Result of FASTA (omim) for
pF1KA1975
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1975, 550 aa
1>>>pF1KA1975 550 - 550 aa - 550 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8138+/-0.000452; mu= 6.5113+/- 0.028
mean_var=184.1748+/-37.912, 0's: 0 Z-trim(116.1): 175 B-trim: 463 in 2/53
Lambda= 0.094506
statistics sampled from 26806 (26996) to 26806 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16
Scan time: 7.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK ( 804) 2814 396.9 1.3e-109
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808) 2814 396.9 1.3e-109
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 2814 397.0 1.5e-109
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 1962 280.8 1.2e-74
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126) 1962 280.9 1.5e-74
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882) 1696 244.5 1e-63
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886) 1696 244.5 1e-63
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098) 1696 244.6 1.2e-63
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106) 1696 244.6 1.2e-63
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147) 1696 244.6 1.3e-63
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151) 1696 244.6 1.3e-63
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565) 1407 204.9 5.4e-52
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630) 1407 205.0 5.8e-52
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683) 1407 205.0 6.2e-52
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK ( 911) 1407 205.1 7.7e-52
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462) 1277 187.1 1e-46
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527) 1277 187.2 1.1e-46
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 1277 187.2 1.2e-46
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580) 1277 187.2 1.2e-46
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 1208 177.9 1.1e-43
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 1208 178.1 1.4e-43
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 1155 170.7 1.6e-41
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 1155 170.9 2.1e-41
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 1155 170.9 2.1e-41
NP_001231817 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 405) 437 72.6 2.7e-12
XP_016868958 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1072) 435 72.6 6.8e-12
XP_016868957 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 435 72.7 6.8e-12
XP_006716629 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1075) 435 72.7 6.8e-12
XP_006716628 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1076) 435 72.7 6.8e-12
XP_016868956 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1087) 435 72.7 6.9e-12
NP_001234925 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domai (1122) 435 72.7 7e-12
XP_011515355 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1125) 435 72.7 7e-12
XP_006716627 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1125) 435 72.7 7e-12
NP_060952 (OMIM: 605953) arf-GAP with SH3 domain, (1129) 435 72.7 7.1e-12
XP_005250982 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1132) 435 72.7 7.1e-12
XP_006716626 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1132) 435 72.7 7.1e-12
XP_011515354 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1132) 435 72.7 7.1e-12
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 414 69.7 3.9e-11
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 414 69.7 3.9e-11
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 414 69.7 3.9e-11
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778) 414 69.7 3.9e-11
XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 785) 414 69.7 3.9e-11
XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 806) 414 69.7 4e-11
XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 414 69.7 4e-11
XP_016861537 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 414 69.7 4e-11
XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 820) 414 69.7 4.1e-11
XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 841) 414 69.7 4.1e-11
XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 848) 414 69.7 4.2e-11
NP_055531 (OMIM: 607763) arf-GAP with coiled-coil, ( 740) 402 68.0 1.2e-10
XP_011508711 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 891) 379 64.9 1.2e-09
>>NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK repe (804 aa)
initn: 2151 init1: 1676 opt: 2814 Z-score: 2089.2 bits: 396.9 E(85289): 1.3e-109
Smith-Waterman score: 2814; 82.6% identity (93.2% similar) in 516 aa overlap (36-548:261-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
:.:::.. ::::::..::::.: ::::::
NP_055 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
240 250 260 270 280 290
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
..: ..::::::::::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
NP_055 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
300 310 320 330 340 350
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: :
NP_055 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
360 370 380 390 400 410
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPH
:::::::::: :.::::::: .::.: ::: :::::.: ::::::::::::. :::::
NP_055 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPH
420 430 440 450 460 470
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAI
::.::: .::::.:.: ::::.::::.:: .:.:::.:::: ::.::::::::::::::
NP_055 ANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAI
480 490 500 510 520 530
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLM
.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.::
NP_055 ESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALM
540 550 560 570 580 590
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 CIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIES
:::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..:
NP_055 CIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDS
600 610 620 630 640 650
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNET
::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_055 TREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNET
660 670 680 690 700 710
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 CGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQ
:::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.::::
NP_055 CGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQ
720 730 740 750 760 770
550
pF1KA1 YGCPDECV
::::::
NP_055 YGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
780 790 800
>>XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (808 aa)
initn: 2151 init1: 1676 opt: 2814 Z-score: 2089.1 bits: 396.9 E(85289): 1.3e-109
Smith-Waterman score: 2814; 82.6% identity (93.2% similar) in 516 aa overlap (36-548:265-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
:.:::.. ::::::..::::.: ::::::
XP_005 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
240 250 260 270 280 290
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
