Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1973
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1973, 1115 aa
1>>>pF1KA1973 1115 - 1115 aa - 1115 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8994+/-0.00103; mu= 15.2910+/- 0.062
mean_var=123.7264+/-24.114, 0's: 0 Z-trim(108.6): 48 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.115304
statistics sampled from 10304 (10349) to 10304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 4.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 7535 1265.6 0
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 3051 519.6 1.4e-146
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 929 166.6 2.3e-40
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 929 166.6 2.3e-40
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 928 166.4 2.6e-40
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 928 166.5 2.7e-40
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 928 166.5 2.7e-40
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 919 165.1 9.9e-40
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 914 164.2 1.7e-39
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 914 164.3 1.9e-39
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 891 160.4 2.7e-38
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 864 155.8 4e-37
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 865 156.1 4.7e-37
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 620 115.2 7e-25
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 620 115.2 7.1e-25
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 605 112.7 3.9e-24
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 605 112.7 3.9e-24
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 605 112.7 3.9e-24
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 590 110.2 2.2e-23
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 585 109.4 3.7e-23
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 582 108.9 5.4e-23
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 582 108.9 5.5e-23
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 541 102.1 6.6e-21
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 533 100.8 1.7e-20
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 520 98.6 7.3e-20
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 443 85.8 5e-16
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 443 85.8 5.4e-16
>>CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115 aa)
initn: 7535 init1: 7535 opt: 7535 Z-score: 6775.8 bits: 1265.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7535; 99.9% identity (100.0% similar) in 1115 aa overlap (1-1115:1-1115)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIRIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110
pF1KA1 ELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
1090 1100 1110
>>CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043 aa)
initn: 3248 init1: 2282 opt: 3051 Z-score: 2745.0 bits: 519.6 E(32554): 1.4e-146
Smith-Waterman score: 3246; 49.8% identity (72.8% similar) in 1035 aa overlap (95-1103:6-1007)
70 80 90 100 110
pF1KA1 ASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLH-GRGPPGSR-KP-------GE
: ::: .: : : :.. .: :
CCDS32 MEFVRALWLGLALALGPGSAGGHPQPCGVLARLGG
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GARAEALWPRDALLFAVDN--LNR--VEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSS
..: :: :: : : : : . ::.:::::.:.: .
CCDS32 SVRLGALLPRAPLARARARAALARAALAPRLPHNLSLELVVA-----------------A
40 50 60 70
180 190 200 210 220
pF1KA1 PWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEF--P
: . :: :. ...:...: ::.::::::... :...: ... . . ::.:..:.: :
CCDS32 PPARDPASLTRGLCQALVPPGVAALLAFPEARPELLQLHFLAAATETPVLSLLRREARAP
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQ-EDWNITDFLLLTQNNSK
. ::.:::: . : . :: :..: . : . .: ::. .: . : .. .
CCDS32 LGAPNPFHLQLHWASPLETLLDVLVAVLQAHAWEDVGLALCRTQDPGGLVALWTSRAGRP
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESI--KNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFG
.: ..... . : . : . . . .:..:..:::. ::..:
CCDS32 PQL--VLDLSRRDTGDAGLRARLAPMAAPVGGEAPVPAAVLLGCDIARARRVLE------
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 VMPPELRWVLGDSQNVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMI
..:: .:.:: . : : ::: ::.: :.... .: ..: ..:::::...:...
CCDS32 AVPPGPHWLLGTPLPPKALPTAGLPPGLLALGEVARPPLEAAIHDIVQLVARALGSAAQV
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 QPELALIPSTMNCMEVETTNLTS-GQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFI
::. ::.:. .:: ... .. : :..:.::::::.:.: .: . : ::. : .: .
