Result of FASTA (omim) for
pF1KA1953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1953, 942 aa
1>>>pF1KA1953 942 - 942 aa - 942 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9080+/-0.000363; mu= 18.1922+/- 0.023
mean_var=73.0751+/-14.348, 0's: 0 Z-trim(113.2): 49 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.150034
statistics sampled from 22332 (22381) to 22332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 10.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_085046 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin inhib ( 942) 6214 1354.9 0
NP_116206 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin inhib ( 728) 4820 1053.1 0
NP_001001851 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin in ( 702) 4435 969.7 0
XP_011518015 (OMIM: 609783) PREDICTED: inter-alpha ( 967) 4200 918.9 0
XP_011518016 (OMIM: 609783) PREDICTED: inter-alpha ( 727) 2421 533.8 1.2e-150
NP_002207 (OMIM: 146640) inter-alpha-trypsin inhib ( 946) 1561 347.7 1.6e-94
NP_002206 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin inhib ( 911) 1314 294.2 1.9e-78
NP_001159921 (OMIM: 143890,600564) inter-alpha-try ( 900) 1255 281.5 1.3e-74
NP_002209 (OMIM: 143890,600564) inter-alpha-trypsi ( 930) 1249 280.2 3.4e-74
NP_001159906 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin in ( 769) 1208 271.3 1.4e-71
NP_002208 (OMIM: 146650) inter-alpha-trypsin inhib ( 890) 1200 269.6 5.1e-71
XP_005265162 (OMIM: 146650) PREDICTED: inter-alpha ( 927) 1200 269.6 5.3e-71
NP_001159907 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin in ( 623) 976 221.0 1.5e-56
NP_001159908 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin in ( 623) 976 221.0 1.5e-56
XP_016861845 (OMIM: 146650) PREDICTED: inter-alpha ( 596) 683 157.6 1.7e-37
XP_011532254 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 617) 171 46.8 0.00041
XP_011532253 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 619) 171 46.8 0.00041
XP_011532252 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 623) 171 46.8 0.00042
XP_011532251 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 653) 171 46.8 0.00043
XP_016862341 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 654) 171 46.8 0.00043
XP_011532250 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 819) 171 46.8 0.00053
XP_016862340 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 914) 171 46.8 0.00058
XP_011532249 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1012) 171 46.9 0.00064
XP_011532248 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1043) 171 46.9 0.00066
NP_060868 (OMIM: 606399) voltage-dependent calcium (1091) 171 46.9 0.00068
XP_011532255 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 617) 167 45.9 0.00075
XP_016862339 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1061) 167 46.0 0.0012
XP_005265375 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1085) 167 46.0 0.0012
>>NP_085046 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin inhibitor (942 aa)
initn: 6214 init1: 6214 opt: 6214 Z-score: 7261.0 bits: 1354.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6214; 99.9% identity (100.0% similar) in 942 aa overlap (1-942:1-942)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DSSASMVGTKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 DSSASMVGTKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 YIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 YIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 NNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 PLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 LKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 LRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 PLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NGELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 NGELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 VGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 VGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LLGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_085 LLGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KA1 QIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_085 QIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGRGMSREL
910 920 930 940
>>NP_116206 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin inhibitor (728 aa)
initn: 4820 init1: 4820 opt: 4820 Z-score: 5632.1 bits: 1053.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4820; 99.9% identity (100.0% similar) in 724 aa overlap (219-942:5-728)
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQAR
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MRNYDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQAR
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 IAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 IAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVG
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 TKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPT
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAAR
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 GQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRI
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 DYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVR
280 290 300 310 320 330
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQAL
340 350 360 370 380 390
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 AVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQ
400 410 420 430 440 450
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 PRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAP
460 470 480 490 500 510
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 APPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 APPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEV
520 530 540 550 560 570
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQ
580 590 600 610 620 630
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 DARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFAR
640 650 660 670 680 690
910 920 930 940
pF1KA1 NNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
:::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_116 NNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGRGMSREL
700 710 720
>>NP_001001851 (OMIM: 609783) inter-alpha-trypsin inhibi (702 aa)
initn: 4435 init1: 4435 opt: 4435 Z-score: 5182.0 bits: 969.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4435; 99.9% identity (99.9% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DSSASMVGTKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSASMVGTKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 YIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTV
:::::::::::::::::: :
NP_001 PLLKKPYQPRIKISKTSVRGFRREEQIFSNVMKFPFASILEL
670 680 690 700
>>XP_011518015 (OMIM: 609783) PREDICTED: inter-alpha-try (967 aa)
initn: 4200 init1: 4200 opt: 4200 Z-score: 4904.8 bits: 918.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6154; 97.3% identity (97.4% similar) in 967 aa overlap (1-942:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KA1 DSSASMVGTKLRQ-------------------------TKDALFTILHDLRPQDRFSIIG
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
XP_011 DSSASMVGTKLRQDIGFSLAVQNWVPKGYLDISCVTLQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGD
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 GLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIER
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 LWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEE
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640 650 660 670 680 690
pF1KA1 AHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTV
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700 710 720 730 740 750
pF1KA1 CFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSY
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEITPSRVILDGGDRLVLPCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKK
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 PAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGP
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 EAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLG
910 920 930 940 950 960
940
pF1KA1 QGMSREL
.::::::
XP_011 RGMSREL
>>XP_011518016 (OMIM: 609783) PREDICTED: inter-alpha-try (727 aa)
initn: 4428 init1: 2421 opt: 2421 Z-score: 2825.7 bits: 533.8 E(85289): 1.2e-150
Smith-Waterman score: 4375; 96.3% identity (96.3% similar) in 705 aa overlap (1-680:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLLLLGLCLGLSLCVGSQEEAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTVVQQARIAQNGILGDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KA1 DSSASMVGTKLRQ-------------------------TKDALFTILHDLRPQDRFSIIG
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
XP_011 DSSASMVGTKLRQDIGFSLAVQNWVPKGYLDISCVTLQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGD
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 GLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIER
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 LWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPVPRMDGLEE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 AHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_011 AHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQPRIKISKTSVRGFRREEQIFSNVMKFP
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700 710 720 730 740 750
pF1KA1 CFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSY
XP_011 FASILEL
>>NP_002207 (OMIM: 146640) inter-alpha-trypsin inhibitor (946 aa)
initn: 1700 init1: 874 opt: 1561 Z-score: 1817.9 bits: 347.7 E(85289): 1.6e-94
Smith-Waterman score: 1700; 34.7% identity (67.0% similar) in 897 aa overlap (54-923:75-935)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 WGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTIISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDI
..:.::: ::.: : .. ...: . . :..
NP_002 LVAENRRYQRSLPGESEEMMEEVDQVTLYSYKVQSTITSRMATTMIQSKVVNNSPQPQNV
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90 100 110 120 130 140
pF1KA1 EFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGDRVKEK-RNKTTE--ENGEKGTEI
:..::: .:::.::.: . :.... : :. . .. . ..::. ... :
NP_002 VFDVQIPKGAFISNFSMTVDGKTFRSSIKEKTVGRALYAQARAKGKTAGLVRSSALDMEN
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 FRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILESAGIASL
::. . . :. : : :.:. :.::.::: : ..: .:. .: ::: ..: :. :
NP_002 FRTEVNVLPGAKVQFELHYQEVKWRKLGSYEHRIYLQPGRLAKHLEVDVWVIEPQGLRFL
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KA1 EVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQARIAQN----GILG
.: : . .:. :. : ::.... :.. :::::.:: :: : .. :
NP_002 HV-P-------DTFEGHFDGVP----VISKGQQKAHVSFKPTVAQQ-RICPNCRETAVDG
230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 DFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTKLRQTKD
.... :::.::.. :...:.::::::.::: .: :.:::..::.: :.:: :.:..:: .
