FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA2022, 1516 aa 1>>>pF1KA2022 1516 - 1516 aa - 1516 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4124+/-0.00104; mu= 13.8694+/- 0.063 mean_var=110.7356+/-21.894, 0's: 0 Z-trim(106.7): 22 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.121879 statistics sampled from 9141 (9148) to 9141 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16 Scan time: 5.160 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS35337.1 KIAA2022 gene_id:340533|Hs108|chrX (1516) 10085 1785.1 0 CCDS69177.1 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3052) 381 78.9 2.7e-13 CCDS5091.2 REV3L gene_id:5980|Hs108|chr6 (3130) 381 78.9 2.7e-13 >>CCDS35337.1 KIAA2022 gene_id:340533|Hs108|chrX (1516 aa) initn: 10085 init1: 10085 opt: 10085 Z-score: 9578.8 bits: 1785.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 10085; 100.0% identity (100.0% similar) in 1516 aa 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CCDS69 KDMPLMGSAVDHPLSASLPTGINAQQKLSGCFSSFLESKKSVDLQTFPSSRDDLHPSVVC 1190 1200 1210 1220 1230 1240 900 910 920 930 940 pF1KA2 SGTQEFMAEVSREIAPTQSSEFGASQ-------VVSMENNLTPTTYNPICLNSGGSNCNK .. ..... . .::. : .. . .. :.:. .. : ..:: :. . CCDS69 NSIGPGVSKINVQRPHNQSAMFTLKESTLIQKNIFDLSNHLSQVAQNTQ-ISSGMSSKIE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 950 960 970 980 990 1000 pF1KA2 VLYDSMQDTQLPSDDSYQLCHFNNGEICFPFQQGPVNMDDGRLFSFDSMAPLSVSSSNYC ...: . : : .: .. :. . ..:. . . : ::. . : .. CCDS69 DNANNIQRNYLSSIG--KLSEYRNS-LESKLDQA---YTPNFLHCKDSQQQI-VCIAEQS 1310 1320 1330 1340 1350 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA2 SLSLKSCEKDGDDDITDDFLAHCSPKLVIQQSIDEIA-PLKESTDLLDISNFTPDKFRHS . : ..: . :. .. . . ... : .:: :. .::.::: :.. . CCDS69 KHS-ETC-SPGNTASEESQMPNNCFVTSLRSPIKQIAWEQKQRGFILDMSNFKPERVKPR 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA2 SLSEMSPPDTPSLSPQITRCESMKTLGTLKGFQEGVPGPLDSVEKIKWDCSTLSRQVQME :::: . : . ...:.. ....: ..: :: : : .... .:: . . 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CCDS50 QETSTKSSETGSTKDNFIQNNPCNS-------NPEKDNALASDLTKTTRGAFENKTP--- 850 860 870 880 890 450 460 470 480 490 500 pF1KA2 ISYDAMGEIKDCSRYMARDTNSGSSSSQQNYGL-------RAKRKVRYSEDYLYDVDSLE . : : :: ..:. ..:..:: :::::: : . :: CCDS50 ----TDGFI-DCH------FGDGTLETEQSFGLYGNKYTLRAKRKVNYETE-----DSES 900 910 920 930 510 520 530 540 550 pF1KA2 GEKVNERKEWLP----VGSKEEDDDEWCPKKRRKVTRKEPPVIIKYIIINRFKGEKNMLV . ... : :: .: : : .::::...: :::::::::::::.:.::::: CCDS50 SFVTHNSKISLPHPMEIG--ESLDGTLKSRKRRKMSKKLPPVIIKYIIINRFRGRKNMLV 940 950 960 970 980 990 560 570 580 590 600 610 pF1KA2 KLGKVDASETTVNLSENQLNKYAKLAPLKGFWQKKKKQRNTNTDSIKTPFSQKQSFEPGS ::::.:..: : :.:.... : :::::: :: : . :. :.. :.: . : CCDS50 KLGKIDSKEKQVILTEEKMELYKKLAPLKDFWPKVPDSPATKYPIY--PLTPKKSHRRKS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 620 630 640 650 660 670 pF1KA2 FEVSFLPPARKR--KSKLGNRHRIQRIPSIEISASSKQISLCNDQRHASNHKEDGGLKGT . : :.:. :.. : . :.: :.. . : .: . . .: . :: :. . 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CCDS50 KDMPLMGSAVDHPLSASLPTGINAQQKLSGCFSSFLESKKSVDLQTFPSSRDDLHPSVVC 1270 1280 1290 1300 1310 1320 900 910 920 930 940 pF1KA2 SGTQEFMAEVSREIAPTQSSEFGASQ-------VVSMENNLTPTTYNPICLNSGGSNCNK .. ..... . .::. : .. . .. :.:. .. : ..:: :. . CCDS50 NSIGPGVSKINVQRPHNQSAMFTLKESTLIQKNIFDLSNHLSQVAQNTQ-ISSGMSSKIE 1330 1340 1350 1360 1370 1380 950 960 970 980 990 1000 pF1KA2 VLYDSMQDTQLPSDDSYQLCHFNNGEICFPFQQGPVNMDDGRLFSFDSMAPLSVSSSNYC ...: . : : .: .. :. . ..:. . . : ::. . : .. CCDS50 DNANNIQRNYLSSIG--KLSEYRNS-LESKLDQA---YTPNFLHCKDSQQQI-VCIAEQS 1390 1400 1410 1420 1430 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA2 SLSLKSCEKDGDDDITDDFLAHCSPKLVIQQSIDEIA-PLKESTDLLDISNFTPDKFRHS . : ..: . :. .. . . ... : .:: :. .::.::: :.. . CCDS50 KHS-ETC-SPGNTASEESQMPNNCFVTSLRSPIKQIAWEQKQRGFILDMSNFKPERVKPR 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA2 SLSEMSPPDTPSLSPQITRCESMKTLGTLKGFQEGVPGPLDSVEKIKWDCSTLSRQVQME :::: . : . ...:.. ....: ..: :: : : .... .:: . . 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