Result of FASTA (ccds) for
pF1KA2004
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA2004, 1589 aa
1>>>pF1KA2004 1589 - 1589 aa - 1589 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3358+/-0.00134; mu= 18.4539+/- 0.081
mean_var=79.7151+/-16.531, 0's: 0 Z-trim(100.2): 39 B-trim: 329 in 1/49
Lambda= 0.143649
statistics sampled from 5990 (6007) to 5990 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.513), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 5.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34680.1 SAMD9 gene_id:54809|Hs108|chr7 (1589) 10517 2190.6 0
CCDS34681.1 SAMD9L gene_id:219285|Hs108|chr7 (1584) 5307 1110.9 0
>>CCDS34680.1 SAMD9 gene_id:54809|Hs108|chr7 (1589 aa)
initn: 10517 init1: 10517 opt: 10517 Z-score: 11769.6 bits: 2190.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10517; 100.0% identity (100.0% similar) in 1589 aa overlap (1-1589:1-1589)
10 20 30 40 50 60
pF1KA2 MAKQLNLPENTDDWTKEDVNQWLESHKIDQKHREILTEQDVNGAVLKWLKKEHLVDMGIT
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CCDS34 MAKQLNLPENTDDWTKEDVNQWLESHKIDQKHREILTEQDVNGAVLKWLKKEHLVDMGIT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA2 HGPAIQIEELFKELRKTAIEDSIQTSKMGKPSKNAPKDQTVSQKERRETSKQKQKGKENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HGPAIQIEELFKELRKTAIEDSIQTSKMGKPSKNAPKDQTVSQKERRETSKQKQKGKENP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA2 DMANPSAMSTTAKGSKSLKVELIEDKIDYTKERQPSIDLTCVSYPFDEFSNPYRYKLDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DMANPSAMSTTAKGSKSLKVELIEDKIDYTKERQPSIDLTCVSYPFDEFSNPYRYKLDFS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA2 LQPETGPGNLIDPIHEFKAFTNTATATEEDVKMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQPETGPGNLIDPIHEFKAFTNTATATEEDVKMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFGVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA2 DKPHGKIVGIKVTNDTKEALINHFNLMINKYFEDHQVQQAKKCIREPRFVEVLLPNSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DKPHGKIVGIKVTNDTKEALINHFNLMINKYFEDHQVQQAKKCIREPRFVEVLLPNSTLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA2 DRFVIEVDIIPQFSECQYDYFQIKMQNYNNKIWEQSKKFSLFVRDGTSSKDITKNKVDFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRFVIEVDIIPQFSECQYDYFQIKMQNYNNKIWEQSKKFSLFVRDGTSSKDITKNKVDFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA2 AFKADFKTLAESRKAAEEKFRAKTNKKEREGPKLVKLLTGNQDLLDNSYYEQYILVTNKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AFKADFKTLAESRKAAEEKFRAKTNKKEREGPKLVKLLTGNQDLLDNSYYEQYILVTNKC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA2 HPDQTKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESNINGVVKAYKESRVANLHFPSVYVEQKTTPNETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPDQTKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESNINGVVKAYKESRVANLHFPSVYVEQKTTPNETI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA2 STLNLYHQPSWIFCNGRLDLDSEKYKPFDPSSWQRERASDVRKLISFLTHEDIMPRGKFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 STLNLYHQPSWIFCNGRLDLDSEKYKPFDPSSWQRERASDVRKLISFLTHEDIMPRGKFL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA2 VVFLLLSSVDDPRDPLIETFCAFYQDLKGMENILCICVHPHIFQGWKDLLEARLIKHQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VVFLLLSSVDDPRDPLIETFCAFYQDLKGMENILCICVHPHIFQGWKDLLEARLIKHQDE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA2 ISSQCISALSLEEINGTILKLKSVTQSSKRLLPSIGLSTVLLKKEEDIMTALEIICENEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ISSQCISALSLEEINGTILKLKSVTQSSKRLLPSIGLSTVLLKKEEDIMTALEIICENEC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA2 EGTLLEKDKNKFLEFKASKEEDFYRGGKVSWWNFYFSSESYSSPFVKRDKYERLEAMIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGTLLEKDKNKFLEFKASKEEDFYRGGKVSWWNFYFSSESYSSPFVKRDKYERLEAMIQN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA2 