..: ..::::::::::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
XP_005 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
300 310 320 330 340 350
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: :
XP_005 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
360 370 380 390 400 410
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPH
:::::::::: :.::::::: .::.: ::: :::::.: ::::::::::::. :::::
XP_005 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPH
420 430 440 450 460 470
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAI
::.::: .::::.:.: ::::.::::.:: .:.:::.:::: ::.::::::::::::::
XP_005 ANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAI
480 490 500 510 520 530
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLM
.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.::
XP_005 ESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALM
540 550 560 570 580 590
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 CIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIES
:::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..:
XP_005 CIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDS
600 610 620 630 640 650
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNET
::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
XP_005 TREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNET
660 670 680 690 700 710
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 CGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQ
:::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.::::
XP_005 CGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQ
720 730 740 750 760 770
550
pF1KA1 YGCPDECV
::::::
XP_005 YGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
780 790 800
>>XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (1073 aa)
initn: 2151 init1: 1676 opt: 2814 Z-score: 2087.5 bits: 397.0 E(85289): 1.5e-109
Smith-Waterman score: 2814; 82.6% identity (93.2% similar) in 516 aa overlap (36-548:530-1045)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
:.:::.. ::::::..::::.: ::::::
XP_011 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
500 510 520 530 540 550
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
..: ..::::::::::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
XP_011 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
560 570 580 590 600 610
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: :
XP_011 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
620 630 640 650 660 670
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPH
:::::::::: :.::::::: .::.: ::: :::::.: ::::::::::::. :::::
XP_011 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPH
680 690 700 710 720 730
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAI
::.::: .::::.:.: ::::.::::.:: .:.:::.:::: ::.::::::::::::::
XP_011 ANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAI
740 750 760 770 780 790
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLM
.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.::
XP_011 ESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALM
800 810 820 830 840 850
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 CIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIES
:::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..:
XP_011 CIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDS
860 870 880 890 900 910
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNET
::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
XP_011 TREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNET
920 930 940 950 960 970
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 CGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQ
:::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.::::
XP_011 CGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQ
980 990 1000 1010 1020 1030
550
pF1KA1 YGCPDECV
::::::
XP_011 YGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
1040 1050 1060 1070
>>NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK r (857 aa)
initn: 2151 init1: 1676 opt: 1962 Z-score: 1461.0 bits: 280.8 E(85289): 1.2e-74
Smith-Waterman score: 2698; 74.9% identity (84.5% similar) in 569 aa overlap (36-548:261-829)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
:.:::.. ::::::..::::.: ::::::
NP_001 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
240 250 260 270 280 290
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
..: ..::::::::::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
NP_001 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
300 310 320 330 340 350
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: :
NP_001 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
360 370 380 390 400 410
190 200 210
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANS-----------------------------
:::::::::: :.::::::: .::.: ::
NP_001 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQ
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250
pF1KA1 ------------------------DIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHL
: :::::.: ::::::::::::. :::::::.:::
NP_001 RSYSVSSADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHR
480 490 500 510 520 530
260 270 280 290 300
pF1KA1 KKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILAS
.::::.:.: ::::.::::.:: .:.:::.:::: ::.::::::::::::::.::::::
NP_001 RKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILAS
540 550 560 570 580 590
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGI
::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
NP_001 LQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGI
600 610 620 630 640 650
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 HRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKER
::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..::::::::
NP_001 HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKER
660 670 680 690 700 710
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGC
:::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_001 WIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGR
720 730 740 750 760 770
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDEC
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.::::::::::
NP_001 TALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDER
780 790 800 810 820 830
550
pF1KA1 V
NP_001 FVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
840 850
>>XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (1126 aa)
initn: 2151 init1: 1676 opt: 1962 Z-score: 1459.4 bits: 280.9 E(85289): 1.5e-74
Smith-Waterman score: 2698; 74.9% identity (84.5% similar) in 569 aa overlap (36-548:530-1098)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
:.:::.. ::::::..::::.: ::::::
XP_011 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
500 510 520 530 540 550
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
..: ..::::::::::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
XP_011 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
560 570 580 590 600 610
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: :
XP_011 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
