Result of FASTA (ccds) for
pF1KA2011
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA2011, 1024 aa
1>>>pF1KA2011 1024 - 1024 aa - 1024 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0502+/-0.000945; mu= -1.7711+/- 0.057
mean_var=373.7653+/-75.895, 0's: 0 Z-trim(116.9): 56 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.066340
statistics sampled from 17552 (17605) to 17552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.802), E-opt: 0.2 (0.541), width: 16
Scan time: 6.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31272.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (1024) 6983 682.9 9.2e-196
CCDS73187.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 ( 645) 4292 425.2 2.2e-118
CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 ( 771) 2008 206.6 1.6e-52
CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047) 1919 198.2 7.4e-50
CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 ( 513) 1904 196.5 1.2e-49
CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs108|chr2 (1056) 1440 152.4 4.7e-36
>>CCDS31272.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (1024 aa)
initn: 6983 init1: 6983 opt: 6983 Z-score: 3628.0 bits: 682.9 E(32554): 9.2e-196
Smith-Waterman score: 6983; 100.0% identity (100.0% similar) in 1024 aa overlap (1-1024:1-1024)
10 20 30 40 50 60
pF1KA2 MAQGAMRFCSEGDCAISPPRCPRRWLPEGPVPQSPPASMYGSTGSLLRRVAGPGPRGREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAQGAMRFCSEGDCAISPPRCPRRWLPEGPVPQSPPASMYGSTGSLLRRVAGPGPRGREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA2 GRVTAPCTPLRGPPSPRVAPSPWAPSSPTGQPPPGAQSSVVIFRFVEKASVRPLNGLPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GRVTAPCTPLRGPPSPRVAPSPWAPSSPTGQPPPGAQSSVVIFRFVEKASVRPLNGLPAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA2 GGLSRSWDLGGVSPPRPTPALGPGSNRKLRLEASTSDPLPARGGSALPGSRNLVHGPPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGLSRSWDLGGVSPPRPTPALGPGSNRKLRLEASTSDPLPARGGSALPGSRNLVHGPPAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA2 PQVGADGLYSSLPNGLGGPPERLATLFGGPADTGFLNQGDTWSSPREVSSHAQRIARAKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQVGADGLYSSLPNGLGGPPERLATLFGGPADTGFLNQGDTWSSPREVSSHAQRIARAKW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA2 EFFYGSLDPPSSGAKPPEQAPPSPPGVGSRQGSGVAVGRAAKYSETDLDTVPLRCYRETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EFFYGSLDPPSSGAKPPEQAPPSPPGVGSRQGSGVAVGRAAKYSETDLDTVPLRCYRETD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA2 IDEVLAEREEADSAIESQPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHPSLGSGNEDEDDDEAGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IDEVLAEREEADSAIESQPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHPSLGSGNEDEDDDEAGGE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA2 EDVDDEVFEASEGARPGSRMPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAILESHRAKGTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EDVDDEVFEASEGARPGSRMPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAILESHRAKGTSY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA2 TSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPLEPDSGTSSAADGPWTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPLEPDSGTSSAADGPWTQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA2 RGEEEEAEARAKLAPGREPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RGEEEEAEARAKLAPGREPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA2 LGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA2 TGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA2 NTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA2 LSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA2 RGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA2 TADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA2 EEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA2 VKLKAGSEELDAVEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSSQPRAQRHSSEPRPGAGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VKLKAGSEELDAVEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSSQPRAQRHSSEPRPGAGSG
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA2 RRKP
::::
CCDS31 RRKP
>>CCDS73187.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (645 aa)
