Result of FASTA (ccds) for
pF1KA2010
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA2010, 820 aa
1>>>pF1KA2010 820 - 820 aa - 820 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6550+/-0.00104; mu= 11.7788+/- 0.064
mean_var=155.1406+/-30.887, 0's: 0 Z-trim(108.9): 12 B-trim: 112 in 1/52
Lambda= 0.102970
statistics sampled from 10511 (10517) to 10511 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 4.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9895.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 ( 820) 5359 808.5 0
CCDS62913.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 ( 817) 2935 448.4 2.2e-125
CCDS46289.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 ( 849) 2806 429.3 1.3e-119
CCDS1855.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 ( 764) 2805 429.1 1.4e-119
CCDS61532.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 ( 594) 2690 412.0 1.5e-114
>>CCDS9895.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 (820 aa)
initn: 5359 init1: 5359 opt: 5359 Z-score: 4310.6 bits: 808.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5359; 100.0% identity (100.0% similar) in 820 aa overlap (1-820:1-820)
10 20 30 40 50 60
pF1KA2 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA2 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA2 RFDDMSSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 RFDDMSSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFHVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA2 EDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHREFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 EDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHREFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA2 TKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKVEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA2 VGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 VGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA2 GILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLIIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 GILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLIIEH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA2 MICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA2 TEDKPSKDDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TEDKPSKDDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA2 CALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 CALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA2 KSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 KSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA2 TLEDEEEMWFNTDEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TLEDEEEMWFNTDEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA2 TNLSGRQSPSFKLSLSSGTKTNLTSQSSTTNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TNLSGRQSPSFKLSLSSGTKTNLTSQSSTTNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KA2 ITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFDS
790 800 810 820
>>CCDS62913.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 (817 aa)
initn: 3085 init1: 2025 opt: 2935 Z-score: 2364.5 bits: 448.4 E(32554): 2.2e-125
Smith-Waterman score: 4016; 74.5% identity (90.5% similar) in 830 aa overlap (1-811:1-813)
10 20 30 40 50 60
pF1KA2 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
:.::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA2 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::
CCDS62 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA2 RFDDM--SSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFH
::..: .: ..::.:::..:::::.::.: : ::.:::::::::::::::::::.::.
CCDS62 RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 VCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHRE
.::.::: ::::::::::.::..::...:::::::.::::::.:::::::::.::..:::
CCDS62 ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA2 FLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKV
::::::::::::::.: ::.::::::::::::::..::::::::::.:::: ::::::::
CCDS62 FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 EIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLS
:::.:::::::::...::::::::::..::.:::::.::::::::::::::::::::::.
CCDS62 EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 NMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLII
..:::::::...:::: :::::::::::::::..::::::::::::::.::::::::..:
CCDS62 KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA2 EHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLA
:.::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.:::.:::.:::::::::::.
CCDS62 EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KA2 NTTEDKPSKDD--------------FQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDIL
::.::: ::. .::::::::.:::::::::::::::::::.:::.:
CCDS62 NTSEDKCEKDNIVGSNKNNTICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA2 RRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLM
::::::: :::.::::::::: :.::::::::::::: :. :::::..:.:.::.::::.
CCDS62 RRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLL
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KA2 NSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLD
:::.::.:::::::::::::::..::..::::...::::::::: ..::...:: : ::.
CCDS62 NSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQ-NQKLN
610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA2 SMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFM
:. ::::..:.::::..::..:::::: ::. :.:.:::.: .: : .::. : :::
CCDS62 SVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNEDEE--EEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFM
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA2 ERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPS-FKLSLS-SGTKTNLT-SQSSTTNLPGSPGSPGS
: :: ::::.:: :: : ::. ::...: :.. .: : :.: ....: :.. :
CCDS62 ETKKAKESEDKE-----NLPKRTSPGGFKFTFSHSASAANGTNSKSVVAQIP--PAT--S
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KA2 PGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFDS
:: .. ..: :: :: :::.::::::::::.:.:.:.:.. :
CCDS62 NGSSSKTTNLP--TSVTA---TKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESSPRKRPRLGS
770 780 790 800 810
>>CCDS46289.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 (849 aa)
initn: 3173 init1: 2023 opt: 2806 Z-score: 2260.7 bits: 429.3 E(32554): 1.3e-119
Smith-Waterman score: 3956; 71.8% identity (87.4% similar) in 862 aa overlap (1-811:1-845)
10 20 30 40 50 60
pF1KA2 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
:.::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA2 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::
CCDS46 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA2 RFDDM--SSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFH
::..: .: ..::.:::..:::::.::.: : ::.:::::::::::::::::::.::.
