Result of FASTA (omim) for
pF1KA1973
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1973, 1115 aa
1>>>pF1KA1973 1115 - 1115 aa - 1115 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7084+/-0.000412; mu= 16.4395+/- 0.026
mean_var=125.4483+/-24.936, 0's: 0 Z-trim(115.6): 129 B-trim: 126 in 1/51
Lambda= 0.114510
statistics sampled from 25957 (26086) to 25957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 15.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_597702 (OMIM: 606650) glutamate receptor ionotr (1115) 7535 1257.1 0
XP_011516513 (OMIM: 606650) PREDICTED: glutamate r ( 925) 6288 1051.0 0
NP_619635 (OMIM: 606651) glutamate receptor ionotr (1043) 3051 516.3 3.7e-145
XP_016881732 (OMIM: 606651) PREDICTED: glutamate r ( 582) 1926 330.3 2.1e-89
NP_000823 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 885) 929 165.7 1.1e-39
NP_001172020 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 906) 929 165.7 1.1e-39
XP_011516885 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 892) 928 165.5 1.3e-39
NP_067544 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 901) 928 165.5 1.3e-39
XP_005266128 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922) 928 165.5 1.3e-39
XP_005266129 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 922) 928 165.5 1.3e-39
NP_015566 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ( 938) 928 165.5 1.3e-39
NP_001172019 (OMIM: 138249,614254) glutamate recep ( 943) 928 165.5 1.3e-39
XP_005266130 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glut ( 959) 928 165.6 1.3e-39
XP_011525174 (OMIM: 602717,617162) PREDICTED: glut (1336) 919 164.2 4.8e-39
NP_000827 (OMIM: 602717,617162) glutamate receptor (1336) 919 164.2 4.8e-39
XP_011520763 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1281) 914 163.3 8.2e-39
NP_001127880 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1281) 914 163.3 8.2e-39
XP_011520760 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1307) 914 163.3 8.4e-39
XP_016878662 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1333) 914 163.4 8.5e-39
NP_001127879 (OMIM: 138253,245570) glutamate recep (1464) 914 163.4 9.1e-39
NP_000824 (OMIM: 138253,245570) glutamate receptor (1464) 914 163.4 9.1e-39
XP_016878661 (OMIM: 138253,245570) PREDICTED: glut (1516) 914 163.4 9.4e-39
NP_000825 (OMIM: 138252,613970,616139) glutamate r (1484) 891 159.6 1.3e-37
XP_011518930 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 891 159.6 1.3e-37
XP_011518931 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 891 159.6 1.3e-37
XP_016874708 (OMIM: 138252,613970,616139) PREDICTE (1484) 891 159.6 1.3e-37
NP_001265482 (OMIM: 138254) glutamate receptor ion ( 873) 864 154.9 1.9e-36
NP_000826 (OMIM: 138254) glutamate receptor ionotr (1233) 865 155.2 2.2e-36
XP_006721908 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1308) 865 155.2 2.3e-36
XP_006721909 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1307) 864 155.1 2.6e-36
XP_011522990 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1316) 631 116.6 1e-24
NP_001317922 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 934) 620 114.7 2.7e-24
NP_001317923 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 949) 620 114.7 2.7e-24
NP_001307550 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 763) 605 112.1 1.3e-23
XP_005261001 (OMIM: 138245) PREDICTED: glutamate r ( 903) 605 112.2 1.5e-23
NP_783300 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 905) 605 112.2 1.5e-23
NP_000821 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 918) 605 112.2 1.5e-23
NP_001307545 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 920) 605 112.2 1.5e-23
NP_000822 (OMIM: 138243) glutamate receptor ionotr ( 919) 590 109.7 8.3e-23
NP_786944 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 869) 585 108.9 1.4e-22
XP_011534080 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 869) 585 108.9 1.4e-22
XP_005267003 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 859) 582 108.4 2e-22