initn: 4292 init1: 4292 opt: 4292 Z-score: 2238.8 bits: 425.2 E(32554): 2.2e-118
Smith-Waterman score: 4292; 100.0% identity (100.0% similar) in 645 aa overlap (380-1024:1-645)
350 360 370 380 390 400
pF1KA2 EDEDDDEAGGEEDVDDEVFEASEGARPGSRMPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAI
10 20 30
410 420 430 440 450 460
pF1KA2 LESHRAKGTSYTSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPLEPDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LESHRAKGTSYTSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPLEPDSG
40 50 60 70 80 90
470 480 490 500 510 520
pF1KA2 TSSAADGPWTQRGEEEEAEARAKLAPGREPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TSSAADGPWTQRGEEEEAEARAKLAPGREPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDS
100 110 120 130 140 150
530 540 550 560 570 580
pF1KA2 DSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKL
160 170 180 190 200 210
590 600 610 620 630 640
pF1KA2 VAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDG
220 230 240 250 260 270
650 660 670 680 690 700
pF1KA2 AHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQ
280 290 300 310 320 330
710 720 730 740 750 760
pF1KA2 WAIDEEELRRSLSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 WAIDEEELRRSLSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHA
340 350 360 370 380 390
770 780 790 800 810 820
pF1KA2 DPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASD
400 410 420 430 440 450
830 840 850 860 870 880
pF1KA2 YSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRP
460 470 480 490 500 510
890 900 910 920 930 940
pF1KA2 LLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEK
520 530 540 550 560 570
950 960 970 980 990 1000
pF1KA2 SRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSSQPRAQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSSQPRAQRH
580 590 600 610 620 630
1010 1020
pF1KA2 SSEPRPGAGSGRRKP
:::::::::::::::
CCDS73 SSEPRPGAGSGRRKP
640
>>CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 (771 aa)
initn: 2054 init1: 1975 opt: 2008 Z-score: 1056.4 bits: 206.6 E(32554): 1.6e-52
Smith-Waterman score: 2096; 48.6% identity (68.9% similar) in 788 aa overlap (254-1013:9-769)
230 240 250 260 270 280
pF1KA2 SPREVSSHAQRIARAKWEFFYGSLDPPSSGAKPPEQAPPSPPGVGSRQGSGVAVGRAAKY
: : : :: .. :: : :..
CCDS42 MEEDKLLSAVPEEGDATRDPGPEPEEEPGVRNGMASEG
10 20 30
290 300 310 320 330 340
pF1KA2 SETDLDTVPLRCYRETDIDEVLAEREEADSAIESQPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHP
...: . : . : : : .:. : . . : : : : ::
CCDS42 LNSSLCS-PGHERRGTPAD---TEEPTKDPDVAFHGLSLGLSLTN-------GLALGPDL
40 50 60 70 80
350 360 370 380 390 400
pF1KA2 SLGSGNEDEDDDEAGGEEDVDDEVFEASEGARPGSRMPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFS
.. . . .:: . :. ::.. : .. : . : : . : :.::
CCDS42 NILEDSAESRPWRAGVLAEGDN----ASRSLYPDAEDPQLG----LDGPGEP-DVRDGFS
90 100 110 120 130
410 420 430 440 450 460
pF1KA2 CVFEAILESHRAKGTSYTSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAP
.:: ::::. .::.:.:: ::..:. ..: .:: : : . .: : :
CCDS42 ATFEKILESELLRGTQYSSLDSLDGLSLTDESDS-CVSFEAPLTPLIQQRARDSPEPGAG
140 150 160 170 180 190
470 480 490 500
pF1KA2 L-------EPDSGTSSAADG----PWTQR---GEEEEAEARAKLA--PG--RE--PPSPC
: : : : ....:: : . .. :.. .: .: :. .: : .:
CCDS42 LGIGDMAFEGDMG-AAGGDGELGSPLRRSISSSRSENVLSRLSLMAMPNGFHEDGPQGPG
200 210 220 230 240 250
510 520 530 540 550 560
pF1KA2 HSEDSLGLGAAPL---GSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQR
.::. . : .:.: :.. .:::::::.:.: : ::.: :.:: .. :::.:
CCDS42 GDEDDDEEDTDKLLNSASDPSLKDGLSDSDSELSSSEGLEPGSADPLANGCQGVSEAAHR
260 270 280 290 300 310
570 580 590 600 610 620
pF1KA2 LAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMG
::.:::.:.::.. ::::.:::::.::.:::::::.:: :.:.::: :::.::: . :::
CCDS42 LARRLYHLEGFQRCDVARQLGKNNEFSRLVAGEYLSFFDFSGLTLDGALRTFLKAFPLMG
320 330 340 350 360 370
630 640 650 660 670 680
pF1KA2 ETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIG
:::::::::.:::.:: ::::. .:::: :::::::::::::::::::::.:.: .::.
CCDS42 ETQERERVLTHFSRRYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQFIA
380 390 400 410 420 430
690 700 710 720 730
pF1KA2 NLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADPN-----PKVIKRI
::. :::: :: ..:::.::.:::::::.:::::.:::.:::::.: . :: . .
