FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1998, 1705 aa 1>>>pF1KA1998 1705 - 1705 aa - 1705 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3513+/-0.00135; mu= 4.4227+/- 0.081 mean_var=191.6722+/-39.946, 0's: 0 Z-trim(107.2): 85 B-trim: 132 in 1/49 Lambda= 0.092639 statistics sampled from 9340 (9410) to 9340 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 4.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705) 11184 1508.9 0 CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1731) 10813 1459.4 0 CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1392) 8989 1215.5 0 CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (1434) 1954 275.3 1e-72 CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813) 1934 272.8 1.2e-71 CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817) 1934 272.8 1.2e-71 CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173) 1901 268.2 1.2e-70 CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015) 1889 266.6 3.2e-70 CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 985) 1643 233.7 2.5e-60 CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 986) 1631 232.1 7.5e-60 CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 958) 1624 231.1 1.4e-59 CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 548 87.3 2.5e-16 CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 912) 548 87.3 2.6e-16 CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 927) 548 87.3 2.7e-16 CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522) 478 78.1 2.7e-13 CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562) 478 78.1 2.7e-13 CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441) 470 77.0 5.3e-13 CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525) 470 77.0 5.6e-13 CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544) 470 77.0 5.7e-13 >>CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705 aa) initn: 11184 init1: 11184 opt: 11184 Z-score: 8084.5 bits: 1508.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 11184; 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 SDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGFEDVHLEPHLLI 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 KPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCEDSCGDSVLADTLSSHDVPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 KPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCEDSCGDSVLADTLSSHDVPG 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 SPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFPGSSQSEIIQAIQNLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 SPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFPGSSQSEIIQAIQNLT 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 RLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQKSRDADRQHEELANV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQKSRDADRQHEELANV 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 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CCDS73 ANCSVLRSSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNHRSFSLEGLTGGA-GVGNKPSSSLEV 190 200 210 220 230 240 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 TPGSQSSSRTGIPSGDELDSFETNTEPDFNISRAESLPLSSNLQLKESLLSGVRSRSYSC . .. : . . ...::. . .: :.. .. : ..... ..: .: . . CCDS73 SSANAEELRHPFSGEERVDSLVSLSEEDLESDQREHRMFDQQI-CHRSKQQGFNYCTSAI 250 260 270 280 290 300 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 SSPKISLGKTRLVRELTVCSSSEEQKAYSLSEPPRENRIQEEEWDKYII--PAKSESE-- ::: . . . . . .: .... . . : ::... .. :.:..:: CCDS73 SSPLTKSISLMTISHPGLDNSRPFHSTFHNTSANLTESITEENYN-FLPHSPSKKDSEWK 310 320 330 340 350 360 620 630 640 650 660 pF1KA1 -KYKVSRTFSFLMNRMTSPR---------NKSKTKSKDAKDKEK----LNRHQFAPGTFS :::::::.. :.:.: . .: : : ::.::::: .: : :. CCDS73 SGTKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKDKEKDKKTVNGHTFSSIPVV 370 380 390 400 410 420 670 680 690 700 710 pF1KA1 GVLQCLVCDKTLLGKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACTK-------KFQEKYNKNKPQT : ..: : : . .:.. :.::.: :::::... .:.: ..: . ... : . CCDS73 GPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCSAFVHKGCRESLASCAKVKMKPKGSLQAHDTSSLPTV 430 440 450 460 470 480 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 ILGN--SSFRDIPQPGLSL-HPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSA :. : :. .. :. .. : ....:. ..:: : ::.:: :.. . CCDS73 IMRNKPSQPKERPRSAVLLVDETATTPIF--ANRRSQ--QSVSLSKSV------SIQNIT 490 500 510 520 530 780 790 800 810 820 pF1KA1 TSLESESDNNSCRSRSHSDELLQSMGS-SPSTESFIME----DVVDSSLWSDLSSDAQEF ..:. .:. . ::: . :..... . ::::. : :. ...: .:. ..... CCDS73 GVGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQL 540 550 560 570 580 590 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 EAESWSLVVDPSFCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLD :::::: ..: .: ..:.:::.:::.::.::::::.::..:: ::: .. .:: .: .. CCDS73 EAESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVIYELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFE 600 610 620 630 640 650 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 HSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFYSMKERRQESCAG-SDRNFVIDRIGDILVQQFSEENAS .. :.:.:::::::. :: .:: . ::..:: . :..::.: ::::.::.::: ::: CCDS73 QQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAE 660 670 680 690 700 710 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 KMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRIT ..:: ::.:: .:...:: ::.: ..:.:: :.: . :. ..:: :::::::::::::: CCDS73 RLKKTYGKFCGQHNQSVNYFKDLYAKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRIT 720 730 740 750 760 770 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 KYPVLVERILQYTKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENK ::::: .:::: ::. :..:: ..: :.::.:..:: :: :::. . :: .: ..: CCDS73 KYPVLFQRILQCTKDNEVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSK 780 790 800 810 820 830 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 TYTKLKNGHVFRKQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKY . ..:.:..: :. : ... :. :: :. :.:.::.:.. :.::::.:.::::::::: CCDS73 SIMRMKSGQMFAKEDL--KRKKLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKY 840 850 860 870 880 890 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 IFAAVDQKPSVISLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQ :::..::: .::::.:::.::::.::.:.:::: . . ::: :.:..::::::.:.. :: CCDS73 IFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQ 900 910 920 930 940 950 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA1 QAVESCP-EEKGGRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAEL ..... .: : ::..:.:. ..:. ... : : ..::.: :::: :. .. CCDS73 DTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTRARELK---EQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDM 960 970 980 990 1000 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 GELSGF--ED---VHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQ .: : :: .: :..:.. . : ... :. .:..:.: :: :... :... CCDS73 AECSTPLPEDCSPTH-SPRVLFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA1 SC-----EDSCGDSVL---ADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDL . .: : : :.:... : : . ::.. .: : .. . .: CCDS73 TVSSPIEQDVVGPVSLPRRAETFGGFD---SHQMNASKGGEKEEG--DDGQDLRRTESDS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA1 AVSDAGEKVECRNFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGL ... .:. . .:. ...:.. .: .:: .::... :::.:: ..:::... CCDS73 GLKKGGNANLVFMLKRNSE-QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSER--- 1130 1140 1150 1160 1170 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA1 SLGHSILRGGPLQDQ-KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRE .: .:. : . : .: :.:. ..:...:::... : : .:.:: :. : ..: :: CCDS73 ALTRSLSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELRERE 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA1 SWLQERERECQSQEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLG . : .::.: :. .. : . : ::. . ::..::::: .:. .:::: ..: . :. CCDS73 ALLAQREEEVQQGQQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA1 HWKHGRQRSLPAVLLPGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQ . . .:.: : : CCDS73 QRQ--TERDLCQVSHPHTKLMRIPSFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSI 1300 1310 1320 1330 1340 1350 >>CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813 aa) initn: 1399 init1: 642 opt: 1934 Z-score: 1399.8 bits: 272.8 E(32554): 1.2e-71 Smith-Waterman score: 2032; 35.7% identity (66.9% similar) in 1125 aa overlap (472-1545:1596-2690) 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 QQSFMSPSSSCASNLNLSFGWHGFEKEQSHLKKRSSSLDALDADSEGEGHSEPSHICYTP ...:: ::..: . . : :.. : . . CCDS32 WGPGKNAASDAEMNHRSSMRVLGDVVRRPPIHRRSFSLEGLTGGA-GVGNKPSSSLEVSS 1570 1580 1590 1600 1610 1620 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 GSQSSSRTGIPSGDELDSFETNTEPDFNISRAESLPLSSNLQLKESLLSGVRSRSYSCSS .. : . . ...::. . .: :.. .. : ..... ..: .: . . :: CCDS32 ANAEELRHPFSGEERVDSLVSLSEEDLESDQREHRMFDQQI-CHRSKQQGFNYCTSAISS 1630 1640 1650 1660 1670 1680 570 580 590 600 610 pF1KA1 PKISLGKTRLVRELTVCSSSEEQKAYSLSEPPRENRIQEEEWDKYII--PAKSESE---K : . . . . . .: .... . . : ::... .. :.:..:: CCDS32 PLTKSISLMTISHPGLDNSRPFHSTFHNTSANLTESITEENYN-FLPHSPSKKDSEWKSG 1690 1700 1710 1720 1730 1740 620 630 640 650 660 pF1KA1 YKVSRTFSFLMNRMTSPR---------NKSKTKSKDAKDKEK----LNRHQFAPGTFSGV :::::::.. :.:.: . .: : : ::.::::: .: : :. : CCDS32 TKVSRTFSYIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKDKEKDKKTVNGHTFSSIPVVGP 1750 1760 1770 1780 1790 1800 670 680 690 700 710 pF1KA1 LQCLVCDKTLLGKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACTK--------KFQEKYNKNKPQTI ..: : : . .:.. :.::.: :::::... .:.: ..: . ... : .: CCDS32 ISCSQCMKPFTNKDAYTCANCSAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVI 1810 1820 1830 1840 1850 1860 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 LGN--SSFRDIPQPGLSL-HPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSAT . : :. .. :. .. : ....:. ..:: : ::.:: :.. . CCDS32 MRNKPSQPKERPRSAVLLVDETATTPI--FANRRSQ--QSVSLSKSV------SIQNITG 1870 1880 1890 1900 1910 780 790 800 810 820 pF1KA1 SLESESDNNSCRSRSHSDELLQSMGS-SPSTESFIME----DVVDSSLWSDLSSDAQEFE ..:. .:. . ::: . :..... . ::::. : :. ...: .:. .....: CCDS32 VGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQLE 1920 1930 1940 1950 1960 1970 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 AESWSLVVDPSFCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDH ::::: ..: .: ..:.:::.:::.::.::::::.::..:: ::: .. .:: .: ... CCDS32 AESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVIYELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQ 1980 1990 2000 2010 2020 2030 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 STVDKIFPCLDELLEIHRHFFYSMKERRQESCAG-SDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASK . :.:.:::::::. :: .:: . ::..:: . :..::.: ::::.::.::: ::: . CCDS32 QMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAER 2040 2050 2060 2070 2080 2090 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 MKKIYGEFCCHHKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITK .:: ::.:: .:...:: ::.: ..:.:: :.: . :. ..:: ::::::::::::::: CCDS32 