CCDS32 QPKRALLPAPVNCGDLQPAGPESPGRFLARFLANTSFQGRTGPVWVTGSSQVHMSRHFKV
320 330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 WNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPF
:.:..:: : : :. .:::. :.. .. : . . :. ::::::.::::
CCDS32 WSLRRDPRGAPAWATVGSWRDGQLDLEPGGASARPPPPQGAQVWPK---LRVVTLLEHPF
380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 VFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLE
::.:. :..: :::::::::: ::::.:::.::..: .: ..: ..::::::::::::
CCDS32 VFARDPDEDGQCPAGQLCLDPGTNDSATLDALFAAL--ANGSAPRALRKCCYGYCIDLLE
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 KIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFT
..::: :::.::.:::::::: ..:.::::::::: : :::::::::::.:::::.:::
CCDS32 RLAEDTPFDFELYLVGDGKYGALRDGRWTGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFT
490 500 510 520 530 540
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 SPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTP
::::::::::.::.::::.:::::::::::. :::.:.:::.::.:::.:::.::.::::
CCDS32 SPFFSTSLGIMVRARDTASPIGAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTP
550 560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 KGRNRSKVFSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLA
.::::: :::.:::::.:::.:: :::. : ::: :::.:::::::::.. ::.::::::
CCDS32 RGRNRSTVFSYSSALNLCYAILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLA
610 620 630 640 650 660
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 AVMVGEKIYEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPAT
:::::.: .::::::::::::::.:::::::: ::::: :...:::.:: .:::...:.:
CCDS32 AVMVGDKTFEELSGIHDPKLHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHMRRHSAPTT
670 680 690 700 710 720
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 PDGVEYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTA
: :: .: .:: ::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.
CCDS32 PRGVAMLTSDPPKLNAFIMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTS
730 740 750 760 770 780
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 NISELISQYKSHGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLS
:.::.::.::: ::.:.::::::..:::::: :::::::::.: ::.:::::::.:.: .
CCDS32 NLSEFISRYKSSGFIDLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSA
790 800 810 820 830 840
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 ILTTIGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINT-----SFIEEKQQHFKTKRV
.:...::: .:: ::::.. :.:::::::::..:::.:: : : . . . .:
CCDS32 LLSSLGEHAFFRLALPRIRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTEPPEGSKEETAEAEPSGPEV
850 860 870 880 890 900
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 EKRSNVG--PRQLTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPAL
:.... : :. . . :..:. : : . . . . : :: :.
CCDS32 EQQQQQQDQPTAPEGWKRARRAVDKERRVRFLLEPA---VVVAPEADAEAEAAPREGPVW
910 920 930 940 950 960
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 RTTNGKADSLNVSRNSVMQELSELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
. :. . . ::.:::..:.: :..:. :. :. .:
CCDS32 LCSYGRPPAARPTGAPQPGELQELERRIEVARERLRQALVRRGQLLAQLGDSARHRPRRL
970 980 990 1000 1010 1020
CCDS32 LQARAAPAEAPPHSGRPGSQE
1030 1040
>>CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 (885 aa)
initn: 660 init1: 244 opt: 929 Z-score: 838.3 bits: 166.6 E(32554): 2.3e-40
Smith-Waterman score: 976; 27.5% identity (61.2% similar) in 833 aa overlap (183-980:77-866)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
CCDS43 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: .. :
CCDS43 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
:. .: : :: . .:: . ..... :.:... ..: .:. :.
CCDS43 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
170 180 190 200 210
330 340 350 360 370
pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
:.... . .. ... ...... :..:. : :. . .:. ::: . .::
CCDS43 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::. .: ..: :
CCDS43 NESA----HISDAVGVVAQAVHE--LLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
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CCDS70 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
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CCDS70 HKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHR
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>>CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 (938 aa)
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CCDS70 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
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CCDS70 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
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CCDS70 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
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pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
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CCDS70 DSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--LSILKSHENGFMED
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pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
: : : : .:: : . . .....:.:.:. :. .:. . : :.:. :
CCDS70 LDKTWVRYQECDSRSNAPA---TLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYK----R
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pF1KA1 IKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWN--TSNLS
:. . :. : . :.:. ... : :. :.: :.. ... ::.:.