CCDS46 RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 VCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHRE
.::.::: ::::::::::.::..::...:::::::.::::::.:::::::::.::..:::
CCDS46 ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA2 FLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKV
::::::::::::::.: ::.::::::::::::::..::::::::::.:::: ::::::::
CCDS46 FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 EIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLS
:::.:::::::::...::::::::::..::.:::::.::::::::::::::::::::::.
CCDS46 EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 NMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLII
..:::::::...:::: :::::::::::::::..::::::::::::::.::::::::..:
CCDS46 KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA2 EHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLA
:.::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.:::.:::.:::::::::::.
CCDS46 EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KA2 NTTEDK-------------------PSK---------------------------DDFQT
::.::: ::. :..::
CCDS46 NTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFICTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQT
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KA2 AQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGL
::::::.:::::::::::::::::::.:::.:::::::: :::.::::::::: :.::::
CCDS46 AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KA2 KDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYW
::::::::: :. :::::..:.:.::.::::.:::.::.:::::::::::::::..::..
CCDS46 KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KA2 KALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNT
::::...::::::::: ..::...:: : ::.:. ::::..:.::::..::..::::::
CCDS46 KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQ-NQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNE
670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KA2 DEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPS-F
::. :.:.:::.: .: : .::. : :::: :: ::::.:: :: : ::. :
CCDS46 DEE--EEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKE-----NLPKRTSPGGF
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780
pF1KA2 KLSLS-SGTKTNLT-SQSSTTNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVG
:...: :.. .: : :.: ....: :.. : :: .. ..: :: :: :::.:::
CCDS46 KFTFSHSASAANGTNSKSVVAQIP--PAT--SNGSSSKTTNLP--TSVTA---TKGSLVG
780 790 800 810 820
790 800 810 820
pF1KA2 LVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFDS
:::::::.:.:.:.:.. :
CCDS46 LVDYPDDEEEDEEEESSPRKRPRLGS
830 840
>>CCDS1855.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 (764 aa)
initn: 3501 init1: 2025 opt: 2805 Z-score: 2260.6 bits: 429.1 E(32554): 1.4e-119
Smith-Waterman score: 3657; 70.2% identity (86.6% similar) in 816 aa overlap (1-811:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KA2 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
:.::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA2 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::
CCDS18 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA2 RFDDM--SSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFH
::..: .: ..::.:::..:::::.::.: : ::.:::::::::::::::::::.::.
CCDS18 RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA2 VCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHRE
.::.::: ::::::::::.::..::...:::::::.::::::.:::::::::.::..:::
CCDS18 ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA2 FLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKV
::::::::::::::.: ::.::::::::::::::..::::::::::.:::: ::::::::
CCDS18 FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA2 EIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLS
:::.:::::::::...::::::::::..::.:::::.::::::::::::::::::::::.
CCDS18 EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 NMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLII
..:::::::...:::: :::::::::::::::..::::::::::::::.::::::::..:
CCDS18 KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
370 380 390 400 410 420
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CCDS18 EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
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::.::: ::. .. ..:. .
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CCDS18 CPGALRFMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVE
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CCDS18 DIKSLTAHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQ-NQKLNSVPSILRSNRFRRD
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CCDS18 AKALEEDEEMWFNEDEE--EEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKE--
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:: : ::. ::...: :.. .: : :.: ....: :.. : :: .. ..: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]