIEN-----DLS-----GL---IDFTRLPS
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pF1KA1 PTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQG
:: :. ::::.:.: .. ::: .: :. .::. .: . .::.::.:::
CCDS68 PTPEN---------KDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQD
680 690 700 710 720
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pF1KA1 ----DGPGGRLNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGM
:: .: . .: : . : ... :.:.:. :: : .. .. ... ::.
CCDS68 ARTLDGEAGSPAGPDV--LPTDG---QAAAAQLVAGW---PARATPVNLAGLATVRRAGQ
730 740 750 760 770
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pF1KA1 RLSQMGVTTDGVPAQ-QLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHH
. : :..:.:.. :: :::::::...::: : : : : .:..: : :
CCDS68 TPTTPG-TSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSH----
780 790 800 810 820 830
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 HHHRGGEPPGDTFAPFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLS
:.::.:.. ::.. . ..:.. ...:::.:
CCDS68 -------------------SNSEELAA------AAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMS
840 850 860
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 LQDNLQHMLSPPQITIGPQR----PAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVS
: .. . : : . :::: : : : ::: ::.. .:
CCDS68 LTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPP--------------PPPPAPRGRTPPNLLS
870 880 890 900 910
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 AAQKPRPSSGNLLQSPEPSYGPA-RPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHS
. : ::::::.: .. ::. : :::: :..:. . ::: . :.
CCDS68 TLQYPRPSSGTLASASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGD-----------SPELKPRAV--HK
920 930 940 950 960
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 QTPSTLNPTMPASERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRL-DRVKE
: :: ..:. : .::.::. .: .:.. ..: : :. : :....
CCDS68 QGPSPVSPN--ALDRTAAWLLTM--------NAQLLEDE-GLGPDPPHRDRLRSKDELSQ
970 980 990 1000
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 YEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDS
:... :...:..:..:::::: . ::: :.:....::::::..:.:::.:: .::
CCDS68 AEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDI
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KA1 QIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNG
:.:.::.::: :::::..:: : . . :....::::... : .: :. :
CCDS68 QMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAV-DSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLK
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA1 LAPPAPPPPPRLQITENGEFRNTADH
CCDS68 ESMH
1130
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10 20 30 40
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CCDS13 EDLDAVVPVSGAVAGGMLDRILLESVCQQQSWVRVYDVKGPPTHRLSCGQSPYTETTTWE
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50 60 70 80 90
pF1KA1 PRFCIISGNQLLMLDEDEIHPLLI-RDRRSESSRNKLLRRTVSVPVEGR-----PHGEHE
..::.. .::..:.... :. ......:.... :::::::: ::. :.: .
CCDS13 RKYCILTDSQLVLLNKEKEIPVEGGQEQQTDSTKGRCLRRTVSVPSEGQFPEYPPEGATK
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 YHLG--RS-RRKSVPGG----KQYSMEGAPAAPFRPSQGFLSRRLKSSIKRTKSQPKLDR
.. :: ::.:. : : ::. : ..::. ::.:.:::.:::::::: ::::
CCDS13 LEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANTSPFK-VPGFFSKRLKGSIKRTKSQSKLDR
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 TSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDEDSIIKPVHSS
..::: :: .::.: ::.: . ..:::.:::::::: :..: :.:. : .::.:::
CCDS13 NTSFR--LPSLRSTD-DRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEPVSVKPLHSS
220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 ILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNVLKLWIIEAR
::::.:::::: ::.:::.: ::.:::::.:::.:.:.::::: ::..:::.::::::.
CCDS13 ILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENVLRLWIIEAK
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRALRLHLYRDSD
.: :::.:.::::::: :.:::::: .. :..:::::::: .:: .... .:.:.: .
CCDS13 DLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKA---DNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVHIYKDVE
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 KKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGGGSGGGSGGK
::.:::: .:::::..:.:...::.:.:.::::. :: . :
CCDS13 KKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPN--------------------K
390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKGKEEVASALV
:: : :..:.:.:.::..::::: ::::::.::..: :::.::::...:..:::.: :::
CCDS13 GKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALV
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 HILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQKYLKDAIGE
:::::::.:::::.:..:::::: :.. :::::::.:::.::::..:.::.::.::.::
CCDS13 HILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGE
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 FIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPRELKEVFASW
::.:::::.::::::: ::..: : .::.::.::::::.::..::.::::::::::::::
CCDS13 FIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASW
550 560 570 580 590 600
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pF1KA1 RLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTLTLIAKVIQN
. .: .::..::..::::::::::::::::::::::.:::::::..::::::::::::::
CCDS13 KQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQN
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::::.:: .::....:::.::: :::.:..:: :::: ::..:. .:.::::::::::.:
CCDS13 LANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVL
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 HALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPN-IQRQPSRQSERPRPQPVVLRGP
:.:::::. ::.: .. :::::::.: ::. .: ::. ::.: : .: ..
CCDS13 HSLLWEVVSQLDKATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTE---------HNS
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CCDS13 SPNVSGSL------SSGLQKIFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRG--KTLLLVQQA
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:: .. : .: : . : ..:::..::: : ..... .:: . : :
CCDS13 ----SSQSMTYSEKDERE---SSLPNGRSVSLMDLQ-DTHAAQVEHASV--MLDVPIRLT
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CCDS13 GSQLSITQVASIKQL---RETQSTPQSAPQVRRPLHPALNQPGGLQ------PLSFQNPV
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.:. :. : . . :: .. . : .. :.:::.. .