CCDS42 NLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEWAIDEDELRKSLSELVDDKFGTGTKKVTRIL
440 450 460 470 480 490
740 750 760 770 780 790
pF1KA2 SGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMIL
.::. ::::. .:..::::.:.::.::: : ..::::.::::.:...::: ::
CCDS42 DGGN-----PFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHADMDGKRTPRGRRGWKKFYAVLKGTIL
500 510 520 530 540 550
800 810 820 830 840 850
pF1KA2 YLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSLE
::::.::.: ::::: .::::: .:::::::::::::. .:. :.::::::::::::: :
CCDS42 YLQKDEYRPDKALSEGDLKNAIRVHHALATRASDYSKKSNVLKLKTADWRVFLFQAPSKE
560 570 580 590 600 610
860 870 880 890 900 910
pF1KA2 QMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAMA
.: ::: :::.:::.:::: :::::::.::: :::::: .::: ::::.:.:: ::. ..
CCDS42 EMLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQLRSHENKLRQLT
620 630 640 650 660 670
920 930 940 950 960 970
pF1KA2 SELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEA
.:: ::: . . ..::::: : :: :: :::::: :: :: .:.:.::..:. .::
CCDS42 AELAEHRCHPVERGIKSKEAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIKVGSDDLERIEA
680 690 700 710 720 730
980 990 1000 1010 1020
pF1KA2 ALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSSQPRAQRHSSEPRPGAGSGRRKP
:: . . .: .::::.:. . .. . .. :
CCDS42 RLATLEGDDPSLRKTHSSPALSQGHVTGSKTTKDATGPDT
740 750 760 770
>>CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047 aa)
initn: 1923 init1: 981 opt: 1919 Z-score: 1008.6 bits: 198.2 E(32554): 7.4e-50
Smith-Waterman score: 1970; 48.5% identity (71.2% similar) in 718 aa overlap (331-1023:368-1045)
310 320 330 340 350
pF1KA2 IDEVLAEREEADSAIESQPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHPSLGSGNEDED-DDEAGG
:. ::: : ... ::. .::.
CCDS43 SKVPRHLISSAGLCNSSSLTENVWDESWKAPSERPGTSSG---TFSPVRLDESGEDEVFL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA2 EEDVDDEVFEASEGARPGSRMP-----LKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAILESHR
.:. ... .. . : :. .:. . : . . :. : .: ::.::..
CCDS43 QEN-KQHLEKTPKPERDRERISEQEEHVKGEDEDILGPGYTEDSTDVYSSQFETILDN--
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460
pF1KA2 AKGTSYTSLASLEALASPGPTQSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPLEPDSG-----
. : : :::.: : : . .:.::.: : . . : : ::
CCDS43 --TSLYYSAESLETLYSE-P--DSYFSFEMPLTPMIQQRIKEGGQFL---ERTSGGGHQD
460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA2 -TSSAADGPWTQRGEEEEAEARAKLAPGREPPSPCHSEDSLGLGAAP----LGSEPPLSQ
: .::: .. : . .. : . : ::. ..: ::. ..
CCDS43 ILSVSADGGIVM-GYS------SGVTNGLNDAS-----DSIYTKGTPEIAFWGSNAGVKT
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KA2 LVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNN
.. ::. ::: : . ..:::: ....:::.:::::::.:: :...:::.::::::
CCDS43 TRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEAAKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNN
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630 640
pF1KA2 DFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEAL
.:::::: :::::: ::::::::.:: :.: ..:.:::::::::: :::.::: :::...
CCDS43 EFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTI
620 630 640 650 660 670
650 660 670 680 690 700
pF1KA2 SSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIK
.:.::.: ::::.::::::::::::::.::: .::.::.:.:.: :: ..::::::.:::
CCDS43 ASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIK
680 690 700 710 720 730
710 720 730 740 750
pF1KA2 NEKLQWAIDEEELRRSLSELADP-----NPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYK
::::.::.:.:: ..: :: .. .::.:.:: :: ..::::. .:.:::::
CCDS43 NEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRI----GSTTNPFLDIPHDPNAAVYK
740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA2 HGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISI
: :.::.::: : .::::::::::.:...::: .:::::.:::: ::::: .::::.:.
CCDS43 SGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSV
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA2 HHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAA
:::::..:.:: :.:.:: :.::::::.:::. : :.::.::..:: :::.:::::::::
CCDS43 HHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAA
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KA2 VSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQR
..:::::::::::...:.::::::...::.::: ...:: :::. :: ..:...: .
