FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1975, 550 aa 1>>>pF1KA1975 550 - 550 aa - 550 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4484+/-0.00103; mu= 8.2690+/- 0.062 mean_var=144.0034+/-29.022, 0's: 0 Z-trim(108.3): 100 B-trim: 96 in 2/48 Lambda= 0.106878 statistics sampled from 10021 (10128) to 10021 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 3.160 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 2814 446.2 6.8e-125 CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 1962 314.9 2.5e-85 CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10 ( 686) 1796 289.2 1.1e-77 CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 1784 287.3 3.8e-77 CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 1759 283.5 5.6e-76 CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 ( 658) 1464 238.0 2.7e-62 CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 911) 1407 229.3 1.5e-59 CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 580) 1277 209.1 1.2e-53 CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 1208 198.6 2.5e-50 CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 1155 190.5 9.5e-48 CCDS58756.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 405) 437 79.5 8.5e-15 CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 ( 834) 438 79.9 1.4e-14 CCDS75788.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1122) 435 79.5 2.4e-14 CCDS6362.1 ASAP1 gene_id:50807|Hs108|chr8 (1129) 435 79.5 2.4e-14 CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3 ( 778) 414 76.1 1.7e-13 CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17 ( 740) 402 74.3 5.8e-13 CCDS46224.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 ( 961) 379 70.8 8.3e-12 CCDS1661.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 (1006) 379 70.8 8.7e-12 CCDS44087.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 ( 894) 377 70.5 9.8e-12 CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 ( 903) 377 70.5 9.8e-12 >>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 (804 aa) initn: 2151 init1: 1676 opt: 2814 Z-score: 2355.7 bits: 446.2 E(32554): 6.8e-125 Smith-Waterman score: 2814; 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89.8% identity (92.9% similar) in 550 aa overlap (1-550:139-663) 10 20 30 pF1KA1 MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL :::::::::: ::::.:::::::.: :::: CCDS72 HVSTVRFSQQYSLCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQL 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS .::: ::::: ::::::::::::::::: :::::::: :::::::::::::::.:: :: CCDS72 HSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG ::::::::::::: ::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 NLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::.:::::::::: CCDS72 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISTSKSNGLSKDM---- 290 300 310 320 330 340 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE : ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: CCDS72 -----DTGLGDSICFSPSISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------ 350 360 370 380 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA :::::.:::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS72 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSKAMA 390 400 410 420 430 440 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 LQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS ::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.::::::::::::: CCDS72 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS 510 520 530 540 550 560 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY :::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS72 LGQQLLRATADEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY 570 580 590 600 610 620 520 530 540 550 pF1KA1 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS72 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDKCV 630 640 650 660 >>CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 (686 aa) initn: 2984 init1: 1745 opt: 1759 Z-score: 1477.5 bits: 283.5 E(32554): 5.6e-76 Smith-Waterman score: 3173; 89.3% identity (92.4% similar) in 550 aa overlap (1-550:162-686) 10 20 30 pF1KA1 MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL :::::::::: ::::.:::::.:.: :::: CCDS44 HVSAVRFSQQYSLCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRTLSIPDEQL 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS .::: ::::: ::::::::::::::::: :::::::: :::::::::::::::.:: :: CCDS44 HSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPSTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG ::::::::::::: ::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 NLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH .:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS44 MLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLQTSTIKVPGKWPSLATSACTPISSSKSNGLSKDM---- 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE : ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: CCDS44 -----DTGLGDSICFSPSISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------ 370 380 390 400 410 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA :::::.:::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::: CCDS44 LQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGPHLSRVRSLELDDWPV 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS ::::::::: ::::::::::::::::::: .:::::::::::::::.::::::::::::: CCDS44 ELRKVMSSIVNDLANSIWEGSSQGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY :::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 LGQQLLRATADEDLQTAILLLAHGSCEEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWY 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 pF1KA1 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 GVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV 650 660 670 680 >>CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 (658 aa) initn: 2706 init1: 1450 opt: 1464 Z-score: 1231.9 bits: 238.0 E(32554): 2.7e-62 Smith-Waterman score: 2892; 88.4% identity (91.8% similar) in 510 aa overlap (1-509:162-646) 10 20 30 pF1KA1 MTIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQL :::::::::: ::::.:::::::.: :::: CCDS73 HVSTERFSQQYSSCSTIFLDDSTAIQHYLTMTIISVTLEIPHHITQRDADRSLSIPDEQL 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 YSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWS .::: ::::: ::::::::::::::::: :::::::: :::::::::::::::.:: :: CCDS73 HSFAVSTVHIMKKRNGGGSLNNYSSSIPPTPSTSQEDPQFSVPPTANTPTPVCKRSMRWS 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 NLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG ::::::::::::: ::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 NLFTSEKGSDPDKERKAPENHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWLKTWKKKYVTLCSNG 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 VLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDM---- 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 MSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEE : ::::::::::.:::::::::: ::::::::::::::::::: CCDS73 -----DTGLGDSICFSPGISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNN------------ 370 380 390 400 410 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 EEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMA :::::.:::: ::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS73 ----FMIVSATGQTWHFEATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCKSSKSKSQLTSQSEAMA 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 LQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPV ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: CCDS73 LQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSFGTRLSRVRSLELDDWPV 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 ELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELS :::::::::::.::::::::::::::::::.::::::: :::::::.::::::::::::: CCDS73 ELRKVMSSIGNELANSIWEGSSQGQTKPSIKSTREEKEWWIRSKYEEKLFLAPLPCTELS 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 pF1KA1 LGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLI-W :::.:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: : CCDS73 LGQQLLRATTDEDLQTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLEQLLTGW 590 600 610 620 630 640 510 520 530 540 550 pF1KA1 YGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV CCDS73 TSWPEMPTGTQR 650 >>CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (911 aa) initn: 1803 init1: 1255 opt: 1407 Z-score: 1182.4 bits: 229.3 E(32554): 1.5e-59 Smith-Waterman score: 1946; 55.1% identity (76.3% similar) in 566 aa overlap (38-549:319-884) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 LEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGS-LNNYSSSIPLTPSTSQE :::.. ::::: ...::::.: ::: ::. CCDS43 RKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQR 290 300 310 320 330 340 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 DLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQG .: . . ...::::. ::: ::.:::.::.: :. .:: : ..:.:::::::::::: CCDS43 ELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQG 350 360 370 380 390 400 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 MLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPS .::::::: : : :::::::::.::.:::. :: :::.::: ::::: .:.::::: CCDS43 ILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLP 410 420 430 440 450 460 190 200 210 220 pF1KA1 LATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHM-------------SANSDIGLGDSICFSP----- :: : :: .: ..:::: . .. : .:. :..: .: CCDS43 RATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTGAPHSASSASLHSERPLSSSAWAGPRPEGL 470 480 490 500 510 520 230 240 250 pF1KA1 -----SISS--------------------------TTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKST :.:: ..::::. :::::.:.::: .:::: CCDS43 HQRSCSVSSADQWSEATTSLPPGMQHPASGPAEVLSSSPKLDPPPSPHSNRKKHRRKKST 530 540 550 560 570 580 260 270 280 290 300 310 pF1KA1 NNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCE .. . :: ::..:: :: .:..::.:::: ::.:.: :::. :::..:.:::::::.:. CCDS43 GTPRPDGPSSATEEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQILASLQGCR 590 600 610 620 630 640 320 330 340 350 360 370 pF1KA1 SSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLG :.:.:..: .:. :.:.:.....:::: :.::.. :: :::::::.::::::::::: :: CCDS43 SAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIECSGIHRHLG 650 660 670 680 690 700 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 TRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSK ..:::::::.::::: :: ::...:: ::::.:::. : .::. .. :::::::::.: CCDS43 AHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACREEKERWIRAK 710 720 730 740 750 760 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 YEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHL ::.:::::::: ... :::.::::....::: ..::::::.:::::: :.::: ::::: CCDS43 YEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGDGDGRTALHL 770 780 790 800 810 820 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 ACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDE-CV . .:::..:::::::::: .:::.: : :.:::.:.:::: ..:.:.::: : : CCDS43 SSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGCPGEGCGLAP 830 840 850 860 870 880 CCDS43 TPNREPANGTNPSAELHRSPSLL 890 900 910 >>CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (580 aa) initn: 1630 init1: 1255 opt: 1277 Z-score: 1076.9 bits: 209.1 E(32554): 1.2e-53 Smith-Waterman score: 1793; 55.3% identity (75.7% similar) in 515 aa overlap (38-549:91-553) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 LEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGS-LNNYSSSIPLTPSTSQE :::.. ::::: ...::::.: ::: ::. CCDS64 RKKQQLAIGPCKSLPNSPSHSAVSAASIPAVHINQATNGGGSAFSDYSSSVPSTPSISQR 70 80 90 100 110 120 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 DLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQG .: . . ...::::. ::: ::.:::.::.: :. .:: : ..:.:::::::::::: CCDS64 ELRIETIAASSTPTPIRKQSKRRSNIFTSRKGADLDREKKAAECKVDSIGSGRAIPIKQG 130 140 150 160 170 180 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 MLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPS .::::::: : : :::::::::.::.:::. :: :::.::: ::::: .:.::::: CCDS64 ILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEIDLLRTTVKVPGKRLP 190 200 210 220 230 240 190 200 210 220 230 240 pF1KA1 LATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHA :: : :: .: ..:::: . .:...: : CCDS64 RATPATAPGTSPRANGLSVE------RSNTQLGGG------------------------- 250 260 250 260 270 280 290 300 pF1KA1 NKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQ : :: .:..::.:::: ::.:.: :::. :::..:.: CCDS64 ---------------------TEAEESFEFVVVSLTGQTWHFEASTAEERELWVQSVQAQ 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 ILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIE ::::::.:.:.:.:..: .:. :.:.:.....:::: :.::.. :: :::::::.::::: CCDS64 ILASLQGCRSAKDKTRLGNQNAALAVQAVRTVRGNSFCIDCDAPNPDWASLNLGALMCIE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 CSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTRE :::::: ::..:::::::.::::: :: ::...:: ::::.:::. : .::. .. :: CCDS64 CSGIHRHLGAHLSRVRSLDLDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGALGGYSKPGPDACRE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 EKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGE :::::::.:::.:::::::: ... :::.::::....::: ..::::::.:::::: :. CCDS64 EKERWIRAKYEQKLFLAPLPSSDVPLGQQLLRAVVEDDLRLLVMLLAHGSKEEVNETYGD 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 GDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGC ::: :::::. .:::..:::::::::: .:::.: : :.:::.:.:::: ..:.:.:: CCDS64 GDGRTALHLSSAMANVVFTQLLIWYGVDVRSRDARGLTPLAYARRAGSQECADILIQHGC 490 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 PDE-CV : : : CCDS64 PGEGCGLAPTPNREPANGTNPSAELHRSPSLL 550 560 570 580 >>CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (836 aa) initn: 1461 init1: 1176 opt: 1208 Z-score: 1017.1 bits: 198.6 E(32554): 2.5e-50 Smith-Waterman score: 1603; 48.5% identity (73.1% similar) in 551 aa overlap (32-548:251-795) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 TIISVTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTP : . ... .. . ..:: ..::::.: .: CCDS89 RVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSP 230 240 250 260 270 280 70 80 90 100 110 pF1KA1 STSQEDLYFSVPPTANTPTP--VCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGR ......: . .:. :: . . . ..::....::: .: ..:.:...: :::: CCDS89 NVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEK--RSLDSRGETTGSGR 290 300 310 320 330 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 AIPIKQGMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIK ::::::..::::::. : : :::::::: ::: : :. :..::... : ::.:: .:.: CCDS89 AIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVK 340 350 360 370 380 390 180 190 200 210 220 pF1KA1 VPGKWPSLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLG-DSICFSPS--------- :::: : : :: .: :.. ::: ::: ...:. . . : ::: CCDS89 VPGKRPPRAISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQT 400 410 420 430 440 450 230 240 250 260 pF1KA1 --------------ISSTTSPKLNL-------PPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSST .:. .:. .: :::: ..:.. .:: :. : .: .. 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CCDS44 SKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQR--RKKLTTPSKTEGSAGQ 800 810 820 830 840 850 270 280 290 300 pF1KA1 AE--------------------EEEEKFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQIL :: ::. .:.::: :::: ::.:...::::::::::.:::: CCDS44 AEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQIL 860 870 880 890 900 910 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 ASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECS :::: ::::: : . :::::.:.:.:.: .::: :::: . :: :::::::.:.::::: CCDS44 ASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECS 920 930 940 950 960 970 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 GIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEK ::::.:::.:::::::.::::: :: :...:::: :: .::....:..::: .:.:::. CCDS44 GIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREER 980 990 1000 1010 1020 1030 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 ERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGD : :::.:::. :::::: .: ::..: :. .:. :..:::::. . .. . . . CCDS44 ESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 GCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPD . :::: . ..::..:::.:::.:: ::::.: ::: :::::.:: : ..:::.::: CCDS44 LRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPG 1100 1110 1120 1130 1140 1150 550 pF1KA1 ECV : CCDS44 EGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV 1160 1170 1180 1190 550 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 22:20:33 2016 done: Wed Nov 2 22:20:34 2016 Total Scan time: 3.160 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]