LKKTYGKFCGQHNQSVNYFKDLYAKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITK 2100 2110 2120 2130 2140 2150 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 YPVLVERILQYTKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKT :::: .:::: ::. :..:: ..: :.::.:..:: :: :::. . :: .: ..:. CCDS32 YPVLFQRILQCTKDNEVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSKS 2160 2170 2180 2190 2200 2210 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 YTKLKNGHVFRKQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYI ..:.:..: :. : ... :. :: :. :.:.::.:.. :.::::.:.:::::::::: CCDS32 IMRMKSGQMFAKEDL--KRKKLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYI 2220 2230 2240 2250 2260 2270 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 FAAVDQKPSVISLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQ ::..::: .::::.:::.::::.::.:.:::: . . ::: :.:..::::::.:.. ::. CCDS32 FASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQD 2280 2290 2300 2310 2320 2330 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA1 AVESCP-EEKGGRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELG .... .: : ::..:.:. ..:. .. .: : ..::.: :::: :. ... CCDS32 TINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTRA---RELKEQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMA 2340 2350 2360 2370 2380 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 ELSGF--ED---VHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQS : : :: .: :..:.. . : ... :. .:..:.: :: :... :... . CCDS32 ECSTPLPEDCSPTH-SPRVLFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPT 2390 2400 2410 2420 2430 2440 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA1 C-----EDSCGDSVL---ADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLA .: : : :.:... : : . ::.. .: : .. . .: . CCDS32 VSSPIEQDVVGPVSLPRRAETFGGFD---SHQMNASKGGEKEEG--DDGQDLRRTESDSG 2450 2460 2470 2480 2490 2500 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA1 VSDAGEKVECRNFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLS .. .:. . .:. ...:.. .: .:: .::... :::.:: ..:::... . CCDS32 LKKGGNANLVFMLKRNSE-QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSER---A 2510 2520 2530 2540 2550 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA1 LGHSILRGGPLQDQ-KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRES : .:. : . : .: :.:. ..:...:::... : : .:.:: :. : ..: ::. CCDS32 LTRSLSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREA 2560 2570 2580 2590 2600 2610 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA1 WLQERERECQSQEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGH : .::.: :. .. : . : ::. . ::..::::: .:. .:::: ..: . :.. CCDS32 LLAQREEEVQQGQQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQ 2620 2630 2640 2650 2660 2670 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA1 WKHGRQRSLPAVLLPGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQD . .:.: : : CCDS32 RQ--TERDLCQVSHPHTKLMRIPSFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSIS 2680 2690 2700 2710 2720 2730 >-- initn: 535 init1: 286 opt: 468 Z-score: 340.9 bits: 76.8 E(32554): 1.1e-12 Smith-Waterman score: 472; 26.4% identity (57.1% similar) in 594 aa overlap (1-541:1-585) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MELSCSEAPLYGQMMIYAKFDKNVYLPEDAEFYFTYDGSHQRHVMIAERIEDNVLQSSVP :.:. ..:::::. .. . . .. .:. ::... :: :: .... ...:.. .: CCDS32 MKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKAEDDVVFYLVFLGSTLRHCTSTRKVSSDTLETIAP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 GHGLQETVTVSVCLCSEGYSPVTMGSGSVTYVDNMACRLARLLVTQANRLTACSHQTLLT :: ::: :..: .:: ... . .:.. : :..:.:.:. : . .: CCDS32 GHDCCETVKVQLCASKEGLPVFVVAEEDFHFVQDEAYDAAQFLATSAGNQQALNFTRFLD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 PFALTAGALPALDEELVLALTHLELPLEWTVLGSS-SLEVSSHRESLLHLAMRWGLAKLS . .: . .::..::::. ::.:: ::.:::.. ::. .. ::.:.:.:.: :: .:. CCDS32 QSGPPSGDVNSLDKKLVLAFRHLKLPTEWNVLGTDQSLHDAGPRETLMHFAVRLGLLRLT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 QFFLCLPGGVQALALPNEEGATPLDLALREGHSKLVEDVTNFQGRRSPSFSRVQLSEE-- :.: ::: ::.. :.:::::..:::..:. :: . .:. .. . :.: .:: : CCDS32 WFLLQKPGGRGALSIHNQEGATPVSLALERGYHKLHQLLTEENAGEPDSWS--SLSYEIP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 -ASLHYIHSSE----TLTLTLNHTAEHLLEADI---KLFRKYFWDRAFLVKAFEQEAR-- .. : : ::: . :: . .: .:. . .. .. ..: CCDS32 YGDCSVRHHRELDIYTLTSESDSHHEHPFPGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDSLM 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KA1 PEERTAM-PSSGAETE-------EEIKNSVSSRSAAEKEDIKRVK-SLVVQHNEHEDQHS : ::. :::. ::. : . :. : :. . : :.: . : : CCDS32 PLMMTAQDPSSAPETDGQFLPCAPEPTDPQRLSSSEETESTQCCPGSPVAQTESPCDLSS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KA1 L----DLDRSF-----DILKKSKP--PSTLLAAGRLSDMLN--------G--GDEVYANC . . ::: . .:.. :. .. .: .::. . : : : ..: CCDS32 IVEEENTDRSCRKKNKGVERKGEEVEPAPIVDSGTVSDQDSCLQSLPDCGVKGTEGLSSC 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 MVIDQVGDLDISYI--NIEGITATTSPESRGCTLWPQSSKHTLPTETSPSVYPLSENVEG .. : . . :.... . .: .. : ..... : . .. . .. CCDS32 GNRNEETGTKSSGMPTDQESLSSGDAVLQRDLVMEPGTAQYSSGGELG-GISTTNVSTPD 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 TAHTEAQQSFMSPSSSCASNLNLSFGWHGFEK-EQSHLKKRSSSLDALDADSEGEGHSEP :: : ....:.:... .:. :. : :. :.:.. ..: :. ... . : : CCDS32 TAG-EMEHGLMNPDATVWKNV-LQGGESTKERFENSNIGTAGAS-DVHVTSKPVDKISVP 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 pF1KA1 SHICYTPGSQS-----SSRTGIPSGDELDSFETNTEPDFNISRAESL--PLSSNLQLKES . : .:...: ..... ..: : : ..: . . :: :: :...: CCDS32 