CCDS43 IGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYK
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KA2 QKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPK
:. ::::::.:: :... :: :..:: :.. : :: :::::::.:
CCDS43 LKDHYLEFEKTRYEMYVSI----LKEGGKEL------LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPD
970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020
pF1KA2 PSS-QPRAQRHSSE---PRPGAGSGRRKP
: ...:. :: :: . : ..:
CCDS43 TSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
1020 1030 1040
>>CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (513 aa)
initn: 1920 init1: 981 opt: 1904 Z-score: 1004.9 bits: 196.5 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 1938; 59.0% identity (82.0% similar) in 505 aa overlap (528-1023:21-511)
500 510 520 530 540 550
pF1KA2 EPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEA
.. ::. ::: : . ..:::: ....::
CCDS34 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEA
10 20 30 40 50
560 570 580 590 600 610
pF1KA2 AQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELA
:.:::::::.:: :...:::.::::::.:::::: :::::: ::::::::.:: :.: ..
CCDS34 AKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFS
60 70 80 90 100 110
620 630 640 650 660 670
pF1KA2 LMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGD
:.:::::::::: :::.::: :::....:.::.: ::::.::::::::::::::.::: .
CCDS34 LVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQE
120 130 140 150 160 170
680 690 700 710 720 730
pF1KA2 FIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADP-----NPKVI
::.::.:.:.: :: ..::::::.:::::::.::.:.:: ..: :: .. .::.:
CCDS34 FIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTI
180 190 200 210 220 230
740 750 760 770 780 790
pF1KA2 KRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKG
.:: :: ..::::. .:.::::: : :.::.::: : .::::::::::.:...:::
CCDS34 SRI----GSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKG
240 250 260 270 280
800 810 820 830 840 850
pF1KA2 MILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAP
.:::::.:::: ::::: .::::.:.:::::..:.:: :.:.:: :.::::::.:::.
CCDS34 TVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQ
290 300 310 320 330 340
860 870 880 890 900 910
pF1KA2 SLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLK
: :.::.::..:: :::.:::::::::..:::::::::::...:.::::::...::.:::
CCDS34 SPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLK
350 360 370 380 390 400
920 930 940 950 960 970
pF1KA2 AMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDA
...:: :::. :: ..:...: . :. ::::::.:: :...: : :..::
CCDS34 QITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSIL----KEGGKEL--
410 420 430 440 450 460
980 990 1000 1010 1020
pF1KA2 VEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSS-QPRAQRHSSE---PRPGAGSGRRKP
:.. : :: :::::::.: : ...:. :: :: . : ..:
CCDS34 ----LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
470 480 490 500 510
>>CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs108|chr2 (1056 aa)
initn: 1582 init1: 716 opt: 1440 Z-score: 760.8 bits: 152.4 E(32554): 4.7e-36
Smith-Waterman score: 1692; 36.3% identity (57.4% similar) in 1074 aa overlap (9-1014:32-1042)
10 20 30
pF1KA2 MAQGAMRFCSEGDCAISPPRCP---RRWLPEGPVPQSP
: . :. : : . : . : :
CCDS33 MGDYRLPDHPQPMEILNLYLGDSLEPHPGECPRETCSHEDPPEPFEEQTWATDPPEPTRQ
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA2 PASMYGSTGSLLRRVAGPGPRGRELGRVTAPC---TPLRGPP-SPRVAPSPWAPSSP-TG
. .:: : : .. : .. : :: : :: : : ::. . :
CCDS33 NVPPWGS-GVELTHL---GSWVHQDG--LEPCQEQTRATDPPESTRQDAPPWGSGVELTH
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KA2 QPPPGAQSSVVIFRFVEKASVRPLNG-LPAPGGLSRS-------WDLGGVSPPRPTPALG
:.:: : . :.:. ::. .:: : : .. . :
CCDS33 LGSPSAQRE---HRQNTASPGSPVNSHLPGSPKQNRSTSTQVVFWA-GILQAQMCVLDLE
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KA2 PGSNRKLRLEASTSDPLPARGGSALPGSRNLVHGPPAPPQVGADGLYSSLPNGLGGPPER
.. :.:. . ::. :::. .: .:: . : : :: :.: : :
CCDS33 EELEKTEGLKAGLKCCLPT-PPVDLPGDTGLHSSPPENEDSGED---SSEPEGEGQAWLR
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KA2 LATLFGGPADTGFLNQGDTWSSPREVSSHAQRIARAKWEFFYGSLDPPSSGAKPPEQA--
.: ..: . : ... .:.: ..: .. . . : .:. : .. ::.
