Result of FASTA (omim) for
pF1KA1948
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1948, 532 aa
1>>>pF1KA1948 532 - 532 aa - 532 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6099+/-0.000915; mu= 8.5813+/- 0.056
mean_var=335.2826+/-68.533, 0's: 0 Z-trim(110.1): 2036 B-trim: 87 in 1/49
Lambda= 0.070044
statistics sampled from 16096 (18395) to 16096 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 6.110
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1957 213.2 1.5e-54
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1957 213.2 1.5e-54
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1957 213.2 1.5e-54
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1957 213.2 1.5e-54
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1957 213.2 1.5e-54
NP_001284552 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 540) 1946 212.1 3.4e-54
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1829 200.3 1.2e-50
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1820 199.4 2.4e-50
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1820 199.4 2.4e-50
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1820 199.4 2.4e-50
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1820 199.4 2.4e-50
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1782 195.6 3.4e-49
NP_001309756 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 509) 1761 193.4 1.4e-48
NP_001309755 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 509) 1761 193.4 1.4e-48
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1717 188.9 3.1e-47
NP_001165697 (OMIM: 613903) zinc finger protein 54 ( 628) 1718 189.2 3.2e-47
NP_001165696 (OMIM: 613903) zinc finger protein 54 ( 660) 1718 189.2 3.3e-47
NP_689819 (OMIM: 613903) zinc finger protein 540 i ( 660) 1718 189.2 3.3e-47
XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1711 188.2 4.3e-47
XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1711 188.2 4.3e-47
NP_062537 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 is ( 533) 1690 186.2 2.1e-46
XP_016875410 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 546) 1690 186.3 2.1e-46
NP_001243208 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 566) 1690 186.3 2.2e-46
XP_016875409 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 575) 1690 186.3 2.2e-46
NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 i ( 517) 1680 185.2 4.1e-46
NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 58 ( 548) 1680 185.2 4.3e-46
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1673 184.5 6.8e-46
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1673 184.6 7.2e-46
XP_016875411 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1665 183.7 1.2e-45
XP_005266240 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1665 183.7 1.2e-45
NP_001317442 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1665 183.7 1.2e-45
XP_016875412 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1665 183.7 1.2e-45
NP_001317443 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1665 183.7 1.2e-45
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1660 183.3 1.8e-45
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 1660 183.3 1.8e-45
NP_001309757 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 475) 1652 182.3 2.8e-45
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1648 182.1 4.3e-45
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1648 182.1 4.3e-45
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1648 182.1 4.3e-45
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1648 182.1 4.4e-45
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1648 182.1 4.4e-45
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1648 182.2 4.5e-45
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1648 182.2 4.5e-45
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1648 182.2 4.5e-45
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1648 182.2 4.5e-45
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1648 182.2 4.5e-45
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1645 181.8 5.1e-45
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1645 181.8 5.1e-45
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1645 181.8 5.4e-45
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1645 181.8 5.4e-45
>>XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
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Smith-Waterman score: 1957; 56.1% identity (77.7% similar) in 503 aa overlap (1-502:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
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XP_011 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQ
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70 80 90 100 110
pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQY-PDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKN
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XP_011 GKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCE--KF-LQKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRA
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pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF
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pF1KA1 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA
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XP_011 SRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTS
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pF1KA1 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI
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pF1KA1 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE
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XP_011 KPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYE
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pF1KA1 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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XP_011 CRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [Homo (499 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
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pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQY-PDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKN
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pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF
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pF1KA1 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA
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NP_689 CRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
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>>XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
initn: 1585 init1: 1585 opt: 1957 Z-score: 1100.2 bits: 213.2 E(85289): 1.5e-54
Smith-Waterman score: 1957; 56.1% identity (77.7% similar) in 503 aa overlap (1-502:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
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XP_016 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQ
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pF1KA1 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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XP_016 CRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
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>>XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
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pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
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XP_011 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQ
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pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQY-PDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKN
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XP_011 GKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCE--KF-LQKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRA
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pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF
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XP_011 DWECEGQFERQVN-EECYFKQVNVTYGHMPVFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAF
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180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA
..: :..:::::::. ::::: :: ...::..:::.:.::: :.::.::.:: .