N--C-APAASSLDGNKPAESSLAFSNEETSTEKTAETETSRSREESADAPVDQNSVVIPA 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 LLSGVRSRSYSCSSPKISLGKTRLVRELTVCSSSEEQKAYSLSEPPRENRIQEEEWDKYI CCDS32 AAKDKISDGLEPYTLLAAGIGEAMSPSDLALLGLEEDVMPHQNSETNSSHAQSQKGKSSP 600 610 620 630 640 650 >>CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817 aa) initn: 1399 init1: 642 opt: 1934 Z-score: 1399.8 bits: 272.8 E(32554): 1.2e-71 Smith-Waterman score: 2042; 35.1% identity (66.3% similar) in 1174 aa overlap (425-1545:1557-2694) 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 GITATTSPESRGCTLWPQSSKHTLPTETSPSVYPLSENVEGTAHTEAQQSFMSPSSS--C :. :. .. : ... :... :. : : CCDS32 PADPGDVEEEEMDSITEVPANCSVLRSSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNHRSMSWC 1530 1540 1550 1560 1570 1580 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 ASNLNLSFGWHGFEKEQSHLKKRSSSLDALDADSEGEGHSEPSHICYTPGSQSSSRTGIP :... : : .. .. :: ::..: . . : :.. : . . .. : . CCDS32 PSGVQYSAGL------SADFNYRSFSLEGLTGGA-GVGNKPSSSLEVSSANAEELRHPFS 1590 1600 1610 1620 1630 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 SGDELDSFETNTEPDFNISRAESLPLSSNLQLKESLLSGVRSRSYSCSSPKISLGKTRLV . ...::. . .: :.. .. : ..... ..: .: . . ::: . . . CCDS32 GEERVDSLVSLSEEDLESDQREHRMFDQQI-CHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTI 1640 1650 1660 1670 1680 1690 580 590 600 610 620 pF1KA1 RELTVCSSSEEQKAYSLSEPPRENRIQEEEWDKYII--PAKSESE---KYKVSRTFSFLM . . .: .... . . : ::... .. :.:..:: :::::::.. CCDS32 SHPGLDNSRPFHSTFHNTSANLTESITEENYN-FLPHSPSKKDSEWKSGTKVSRTFSYIK 1700 1710 1720 1730 1740 1750 630 640 650 660 670 pF1KA1 NRMTSPR---------NKSKTKSKDAKDKEK----LNRHQFAPGTFSGVLQCLVCDKTLL :.:.: . .: : : ::.::::: .: : :. : ..: : : . CCDS32 NKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKDKEKDKKTVNGHTFSSIPVVGPISCSQCMKPFT 1760 1770 1780 1790 1800 1810 680 690 700 710 720 pF1KA1 GKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACTK--------KFQEKYNKNKPQTILGN--SSFRDI .:.. :.::.: :::::... .:.: ..: . ... : .:. : :. .. CCDS32 NKDAYTCANCSAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSLQAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKER 1820 1830 1840 1850 1860 1870 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 PQPGLSL-HPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSATSLESESDNNSC :. .. : ....:. ..:: : ::.:: :.. . ..:. .:. CCDS32 PRSAVLLVDETATTPI--FANRRSQ--QSVSLSKSV------SIQNITGVGNDENMSNTW 1880 1890 1900 1910 1920 790 800 810 820 830 pF1KA1 RSRSHSDELLQSMGS-SPSTESFIME----DVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPS . ::: . :..... . ::::. : :. ...: .:. .....:::::: ..: . CCDS32 KFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSK 1930 1940 1950 1960 1970 1980 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 FCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLD : ..:.:::.:::.::.::::::.::..:: ::: .. .:: .: .... :.:.::::: CCDS32 FLKQQKKDVVKRQEVIYELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLD 1990 2000 2010 2020 2030 2040 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 ELLEIHRHFFYSMKERRQESCAG-SDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCH ::. :: .:: . ::..:: . :..::.: ::::.::.::: ::: ..:: ::.:: . CCDS32 ELISIHSQFFQRILERKKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAERLKKTYGKFCGQ 2050 2060 2070 2080 2090 2100 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA1 HKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQY :...:: ::.: ..:.:: :.: . :. ..:: ::::::::::::::::::: .:::: CCDS32 HNQSVNYFKDLYAKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRILQC 2110 2120 2130 2140 2150 2160 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA1 TKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFR ::. :..:: ..: :.::.:..:: :: :::. . :: .: ..:. ..:.:..: CCDS32 TKDNEVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFA 2170 2180 2190 2200 2210 2220 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA1 KQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVI :. : ... :. :: :. :.:.::.:.. :.::::.:.::::::::::::..::: .:: CCDS32 KEDL--KRKKLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYIFASLDQKSTVI 2230 2240 2250 2260 2270 2280 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA1 SLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCP-EEKG ::.:::.::::.::.:.:::: . . ::: :.:..::::::.:.. ::..... .: CCDS32 SLKKLIVREVAHEEKGLFLISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDE 2290 2300 2310 2320 2330 2340 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA1 GRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGF--ED-- : ::..:.:. ..:. ... : : ..::.: :::: :. ...: : :: CCDS32 GIPSENEEEKKMLDTRARELK---EQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECSTPLPEDCS 2350 2360 2370 2380 2390 2400 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA1 -VHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSC-----EDSCG .: :..:.. . : ... :. .:..:.: :: :... :... . .: : CCDS32 PTH-SPRVLFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSPIEQDVVG 2410 2420 2430 2440 2450 2460 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA1 DSVL---ADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECR : :.:... : : . ::.. .: : .. . .: ... .:. CCDS32 PVSLPRRAETFGGFD---SHQMNASKGGEKEEG--DDGQDLRRTESDSGLKKGGNANLVF 2470 2480 2490 2500 2510 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA1 NFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPL . .:. ...:.. .: .:: .::... :::.:: ..:::... .: .:. : . : CCDS32 MLKRNSE-QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSER---ALTRSLSRPSSL 2520 2530 2540 2550 2560 2570 