NP_002 ELVVLYDVKREEKAGELEVFNGYFVHFFAPDNLDPIPKNILFVIDVSGSMWGVKMKQTVE
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 ALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGA
:. ::: ::: .:.::.: :.. :..:.. :::.: .. :.: ::....:.:::.:: :
NP_002 AMKTILDDLRAEDHFSVIDFNQNIRTWRNDLISATKTQVADAKRYIEKIQPSGGTNINEA
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 LQRAIRLLNKYVAHSGIGD-RSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFT
: ::: .::. . . :. : :::::....:: ::::: . :: .:..: . .. .:.
NP_002 LLRAIFILNE-ANNLGLLDPNSVSLIILVSDGDPTVGELKLSKIQKNVKENIQDNISLFS
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 IGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSV
.:.: :::. .:..:: :: :...:.. ..:..::: ::... :::: .....:: .::
NP_002 LGMGFDVDYDFLKRLSNENHGIAQRIYGNQDTSSQLKKFYNQVSTPLLRNVQFNYPHTSV
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKD
...:.. : :::.::::..:::. :::... .::.... ..:.: . . .:
NP_002 TDVTQNNFHNYFGGSEIVVAGKFDPAKLDQIESVITATSANTQLVLET---LAQMDDLQD
520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFL
.. : ..: . ..::.::: ..::. . :.:. . ........
NP_002 FLSK-----DKHADPDFTRKLWAYLTINQLLAERSLAPTAAAKRRITRSILQMSLDHHIV
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650 660
pF1KA1 TPFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGM-----SAAM--GPEPVVQSVRG-AGTQPGPLLKKPY
::.::. ... . : .: . :.:. : . : .:. . :. .: :...
NP_002 TPLTSLVIENEAGDERMLADAPPQDPSCCSGALYYGSKVVPDSTPSWANPSPTPVISMLA
630 640 650 660 670 680
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QPRIKISKTS------VDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVN
: . .: :..::::.. .: :. ..:::::..:: :: :::: .::..::
NP_002 QGSQVLESTPPPHVMRVENDPHFIIYLPKSQKNICFNIDSEPGKILNLVSDP-ESGIVVN
690 700 710 720 730 740
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GELIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSYLEITPSRVILD-GGDRLVLPCNQSVV
:.:.:: : :: : ::. . . . . : .::. . :. :.. . : ....
NP_002 GQLVGAKKPNNG--KLSTYFGKLGFYF-QSEDIKIEISTETITLSHGSSTFSLSWSDTAQ
750 760 770 780 790
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 VGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHG
: . ...::. . ::.:.. ..: .:.: : : . ::.:: .. .: . ::
NP_002 VTNQRVQISVKKEKVVTITLDKEMSFSVLLHRVWKKHPVNVDFLGIYIPPTNKFSPKAHG
800 810 820 830 840 850
850 860 870 880 890
pF1KA1 LLGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGE-
:.:::. :. .. :... : : ::: . :::... .. .: : .
NP_002 LIGQFM-QEPKIHIFNERPGKD---P------EKPEASMEVKGQKLIITRGLQKDYRTDL
860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KA1 ---EQIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
.. :::..:.. .:::.::::.
NP_002 VFGTDVTCWFVHNSGKGFIDGHYKDYFVPQLYSFLKRP
910 920 930 940
>>NP_002206 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin inhibitor (911 aa)
initn: 1232 init1: 691 opt: 1314 Z-score: 1529.2 bits: 294.2 E(85289): 1.9e-78
Smith-Waterman score: 1530; 31.7% identity (63.9% similar) in 901 aa overlap (50-928:52-911)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 EAQSWGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTIISRYAFTTVSCRMLNRASE
.. ..:. . ::.: .:. ...: :.:
NP_002 LQAMPALGSATGRSKSSEKRQAVDTAVDGVFIRSLKVNCKVTSRFAHYVVTSQVVNTANE
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 DQDIEFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKKSGDRVKEKRNKTTEENGE----
... :...:: .:::..:.. ... :.: ..: .. . .: . :. :
NP_002 AREVAFDLEIPKTAFISDFAVTADGNAFIGDI--KDKVTAWKQYRKAAISGENAGLVRAS
90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 -KGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILES
. : : .. ..:..: :.:::.:.: .:: :.:.:.:: .. .::.:.:
NP_002 GRTMEQFTIHLTVNPQSKVTFQLTYEEVLKRNHMQYEIVIKVKPKQLVHHFEIDVDIFEP
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 AGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDD-SGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQAR--IAQ
::..:.. .. .. . . :: ....:.::: :: .
