Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0013
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0013, 2157 aa
1>>>pF1KB0013 2157 - 2157 aa - 2157 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2063+/-0.00132; mu= -0.0607+/- 0.080
mean_var=322.8540+/-65.033, 0's: 0 Z-trim(111.2): 183 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.071379
statistics sampled from 12039 (12220) to 12039 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 8.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 13175 1372.3 0
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 1632 183.7 9.3e-45
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1495 169.6 2.1e-40
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1464 166.3 1.3e-39
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1450 164.7 2.2e-39
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1450 164.9 3.6e-39
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1450 164.9 3.6e-39
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1368 156.3 8.3e-37
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1368 156.3 8.5e-37
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1335 153.0 1.2e-35
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 1327 152.1 1.8e-35
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1294 148.7 2.1e-34
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1294 148.8 2.2e-34
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1273 146.6 9.2e-34
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 1239 142.9 7.2e-33
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 1235 142.7 1.5e-32
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 1209 140.0 9.7e-32
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 1209 140.0 9.8e-32
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 1207 139.8 1.1e-31
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 1182 137.1 4.2e-31
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 1158 134.8 3.7e-30
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1147 133.5 5.1e-30
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1147 133.5 5.2e-30
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1147 133.5 5.3e-30
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1144 133.1 6.1e-30
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 1146 133.5 8.7e-30
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 1139 132.8 1.4e-29
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 1135 132.4 1.9e-29
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 1128 131.7 3.1e-29
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 1126 131.5 3.6e-29
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 1124 131.3 4.3e-29
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 1119 130.7 6e-29
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1115 130.3 7.9e-29
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 1114 130.2 8.7e-29
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1106 129.2 9.3e-29
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1101 128.7 1.3e-28
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 1106 129.4 1.5e-28
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1098 128.4 1.6e-28
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 1047 123.1 5.8e-27
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 1047 123.1 6e-27
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1006 118.7 5.8e-26
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 938 112.1 2.6e-23
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 932 111.5 3.8e-23
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 917 109.7 6.3e-23
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 923 110.6 7.3e-23
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 900 108.2 3.5e-22
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 900 108.2 3.6e-22
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 829 100.9 6.1e-20
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 827 100.7 6.9e-20
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 770) 676 84.9 1.5e-15
>>CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022 aa)
initn: 13175 init1: 13175 opt: 13175 Z-score: 7342.6 bits: 1372.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13175; 100.0% identity (100.0% similar) in 2020 aa overlap (1-2020:1-2020)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MSVKEAGSSGRREQAAYHLHIYPQLSTTESQASCRVTATKDSTTSDVIKDAIASLRLDGT