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 QDQ-KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQS .: :.:. ..:...:::... : : .:.:: :. : ..: ::. : .::.: :. CCDS32 IEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQ 2580 2590 2600 2610 2620 2630 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 QEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPA .. : . : ::. . ::..::::: .:. .:::: ..: . :. .. .:.: CCDS32 GQQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLS--QRQTERDLCQ 2640 2650 2660 2670 2680 2690 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA1 VLLPGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSD : : CCDS32 VSHPHTKLMRIPSFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSISRTHKDKGPFHI 2700 2710 2720 2730 2740 2750 >-- initn: 535 init1: 286 opt: 468 Z-score: 340.9 bits: 76.8 E(32554): 1.1e-12 Smith-Waterman score: 472; 26.4% identity (57.1% similar) in 594 aa overlap (1-541:1-585) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MELSCSEAPLYGQMMIYAKFDKNVYLPEDAEFYFTYDGSHQRHVMIAERIEDNVLQSSVP :.:. ..:::::. .. . . .. .:. ::... :: :: .... ...:.. .: CCDS32 MKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKAEDDVVFYLVFLGSTLRHCTSTRKVSSDTLETIAP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 GHGLQETVTVSVCLCSEGYSPVTMGSGSVTYVDNMACRLARLLVTQANRLTACSHQTLLT :: ::: :..: .:: ... . .:.. : :..:.:.:. : . .: CCDS32 GHDCCETVKVQLCASKEGLPVFVVAEEDFHFVQDEAYDAAQFLATSAGNQQALNFTRFLD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 PFALTAGALPALDEELVLALTHLELPLEWTVLGSS-SLEVSSHRESLLHLAMRWGLAKLS . .: . .::..::::. ::.:: ::.:::.. ::. .. ::.:.:.:.: :: .:. CCDS32 QSGPPSGDVNSLDKKLVLAFRHLKLPTEWNVLGTDQSLHDAGPRETLMHFAVRLGLLRLT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 QFFLCLPGGVQALALPNEEGATPLDLALREGHSKLVEDVTNFQGRRSPSFSRVQLSEE-- :.: ::: ::.. :.:::::..:::..:. :: . .:. .. . :.: .:: : CCDS32 WFLLQKPGGRGALSIHNQEGATPVSLALERGYHKLHQLLTEENAGEPDSWS--SLSYEIP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 -ASLHYIHSSE----TLTLTLNHTAEHLLEADI---KLFRKYFWDRAFLVKAFEQEAR-- .. : : ::: . :: . .: .:. . .. .. ..: CCDS32 YGDCSVRHHRELDIYTLTSESDSHHEHPFPGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDSLM 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KA1 PEERTAM-PSSGAETE-------EEIKNSVSSRSAAEKEDIKRVK-SLVVQHNEHEDQHS : ::. :::. ::. : . :. : :. . : :.: . : : CCDS32 PLMMTAQDPSSAPETDGQFLPCAPEPTDPQRLSSSEETESTQCCPGSPVAQTESPCDLSS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KA1 L----DLDRSF-----DILKKSKP--PSTLLAAGRLSDMLN--------G--GDEVYANC . . ::: . .:.. :. .. .: .::. . : : : ..: CCDS32 IVEEENTDRSCRKKNKGVERKGEEVEPAPIVDSGTVSDQDSCLQSLPDCGVKGTEGLSSC 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 MVIDQVGDLDISYI--NIEGITATTSPESRGCTLWPQSSKHTLPTETSPSVYPLSENVEG .. : . . :.... . .: .. : ..... : . .. . .. CCDS32 GNRNEETGTKSSGMPTDQESLSSGDAVLQRDLVMEPGTAQYSSGGELG-GISTTNVSTPD 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 TAHTEAQQSFMSPSSSCASNLNLSFGWHGFEK-EQSHLKKRSSSLDALDADSEGEGHSEP :: : ....:.:... .:. :. : :. :.:.. ..: :. ... . : : CCDS32 TAG-EMEHGLMNPDATVWKNV-LQGGESTKERFENSNIGTAGAS-DVHVTSKPVDKISVP 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 pF1KA1 SHICYTPGSQS-----SSRTGIPSGDELDSFETNTEPDFNISRAESL--PLSSNLQLKES . : .:...: ..... ..: : : ..: . . :: :: :...: CCDS32 N--C-APAASSLDGNKPAESSLAFSNEETSTEKTAETETSRSREESADAPVDQNSVVIPA 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 LLSGVRSRSYSCSSPKISLGKTRLVRELTVCSSSEEQKAYSLSEPPRENRIQEEEWDKYI CCDS32 AAKDKISDGLEPYTLLAAGIGEAMSPSDLALLGLEEDVMPHQNSETNSSHAQSQKGKSSP 600 610 620 630 640 650 >>CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173 aa) initn: 1360 init1: 996 opt: 1901 Z-score: 1381.8 bits: 268.2 E(32554): 1.2e-70 Smith-Waterman score: 2172; 45.7% identity (72.6% similar) in 855 aa overlap (719-1545:135-967) 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 HKGCKDAAPACTKKFQEKYNKNKPQTILGNSSFRDIPQPGL--SLHPSSSVPVGLPTGRR .:... :. : . :. : ::. .... CCDS45 RPQSERGFRAGDLRYPTHFLSTNSVLASVTASLKEHPRGTLLSDGSPALSRNVGMTVSQK 110 120 130 140 150 160 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 ETVGQVHPL-SRSVPGTTLESFRRSATSLESESDNNSCRSRSHSDELLQSMGSSPSTESF : .: : . ::: : . :. .:.:. . .. .:. : :. .::.:::. CCDS45 ---GGPQPTPSPAGPGTQLGPI----TGEMDEADSAFLKFKQTADDSL-SL-TSPNTESI 170 180 190 200 210 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 IMEDVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPSFCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHI ..:: .:: :.. ::..:::::::::.:: .. ..:...:.:::::..::::::.::. CCDS45 FVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHV 220 230 240 250 260 270 870 880 890 900 910 920 pF1KA1 QTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFYSMKERRQESCA-GSDR .:: :: ... ....::::.. ... ..::: :.::: : ::. .::::::: :::: CCDS45 RTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKERRQESLEEGSDR 280 290 300 310 320 330 930 940 950 960 970 980 pF1KA1 NFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKEL-QQNKKFQNFIKLRNS :.::..:::.:::::: ::. .::. :: :: :.:::. .: : ::::::::.:: .. CCDS45 NYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNKKFQNLIKKIGN 340 350 360 370 380 390 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA1 NLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQYTKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDL ..:: :. ::::::::::::::::::::.: :. ::...:: .:: ::::.:. :: CCDS45 FSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALNLIKDIISQVDA 400 410 420 430 440 450 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KA1 KVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFRKQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFK ::.: ::.:. :: .:.. :. .::::: .:::. .. .: : .:.. :::..::.: CCDS45 KVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDML--QRQLHLEGMLCWKTTSGRLK 460 470 480 490 500 510 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA1 DILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVISLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGP ::::.:::::::.::::::::.::.::.:: ::::::::.:::::::..::::::: :: CCDS45 DILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMFLISASLQGP 520 530 540 550 560 570 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KA1 EMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCPEEKGGRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILT :::::.:.:::.:: :: .::.::::::.:. : : .:... .:::...... :: :. CCDS45 EMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKVVEARATRLRDFQERLS 580 590 600 610 620 630 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA1 NQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGFEDVHLEPHLLIKP-DPGEPPQAASLLAAALKEAE .:: : : :: .:: :..:..:.::. .:. :.. ::.: :. .: .:..: : CCDS45 MKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLP-QPRGLFRGGDPSETLQGELILKSAMSEIE 640 650 660 670 680 690 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA1 SLQVAVKASQMGAVSQSCED---SCGDSVLADTLSSHDVPGSPT---------ASLVTGG ..: . :.:... . :: : : :.:....: .::: .: CCDS45 GIQSLI-CRQLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKKKVSSTDPRP 700 710 720 730 740 750 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 REGRG--------CSDVD-PGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFPGSSQSEIIQAIQNLTR :. :: :: : :: .. . .: : . . : .: .::..: ::.:.. CCDS45 RDWRGPPNSPDLKLSDSDIPG-SSEESPQVVEAPGTESDPR-LPTVLESELVQRIQTLSQ 760 770 780 790 800 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 LLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQ-KSRDADRQHEELANV :: .:::... :::..: .: ..:..: .: ::. : .: ..:. ..:.:: : . CCDS45 LLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQST-RGNLLLEQERQRNFEKQREERAAL 810 820 830 840 850 860 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 HQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQSQEELLLRSRGELDLQLQEY ..:: ::..::.:: :. . :.. . ::::: : .. .: : . :.::. : : : CCDS45 EKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRERLEQERAELERQRQAY 870 880 890 900 910 920 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA1 QHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPAVLLPGGPEVMELNRSESLC ::.::::::.:: ::::. :.. :: . : .: . :..: : CCDS45 QHDLERLREAQRAVERERERLE----LLRRLK--KQNTAPGALPPDTLAEAQPPSHPPSF 930 940 950 960 970 980 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KA1 HENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSDLVRTSEHQVDLKVDPSQPS CCDS45 NGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTENRLAKSDVPIQLLSATNQFQRQAA 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015 aa) initn: 1360 init1: 996 opt: 1889 Z-score: 1374.2 bits: 266.6 E(32554): 3.2e-70 Smith-Waterman score: 2160; 47.0% identity (73.6% similar) in 811 aa overlap (760-1545:18-809) 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 SLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSATSLESESDNNSCRSRSHS ::: : . :. .:.:. . .. . CCDS12 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPI----TGEMDEADSAFLKFKQTA 10 20 30 40 790 800 810 820 830 840 pF1KA1 DELLQSMGSSPSTESFIMEDVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPSFCNRQEKDVIK :. : :. .::.:::...:: .:: :.. ::..:::::::::.:: .. ..:...:.: CCDS12 DDSL-SL-TSPNTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVK 50 60 70 80 90 100 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 RQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFY ::::..::::::.::..:: :: ... ....::::.. ... ..::: :.::: : ::. CCDS12 RQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLA 110 120 130 140 150 160 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 SMKERRQESCA-GSDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKEL .::::::: :::::.::..:::.:::::: ::. .::. :: :: :.:::. .: : CCDS12 RLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLL 170 180 190 200 210 220 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 -QQNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQYTKERTEEHKDL ::::::::.:: .. ..:: :. ::::::::::::::::::::.: :. ::...:: CCDS12 LQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDL 230 240 250 260 270 280 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 RKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFRKQALMSEERTL .:: ::::.:. :: ::.: ::.:. :: .:.. :. .::::: .:::. .. .: : CCDS12 TQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDML--QRQL 290 300 310 320 330 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA1 LYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVISLQKLIAREVA .:.. :::..::.:::::.:::::::.::::::::.::.::.:: ::::::::.:::: CCDS12 HLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVA 340 350 360 370 380 390 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 NEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCPEEKGGRTSESDEDKRK :::..::::::: :::::::.:.:::.:: :: .::.::::::.:. : : .:... CCDS12 NEEKAMFLISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKV 400 410 420 430 440 450 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 AEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGFEDVHLEPHLLIKP-DPGE .:::...... :: :. .:: : : :: .:: :..:..:.::. .:. :.. ::.: CCDS12 VEARATRLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLP-QPRGLFRGGDPSE 