620 630 640 650 660 670
190 200 210
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANS-----------------------------
:::::::::: :.::::::: .::.: ::
XP_011 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQ
680 690 700 710 720 730
220 230 240 250
pF1KA1 ------------------------DIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHL
: :::::.: ::::::::::::. :::::::.:::
XP_011 RSYSVSSADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHR
740 750 760 770 780 790
260 270 280 290 300
pF1KA1 KKKSTNNLKDDGLSSTAEEEEE--KFMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILAS
.::::.:.: ::::.::::.:: .:.:::.:::: ::.::::::::::::::.::::::
XP_011 RKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILAS
800 810 820 830 840 850
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGI
::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:::::::::
XP_011 LQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGI
860 870 880 890 900 910
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 HRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKER
::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.::::..::::::::
XP_011 HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKER
920 930 940 950 960 970
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGC
:::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_011 WIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGR
980 990 1000 1010 1020 1030
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDEC
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.::::::::::
XP_011 TALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDER
1040 1050 1060 1070 1080 1090
550
pF1KA1 V
XP_011 FVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
1100 1110 1120
>>XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (882 aa)
initn: 2160 init1: 1685 opt: 1696 Z-score: 1264.8 bits: 244.5 E(85289): 1e-63
Smith-Waterman score: 2575; 71.9% identity (80.9% similar) in 580 aa overlap (50-548:275-854)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 DRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTP
:..::::.: ::::::..: ..::::::::
XP_006 SLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTANTP
250 260 270 280 290 300
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 TPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KT
::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::::::::::: : :
XP_006 TPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKE
310 320 330 340 350 360
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 WKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSK
:::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: : :::::::::: :
XP_006 WKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPK
370 380 390 400 410 420
200 210
pF1KA1 SNGLSKDMEALHMSANS-------------------------------------------
.::::::: .::.: ::
XP_006 TNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVSSADQWSEA
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250 260
pF1KA1 ----------DIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLS
: :::::.: ::::::::::::. :::::::.::: .::::.:.: ::::
XP_006 TVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLS
490 500 510 520 530 540
270 280 290
pF1KA1 STAE------------------------EEEEK---FMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAW
.::: ::.:. :.:::.:::: ::.::::::::::
XP_006 GTAEAKRKAWKLNRVGSLRNIYSSSTNTEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAW
550 560 570 580 590 600
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNL
::::.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
XP_006 VQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNL
610 620 630 640 650 660
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 GVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKP
:.:::::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.:::
XP_006 GALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKP
670 680 690 700 710 720
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREE
:..:::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_006 SVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDE
730 740 750 760 770 780
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECIN
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.
XP_006 VNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECID
790 800 810 820 830 840
540 550
pF1KA1 VLLQYGCPDECV
::::::::::
XP_006 VLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
850 860 870 880
>>XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (886 aa)
initn: 2160 init1: 1685 opt: 1696 Z-score: 1264.8 bits: 244.5 E(85289): 1e-63
Smith-Waterman score: 2575; 71.9% identity (80.9% similar) in 580 aa overlap (50-548:279-858)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 DRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTP
:..::::.: ::::::..: ..::::::::
XP_006 SLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTANTP
250 260 270 280 290 300
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 TPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KT
::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::::::::::: : :
XP_006 TPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKE
310 320 330 340 350 360
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 WKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSK
:::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: : :::::::::: :
XP_006 WKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPK
370 380 390 400 410 420
200 210
pF1KA1 SNGLSKDMEALHMSANS-------------------------------------------
.::::::: .::.: ::
XP_006 TNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVSSADQWSEA
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250 260
pF1KA1 ----------DIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLS
: :::::.: ::::::::::::. :::::::.::: .::::.:.: ::::
XP_006 TVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLS
490 500 510 520 530 540
270 280 290
pF1KA1 STAE------------------------EEEEK---FMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAW
.::: ::.:. :.:::.:::: ::.::::::::::
XP_006 GTAEAKRKAWKLNRVGSLRNIYSSSTNTEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAW
550 560 570 580 590 600
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNL
::::.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
XP_006 VQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNL
610 620 630 640 650 660
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 GVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKP
:.:::::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.:::
XP_006 GALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKP
670 680 690 700 710 720
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 SIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREE
:..:::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_006 SVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDE
730 740 750 760 770 780
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMARDAHGNTALTYARQASSQECIN
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.