XP_011 SRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR
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XP_011 ELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI
:...... : :::::::::: : : ::...::::::::::::::.: ...: ::::
XP_011 HRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV
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XP_011 HSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE
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XP_011 KPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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XP_011 CRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [H (499 aa)
initn: 1585 init1: 1585 opt: 1957 Z-score: 1100.2 bits: 213.2 E(85289): 1.5e-54
Smith-Waterman score: 1957; 56.1% identity (77.7% similar) in 503 aa overlap (1-502:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
:: : : ::.:.:: :::. :. :.::::.: :::...:.::: ::::::.: :::
NP_001 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQY-PDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKN
::::: .. . ::::.. : :. :..::.::. .:.::: .. :.: ..
NP_001 GKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCE--KF-LQKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF
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NP_001 DWECEGQFERQVN-EECYFKQVNVTYGHMPVFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA
..: :..:::::::. ::::: :: ...::..:::.:.::: :.::.::.:: .
NP_001 SRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR
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NP_001 ELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI
:...... : :::::::::: : : ::...::::::::::::::.: ...: ::::
NP_001 HRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRI
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV
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NP_001 HSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGD
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE
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NP_001 KPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYE
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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NP_001 CRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>NP_001284552 (OMIM: 608640) zinc finger protein 461 is (540 aa)
initn: 3753 init1: 1271 opt: 1946 Z-score: 1093.9 bits: 212.1 E(85289): 3.4e-54
Smith-Waterman score: 1946; 54.6% identity (75.6% similar) in 529 aa overlap (1-528:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
:: . ::: ::.:: : :::: :. :..::..::::::::::::: .::: :::::::
NP_001 MAHELVMFRDVAIDVSQEEWECLNPAQRNLYKEVMLENYSNLVSLGLSVSKPAVISSLEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA1 GKEPWKVVRKGR-RQYPDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKIMERIENHGLKGLILKN
::::: :::. : ::: .. : .::: . :::: .:::: ::....:. . :..
NP_001 GKEPWMVVREETGRWCPDLASRDEPQKLSPKRDIYETELSQWVNMEEFKSHSPERSIFSA
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120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEGYFSSVKMPSEKVSSYQKRTSVTPHQRLHFVDKPYECKECGKAF
::.. ..: .. .:::: .. . :.. ....: .: :... .: :::.: : :
NP_001 IWEGNCHFEQHQGQEEGYFRQLMINHENMPIFSQHTLLT--QEFYDREKISECKKCRKIF
130 140 150 160 170
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pF1KA1 RVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECGEAFICGA
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NP_001 SYHLFFSHHKRTHSKELS-ECKEC-TEIVNTPCLFKQQTIQNGDKCNECKECWKAFVHCS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 DLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFRQYAHLTR
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NP_001 QLK-HLRIHNGEKRYECNECGKAFNYGSELTLHQRIHTGEKPYECKECGKAFRQRSQLTQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 HQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQLTLHQRI
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NP_001 HQRLHTGEKPYECKQCGKAFIRGFQLTEHLRLHTGEKPYECKECGKTFRHRSHLTIHQRI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 HTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISHQSIHIGV
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NP_001 HTGEKPYECRECGKAFSYHSSFSHHQKIHSGKKPYECHECGKAFCDGLQLTLHQRIHTGE
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 KPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIHTGEKPFE
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NP_001 KPYECKECGKTFRQCSHLKRHQRIHTGEKPHECMICGKAFRLHSHLIQHQRIHTGEKPYE
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 CKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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NP_001 CKECGKAFSYHSSFSHHQRIHSGKKPYQC---GKAFNHRLQLNLHQTLHTGEKPVRFPLL
480 490 500 510 520 530
NP_001 PPHPSLAS
540
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
initn: 1549 init1: 1549 opt: 1829 Z-score: 1030.0 bits: 200.3 E(85289): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 1829; 49.2% identity (74.8% similar) in 531 aa overlap (6-528:4-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
..: ::.:.:: :::. :: :..:::.:::::: ::: :: .::::.:. :::
NP_001 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQ
10 20 30 40 50
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pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQYPDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKI-MERIENHGLKGLILKN
::.: . .. :.. .. .. : :..: . : :. ..: ::.: .: .:.