XP_011534079 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 892) 582 108.4 2e-22
NP_001159719 (OMIM: 138244,611092) glutamate recep ( 892) 582 108.4 2e-22
XP_005267002 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 908) 582 108.4 2.1e-22
NP_068775 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 908) 582 108.4 2.1e-22
XP_011522994 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r ( 879) 541 101.6 2.2e-20
XP_005258878 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 980) 541 101.6 2.4e-20
NP_002079 (OMIM: 600283) glutamate receptor ionotr ( 980) 541 101.6 2.4e-20
XP_011522991 (OMIM: 138254) PREDICTED: glutamate r (1262) 541 101.7 2.9e-20
>>NP_597702 (OMIM: 606650) glutamate receptor ionotropic (1115 aa)
initn: 7535 init1: 7535 opt: 7535 Z-score: 6730.0 bits: 1257.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7535; 99.9% identity (100.0% similar) in 1115 aa overlap (1-1115:1-1115)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 PRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 PRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIRIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110
pF1KA1 ELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 ELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
1090 1100 1110
>>XP_011516513 (OMIM: 606650) PREDICTED: glutamate recep (925 aa)
initn: 6288 init1: 6288 opt: 6288 Z-score: 5617.8 bits: 1051.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6288; 99.8% identity (99.9% similar) in 924 aa overlap (1-924:1-924)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRRLSLWWLLSRVCLLLPPPCALVLAGVPSSSSHPQPCQILKRIGHAVRVGAVHLQPWTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APRAASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLHGRGPPGSRKPGEGARAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALWPRDALLFAVDNLNRVEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFLLLTQNNSKFHLGSIINITAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGDSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EVETTNLTSGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSFSSAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLL
:::::::::::::::::::::: .
XP_011 DMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTERII
910 920
>>NP_619635 (OMIM: 606651) glutamate receptor ionotropic (1043 aa)
initn: 3248 init1: 2282 opt: 3051 Z-score: 2727.0 bits: 516.3 E(85289): 3.7e-145
Smith-Waterman score: 3246; 49.8% identity (72.8% similar) in 1035 aa overlap (95-1103:6-1007)
70 80 90 100 110
pF1KA1 ASRAPDDSRAGAQRDEPEPGTRRSPAPSPGARWLGSTLH-GRGPPGSR-KP-------GE
: ::: .: : : :.. .: :
NP_619 MEFVRALWLGLALALGPGSAGGHPQPCGVLARLGG
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GARAEALWPRDALLFAVDN--LNR--VEGLLPYNLSLEVVMAIEAGLGDLPLLPFSSPSS
..: :: :: : : : : . ::.:::::.:.: .
NP_619 SVRLGALLPRAPLARARARAALARAALAPRLPHNLSLELVVA-----------------A
40 50 60 70
180 190 200 210 220
pF1KA1 PWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALLAFPQSQGEMMELDLVSLVLHIPVISIVRHEF--P
: . :: :. ...:...: ::.::::::... :...: ... . . ::.:..:.: :
NP_619 PPARDPASLTRGLCQALVPPGVAALLAFPEARPELLQLHFLAAATETPVLSLLRREARAP
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 RESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSLLLCQ-EDWNITDFLLLTQNNSK
. ::.:::: . : . :: :..: . : . .: ::. .: . : .. .
NP_619 LGAPNPFHLQLHWASPLETLLDVLVAVLQAHAWEDVGLALCRTQDPGGLVALWTSRAGRP
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESI--KNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFG
.: ..... . : . : . . . .:..:..:::. ::..:
NP_619 PQL--VLDLSRRDTGDAGLRARLAPMAAPVGGEAPVPAAVLLGCDIARARRVLE------
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 VMPPELRWVLGDSQNVEELRTEGLPLGLIAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMI
..:: .:.:: . : : ::: ::.: :.... .: ..: ..:::::...:...
NP_619 AVPPGPHWLLGTPLPPKALPTAGLPPGLLALGEVARPPLEAAIHDIVQLVARALGSAAQV
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 QPELALIPSTMNCMEVETTNLTS-GQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFI
::. ::.:. .:: ... .. : :..:.::::::.:.: .: . : ::. : .: .
