Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1953, 942 aa
1>>>pF1KA1953 942 - 942 aa - 942 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7638+/-0.000862; mu= 18.9591+/- 0.052
mean_var=71.6478+/-14.197, 0's: 0 Z-trim(106.1): 29 B-trim: 8 in 1/52
Lambda= 0.151521
statistics sampled from 8759 (8783) to 8759 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31140.2 ITIH5 gene_id:80760|Hs108|chr10 ( 728) 4820 1063.3 0
CCDS31141.1 ITIH2 gene_id:3698|Hs108|chr10 ( 946) 1561 350.9 6.6e-96
CCDS14361.1 ITIH6 gene_id:347365|Hs108|chrX (1313) 1418 319.7 2.3e-86
CCDS2864.1 ITIH1 gene_id:3697|Hs108|chr3 ( 911) 1314 296.9 1.1e-79
CCDS54596.1 ITIH4 gene_id:3700|Hs108|chr3 ( 900) 1255 284.0 8.6e-76
CCDS2865.1 ITIH4 gene_id:3700|Hs108|chr3 ( 930) 1249 282.7 2.2e-75
CCDS46845.1 ITIH3 gene_id:3699|Hs108|chr3 ( 890) 1200 272.0 3.6e-72
CCDS54595.1 ITIH1 gene_id:3697|Hs108|chr3 ( 623) 976 223.0 1.4e-57
>>CCDS31140.2 ITIH5 gene_id:80760|Hs108|chr10 (728 aa)
initn: 4820 init1: 4820 opt: 4820 Z-score: 5687.3 bits: 1063.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4820; 99.9% identity (100.0% similar) in 724 aa overlap (219-942:5-728)
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQAR
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CCDS31 MRNYDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQAR
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 IAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVG
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPT
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAAR
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRI
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CCDS31 GQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRI
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVR
280 290 300 310 320 330
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQAL
340 350 360 370 380 390
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQ
400 410 420 430 440 450
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAP
460 470 480 490 500 510
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 APPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 APPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEV
520 530 540 550 560 570
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQ
580 590 600 610 620 630
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFAR
640 650 660 670 680 690
910 920 930 940
pF1KA1 NNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
:::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS31 NNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGRGMSREL
700 710 720
>>CCDS31141.1 ITIH2 gene_id:3698|Hs108|chr10 (946 aa)
initn: 1700 init1: 874 opt: 1561 Z-score: 1835.3 bits: 350.9 E(32554): 6.6e-96
Smith-Waterman score: 1700; 34.7% identity (67.0% similar) in 897 aa overlap (54-923:75-935)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 WGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTIISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDI
..:.::: ::.: : .. ...: . . :..
CCDS31 LVAENRRYQRSLPGESEEMMEEVDQVTLYSYKVQSTITSRMATTMIQSKVVNNSPQPQNV
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 EFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGDRVKEK-RNKTTE--ENGEKGTEI
:..::: .:::.::.: . :.... : :. . .. . ..::. ... :
CCDS31 VFDVQIPKGAFISNFSMTVDGKTFRSSIKEKTVGRALYAQARAKGKTAGLVRSSALDMEN
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 FRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILESAGIASL
::. . . :. : : :.:. :.::.::: : ..: .:. .: ::: ..: :. :
CCDS31 FRTEVNVLPGAKVQFELHYQEVKWRKLGSYEHRIYLQPGRLAKHLEVDVWVIEPQGLRFL
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KA1 EVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQARIAQN----GILG
.: : . .:. :. : ::.... :.. :::::.:: :: : .. :
CCDS31 HV-P-------DTFEGHFDGVP----VISKGQQKAHVSFKPTVAQQ-RICPNCRETAVDG
230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 DFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTKLRQTKD
.... :::.::.. :...:.::::::.::: .: :.:::..::.: :.:: :.:..:: .