NP_002 QGISKLDAQASFLPKELAAQTIKKSFSGKK-----------GHVLFRPTVSQQQSCPTCS
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 NGIL-GDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTK
...: : : . :::.:.. : :. : :..:.:.:::..: . ::::::.: :.:: : :
NP_002 TSLLNGHFKVTYDVSRDK-ICDLLVANNHFAHFFAPQNLTNMNKNVVFVIDISGSMRGQK
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 LRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGG
..:::.::. :: :..: : :... :..:.. :: :.... ... .. ... .: .
NP_002 VKQTKEALLKILGDMQPGDYFDLVLFGTRVQSWKGSLVQASEANLQAAQDFVRGFSLDEA
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 TDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQ
:..::.: :.:..::. . .:....:::: :: : : .::.:.:.: ::.
NP_002 TNLNGGLLRGIEILNQVQESLPELSNHASILIMLTDGDPTEGVTDRSQILKNVRNAIRGR
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 VCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDY
....:.:..::: .:: .:.:: : ..:..:..:: .:: :::... ::: :. ..:
NP_002 FPLYNLGFGHNVDFNFLEVMSMENNGRAQRIYEDHDATQQLQGFYSQVAKPLLVDVDLQY
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540
pF1KA1 PPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTA-SNSKKFIILKTDVPVRP
: ..:. :.. .:..::::..::...: : . ....: : .....: : :
NP_002 PQDAVLALTQNHHKQYYEGSEIVVAGRIADNKQSSFKADVQAHGEGQEFSITCL---VDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QKAGKDVTGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALA
.. : . :. ::.::::.::: .:::.. .. : : :. : ..: ..
NP_002 EEMKKLLRER------GHMLENHVERLWAYLTIQELLAKRMKVDRE-ERANLSSQALQMS
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 VSYRFLTPFTSMKLRGPV------PRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLL
..: :.::.:::..:: . : .: : .::. .. .. ::.:
NP_002 LDYGFVTPLTSMSIRGMADQDGLKPTIDKPSEDSPPLEMLGPR---RTFVLSALQPSPTH
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KKPYQPRIKISKTSVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGE
.. :. :.:: ::::.. : .. :.::::. .:: :: ::.: ..: .:::.
NP_002 SSSNTQRLPDRVTGVDTDPHFIIHVPQKEDTLCFNINEEPGVILSLVQDP-NTGFSVNGQ
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LIGAPAPPNGHKKQRTYLRTITILINKPERSY-LEITPSRVILDGG-DRLVLPCNQSVVV
::: : :.. . : . : .: .. ::.::. . :. : :. ...:.
NP_002 LIGNKARSPGQHDGTYFGR---LGIANPATDFQLEVTPQNITLNPGFGGPVFSWRDQAVL
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGL
. :. :... . :..:... . .: ...: : . .. ::::. .:. .:. :::
NP_002 RQDGVVVTINKKRNLVVSVDDGGTFEVVLHRVWKGSSVHQDFLGFYVLDSHRMSARTHGL
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LGQFLNQDARLTEDPAGPSQNLTHPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEE-
::::.. : : . :: . :.:...:..... :. .: :. .
NP_002 LGQFFH--------PIGFEVSDIHPG--SDPTKPDATMVVRNRRLTVTRGLQKDYSKDPW
840 850 860 870 880
910 920 930 940
pF1KA1 ---QIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTGMTLGQGMSREL
...::: .::.: :::: : ::.. :
NP_002 HGAEVSCWFIHNNGAGLIDGAYTDYIVPDIF
890 900 910
>>NP_001159921 (OMIM: 143890,600564) inter-alpha-trypsin (900 aa)
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Smith-Waterman score: 1333; 33.1% identity (61.0% similar) in 885 aa overlap (54-878:38-891)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 WGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTIISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDI
..: : . ::.: :.:. :..:::. :.