NP_619 QPKRALLPAPVNCGDLQPAGPESPGRFLARFLANTSFQGRTGPVWVTGSSQVHMSRHFKV
320 330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 WNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPF
:.:..:: : : :. .:::. :.. .. : . . :. ::::::.::::
NP_619 WSLRRDPRGAPAWATVGSWRDGQLDLEPGGASARPPPPQGAQVWPK---LRVVTLLEHPF
380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 VFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLE
::.:. :..: :::::::::: ::::.:::.::..: .: ..: ..::::::::::::
NP_619 VFARDPDEDGQCPAGQLCLDPGTNDSATLDALFAAL--ANGSAPRALRKCCYGYCIDLLE
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 KIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFT
..::: :::.::.:::::::: ..:.::::::::: : :::::::::::.:::::.:::
NP_619 RLAEDTPFDFELYLVGDGKYGALRDGRWTGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFT
490 500 510 520 530 540
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 SPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTP
::::::::::.::.::::.:::::::::::. :::.:.:::.::.:::.:::.::.::::
NP_619 SPFFSTSLGIMVRARDTASPIGAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTP
550 560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 KGRNRSKVFSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLA
.::::: :::.:::::.:::.:: :::. : ::: :::.:::::::::.. ::.::::::
NP_619 RGRNRSTVFSYSSALNLCYAILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLA
610 620 630 640 650 660
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 AVMVGEKIYEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPAT
:::::.: .::::::::::::::.:::::::: ::::: :...:::.:: .:::...:.:
NP_619 AVMVGDKTFEELSGIHDPKLHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHMRRHSAPTT
670 680 690 700 710 720
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 PDGVEYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTA
: :: .: .:: ::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.
NP_619 PRGVAMLTSDPPKLNAFIMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTS
730 740 750 760 770 780
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 NISELISQYKSHGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLS
:.::.::.::: ::.:.::::::..:::::: :::::::::.: ::.:::::::.:.: .
NP_619 NLSEFISRYKSSGFIDLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSA
790 800 810 820 830 840
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 ILTTIGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINT-----SFIEEKQQHFKTKRV
.:...::: .:: ::::.. :.:::::::::..:::.:: : : . . . .:
NP_619 LLSSLGEHAFFRLALPRIRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTEPPEGSKEETAEAEPSGPEV
850 860 870 880 890 900
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 EKRSNVG--PRQLTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPAL
:.... : :. . . :..:. : : . . . . : :: :.
NP_619 EQQQQQQDQPTAPEGWKRARRAVDKERRVRFLLEPA---VVVAPEADAEAEAAPREGPVW
910 920 930 940 950 960
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 RTTNGKADSLNVSRNSVMQELSELEKQIQVIRQELQLAVSRKTELEEYQRTSRTCES
. :. . . ::.:::..:.: :..:. :. :. .:
NP_619 LCSYGRPPAARPTGAPQPGELQELERRIEVARERLRQALVRRGQLLAQLGDSARHRPRRL
970 980 990 1000 1010 1020
NP_619 LQARAAPAEAPPHSGRPGSQE
1030 1040
>>XP_016881732 (OMIM: 606651) PREDICTED: glutamate recep (582 aa)
initn: 1956 init1: 1926 opt: 1926 Z-score: 1726.0 bits: 330.3 E(85289): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 1926; 76.4% identity (93.2% similar) in 351 aa overlap (627-977:1-351)
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 LYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGIL
:::::::::.:::::.:::::::::::::.
XP_016 MAVTSFSINSARSQVVDFTSPFFSTSLGIM
10 20 30
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSKVFSF
::.::::.:::::::::::. :::.:.:::.::.:::.:::.::.::::.::::: :::.
XP_016 VRARDTASPIGAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTPRGRNRSTVFSY
40 50 60 70 80 90
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 SSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEE
:::::.:::.:: :::. : ::: :::.:::::::::.. ::.:::::::::::.: .::
XP_016 SSALNLCYAILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAVMVGDKTFEE
100 110 120 130 140 150
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 LSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDP
::::::::::::.:::::::: ::::: :...:::.:: .:::...:.:: :: .: .::
XP_016 LSGIHDPKLHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHMRRHSAPTTPRGVAMLTSDP
160 170 180 190 200 210
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 EKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKS
::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:.::.::.:::
XP_016 PKLNAFIMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNLSEFISRYKS
220 230 240 250 260 270
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 HGFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVY
::.:.::::::..:::::: :::::::::.: ::.:::::::.:.: ..:...::: .