CCDS31 ELVVLYDVKREEKAGELEVFNGYFVHFFAPDNLDPIPKNILFVIDVSGSMWGVKMKQTVE
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 ALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGA
:. ::: ::: .:.::.: :.. :..:.. :::.: .. :.: ::....:.:::.:: :
CCDS31 AMKTILDDLRAEDHFSVIDFNQNIRTWRNDLISATKTQVADAKRYIEKIQPSGGTNINEA
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 LQRAIRLLNKYVAHSGIGD-RSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFT
: ::: .::. . . :. : :::::....:: ::::: . :: .:..: . .. .:.
CCDS31 LLRAIFILNE-ANNLGLLDPNSVSLIILVSDGDPTVGELKLSKIQKNVKENIQDNISLFS
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 IGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSV
.:.: :::. .:..:: :: :...:.. ..:..::: ::... :::: .....:: .::
CCDS31 LGMGFDVDYDFLKRLSNENHGIAQRIYGNQDTSSQLKKFYNQVSTPLLRNVQFNYPHTSV
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKD
...:.. : :::.::::..:::. :::... .::.... ..:.: . . .:
CCDS31 TDVTQNNFHNYFGGSEIVVAGKFDPAKLDQIESVITATSANTQLVLET---LAQMDDLQD
520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFL
.. : ..: . ..::.::: ..::. . :.:. . ........
CCDS31 FLSK-----DKHADPDFTRKLWAYLTINQLLAERSLAPTAAAKRRITRSILQMSLDHHIV
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650 660
pF1KA1 TPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGM-----SAAM--GPEPVVQSVRG-AGTQPGPLLKKPY
::.::. ... . : .: . :.:. : . : .:. . :. .: :...
CCDS31 TPLTSLVIENEAGDERMLADAPPQDPSCCSGALYYGSKVVPDSTPSWANPSPTPVISMLA
630 640 650 660 670 680
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QPRIKISKTS------VDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVN
: . .: :..::::.. .: :. ..:::::..:: :: :::: .::..::
CCDS31 QGSQVLESTPPPHVMRVENDPHFIIYLPKSQKNICFNIDSEPGKILNLVSDP-ESGIVVN
690 700 710 720 730 740
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILD-GGDRLVLPCNQSVV
:.:.:: : :: : ::. . . . . : .::. . :. :.. . : ....
CCDS31 GQLVGAKKPNNG--KLSTYFGKLGFYF-QSEDIKIEISTETITLSHGSSTFSLSWSDTAQ
750 760 770 780 790
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 VGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHG
: . ...::. . ::.:.. ..: .:.: : : . ::.:: .. .: . ::
CCDS31 VTNQRVQISVKKEKVVTITLDKEMSFSVLLHRVWKKHPVNVDFLGIYIPPTNKFSPKAHG
800 810 820 830 840 850
850 860 870 880 890
pF1KA1 LLGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGE-
:.:::. :. .. :... : : ::: . :::... .. .: : .
CCDS31 LIGQFM-QEPKIHIFNERPGKD---P------EKPEASMEVKGQKLIITRGLQKDYRTDL
860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KA1 ---EQIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
.. :::..:.. .:::.::::.
CCDS31 VFGTDVTCWFVHNSGKGFIDGHYKDYFVPQLYSFLKRP
910 920 930 940
>>CCDS14361.1 ITIH6 gene_id:347365|Hs108|chrX (1313 aa)
initn: 1624 init1: 451 opt: 1418 Z-score: 1664.2 bits: 319.7 E(32554): 2.3e-86
Smith-Waterman score: 1434; 33.3% identity (63.5% similar) in 871 aa overlap (47-887:33-862)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 SQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTIISRYAFTTVSCRMLNR
:: ::: .:..::..:::: : :. ..:
CCDS14 GWRYLICVSFLLTILLELTYQGPPVPASSSTKLLMTSYSMRSTVVSRYAHTLVTSVLFNP
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 ASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGDRVKE---KRNKTTEEN
.: .. :....: :::.:::: :..::: .:. .::... .. : ...::. .