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CCDS46 MSVKEAGSSGRREQAAYHLHIYPQLSTTESQASCRVTATKDSTTSDVIKDAIASLRLDGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 KCYVLVEVKESGGEEWVLDANDSPVHRVLLWPRRAQDEHPQEDGYYFLLQERNADGTIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KCYVLVEVKESGGEEWVLDANDSPVHRVLLWPRRAQDEHPQEDGYYFLLQERNADGTIKY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 VHMQLVAQATATRRLVERGLLPRQQADFDDLCNLPELTEGNLLKNLKHRFLQQKIYTYAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VHMQLVAQATATRRLVERGLLPRQQADFDDLCNLPELTEGNLLKNLKHRFLQQKIYTYAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 SILVAINPFKFLPIYNPKYVKMYENQQLGKLEPHVFALADVAYYTMLRKRVNQCIVISGE
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CCDS46 SILVAINPFKFLPIYNPKYVKMYENQQLGKLEPHVFALADVAYYTMLRKRVNQCIVISGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 SGSGKTQSTNFLIHCLTALSQKGYASGVERTILGAGPVLEAFGNAKTAHNNNSSRFGKFI
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CCDS46 SGSGKTQSTNFLIHCLTALSQKGYASGVERTILGAGPVLEAFGNAKTAHNNNSSRFGKFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 QVSYLESGIVRGAVVEKYLLEKSRLVSQEKDERNYHVFYYLLLGVSEEERQEFQLKQPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QVSYLESGIVRGAVVEKYLLEKSRLVSQEKDERNYHVFYYLLLGVSEEERQEFQLKQPED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 YFYLNQHNLKIEDGEDLKHDFERLKQAMEMVGFLPATKKQIFAVLSAILYLGNVTYKKRA
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CCDS46 YFYLNQHNLKIEDGEDLKHDFERLKQAMEMVGFLPATKKQIFAVLSAILYLGNVTYKKRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 TGREEGLEVGPPEVLDTLSQLLKVKREILVEVLTKRKTVTVNDKLILPYSLSEAITARDS
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CCDS46 TGREEGLEVGPPEVLDTLSQLLKVKREILVEVLTKRKTVTVNDKLILPYSLSEAITARDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 MAKSLYSALFDWIVLRINHALLNKKDVEEAVSCLSIGVLDIFGFEDFERNSFEQFCINYA
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CCDS46 MAKSLYSALFDWIVLRINHALLNKKDVEEAVSCLSIGVLDIFGFEDFERNSFEQFCINYA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 NEQLQYYFNQHIFKLEQEEYQGEGITWHNIGYTDNVGCIHLISKKPTGLFYLLDEESNFP
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CCDS46 NEQLQYYFNQHIFKLEQEEYQGEGITWHNIGYTDNVGCIHLISKKPTGLFYLLDEESNFP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 HATSQTLLAKFKQQHEDNKYFLGTPVMEPAFIIQHFAGKVKYQIKDFREKNMDYMRPDIV
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CCDS46 HATSQTLLAKFKQQHEDNKYFLGTPVMEPAFIIQHFAGKVKYQIKDFREKNMDYMRPDIV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 ALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFRWAVLRAAIRAMAVLREAGRLRAERAEKAAGMSSPGA
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CCDS46 ALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFRWAVLRAAIRAMAVLREAGRLRAERAEKAAGMSSPGA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
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CCDS46 QSHPEELPRGASTPSEKLYRDLHNQMIKSIKGLPWQGEDPRSLLQSLSRLQKPRAFILKS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 KGIKQKQIIPKNLLDSKSLKLIISMTLHDRTTKSLLHLHKKKKPPSISAQFQTSLNKLLE
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CCDS46 KGIKQKQIIPKNLLDSKSLKLIISMTLHDRTTKSLLHLHKKKKPPSISAQFQTSLNKLLE
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850 860 870 880 890 900
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CCDS46 ALGKAEPFFIRCIRSNAEKKELCFDDELVLQQLRYTGMLETVRIRRSGYSAKYTFQDFTE
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910 920 930 940 950 960
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CCDS46 QFQVLLPKDAQPCREVISTLLEKMKIDKRNYQIGKTKVFLKETERQALQETLHREVVRKI
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CCDS46 LLLQSWFRMVLERRHFLQMKRAAVTIQACWRSYRVRRALERTQAAVYLQASWRGYWQRKL
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CCDS46 QQVAEQGPEPAEDGGHLASEPEVQPSDRSPLEHSSPEKEAPSPEKTLPPQKTVAAESHEK
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CCDS46 VPSSREKRESRRQRGLEHVKFQNKHIQSCKEESALREPSRRVTQEQGVSLLEDKKESRED
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CCDS46 ETLLVVETEAENTSQKQPTEQPQAMAVGKVSEETEKTLPSGSPRPGQLERPTSLALDSRV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KB0 SPPAPGSAPETPEDKSKPCGSPRVQEKPDSPGGSTQIQRYLDAERLASAVELWRGKKLVA
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CCDS46 SPPAPGSAPETPEDKSKPCGSPRVQEKPDSPGGSTQIQRYLDAERLASAVELWRGKKLVA
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CCDS46 AASPSAMLSQSLDLSDRHRATGAALTPTEERRTSFSTSDVSKLLPSLAKAQPAAETTDGE
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CCDS46 RSAKKPAVQKKKPGDASSLPDAGLSPGSQVDSKSTFKRLFLHKTKDKKYSLEGAEELENA