NP_001 GKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD---SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKK
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120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEG---YFSSVKMPSEKVSSY----QKRTSVTPHQRLHFVDKPYEC
::. . . ..: .: :..... . ..: .: .. . :. : ::..:
NP_001 GCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECG
:::::: . :: :..:::::::..:.::: :: ..::: :.:.:.::: :.:..::
NP_001 IECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFR
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NP_001 KAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 QYAHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQ
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NP_001 RSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISH
:: :. ::.:::::.:.::::.:. . :: :.:::::::::.:.:: .::. :.: .:
NP_001 LTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIH
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NP_001 KIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 TGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
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NP_001 TGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEK
480 490 500 510 520 530
NP_001 L
>>XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (550 aa)
initn: 3946 init1: 1540 opt: 1820 Z-score: 1025.0 bits: 199.4 E(85289): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 1820; 49.1% identity (75.0% similar) in 527 aa overlap (6-524:4-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
..: ::.:.:: :::. :: :..:::.:::::: ::: :: .::::.:. :::
XP_006 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQYPDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKI-MERIENHGLKGLILKN
::.: . .. :.. .. .. : :..: . : :. ..: ::.: .: .:.
XP_006 GKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD---SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEG---YFSSVKMPSEKVSSY----QKRTSVTPHQRLHFVDKPYEC
::. . . ..: .: :..... . ..: .: .. . :. : ::..:
XP_006 GCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECG
:::::: . :: :..:::::::..:.::: :: ..::: :.:.:.::: :.:..::
XP_006 IECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFR
.:: . : .:. .: :::::.:.::::::. ..:: :. :::::::: :.::::::.
XP_006 KAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFK
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 QYAHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQ
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XP_006 RSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSS
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 LTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISH
:: :. ::.:::::.:.::::.:. . :: :.:::::::::.:.:: .::. :.: .:
XP_006 LTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTH
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 QSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIH
. :: : .:. :.::::::. .: :: :. :: :::::::.:::::: ..:: :. ::
XP_006 KIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIH
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 TGEKPFECKECRKAFRLNSSLIQHLRIHSGEKPYECKECKKAFRQHSHLTHHLKIHNVKI
:::::..:..: :::. . : .: :::.:::::.:.:: :.:. : :: :
XP_006 TGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEECGKGFKCPSTLTTHKFFVYCRE
480 490 500 510 520 530
XP_006 VAVLLENCYSHLYPH
540 550
>>XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (550 aa)
initn: 3946 init1: 1540 opt: 1820 Z-score: 1025.0 bits: 199.4 E(85289): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 1820; 49.1% identity (75.0% similar) in 527 aa overlap (6-524:4-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MALRSVMFSDVSIDFSPEEWEYLDLEQKDLYRDVMLENYSNLVSLGCFISKPDVISSLEQ
..: ::.:.:: :::. :: :..:::.:::::: ::: :: .::::.:. :::
XP_011 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 GKEPWKVVRKGRRQYPDLETKYETKKLSLENDIYEINLSQWKI-MERIENHGLKGLILKN
::.: . .. :.. .. .. : :..: . : :. ..: ::.: .: .:.
XP_011 GKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD---SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DWESTGKIEGQERPQEG---YFSSVKMPSEKVSSY----QKRTSVTPHQRLHFVDKPYEC
::. . . ..: .: :..... . ..: .: .. . :. : ::..:
XP_011 GCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KECGKAFRVRQQLTFHHRIHTGEKPYECKECGMAFRQTAHLTRHQRLHSGEKLYECKECG
:::::: . :: :..:::::::..:.::: :: ..::: :.:.:.::: :.:..::
XP_011 IECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EAFICGADLRVHQKMHIGEKPYECKECGKAFRVRGQLTLHQRIHTGEKPYVCKECGKAFR
.:: . : .:. .: :::::.:.::::::. ..:: :. :::::::: :.::::::.
XP_011 KAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 QYAHLTRHQKLNSADRLYECKECGKAFLCGSGLRVHHKLHTGEKPYECKECGKAFRVRQQ
. . :: :. ..:... :.:.:::::: : : .:...:::::::.:.:::.::. ..
XP_011 RSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LTLHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGYHLILHHRIHTGEKPYECKECWKAFSRYSQLISH
:: :. ::.:::::.:.::::.:. . :: :.:::::::::.:.:: .::. :.: .:
XP_011 LTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QSIHIGVKPYDCKECGKAFRLLSQLTQHQSIHIGEKPYKCKECGKAFRLRQKLTLHQSIH
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