CCDS14 HAEAHEAIFDLDLPHLAFISNFTMTINNKVYIAEV--KEKHQAKKIYEEAHQQGKTAAHV
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 G--EKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNI
: .. .: :: :. . . ...: :.:::::::. :.:. .:.:: :: :::..:..
CCDS14 GIRDRESEKFRISTSLAAGTEVTFSLAYEELLQRHQGQYQLVVSLRPGQLVKRLSIEVTV
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 LESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRG-EDDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQARIA
: .::. ... ::...: : .... : :: :::: :...:: . : . ::. .:. :.
CCDS14 SERTGISYVHIPPLRTGRLRTNAHASEVDS--PPSTRIERGETCVRITYCPTLQDQSSIS
190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 QNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTK
.::..::...::: :. :::.:. . ::.:::::. :::. ::::::.: :.:: :::
CCDS14 GSGIMADFLVQYDVVMEDIIGDVQIYDDYFIHYFAPRGLPPMEKNVVFVIDVSSSMFGTK
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360
pF1KA1 LRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWK-DHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTG
..::: :. .:: ::. .: :.::.::. ..::: :..: ......: :.: : :
CCDS14 MEQTKTAMNVILSDLQANDYFNIISFSDTVNVWKAGGSIQATIQNVHSAKDYLHCMEADG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDR--SVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAA
::.:.:: : .::. . : : . ::.:::::.::.: : ::.:.:.:
CCDS14 WTDVNSALLAAASVLNHSNQEPGRGPSVGRIPLIIFLTDGEPTAGVTTPSVILSNVRQAL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIR
.: .:....:.:.:: ::..::::: :..::..:. ::. :: :.:.:: :::.:.:
CCDS14 GHRVSLFSLAFGDDADFTLLRRLSLENRGIARRIYEDTDAALQLKGLYEEISMPLLADVR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLD-HLHVEVTASNSKKFIILKTDVP
..: . : . ..:::::.:::...::.. : . .:. . . ... .. ...
CCDS14 LNYLGGLVGASPWAVFPNYFGGSELVVAGQVQPGKQELGIHLAARGPKDQLLVAHHSEGA
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 VRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNH-IERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRA
. .. . : : : .. : :.:::.:.: :::.. .:. : .. : ..
CCDS14 TNNSQKAFGCPGEPAP------NVAHFIRRLWAYVTIGELLDAHFQARDTTTRHLLAAKV
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KA1 QALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPE---PVVQSVRGAGT---QP
:.. : :.::.::. . : .. . : . :.. ::. : .: .: :. ::
CCDS14 LNLSLEYNFVTPLTSLVMVQP--KQASEETRRQTSTSAGPDTIMPSSSSRHGLGVSTAQP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 GPLLK------KPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDH
. . : .: .:.. .:.:.. . ... . : : . ..: . .
CCDS14 ALVPKVISPKSRPVKPKFYLSSTTTASTKKMLSSKELEPLGESPHTLSMPTYPKAKIPAQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 RDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVL
.:::. .. : : :::. . . : . :. . .. : .:
CCDS14 QDSGTLAQPTLRTKP----------------TILVPSNSGTLLPLKPGSLSHQNPD--IL
720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANS-E
: :. . : . .: .:. .. : .: .::. .. .:: ... .
CCDS14 PTNSRTQVPPVKPGIPASPKAD-------TVKCVTPLH--SKPGAPSHPQLGALTSQAPK
760 770 780 790 800
840 850 860 870 880
pF1KA1 GLSSNCHGLLGQFLNQDARLTEDPAGPS----QNLTH--PLLLQVGEGPEAVLTVKGHQV
:: .. :. . . : : :. .:. : : .: ... :. .:..:
CCDS14 GLPQSRPGV-STLQVPKYPLHTRPRVPAPKTRNNMPHLGPGIL-LSKTPKILLSLKPSAP
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 PVVWKQRKIYNGEEQIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
:
CCDS14 PHQISTSISLSKPETPNPHMPQTPLPPRPDRPRPPLPESLSTFPNTISSSTGPSSTTTTS
870 880 890 900 910 920
>--
initn: 521 init1: 343 opt: 542 Z-score: 629.2 bits: 128.3 E(32554): 9.9e-29
Smith-Waterman score: 556; 31.7% identity (57.2% similar) in 388 aa overlap (546-923:959-1312)
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIER
: :: .. .: :: ::. ..