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CCDS46 VSGHVVLEATTMKKGLEAPSGQQHRHAAGEKRTKEPGGKGKKNRNVKIGKITVSEKWRES
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pF1KB0 VFRQITNANELKYLDEFLLNKINDLRSQKTPIESLFIEATEKFRSNIKTMYSVPNGKIHV
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CCDS46 VFRQITNANELKYLDEFLLNKINDLRSQKTPIESLFIEATEKFRSNIKTMYSVPNGKIHV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 GYKDLMENYQIVVSNLATERGQKDTNLVLNLFQSLLDEFTRGYTKNDFEPVKQSKAQKKK
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CCDS46 GYKDLMENYQIVVSNLATERGQKDTNLVLNLFQSLLDEFTRGYTKNDFEPVKQSKAQKKK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 RKQERAVQEHNGHVFASYQVSIPQSCEQCLSYIWLMDKALLCSVCKMTCHKKCVHKIQSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RKQERAVQEHNGHVFASYQVSIPQSCEQCLSYIWLMDKALLCSVCKMTCHKKCVHKIQSH
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KB0 CSYTYGRKGEPGVEPGHFGVCVDSLTSDKASVPIVLEKLLEHVEMHGLYTEGLYRKSGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CSYTYGRKGEPGVEPGHFGVCVDSLTSDKASVPIVLEKLLEHVEMHGLYTEGLYRKSGAA
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pF1KB0 NRTRELRQALQTDPAAVKLENFPIHAITGVLKQWLRELPEPLMTFAQYGDFLRAVELPEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NRTRELRQALQTDPAAVKLENFPIHAITGVLKQWLRELPEPLMTFAQYGDFLRAVELPEK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB0 QEQLAAIYAVLEHLPEANHNSLERLIFHLVKVALLEDVNRMSPGALAIIFAPCLLRCPDN
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CCDS46 QEQLAAIYAVLEHLPEANHNSLERLIFHLVKVALLEDVNRMSPGALAIIFAPCLLRCPDN
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB0 SDPLTSMKDVLKITTCVEMLIKEQMRKYKVKMEEISQLEAAESIAFRRLSLLRQNAPWPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SDPLTSMKDVLKITTCVEMLIKEQMRKYKVKMEEISQLEAAESIAFRRLSLLRQNAPWPL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB0 KLGFSSPYEGVLNKSPKTRDIQEEELEVLLEEEAAGGDEDREKEILIERIQSIKEEKEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLGFSSPYEGVLNKSPKTRDIQEEELEVLLEEEAAGGDEDREKEILIERIQSIKEEKEDI
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB0 TYRLPELDPRGSDEENLDSETSASTESLLEERAGRGASEGPPAPALPCPGAPTPSPLPTV
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CCDS46 TYRLPELDPRGSDEENLDSETSASTESLLEERAGRGASEGQY
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2050 2060 2070 2080 2090 2100
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CCDS10 NPLMTFELYEEFLRAMGLQERKETIRGVYSVIDQLSRTHLNTLERLIFHLVRIALQEDTN
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CCDS10 RMSANALAIVFAPCILRCPDTTDPLQSVQDISKTTTCVELIVVEQMNKYKARLKDISSLE
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CCDS42 VGPPSWRNKMHSIRNLPSMRFREQHGEDGVEDMTQLEDLQETTVLSNLKIRFERNLIYTY
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CCDS42 IGSILVSVNPYQMFGIYGPEQVQQYNGRALGENPPHLFAVANLAFAKMLDAKQNQCIIIS
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CCDS42 FVEI-FLEGGVISGAITSQYLLEKSRIVFQAKNERNYHIFYELLAGLPAQLRQAFSLQEA
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CCDS42 ETYYYLNQGGNCEIA-GKSDADDFRRLLAAMEVLGFSSEDQDSIFRILASILHLGNVYFE
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CCDS42 RDAIAKVLYALLFSWLITRVNALVSPRQDT------LSIAILDIYGFEDLSFNSFEQLCI
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CCDS42 NYANENLQYLFNKIVFQEEQEEYIREQIDWQEITFADNQPCINLISLKPYGILRILDDQC
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CCDS42 CFPQATDHTFLQKCHYHHGANPLY-SKPKMPLPEFTIKHYAGKVTYQVHKFLDKNHDQVR
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pF1KB0 PDIVALLRGSDSSYVRELIGMDPVAVFRWAVLRAAIRAMAVLREAGRLRAERAEKAAGMS
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CCDS42 QDVLDLF------------------------VRSRTRVVAHL----------------FS
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pF1KB0 SPGAQSHPEELPRGASTPSEKLYRDLHNQMIKSIKGLPWQGEDPRSLLQSLSRLQKPRAF
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CCDS42 SHAPQAAPQRL--GKSSSVTRLY-------------------------------------
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CCDS42 ----------------------------------------------KAHTVAAKFQQSLL
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CCDS42 DLVEKMERCNPLFMRCLKPNHKKEPGLFEPDVVMAQLRYSGVLETVRIRKEGFPVRLPFQ
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CCDS42 -----------LLESM------REHVLNL--AALTLQRCLRGFFIKRRFRSLRHKIILLQ
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CCDS42 SRARGYLARQRYQQMRRSLVKFRSLVHAYVSRRRYLKL-----RAE--WRCQVEGALLWE
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