CCDS33 EGTPDSSP-QWGAEEESMFFSNPLFLASPCSENSASGECFSWGASDSHAGVRTGPESPAT
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310
pF1KA2 --PPSPPG-VGSRQGSGVAVGRAAKYSETDLDTVPLRCYRETDIDEVLAEREEADSAIES
:: : : . : .: .: : :. :. .: . . .: :.
CCDS33 LEPPLPEDTVLWELESEPDLGDGAAISGHCTPPFPVPIYKPHSICWASV------AAAEG
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KA2 QPSSEGPPGTAYPPAPRPGPLPGPHPSLGSGNEDEDDDEAGGEED--VDDEVFEASEGAR
:.. ::: . . : :: :. : . ::: :. : ... :.. ..
CCDS33 APAA--PPGHGESEGDRLGPAPSAAPCV---------DEALTWESGCVGSDLGPAAHPVQ
350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KA2 PGSRMPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAILESHRAKGTSYTSLASLEALASPGPT
: . . :: . : :: . .... ...: : :: : : :
CCDS33 PWASL---SPEGWQRG------GPFWPQVTLNSQDRDEREGGHPQESLPCTLA---PCPW
390 400 410 420 430
440 450 460 470
pF1KA2 QSPFFTFELPPQP------PAPRPDPPAPAPLAP--------LEP----DSGTSSAADGP
.:: . : : .: :.:::.: . .: . : :.. :: .
CCDS33 RSPASSPE-PSSPESESRGPGPRPSPASSQEGSPQLQHHSSGILPKWTLDASQSSLLETD
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520
pF1KA2 WTQRGEEEEAEARAKLAPGREPPS-----PCHSED---SLGLGAA-------PLGSE--P
: . .. :: ::.: : : .. : .. : .: :..: :
CCDS33 GEQPSSLKKKEAGEAPKPGEEVKSEGTARPAETGDVQPDIHLTSAEHENLRTPMNSSWLP
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570
pF1KA2 --PLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVAR
:. : : ... : : : :.:: . . ..: ::.:::::.::::..::
CCDS33 GSPMPQAQSPEEGQ-----RPPAG--DKLANGVRNN-KVAWNLASRLYRLEGFRKSEVAA
560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA2 HLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQ
.: ::::::. :: :::.:: : :..::.::: ::. :.: ::::::::.: .::.:. .
CCDS33 YLQKNNDFSRAVAEEYLSFFQFGGQSLDRALRSFLQALVLSGETQERERILYQFSRRFHH
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA2 CNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKA
::: . : :..::::::.:::::::::.:::: :.: .:: ::.:: :::.::.:::::
CCDS33 CNPGIFPSVDSVHTLTCAIMLLNTDLHGQNIGKSMSCQEFITNLNGLRDGGNFPKELLKA
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA2 LYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVY
:: ::..:::.::.:::. : : :.: : .:. :.:::.:. .: . .:
CCDS33 LYWSIRSEKLEWAVDEEDTAR--PEKAQP--------SLPAGKMSKPFLQLAQDPTVPTY
730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA2 KHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKGMILYL--QKEEYK-PGKALSETELKN
:.: :.::.: : : .::: :::::: :: .:.::.::. : :.. :..: . .
CCDS33 KQGILARKMHQDADGKKTPWGKRGWKMFHTLLRGMVLYFLKQGEDHCLEGESLVGQMVDE
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA2 AISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAPSLEQMQSWITRINVVAAMFSAPP
...::.::: :. :.:.:::: :::::::..:::::. ..:.:::.:::..:: ::::
CCDS33 PVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIARINLAAATHSAPP
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA2 FPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLKAMASELREHRAAQLGKKGRGKEA
:::::.::..: ::.:: . .. : ::: :.:: : : :..: . . ..:::.:
CCDS33 FPAAVGSQRRFVRPILPVGPAQSSLEEQHRSHENCLDAAADDLLDLQRNLPERRGRGREL
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA2 EEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDAVEAALA-QAGSTED---GLPPSH
::.: .. :::.::.:: ::. :: ..:. :. :: : :. .::.:.. .: ::
CCDS33 EEHRLRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPSDALDLWEEQLGREAGGTREPKLSLKKSH
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020
pF1KA2 SSPSL-QPKPSSQPRAQRHSSEPRPGAGSGRRKP
::::: : . . ...:. :: :
CCDS33 SSPSLHQDEAPTTAKVKRNISERRTYRKIIPKRNRNQL
1020 1030 1040 1050
1024 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:57:51 2016 done: Fri Nov 4 01:57:52 2016
Total Scan time: 6.380 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]