CCDS14 MPFTPTLPPGRFWHQYDLLPGPQRTRQVLGPSRPGVPTMSLLNSSRP--TPEGSPPNLPI
930 940 950 960 970 980
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 LWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGP----VPRMD
: : .: : ::. .: ..... . . :.: . . . : : :
CCDS14 LLPSSILPEAISLLLL----PEELELLSESMVESKFVESLNPPAFYTFLTPDEDGSPNWD
990 1000 1010 1020 1030 1040
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 GLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLS
: : . ...: : :... :.. : : : : : ..:::::::::...: :
CCDS14 GNSE-EILGGAGG------SMESQGSSVG--LAKGTLPSIFTFSSSVDGDPHFVIQIPHS
1050 1060 1070 1080 1090
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 RLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKKQ-RTYLRTITILINK
. .::...:.:::.:.:. : . .:. :.:.:.::: : ::: : :::.. ::. .:
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pF1KA1 PERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILI
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CCDS14 PRAYTITISRSSISLRGEGTLRLSWDQPALLKRPQLELYVAAAARLTLRLGPYLEFLVLR
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pF1KA1 LIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSY-LEITPSRVILDGG-DRLVLPCNQSVVV
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CCDS28 LIGNKARSPGQHDGTYFGR---LGIANPATDFQLEVTPQNITLNPGFGGPVFSWRDQAVL
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pF1KA1 LGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEE-
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CCDS28 LGQFFH--------PIGFEVSDIHPG--SDPTKPDATMVVRNRRLTVTRGLQKDYSKDPW
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pF1KA1 ---QIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
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CCDS28 HGAEVSCWFIHNNGAGLIDGAYTDYIVPDIF
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pF1KA1 YLEITPSRVILDGGDRL-VLPCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLY
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CCDS54 WVHASPEHVVVTRNRRSSAYKWKETLFSVMPGLKMTMDKTGLLLLSDPDKVTIGLLFWDG
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CCDS28 TFQMELPKKAFITNFSMIIDGMTYPGIIKEKAEAQAQYSAAVAKGKSAGLVKATG-RNME
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CCDS28 EVTQNNFRLLFKGSEMVVAGKLQDRGPDVLTATVSGKLPTQNITFQTESSVAEQEAEFQ-
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CCDS28 PLTSMVVTKP----DDQEQSQ-----VAEKPMEGESRNRNVHSGSTFFKYYLQGAKIPKP
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pF1KA1 SVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKK
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CCDS28 EASFSPRRGWNRQAGAAGSRMNFRPGVLSSRQLGLPGPPDVPDHAAYHPFRRLAILPASA
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CCDS46 SGFPRSPFRLLGKRSLPEGVANGIEVYSTKINSKVTSRFAHNVVTMRAVNRADTAKEVSF
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CCDS46 DVELPKTAFITNFTLTIDGVTYPGNVKEKEVAKKQYEKAVSQGKTAGLVKASGRK-LEKF
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pF1KA1 RASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILESAGIASLE
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CCDS46 TVSVNVAAGSKVTFELTYEELLKRHKGKYEMYLKVQPKQLVKHFEIEVDIFEPQGISMLD
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CCDS46 AEASFITNDLLGSALTKSFSGKK-----------GHVSFKPSLDQQRSCPTCTDSLLNGD
200 210 220 230 240
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pF1KA1 FIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTKLRQTKDA
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