XP_016 SGFIDLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSALLSSLGEHAFF
280 290 300 310 320 330
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 RLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNT
:: ::::.. :.:::::::::
XP_016 RLALPRIRKGSRLQYWLHTSQVGSGWAAGGPTPPASSPTGSVWGLRKSTAPSTRSHQRGR
340 350 360 370 380 390
>>NP_000823 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ion (885 aa)
initn: 660 init1: 244 opt: 929 Z-score: 833.4 bits: 165.7 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 976; 27.5% identity (61.2% similar) in 833 aa overlap (183-980:77-866)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
NP_000 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: .. :
NP_000 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
:. .: : :: . .:: . ..... :.:... ..: .:. :.
NP_000 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
170 180 190 200 210
330 340 350 360 370
pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
:.... . .. ... ...... :..:. : :. . .:. ::: . .::
NP_000 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::. .: ..: :
NP_000 NESA----HISDAVGVVAQAVHE--LLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 NTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYG--I
.. . :..: .. . . . :. : :::. . ...: ..: ... . :
NP_000 SSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRKII
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSSTL
:: .. .: ..: ..::. ..:::... . ..: : . ::. . :
NP_000 WPGGETEKPRGYQMSTRL--KIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG
390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 DSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK---NG
. .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. . :.
NP_000 PND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNS
440 450 460 470 480 490
620 630 640 650 660
pF1KA1 H---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGA
. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :::. . . . .
NP_000 NKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDS
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 FMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--VFSFSSALNICYAL
:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . ....:::. . ...
NP_000 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPKLH
:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: .. :...::.::.:.
NP_000 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
620 630 640 650 660 670
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAFIM
.::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. .... .... :: :::
NP_000 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
:.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: .: ::: :::.
NP_000 DSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--LSILKSHENGFMED
740 750 760 770 780
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
: : : : .:: : . .....:.:.:. :. .:. . : :.:.
NP_000 LDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYKRHKDA
790 800 810 820 830 840
970 980 990 1000 1010
pF1KA1 IKNKSKLQY-----WLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTS
... .: . : .. :. :
NP_000 RRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV
850 860 870 880
>>NP_001172020 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor (906 aa)
initn: 660 init1: 244 opt: 929 Z-score: 833.2 bits: 165.7 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 966; 27.1% identity (60.2% similar) in 846 aa overlap (183-980:77-887)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
NP_001 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: : .
NP_001 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSW-NHII
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310
pF1KA1 LLCQEDWN-------ITDFLLLTQNNSK----FHLGSIINITANLPSTQDLLSF------
:: ..: . . .: ...:: .: .. . :... .:.:
NP_001 LLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKN
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360
pF1KA1 LQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRT
. : :. :.... . .. ... ...... :..:. : :. .
NP_001 VTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAP
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EGLPLGL-IAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTN
.:. ::: . .::. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::
NP_001 DGI-LGLQLINGKNESA----HISDAVGVVAQAVHE--LLEKENITDPPR-GC--VGNTN
290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 L-TSGQYLSRFLANTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSW
. .: ..: : .. . :..: .. . . . :. : :::. . ...: .
NP_001 IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIY
340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QGGKIVMDYG--IWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-Q
.: ... . ::: .. .: ..: ..::. ..:::... . ..: :
NP_001 NGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRL--KIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFT
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVG
. ::. . : . .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.
NP_001 VNGDPVKKVICTGPND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650
pF1KA1 DGKYGAWK---NGH---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGI
:::.:. . :.. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :
NP_001 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--V
::. . . . .:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . .
NP_001 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 FSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKI
...:::. . ...:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: ..
NP_001 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 YEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEY
:...::.::.:..::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. ....
NP_001 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
690 700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 LKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
.... :: ::: :.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: .
NP_001 VRDN--KLHAFIWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--L
750 760 770 780 790
900 910 920 930 940
pF1KA1 SQYKSH--GFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTT
: ::: :::. : : : : .:: : . .....:.:.:. :. .:.
NP_001 SILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLI
800 810 820 830 840 850
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 IGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQY-----WLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRS
. : :.:. ... .: . : .. :. :
NP_001 FIE-IAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV
860 870 880 890 900
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 NVGPRQLTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGK
>>XP_011516885 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glutamat (892 aa)
initn: 660 init1: 244 opt: 928 Z-score: 832.4 bits: 165.5 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 965; 27.5% identity (60.4% similar) in 834 aa overlap (183-973:77-871)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
XP_011 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: : .