CADSSKPTSTKIIHLYHHPGCGGTTLAMHILWELRKKFRCAVLKNKTVDFSEIGEQVTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CADSSKPTSTKIIHLYHHPGCGGTTLAMHILWELRKKFRCAVLKNKTVDFSEIGEQVTSL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA2 ITYGAMNRQEYVPVLLLVDDFEEQDNVYLLQYSIQTAIAKKYIRYEKPLVIILNCMRSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ITYGAMNRQEYVPVLLLVDDFEEQDNVYLLQYSIQTAIAKKYIRYEKPLVIILNCMRSQN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA2 PEKSARIPDSIAVIQQLSPKEQRAFELKLKEIKEQHKNFEDFYSFMIMKTNFNKEYIENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PEKSARIPDSIAVIQQLSPKEQRAFELKLKEIKEQHKNFEDFYSFMIMKTNFNKEYIENV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA2 VRNILKGQNIFTKEAKLFSFLALLNSYVPDTTISLSQCEKFLGIGNKKAFWGTEKFEDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VRNILKGQNIFTKEAKLFSFLALLNSYVPDTTISLSQCEKFLGIGNKKAFWGTEKFEDKM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA2 GTYSTILIKTEVIECGNYCGVRIIHSLIAEFSLEELKKSYHLNKSQIMLDMLTENLFFDT
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CCDS34 GTYSTILIKTEVIECGNYCGVRIIHSLIAEFSLEELKKSYHLNKSQIMLDMLTENLFFDT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA2 GMGKSKFLQDMHTLLLTRHRDEHEGETGNWFSPFIEALHKDEGNEAVEAVLLESIHRFNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GMGKSKFLQDMHTLLLTRHRDEHEGETGNWFSPFIEALHKDEGNEAVEAVLLESIHRFNP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA2 NAFICQALARHFYIKKKDFGNALNWAKQAKIIEPDNSYISDTLGQVYKSKIRWWIEENGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NAFICQALARHFYIKKKDFGNALNWAKQAKIIEPDNSYISDTLGQVYKSKIRWWIEENGG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA2 NGNISVDDLIALLDLAEHASSAFKESQQQSEDREYEVKERLYPKSKRRYDTYNIAGYQGE
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CCDS34 NGNISVDDLIALLDLAEHASSAFKESQQQSEDREYEVKERLYPKSKRRYDTYNIAGYQGE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA2 IEVGLYTIQILQLIPFFDNKNELSKRYMVNFVSGSSDIPGDPNNEYKLALKNYIPYLTKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IEVGLYTIQILQLIPFFDNKNELSKRYMVNFVSGSSDIPGDPNNEYKLALKNYIPYLTKL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA2 KFSLKKSFDFFDEYFVLLKPRNNIKQNEEAKTRRKVAGYFKKYVDIFCLLEESQNNTGLG
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CCDS34 KFSLKKSFDFFDEYFVLLKPRNNIKQNEEAKTRRKVAGYFKKYVDIFCLLEESQNNTGLG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA2 SKFSEPLQVERCRRNLVALKADKFSGLLEYLIKSQEDAISTMKCIVNEYTFLLEQCTVKI
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CCDS34 SKFSEPLQVERCRRNLVALKADKFSGLLEYLIKSQEDAISTMKCIVNEYTFLLEQCTVKI
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA2 QSKEKLNFILANIILSCIQPTSRLVKPVEKLKDQLREVLQPIGLTYQFSEPYFLASLLFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSKEKLNFILANIILSCIQPTSRLVKPVEKLKDQLREVLQPIGLTYQFSEPYFLASLLFW
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA2 PENQQLDQHSEQMKEYAQALKNSFKGQYKHMHRTKQPIAYFFLGKGKRLERLVHKGKIDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PENQQLDQHSEQMKEYAQALKNSFKGQYKHMHRTKQPIAYFFLGKGKRLERLVHKGKIDQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA2 CFKKTPDINSLWQSGDVWKEEKVQELLLRLQGRAENNCLYIEYGINEKITIPITPAFLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CFKKTPDINSLWQSGDVWKEEKVQELLLRLQGRAENNCLYIEYGINEKITIPITPAFLGQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580
pF1KA2 LRSGRSIEKVSFYLGFSIGGPLAYDIEIV
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LRSGRSIEKVSFYLGFSIGGPLAYDIEIV
1570 1580
>>CCDS34681.1 SAMD9L gene_id:219285|Hs108|chr7 (1584 aa)
initn: 4712 init1: 3005 opt: 5307 Z-score: 5934.2 bits: 1110.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6201; 60.2% identity (81.9% similar) in 1600 aa overlap (1-1589:1-1584)
10 20 30 40 50
pF1KA2 MAKQLNLPENTDDWTKEDVNQWL-ESHKIDQKHREILTEQDVNGAVLKWLKKEHLVDMGI
:.::..::: ::::: :..:. :. ::.... .:: ..:.: ::. : .. ::.::.