CCDS13 YHLNNPIPAMPKA-------SIDSSLENL--------------STASSRSQSNSEDFKLS
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:. . . ..: ..: ::.::. .. : . : : . : . ::
CCDS13 GPSNSSMEDFTKRSTQSE------DFSRRH-TVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGG
970 980 990 1000 1010
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:. . :: : .. : . : : . :. :. :: . .: :::: :
CCDS13 L------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMS----VVSAALVA--EPVQNGSRSRQQSSSS
1020 1030 1040 1050 1060
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA1 KEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK-QHSQTPSTLNP----TMPASERTVAWVSNMPHLS
.:. . :.. :..:: .. .: :: :::.::: : .
CCDS13 RESPV---------------PKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLNNGQYE
1070 1080 1090 1100 1110
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 ADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRLDRVKEYEEEIHSLKERLHMSNRKLEEYERRLLS
:.: : ...::.. ....::.:: .:::::..:.:.:::::::::
CCDS13 EDVE------------ETEQNLDEAK--HAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLV
1120 1130 1140 1150
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pF1KA1 QEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVEEELRRDHPAMAEPLP
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CCDS13 QEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEM-QAVI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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pF1KA1 EPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPW----------NGLAPPAPPPPPRLQITENG
. :....::::... : .: :. : ::..: : .:.:::::
CCDS13 DAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTN---PTKLSITENG
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1340
pF1KA1 EFRNTADH
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CCDS13 EFKNSSC
1280
>>CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1139 aa)
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80 90 100 110 120 130
pF1KA1 SSRNKLLRRTVSVPVEGRPHGEHEYHLGRSRRKSVPGG----KQYSMEGAPAAPFRPSQG
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CCDS13 MQTPEVPAERSPRRRSISGTSTSEKPNSMDTANTSPFK-VPG
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 FLSRRLKSSIKRTKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSS
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CCDS13 FFSKRLKGSIKRTKSQSKLDRNTSFR--LPSLRSTD-DRSRGLPKLKESRSHESLLSPCS
50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 AAEALELNLDEDSIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVK
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CCDS13 TVECLDLGRGEPVSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQ
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 PNKDNSRRVDNVLKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEH
::::: ::..:::.::::::..: :::.:.::::::: :.:::::: .. :..:::::
CCDS13 PNKDNCRRAENVLRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKA---DNIFWGEH
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 FEFNNLPAVRALRLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGS
::: .:: .... .:.:.: .::.:::: .:::::..:.:...::.:.:.::::. :: .
CCDS13 FEFFSLPPLHSITVHIYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPN
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 GGSGGMGSGGGGGSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRML
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CCDS13 --------------------KGKTGGPSIRIKSRFQTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTML
280 290 300 310
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pF1KA1 CAVLEPALNVKGKEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLAT
:.::::...:..:::.: ::::::::::.:::::.:..:::::: :.. :::::::.::
CCDS13 CSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLTDLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIAT
320 330 340 350 360 370
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 KAIEEYMRLIGQKYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELAL
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CCDS13 KSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAF
380 390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 CKVVNSHCVFPRELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLM
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CCDS13 CKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLM
440 450 460 470 480 490
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 QEYPDEQTSRTLTLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLD
:::::..::::::::::::::::::.:: .::....:::.::: :::.:..:: :::: :
CCDS13 QEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYMAFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPD
500 510 520 530 540 550
680 690 700 710 720
pF1KA1 TLTNSSSFEGYIDLGRELSTLHALLWEVLPQLSK-------EALLKLGPLPRLLNDISTA
:..:. .:.::::::::::.::.:::::. ::.: .. :::::::.: ::. .
CCDS13 TISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKGENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKS
560 570 580 590 600 610
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pF1KA1 LRNPN-IQRQPSRQSERPRPQPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDM
: ::. ::.: : .:. . : ...: . : ::... .: :.
CCDS13 LTNPTPIQQQLRRFTEH---------NSSPNVSGSL------SSGLQKIFEDPTDS--DL
620 630 640 650
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 ARLPSPTKEKPPPPPPGGGKDLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSM
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CCDS13 HKLKSPSQDNTDSYFRG--KTLLLVQQA----SSQSMTYSEKD--ERESS-LPNGRSVSL
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.::: : ..... .:: . : : .:: :.: . ... : .:.. .: .
CCDS13 MDLQ-DTHAAQVEHASV--MLDVPIRLTGSQLSITQVASIKQL---RETQSTPQSAPQVR
710 720 730 740 750 760
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 MRLSQMGVTTDGVPAQQLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGGGHGPPSSHHHHHHH
: :. :::::::..:. :. : . . :: ..
CCDS13 RPLHPALNQPGGLQ------PLSFQNPVYHLNNPIPAMPKA-------SIDSSLENL---
770 780 790 800
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CCDS13 -----------STASSRSQSNSEDFKLSGPSNSSMEDFTKRSTQSE------DFSRRH-T
810 820 830 840
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