XP_011 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSW-NHII
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310
pF1KA1 LLCQEDWN-------ITDFLLLTQNNSK----FHLGSIINITANLPSTQDLLSF------
:: ..: . . .: ...:: .: .. . :... .:.:
XP_011 LLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKN
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360
pF1KA1 LQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRT
. : :. :.... . .. ... ...... :..:. : :. .
XP_011 VTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAP
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EGLPLGL-IAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTN
.:. ::: . .::. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::
XP_011 DGI-LGLQLINGKNESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTN
290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 L-TSGQYLSRFLANTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSW
. .: ..: : .. . :..: .. . . . :. : :::. . ...: .
XP_011 IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIY
340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QGGKIVMDYG--IWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-Q
.: ... . ::: .. .: .. :..::. ..:::... . ..: :
XP_011 NGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTR--LKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFT
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVG
. ::. . : . .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.
XP_011 VNGDPVKKVICTGPND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650
pF1KA1 DGKYGAWK---NGH---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGI
:::.:. . :.. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :
XP_011 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--V
::. . . . .:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . .
XP_011 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 FSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKI
...:::. . ...:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: ..
XP_011 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 YEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEY
:...::.::.:..::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. ....
XP_011 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
690 700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 LKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
.... :: ::: :.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: .
XP_011 VRDN--KLHAFIWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--L
750 760 770 780 790
900 910 920 930 940
pF1KA1 SQYKSH--GFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTT
: ::: :::. : : : : .:: : . .....:.:.:. :. .:.
XP_011 SILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLI
800 810 820 830 840 850
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 IGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPR
. : :.:. : :. . :. :
XP_011 FIE-IAYK----RHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQSRPPVPIP
860 870 880 890
>>NP_067544 (OMIM: 138249,614254) glutamate receptor ion (901 aa)
initn: 605 init1: 244 opt: 928 Z-score: 832.4 bits: 165.5 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 975; 27.9% identity (61.5% similar) in 821 aa overlap (183-973:77-850)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
NP_067 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: .. :
NP_067 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
:. .: : :: . .:: . ..... :.:... ..: .:. :.
NP_067 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
170 180 190 200 210
330 340 350 360 370
pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
:.... . .. ... ...... :..:. : :. . .:. ::: . .::
NP_067 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::. .: ..: :
NP_067 NESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 NTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYG--I
.. . :..: .. . . . :. : :::. . ...: ..: ... . :
NP_067 SSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRKII
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSSTL
:: .. .: .. :..::. ..:::... . ..: : . ::. . :
NP_067 WPGGETEKPRGYQMSTR--LKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG
390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 DSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK---NG
. .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. . :.
NP_067 PND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNS
440 450 460 470 480 490
620 630 640 650 660
pF1KA1 H---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGA
. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :::. . . . .
NP_067 NKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDS
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 FMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--VFSFSSALNICYAL
:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . ....:::. . ...
NP_067 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPKLH
:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: .. :...::.::.:.
NP_067 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
620 630 640 650 660 670
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAFIM
.::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. .... .... :: :::
NP_067 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
:.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: .: ::: :::.
NP_067 DSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--LSILKSHENGFMED
740 750 760 770 780
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
: : : : .:: : . .....:.:.:. :. .:. . : :.:. :
NP_067 LDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYK----R
790 800 810 820 830
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 IKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLSHD
:. . :. :
NP_067 HKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHR
840 850 860 870 880 890
>>XP_005266128 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glutamat (922 aa)
initn: 660 init1: 244 opt: 928 Z-score: 832.2 bits: 165.5 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 976; 27.5% identity (60.9% similar) in 883 aa overlap (183-1033:77-901)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
XP_005 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: .. :
XP_005 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP
:. .: : :: . .:: . ..... :.:... ..: .:. :.