CCDS34 MSKQVSLPEMIKDWTKEHVKKWVNEDLKINEQYGQILLSEEVTGLVLQELTEKDLVEMGL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA2 THGPAIQIEELFKELRKTAIEDSIQTSKMGKPSKNAPKDQTVSQKERRETSKQKQKG-KE
:::. :.. ...: . . :.. . :. ... :. .: ::. ..:.:..... .
CCDS34 PWGPALLIKRSYNKLNSKSPESDNHDP--GQLDNSKPS-KTEHQKNPKHTKKEEENSMSS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA2 NPDMANPSAMSTTAKGSKSLKVELIEDKIDYTKERQPSI----DLTCVSYPFDEFSNPYR
: :. .: . . . : : . :.. .:... . .:::. ::::.: . .:
CCDS34 NIDY-DPREIRDIKQEESILMKENVLDEVANAKHKKKGKLKPEQLTCMPYPFDQFHDSHR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 YKLDFSLQPETGPGNLIDPIHEFKAFTNTATATEEDVKMKFSNEVFRFASACMNSRTNGT
: ..:::::: :::::::::::.::: :::: :.:::::::::::::::::::::::
CCDS34 YIEHYTLQPETGALNLIDPIHEFKALTNTETATEVDIKMKFSNEVFRFASACMNSRTNGT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA2 IHFGVKDKPHGKIVGIKVTNDTKEALINHFNLMINKYFEDHQVQQAKKCIREPRFVEVLL
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CCDS34 IHFGVKDKPHGEIVGVKIT--SKAAFIDHFNVMIKKYFEESEINEAKKCIREPRFVEVLL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 PNSTLSDRFVIEVDIIPQFSECQYDYFQIKMQNYNNKIWEQSKKFSLFVRDGTSSKDITK
:.: ::::::::: ::. : :. :: :.:: ..:::.:....:::::.:.::.::
CCDS34 QNNTPSDRFVIEVDTIPKHSICNDKYFYIQMQICKDKIWKQNQNLSLFVREGASSRDILA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 NK----VDFRAFKADFKTLAESRKAAEEKFRAKTNKKEREGPKLVKLLTGNQDLLDNSYY
:. :::.:: ..:.:. ::: :::.. :. ::: :: :::::: ::.: ::::::
CCDS34 NSKQRDVDFKAFLQNLKSLVASRKEAEEEYGMKAMKKESEGLKLVKLLIGNRDSLDNSYY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA2 EQYILVTNKCHPDQTKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESNINGVVKAYKESRVANLHFPSVYV
. ::::::::::.: ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::. :
CCDS34 DWYILVTNKCHPNQIKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESMINGVVKAYKESRVANLHFPNQYE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA2 EQKTTPNETISTLNLYHQPSWIFCNGRLDLDSEKYKPFDPSSWQRERASDVRKLISFLTH
.. :. : :::::::.:::::::::: :: :: :::..: :::::::.::::: :::
CCDS34 DKTTNMWEKISTLNLYQQPSWIFCNGRSDLKSETYKPLEPHLWQRERASEVRKLILFLTD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA2 EDIMPRGKFLVVFLLLSSVDDPRDPLIETFCAFYQDLKGMENILCICVHPHIFQGWKDLL
:.:: ::::::::::::::..: ::::::: :::: ::::::.::: :. ::.: :::::
CCDS34 ENIMTRGKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFWAFYQALKGMENMLCISVNSHIYQRWKDLL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KA2 EARLIKHQDEISSQCISALSLEEINGTILKLKSVTQSSKRLLPSIGLSTVLL-KKEEDIM
..:. : .::.... ::.:..: .:.:::::::::.::.:.::. : :.:.: ::.::..