CCDS70 HKDARRKQMQLAFA-----AVNV--WRKNLQDRKSGRAEP----DPKKKATFRAITSTLA
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pF1KA1 HDNRRKYIFSDEE-GQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQEL
. .:. .: : .. ..: ..: :: :
CCDS70 SSFKRRRSSKDTSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHRES
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. : :. :.... . .. ... ...... :..:. : :. .
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::. . . . .:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . .
CCDS55 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
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CCDS55 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
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pF1KA1 YEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEY
:...::.::.:..::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. ....
CCDS55 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
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pF1KA1 LKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
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CCDS55 VRDN--KLHAFIWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--L
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CCDS55 SILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNA-PATLTF--ENMAGVFMLVAGGIVAGIFLI
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pF1KA1 IGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPR
. : :.:. : :. . :. : . :.:. ... : :. :.: :.
CCDS55 FIE-IAYK----RHKDARRKQMQLAFA-----AVNV--WRKNLQDRKSGRAEP----DPK
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pF1KA1 QLTVWN--TSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADS
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CCDS55 KKATFRAITSTLASSFKRRRSSKDTQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV
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CCDS12 EYDWTSFVAVTTRAPGH-RAFLSYIEVLTD---GSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQL
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: :: ::.: .. .. . . : .. .:::. : . . ...: .: .
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CCDS12 CI----RDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTN
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:..: .::. : ..:. .:: : ..:: . ..:. :: : :. : ...:..
CCDS12 TVSP-SAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTI
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.... . .::.:. .: .. :. :..... .::.: .. :..::::::: :. :. .
CCDS12 GKSIWLLWALVFNNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDT
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pF1KA1 LSGIHDPKLHHPSQGF---RFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLK
.::. : :...:.. . .:::: ..:.: .:...:.:: :: ::: : . ... ::
CCDS12 VSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLK
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pF1KA1 NDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVG--KPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
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CCDS12 AG--KLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLAL
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pF1KA1 SQYKSHGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIG
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CCDS12 LQFLGDDEIEMLERLWLSGI-CHNDKIEVMSS-KLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAW
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pF1KA1 EHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQL
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CCDS12 EHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAEAAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRP
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CCDS45 EAVAQMLDFISSHTFVPILGI--HGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQD
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CCDS45 YDWHVFSLVTTIFPGYREFISFVKTTVDNS-FVGWDMQNVITLDTSFEDAKT--QVQLKK
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CCDS45 IHSS---VILLYCSKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKE-FPSGLI
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. . . .: :.:.. .. ..:...:.. ... :: . .:. . . :
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CCDS45 WNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRSNGTVSP-SAFLE
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CCDS45 PFSASVWVMMFVMLLIVSAIAVFVFEYFSPVGYNRNLAKGKAPHGPSFTIGKAIWLLWGL
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CCDS45 RPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTG--KLDAFI
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CCDS45 YDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEME
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CCDS45 ELETLWLTGI-CHNEKNEVMSS-QLDIDNMAGVFYMLAAAMALSLITFIWEHLFYWKLRF
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pF1KA1 LLPRI-KNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTS
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CCDS45 CFTGVCSDRPGLLFSI--SRGIYSCIHGVHIEEKKKSPDFNLTGSQSNMLKLLRSAKNIS
850 860 870 880 890 900
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pF1KA1 NLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQ
..:. : .
CCDS45 SMSNMNSSRMDSPKRAADFIQRGSLIMDMVSDKGNLMYSDNRSFQGKESIFGDNMNELQT
910 920 930 940 950 960
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pF1KA1 NLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQG
.:: :.. :: . . .:. ...
CCDS10 TERELRTLWGPEQAAGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQ
50 60 70 80 90 100
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