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pF1KA1 EFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKK----SGDRVKEKRNKTTEENGEKGTE
:::..: ::::::.:.: .: : : :. . :. .: : .. .: .. :
NP_001 TFQMELPKKAFITNFSMIIDGMTYPGIIKEKAEAQAQYSAAVAKGKSAGLVKATG-RNME
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pF1KA1 IFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILESAGIAS
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NP_001 QFQVSVSVAPNAKITFELVYEELLKRRLGVYELLLKVRPQQLVKHLQMDIHIFEPQGISF
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NP_001 LETESTFMTNQLVD-----------ALTTWQNKTKAHIRFKPTLSQQQKSPEQQETVLDG
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pF1KA1 DFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTKLRQTKD
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NP_001 NLIIRYDVDRAISGGSIQIENGYFVHYFAPEGLTTMPKNVVFVIDKSGSMSGRKIQQTRE
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NP_001 ALIKILDDLSPRDQFNLIVFSTEATQWRPSLVPASAENVNKARSFAAGIQALGGTNINDA
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NP_001 MLMAVQLLDSSNQEERLPEGSVSLIILLTDGDPTVGETNPRSIQNNVREAVSGRYSLFCL
360 370 380 390 400 410
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NP_001 GFGFDVSYAFLEKLALDNGGLARRIHEDSDSALQLQDFYQEVANPLLTAVTFEYPSNAVE
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pF1KA1 QATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDV
..:.. : :.:::...:::: :: : : . :... . : ..:. : :.: .
NP_001 EVTQNNFRLLFKGSEMVVAGKLQDRGPDVLTATVSGKLPTQNITFQTESSVAEQEAEFQ-
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pF1KA1 TGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLT
::. : .::::.::: ..:: . ....: ... ::..: :...: :.:
NP_001 --SPKYIFH-----NFMERLWAYLTIQQLLEQTVSASDA-DQQALRNQALNLSLAYSFVT
540 550 560 570 580
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pF1KA1 PFTSMKLRGPVPR---------MDGL---EEAHGMSAA---MGPEPVVQSVRGAGTQPGP
:.::: . : . :.: ...:. .:: :. .: : : : : :::
NP_001 PLTSMVVTKPDDQEQSQVAEKPMEGESRNRNVHSAGAAGSRMNFRPGVLSSRQLGL-PGP
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pF1KA1 LL---KKPYQP--RIKISKTSV-----DGDPHF--VVDFPLSRLTVCFNIDGQ-------
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NP_001 PDVPDHAAYHPFRRLAILPASAPPATSNPDPAVSRVMNMKIEETTMTTQTPAPIQAPSAI
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pF1KA1 ---PGD-ILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAP----PNGHKKQRTYLRTITILINKPERS
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NP_001 LPLPGQSVERLCVDPRHRQGPVN--LLSDPEQGVEVTGQYEREKAGFSWIEVTFKNPL-V
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760 770 780 790 800 810
pF1KA1 YLEITPSRVILDGGDRL-VLPCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLY
... .: .:.. . : . .... ::..... .. . .. .... .:.
NP_001 WVHASPEHVVVTRNRRSSAYKWKETLFSVMPGLKMTMDKTGLLLLSDPDKVTIGLLFWDG
770 780 790 800 810 820
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pF1KA1 KKPAPFQRHHLGFYIANSEGLSSNCHGLLGQFLNQ----------DARLTEDPAGPSQNL
. . : . . ... .::. : :::: .. :.: : : ...