460 470 480 490 500 510 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 PPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCED---SCGDSVLADTLSSHDVPGSPT :. .: .:..: :..: . :.:... . :: : : :.:....: .::: CCDS12 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLI-CRQLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPT 520 530 540 550 560 570 1330 1340 1350 1360 pF1KA1 ---------ASLVTGGREGRG--------CSDVD-PGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFP .: :. :: :: : :: .. . .: : . . : .: CCDS12 KNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPG-SSEESPQVVEAPGTESDPR-LP 580 590 600 610 620 630 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA1 GSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQ .::..: ::.:..:: .:::... :::..: .: ..:..: .: ::. : .: CCDS12 TVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQST-RGNLLLEQ 640 650 660 670 680 690 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 -KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQSQEE ..:. ..:.:: : ...:: ::..::.:: :. . :.. . ::::: : .. .: CCDS12 ERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRE 700 710 720 730 740 750 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 LLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPAVLL : . :.::. : : :::.::::::.:: ::::. :.. :: . : .: . :..: CCDS12 RLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLE----LLRRLK--KQNTAPGALP 760 770 780 790 800 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA1 PGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSDLVR : CCDS12 PDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTENRLAKSDV 810 820 830 840 850 860 >>CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (985 aa) initn: 851 init1: 432 opt: 1643 Z-score: 1196.7 bits: 233.7 E(32554): 2.5e-60 Smith-Waterman score: 1764; 38.0% identity (66.4% similar) in 886 aa overlap (628-1497:15-859) 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 IQEEEWDKYIIPAKSESEKYKVSRTFSFLMNRMTSPRNKSKTKSKDAKDKEKLNRHQFAP .: . ... : : :.::: . : : :. CCDS53 MSRIESLTRARIDRSRELASKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTT 10 20 30 40 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 GTFSGVLQCLVCDKTLLGKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACTK--KFQEKYNKNKPQTI . ::. .: .:.:.. .::.: : .::...:. :::. ::: . :.: : .: CCDS53 ISVSGMTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTA 50 60 70 80 90 100 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 LGNSSFRDIP----QPGLSLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSA : . :.:. .:. ...::.: .: .:: . :..:: :.. : CCDS53 LQSVSLRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSL--SLAKSVSTTNI------A 110 120 130 140 150 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 TSLESESDNNSCRSRSHSDELLQSMGSSPSTESFIMEDVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESW ...:: . : :.: . :. . . :.::.: :.:. : : ::. : ..: :.:: CCDS53 GHFNDESPLGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSW 160 170 180 190 200 210 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 SLVVDPSFCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVD ::.:: :: ....:.:.:.::::.::.:::.::..:: ::...:: :: :::.:. ..:. CCDS53 SLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQ 220 230 240 250 260 270 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 KIFPCLDELLEIHRHFFYSMKERRQES-CAGSDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKI .:::.::: .:: .:. .. :::... : :: ::::: :.::.:..::: .: .: : CCDS53 GLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKT 280 290 300 310 320 330 960 970 980 990 1000 pF1KA1 YGEFCCHHKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVL :.::: .:..:..:.::: ..:.::.::. . . .:.:. ::::::::::::::.: CCDS53 YSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLL 340 350 360 370 380 390 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 VERILQYTKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKL . ::::... ::..:: :: :.:.....:: . . ::. . :: :... .. : . CCDS53 ISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPV 400 410 420 430 440 450 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 KNGHVFRKQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAV . : .. :. .: :..:: . ::::::::::.:.::.::::.::::::::::: .. CCDS53 PGKGPFGREELL--RRKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTL 460 470 480 490 500 510 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 DQKPSVISLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVES : ::::.:::.::.:..::.:.::::::: : :::::.:: :...:..:.: :::.:.. CCDS53 D-KPSVVSLQNLIVRDIANQEKGMFLISA--APPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRT 520 530 540 550 560 570 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA1 CPEEKGGRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGF :: .. :... :: . .:.. : ..:. . :.::. ..::. .... CCDS53 CPSREDFPLIETED-----EAYLRRIKME---LQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAE 580 590 600 610 620 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA1 ED------VHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCEDS :: . :. :.. . : :.. :: :..:.:.:. . . . . : . CCDS53 EDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPA 630 640 650 660 670 680 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA1 CGDSVLADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRN : . :. :. ::.. :.: . .:. .: ::.... . : CCDS53 ---------LPLEPDSGGNTSPGVTANGEAR---TFNGSIELCRAD---SDSSQRDRNGN 690 700 710 720 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA1 FPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQ : : : .: . :: ::..::::.. ::. .: :. .. .: .. : : CCDS53 QLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEA-RFPEGPERREKLCRANSRDGEAG 730 740 750 760 770 780 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 DQKSRDA--DRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQS . . ..: ::: . : :: : ::. ::::.. . .::. . :. : :: .. CCDS53 RAGAAPVAPEKQATELA-LLQRQHALLQEE---LRRCRRLGEERATEAGSLEARLRESEQ 790 800 810 820 830 840 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 QEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPA . :: : : :: CCDS53 ARALLEREAEEARRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSR 850 860 870 880 890 900 >>CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (986 aa) initn: 626 init1: 408 opt: 1631 Z-score: 1188.0 bits: 232.1 E(32554): 7.5e-60 Smith-Waterman score: 1752; 38.0% identity (66.3% similar) in 887 aa overlap (628-1497:15-860) 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 IQEEEWDKYIIPAKSESEKYKVSRTFSFLMNRMTSPRNKSKTKSKDAKDKEKLNRHQFAP .: . ... : : :.::: . : : :. CCDS53 MSRIESLTRARIDRSRELASKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTT 10 20 30 40 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 GTFSGVLQCLVCDKTLLGKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACTK--KFQEKYNKNKPQTI . ::. .: .:.:.. .::.: : .::...:. :::. ::: . :.: : .: CCDS53 ISVSGMTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTA 50 60 70 80 90 100 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 LGNSSFRDIP----QPGLSLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSA : . :.:. .:. ...::.: .: .:: . :..:: :.. : CCDS53 LQSVSLRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSL--SLAKSVSTTNI------A 110 120 130 140 150 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 TSLESESDNNSCRSRSHSDELLQSMGSSPSTESFIME-DVVDSSLWSDLSSDAQEFEAES ...:: . : :.: . :. . . :.::.: : .:. : : ::. : ..: :.: CCDS53 GHFNDESPLGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEAEVIYSELMSDFEMDEKDFAADS 160 170 180 190 200 210 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 WSLVVDPSFCNRQEKDVIKRQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTV :::.:: :: ....:.:.:.::::.::.:::.::..:: ::...:: :: :::.:. ..: CCDS53 WSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVV 220 230 240 250 260 270 900 910 920 930 940 pF1KA1 DKIFPCLDELLEIHRHFFYSMKERRQES-CAGSDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKK . .:::.::: .:: .:. .. :::... : :: ::::: :.::.:..::: .: .: : CCDS53 QGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCK 280 290 300 310 320 330 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 IYGEFCCHHKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPV :.::: .:..:..:.::: ..:.::.::. . . .:.:. ::::::::::::::. CCDS53 TYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPL 340 350 360 370 380 390 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 LVERILQYTKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTK :. ::::... ::..:: :: :.:.....:: . . ::. . :: :... .. : CCDS53 LISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTP 400 410 420 430 440 450 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 LKNGHVFRKQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAA . . : .. :. .: :..:: . ::::::::::.:.::.::::.::::::::::: . CCDS53 VPGKGPFGREELL--RRKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPT 460 470 480 490 500 510 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 VDQKPSVISLQKLIAREVANEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVE .: ::::.:::.::.:..::.:.::::::: : :::::.:: :...:..:.: :::.:. CCDS53 LD-KPSVVSLQNLIVRDIANQEKGMFLISA--APPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVR 520 530 540 550 560 570 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA1 SCPEEKGGRTSESDEDKRKAEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSG .:: .. :... :: . .:.. : ..:. . :.::. ..::. .... CCDS53 TCPSREDFPLIETED-----EAYLRRIKME---LQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQA 580 590 600 610 620 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA1 FED------VHLEPHLLIKPDPGEPPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCED :: . :. :.. . : :.. :: :..:.:.:. . . . . : CCDS53 EEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREP 630 640 650 660 670 680 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA1 SCGDSVLADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAGEKVECR . : . :. :. ::.. :.: . .:. .: ::.... . CCDS53 A---------LPLEPDSGGNTSPGVTANGEAR---TFNGSIELCRAD---SDSSQRDRNG 690 700 710 720 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA1 NFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPL : : : : .: . :: ::..::::.. ::. .: :. .. .: .. : : CCDS53 NQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEA-RFPEGPERREKLCRANSRDGEA 730 740 750 760 770 780 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 QDQKSRDA--DRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQ . . ..: ::: . : :: : ::. ::::.. . .::. . :. : :: . CCDS53 GRAGAAPVAPEKQATELA-LLQRQHALLQEE---LRRCRRLGEERATEAGSLEARLRESE 790 800 810 820 830 840 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 SQEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLP . . :: : : :: CCDS53 QARALLEREAEEARRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPS 850 860 870 880 890 900 1705 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 22:22:11 2016 done: Wed Nov 2 22:22:12 2016 Total Scan time: 4.720 Total Display time: 0.840 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]