CCDS34 QTRM-KMEDELTNHSISTLNIELVNSTILKLKSVTRSSRRFLPARGSSSVILEKKKEDVL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA2 TALEIICENECEGTLLEKDKNKFLEFKASKEEDFYRGGKVSWWNFYFSSESYSSPFVKRD
:::::.::::: : .::::.:::::: :::: :::::::::::::::::.::: :::::
CCDS34 TALEILCENECTETDIEKDKSKFLEFKKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSDFVKRD
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA2 KYERLEAMIQNCADSSKPTSTKIIHLYHHPGCGGTTLAMHILWELRKKFRCAVLKNKTVD
.::.:. .:. :.: :: .:::.:::::::::::::::.::.:.:.::::::::::.:
CCDS34 SYEKLKDLIHCWAESPKPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHVLWDLKKNFRCAVLKNKTTD
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KA2 FSEIGEQVTSLITYGAMNRQEYVPVLLLVDDFEEQDNVYLLQYSIQTAIAKKYIRYEKPL
:.::.::: .:.:: : ..:.:.::::::::::::.:::.:: .:....:.: .:::: :
CCDS34 FAEIAEQVINLVTYRAKSHQDYIPVLLLVDDFEEQENVYFLQNAIHSVLAEKDLRYEKTL
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KA2 VIILNCMRSQNPEKSARIPDSIAVIQQLSPKEQRAFELKLKEIKEQHKNFEDFYSFMIMK
:::::::::.::..::.. ::::. ::: :::::: :::::..:::: :.::::::::
CCDS34 VIILNCMRSRNPDESAKLADSIALNYQLSSKEQRAFGAKLKEIEKQHKNCENFYSFMIMK
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KA2 TNFNKEYIENVVRNILKGQNIFTKEAKLFSFLALLNSYVPDTTISLSQCEKFLGIGNKKA
.::.. :::::::::::::.. .:::.:.::::::.::: :.:::.:::: :::: ..
CCDS34 SNFDETYIENVVRNILKGQDVDSKEAQLISFLALLSSYVTDSTISVSQCEIFLGIIYTST
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KA2 FWGTEKFEDKMGTYSTILIKTEVIECGNYCGVRIIHSLIAEFSLEELKKSYHLNKSQIML
: :..:::::::::.:::::: : : : :::::: ::: . :.::..::::.: :: :
CCDS34 PWEPESLEDKMGTYSTLLIKTEVAEYGRYTGVRIIHPLIALYCLKELERSYHLDKCQIAL
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA2 DMLTENLFFDTGMGKSKFLQDMHTLLLTRHRDEHEGETGNWFSPFIEALHKDEGNEAVEA
..: ::::.:.:.:..:: .:..::::::.: . :: . :::..:::. :. .:
CCDS34 NILEENLFYDSGIGRDKFQHDVQTLLLTRQRKVYGDETDTLFSPLMEALQ----NKDIEK
1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA2 VLLESIHRFNPNAFICQALARHFYIKKKDFGNALNWAKQAKIIEPDNSYISDTLGQVYKS
:: . .:: :::::::::::::::.:::..::.::.:::. : ::::::::::::::
CCDS34 VLSAGSRRFPQNAFICQALARHFYIKEKDFNTALDWARQAKMKAPKNSYISDTLGQVYKS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA2 KIRWWIEENGGNGNISVDDLIALLDLAEHASSAFKESQQQSEDREYEVKERLYPKSKRRY
.:.::.. : . .:.:.:: ::. ::.:: ::::::.:.....::... ::.:::
CCDS34 EIKWWLDGNKNCRSITVNDLTHLLEAAEKASRAFKESQRQTDSKNYETENWSPQKSQRRY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA2 DTYNIAGYQGEIEVGLYTIQILQLIPFFDNKNELSKRYMVNFVSGSSDIPGDPNNEYKLA
: :: : . ::::::::::::::: ::: ..:::::..::.:.::. :: :: :: ::
CCDS34 DMYNTACFLGEIEVGLYTIQILQLTPFFHKENELSKKHMVQFLSGKWTIPPDPRNECYLA
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA2 LKNYIPYLTKLKFSLKKSFDFFDEYFVLLKPRNNIKQNEEAKTRRKVAGYFKKYVDIFCL
:... .: .:. .::. :::: .:.:::: : . :. : .::. :.::...::
CCDS34 LSKFTSHLKNLQSDLKRCFDFFIDYMVLLKMRYTQKEIAEIMLSKKVSRCFRKYTELFCH
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA2 LEESQNNTGLGSKFSEPLQVERCRRNLVALKADKFSGLLEYLIKSQEDAISTMKCIVNEY
:. : :: :. :: : ::..: ::.::.:.:::::: . .:: .::. :::::
CCDS34 LDPCL----LQSKESQLLQEENCRKKLEALRADRFAGLLEYLNPNYKDA-TTMESIVNEY
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA2 TFLLEQCTVKIQSKEKLNFILANIILSCIQPTSRLVKPVEKLKDQLREVLQPIGLTYQFS
.:::.: . : ...:: : :::::::::..:.:.:..:. :: ::::::: .::..:.
CCDS34 AFLLQQNSKKPMTNEKQNSILANIILSCLKPNSKLIQPLTTLKKQLREVLQFVGLSHQYP
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KA2 EPYFLASLLFWPENQQLDQHSEQMKEYAQALKNSFKGQYKHMHRTKQPIAYFFLGKGKRL
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