NP_001 RGEG------LRLLLRDTDRFSSHVGGTLGQFYQEVLWGSPAASDDGRRTLRVQGNDHSA
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pF1KA1 THPLLLQVGEGPEAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEEQIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYL
:. :. ::: .:
NP_001 TRERRLDYQEGPPGVEISCWSVEL
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Smith-Waterman score: 1329; 38.5% identity (66.2% similar) in 636 aa overlap (54-682:38-643)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 WGHSSEQDGLRVPRQVRLLQRLKTKPLMTEFSVKSTIISRYAFTTVSCRMLNRASEDQDI
..: : . ::.: :.:. :..:::. :.
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pF1KA1 EFQMQIPAAAFITNFTMLIGDKVYQGEITEREKK----SGDRVKEKRNKTTEENGEKGTE
:::..: ::::::.:.: .: : : :. . :. .: : .. .: .. :
NP_002 TFQMELPKKAFITNFSMIIDGMTYPGIIKEKAEAQAQYSAAVAKGKSAGLVKATG-RNME
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pF1KA1 IFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLGKYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILESAGIAS
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NP_002 QFQVSVSVAPNAKITFELVYEELLKRRLGVYELLLKVRPQQLVKHLQMDIHIFEPQGISF
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pF1KA1 LEVLPLHNSRQRGSGRGEDDSGPPPSTVINQNETFANIIFKPTVVQQARIA--QNGIL-G
::. . : . . . ::.: :.: ::::. :: . :. .: :
NP_002 LETESTFMTNQLVD-----------ALTTWQNKTKAHIRFKPTLSQQQKSPEQQETVLDG
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pF1KA1 DFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYFAPKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTKLRQTKD
..::::::.: : :.::. ::::::::::. : .:::::::.:.:.:: : :..::..
NP_002 NLIIRYDVDRAISGGSIQIENGYFVHYFAPEGLTTMPKNVVFVIDKSGSMSGRKIQQTRE
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pF1KA1 ALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWKDHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGA
::. :: :: :.:.:..: ::.. :. :. .. ... .. . .. :::.:: :
NP_002 ALIKILDDLSPRDQFNLIVFSTEATQWRPSLVPASAENVNKARSFAAGIQALGGTNINDA
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 LQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFLTDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFTI
. :..::.. . . . :::::..:::: ::::::. .: ::.:::. :. .: .
NP_002 MLMAVQLLDSSNQEERLPEGSVSLIILLTDGDPTVGETNPRSIQNNVREAVSGRYSLFCL
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 GIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEEEDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSVV
:.: ::.. .::::.:.: ::.::.::. :.. :: ::.:. .:::. . ..:: ..:
NP_002 GFGFDVSYAFLEKLALDNGGLARRIHEDSDSALQLQDFYQEVANPLLTAVTFEYPSNAVE
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pF1KA1 QATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLDHLHVEVTASNSKKFIILKTDVPVRPQKAGKDV
..:.. : :.:::...:::: :: : : . :... . : ..:. : :.: .
NP_002 EVTQNNFRLLFKGSEMVVAGKLQDRGPDVLTATVSGKLPTQNITFQTESSVAEQEAEFQ-
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 TGSPRPGGDGEGDTNHIERLWSYLTTKELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLT
::. : .::::.::: ..:: . ....: ... ::..: :...: :.:
NP_002 --SPKYIFH-----NFMERLWAYLTIQQLLEQTVSASDA-DQQALRNQALNLSLAYSFVT
540 550 560 570 580
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pF1KA1 PFTSMKLRGPVPRMDGLEEAHGMSAAMGPEPVVQSVRGAGTQPGPLLKKPYQPRIKISKT
:.::: . : : :... .. .:. :. ... : . : : :: :
NP_002 PLTSMVVTKP----DDQEQSQ-----VAEKPMEGESRNRNVHSGSTFFKYYLQGAKIPKP