XP_006 VNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECID
790 800 810 820 830 840
540 550
pF1KA1 VLLQYGCPDECV
::::::::::
XP_006 VLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
850 860 870 880
>>XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (1098 aa)
initn: 2160 init1: 1685 opt: 1696 Z-score: 1263.6 bits: 244.6 E(85289): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 2754; 78.7% identity (88.9% similar) in 541 aa overlap (36-548:530-1070)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 VTLEIHHHITERDADRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQ
:.:::.. ::::::..::::.: ::::::
XP_011 ATRKKQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQ
500 510 520 530 540 550
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EDLYFSVPPTANTPTPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQ
..: ..::::::::::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::
XP_011 KELRIDVPPTANTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQ
560 570 580 590 600 610
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GMLLKRSGKWL-KTWKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWP
::::::::: : : :::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: :
XP_011 GMLLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRP
620 630 640 650 660 670
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SLATSACAPISSSKSNGLSKDMEALHMSANSDIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPH
:::::::::: :.::::::: .::.: ::: :::::.: ::::::::::::. :::::
XP_011 PRATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPH
680 690 700 710 720 730
250 260 270
pF1KA1 ANKKKHLKKKSTNNLKDDGLSSTAE------------------------EEEEK---FMI
::.::: .::::.:.: ::::.::: ::.:. :.:
XP_011 ANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEAKRKAWKLNRVGSLRNIYSSSTNTEEQEENFEFII
740 750 760 770 780 790
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 VSVTGQTCHFKATTYEERDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNM
::.:::: ::.::::::::::::::.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::
XP_011 VSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNM
800 810 820 830 840 850
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 RGNSHCVDCETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMS
::::::::::::::.:::::::.:::::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::
XP_011 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
860 870 880 890 900 910
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 SIGNDLANSIWEGSSQGQTKPSIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
::::.::::.:: ::::.::::..:::::::::::.:::.::::::::::::::::::::
XP_011 SIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
920 930 940 950 960 970
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ATADEDLRTAILLLAHGSREEVNETCGEGDGCTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVMAR
:::::::::::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::
XP_011 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR
980 990 1000 1010 1020 1030
520 530 540 550
pF1KA1 DAHGNTALTYARQASSQECINVLLQYGCPDECV
::::::::.:::::::::::.::::::::::
XP_011 DAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
1040 1050 1060 1070 1080 1090
>>XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (1106 aa)
initn: 2160 init1: 1685 opt: 1696 Z-score: 1263.5 bits: 244.6 E(85289): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 2575; 71.9% identity (80.9% similar) in 580 aa overlap (50-548:499-1078)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 DRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTP
:..::::.: ::::::..: ..::::::::
XP_016 SLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTANTP
470 480 490 500 510 520
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 TPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KT
::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::::::::::: : :
XP_016 TPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKSLNKE
530 540 550 560 570 580
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 WKKKYVTLCSNGVLTYYSSLGDYMKNIHKKEIDLRTSTIKVPGKWPSLATSACAPISSSK
:::::::::.::::::. :: :::.:.: ::::: .:.::::: : :::::::::: :
XP_016 WKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPISSPK
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200 210
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.::::::: .::.: ::
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220 230 240 250 260
pF1KA1 ----------DIGLGDSICFSPSISSTTSPKLNLPPSPHANKKKHLKKKSTNNLKDDGLS
: :::::.: ::::::::::::. :::::::.::: .::::.:.: ::::
XP_016 TVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLS
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.::: ::.:. :.:::.:::: ::.::::::::::
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pF1KA1 VQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNSHCVDCETQNPKWASLNL
::::.::::::::::::::.::.:::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
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pF1KA1 GVLMCIECSGIHRSLGTRLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIGNDLANSIWEGSSQGQTKP
:.:::::::::::.:::.:::::::.:::::::: ::::::::.::::.:: ::::.:::
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pF1KA1 SIESTREEKERWIRSKYEHKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSREE
:..:::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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:::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::::.
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pF1KA1 VLLQYGCPDECV
::::::::::
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20 30 40 50 60 70
pF1KA1 DRSLTILDEQLYSFAFSTVHITKKRNGGGSLNNYSSSIPLTPSTSQEDLYFSVPPTANTP
:..::::.: ::::::..: ..::::::::
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pF1KA1 TPVCKQSMGWSNLFTSEKGSDPDKGRKALESHADTIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKWL-KT
::: ::: ::::::.::::::: .:.:::.::.:::::::::::::::::::: : :
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pF1KA1 SNGLSKDMEALHMSANS-------------------------------------------
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pF1KA1 STAE------------------------EEEEK---FMIVSVTGQTCHFKATTYEERDAW
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:..:::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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XP_006 VLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
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550 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:20:34 2016 done: Wed Nov 2 22:20:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]