XP_005 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA
170 180 190 200 210
330 340 350 360 370
pF1KA1 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK
:.... . .. ... ...... :..:. : :. . .:. ::: . .::
XP_005 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA
. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::. .: ..: :
XP_005 NESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM
280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 NTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIVMDYG--I
.. . :..: .. . . . :. : :::. . ...: ..: ... . :
XP_005 SSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRKII
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSSTL
:: .. .: ..: ..::. ..:::... . ..: : . ::. . :
XP_005 WPGGETEKPRGYQMSTRL--KIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG
390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 DSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK---NG
. .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. . :.
XP_005 PND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNS
440 450 460 470 480 490
620 630 640 650 660
pF1KA1 H---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPIGA
. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :::. . . . .
XP_005 NKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDS
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 FMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--VFSFSSALNICYAL
:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . ....:::. . ...
XP_005 FMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGV
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPKLH
:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: .. :...::.::.:.
XP_005 LLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLR
620 630 640 650 660 670
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 HPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAFIM
.::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. .... .... :: :::
XP_005 NPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAFIW
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH--GFMDM
:.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: .: ::: :::.
XP_005 DSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--LSILKSHENGFMED
740 750 760 770 780
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR
: : : : .:: : :: . ....:.:.:. :. .:. . : :.:. :
XP_005 LDKTWVRYQECDSRSNA-PATLTF--ENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYK----R
790 800 810 820 830
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 IKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWN--TSNLS
:. . :. : . :.:. ... : :. :.: :.. ... ::.:.
XP_005 HKDARRKQMQLAFA-----AVNV--WRKNLQDRKSGRAEP----DPKKKATFRAITSTLA
840 850 860 870 880
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 HDNRRKYIFSDEEGQNQLGIQIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNVSRNSVMQELS
. .:. .: .
XP_005 SSFKRRRSSKDTQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV
890 900 910 920
>>XP_005266129 (OMIM: 138249,614254) PREDICTED: glutamat (922 aa)
initn: 605 init1: 244 opt: 928 Z-score: 832.2 bits: 165.5 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 965; 27.5% identity (60.4% similar) in 834 aa overlap (183-973:77-871)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
:::. .. . : :.: . : . .. .
XP_005 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
50 60 70 80 90 100
220 230 240 250 260
pF1KA1 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: : .
XP_005 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSW-NHII
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310
pF1KA1 LLCQEDWN-------ITDFLLLTQNNSK----FHLGSIINITANLPSTQDLLSF------
:: ..: . . .: ...:: .: .. . :... .:.:
XP_005 LLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKN
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360
pF1KA1 LQIQLESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRT
. : :. :.... . .. ... ...... :..:. : :. .
XP_005 VTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAP
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EGLPLGL-IAHGKTTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTN
.:. ::: . .::. .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::
XP_005 DGI-LGLQLINGKNESA----HISDAVGVVAQAVH--ELLEKENITDPPR-GC--VGNTN
290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 L-TSGQYLSRFLANTTFR-GLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSW
. .: ..: : .. . :..: .. . . . :. : :::. . ...: .
XP_005 IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGD-RKFANYSIMNLQNRKL-----VQVGIY
340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QGGKIVMDYG--IWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-Q
.: ... . ::: .. .: .. :..::. ..:::... . ..: :
XP_005 NGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTR--LKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFT
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LCLDPMTNDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVG
. ::. . : . .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.
XP_005 VNGDPVKKVICTGPND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650
pF1KA1 DGKYGAWK---NGH---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGI
:::.:. . :.. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :
XP_005 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LVRTRDTAAPIGAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFGLTPKGRNRSK--V
::. . . . .:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . .. . .
XP_005 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 FSFSSALNICYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKI
...:::. . ...:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: ..
XP_005 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 YEELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEY
:...::.::.:..::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. ....
XP_005 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
690 700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 LKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELI
.... :: ::: :.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: .
XP_005 VRDN--KLHAFIWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVS--L
750 760 770 780 790
900 910 920 930 940
pF1KA1 SQYKSH--GFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTT
: ::: :::. : : : : .:: : . .....:.:.:. :. .:.
XP_005 SILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNA---PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLI
800 810 820 830 840 850
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 IGEHIVYRLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPR
. : :.:. : :. . :. :
XP_005 FIE-IAYK----RHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIE
860 870 880 890 900
1115 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 11:28:37 2016 done: Thu Nov 3 11:28:39 2016
Total Scan time: 15.350 Total Display time: 0.310
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]