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pF1KA1 SVDGDPHFVVDFPLSRLTVCFNIDGQPGDILRLVSDHRDSGVTVNGELIGAPAPPNGHKK
.. .:
NP_002 EASFSPRRGWNRQAGAAGSRMNFRPGVLSSRQLGLPGPPDVPDHAAYHPFRRLAILPASA
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>>NP_001159906 (OMIM: 147270) inter-alpha-trypsin inhibi (769 aa)
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pF1KA1 GEITEREKKSGDRVKEKRNKTTEENGEKGTEIFRASAVIPSKDKAAFFLSYEELLQRRLG
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NP_001 MEQFTIHLTVNPQSKVTFQLTYEEVLKRNHM
10 20 30
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pF1KA1 KYEHSISVRPQQLSGRLSVDVNILESAGIASLEVLPLHNSRQRGSGRGEDD-SGPPPSTV
.:: :.:.:.:: .. .::.:.: ::..:.. .. .. . . ::
NP_001 QYEIVIKVKPKQLVHHFEIDVDIFEPQGISKLDAQASFLPKELAAQTIKKSFSGKK----
40 50 60 70 80
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pF1KA1 INQNETFANIIFKPTVVQQAR--IAQNGIL-GDFIIRYDVNREQSIGDIQVLNGYFVHYF
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NP_001 -------GHVLFRPTVSQQQSCPTCSTSLLNGHFKVTYDVSRDK-ICDLLVANNHFAHFF
90 100 110 120 130
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pF1KA1 APKDLPPLPKNVVFVLDSSASMVGTKLRQTKDALFTILHDLRPQDRFSIIGFSNRIKVWK
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NP_001 APQNLTNMNKNVVFVIDISGSMRGQKVKQTKEALLKILGDMQPGDYFDLVLFGTRVQSWK
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pF1KA1 DHLISVTPDSIRDGKVYIHHMSPTGGTDINGALQRAIRLLNKYVAHSGIGDRSVSLIVFL
:.... ... .. ... .: .:..::.: :.:..::. . .:....:
NP_001 GSLVQASEANLQAAQDFVRGFSLDEATNLNGGLLRGIEILNQVQESLPELSNHASILIML
200 210 220 230 240 250
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pF1KA1 TDGKPTVGETHTLKILNNTREAARGQVCIFTIGIGNDVDFRLLEKLSLENCGLTRRVHEE
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NP_001 TDGDPTEGVTDRSQILKNVRNAIRGRFPLYNLGFGHNVDFNFLEVMSMENNGRAQRIYED
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pF1KA1 EDAGSQLIGFYDEIRTPLLSDIRIDYPPSSVVQATKTLFPNYFNGSEIIIAGKLVDRKLD
.:: .:: :::... ::: :. ..:: ..:. :.. .:..::::..::...: : .
NP_001 HDATQQLQGFYSQVAKPLLVDVDLQYPQDAVLALTQNHHKQYYEGSEIVVAGRIADNKQS
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NP_001 SFKADVQAHGEGQEFSITCL---VDEEEMKKLLRER------GHMLENHVERLWAYLTIQ
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pF1KA1 ELLSSWLQSDDEPEKERLRQRAQALAVSYRFLTPFTSMKLRGPV------PRMDGLEEAH
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NP_001 ELLAKRMKVDRE-ERANLSSQALQMSLDYGFVTPLTSMSIRGMADQDGLKPTIDKPSEDS
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pF1KA1 EITPSRVILDGG-DRLVLPCNQSVVVGSWGLEVSVSANANVTVTIQGSIAFVILIHLYKK
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NP_001 EVTPQNITLNPGFGGPVFSWRDQAVLRQDGVVVTINKKRNLVVSVDDGGTFEVVLHRVWK
610 620 630 640 650 660
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. .. ::::. .:. .:. :::::::.. : : . :: . :
NP_001 GSSVHQDFLGFYVLDSHRMSARTHGLLGQFFH--------PIGFEVSDIHPG--SDPTKP
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pF1KA1 EAVLTVKGHQVPVVWKQRKIYNGEE----QIDCWFARNNAAKLIDGEYKDYLASHPFDTG
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NP_001 DATMVVRNRRLTVTRGLQKDYSKDPWHGAEVSCWFIHNNGAGLIDGAYTDYIVPDIF
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940
pF1KA1 MTLGQGMSREL
942 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:19:01 2016 done: Wed Nov 2 22:19:03 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]