Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0039
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0039, 512 aa
1>>>pF1KB0039 512 - 512 aa - 512 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5362+/-0.00114; mu= 3.5898+/- 0.069
mean_var=199.7731+/-41.134, 0's: 0 Z-trim(109.3): 118 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.090741
statistics sampled from 10684 (10802) to 10684 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 512) 3340 450.2 2.5e-126
CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 514) 3316 447.1 2.2e-125
CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 485) 3158 426.4 3.6e-119
CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 486) 3146 424.8 1.1e-118
CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 482) 3103 419.2 5.2e-117
CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 ( 483) 3091 417.6 1.6e-116
CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 521) 2606 354.1 2.1e-97
CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 508) 2577 350.3 2.9e-96
CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 488) 2547 346.4 4.3e-95
CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 ( 490) 2543 345.9 6.2e-95
CCDS1002.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 465) 961 138.8 1.3e-32
CCDS45858.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 448) 860 125.5 1.2e-28
CCDS45857.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 805 118.3 1.9e-26
CCDS82250.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 484) 803 118.1 2.3e-26
CCDS12106.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 485) 754 111.7 2e-24
CCDS54197.1 CELF5 gene_id:60680|Hs108|chr19 ( 409) 751 111.2 2.2e-24
CCDS45856.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 485) 641 96.9 5.5e-20
CCDS32818.1 CELF4 gene_id:56853|Hs108|chr18 ( 486) 639 96.6 6.7e-20
CCDS10242.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 481) 609 92.7 1e-18
CCDS53955.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 344) 575 88.1 1.7e-17
CCDS53956.1 CELF6 gene_id:60677|Hs108|chr15 ( 454) 541 83.8 4.6e-16
CCDS53367.1 CELF3 gene_id:11189|Hs108|chr1 ( 415) 527 81.9 1.5e-15
>>CCDS53623.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (512 aa)
initn: 3340 init1: 3340 opt: 3340 Z-score: 2381.5 bits: 450.2 E(32554): 2.5e-126
Smith-Waterman score: 3340; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 MKPADSEKNNVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKPADSEKNNVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 FTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 GNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 QNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 KEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB0 AQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
490 500 510
>>CCDS81565.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (514 aa)
initn: 2235 init1: 1263 opt: 3316 Z-score: 2364.5 bits: 447.1 E(32554): 2.2e-125
Smith-Waterman score: 3316; 99.6% identity (99.6% similar) in 514 aa overlap (1-512:1-514)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSS-GSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGS
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSAGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 LAGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LAGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 SQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB0 VSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
490 500 510
>>CCDS53622.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (485 aa)
initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158 Z-score: 2253.0 bits: 426.4 E(32554): 3.6e-119
Smith-Waterman score: 3158; 100.0% identity (100.0% similar) in 485 aa overlap (28-512:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 MKPADSEKNNVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKPADSEKNNVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFVT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 FTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASVW
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 GNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASAA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 QNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSLA
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGSQ
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 KEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPVS
400 410 420 430 440 450
490 500 510
pF1KB0 AQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
460 470 480
>>CCDS31482.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (486 aa)
initn: 2446 init1: 2446 opt: 3146 Z-score: 2244.5 bits: 424.8 E(32554): 1.1e-118
Smith-Waterman score: 3146; 99.8% identity (99.8% similar) in 486 aa overlap (28-512:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 AGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 QKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KB0 SAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
460 470 480
>>CCDS7938.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (482 aa)
initn: 1598 init1: 1598 opt: 3103 Z-score: 2214.1 bits: 419.2 E(32554): 5.2e-117
Smith-Waterman score: 3103; 99.0% identity (99.0% similar) in 486 aa overlap (28-512:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 WGNLAGLNTLGPQYLAL----LQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGSL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 AGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAGS
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 QKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 QKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNPV
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KB0 SAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
450 460 470 480
>>CCDS7939.1 CELF1 gene_id:10658|Hs108|chr11 (483 aa)
initn: 2053 init1: 1237 opt: 3091 Z-score: 2205.6 bits: 417.6 E(32554): 1.6e-116
Smith-Waterman score: 3091; 98.8% identity (98.8% similar) in 487 aa overlap (28-512:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MKPADSEKNNAVEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 WGNLAGLNTLGPQYLAL----LQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSS-GSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGS
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AQNTPSGTNALTTSSSPLSVLTSSAGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLNVGS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 LAGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LAGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSIGAAG
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 SQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNP
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KB0 VSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 VSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
450 460 470 480
>>CCDS44355.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (521 aa)
initn: 1537 init1: 771 opt: 2606 Z-score: 1862.0 bits: 354.1 E(32554): 2.1e-97
Smith-Waterman score: 2606; 76.8% identity (91.8% similar) in 526 aa overlap (2-512:3-521)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVS---KKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSE
.::::::::.:::. : . .. .::::.::: :::: :::::::::.::.:::
CCDS44 MTSAFKLDFLPDMMVEGRLLVPDRINGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 KDLRELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMH
:.:.:::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::
CCDS44 KELKELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 HPIQMKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRG
::::::::::::.: ::::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS44 HPIQMKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 CAFVTFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQIS
::::::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::.:. ::: :::::..
CCDS44 CAFVTFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 AASVWGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAA
.:. ::::.::. : :::::: :::..::.::...:... :.:.::.::::::.:::
CCDS44 TAT-WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAA
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AASAAQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGAT
::.:::.. ..::: :.:.:: :..::: ..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::
CCDS44 AAAAAQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGAT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB0 AGLN-VGSLA------GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLY
.::: ...:: ::::::::::..::.:::..::.:::::::::::::::::::::
CCDS44 VGLNNINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB0 NQNLLTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQT
.:.:: ::: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::
CCDS44 SQSLLQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KB0 NLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLSKCFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
480 490 500 510 520
>>CCDS44354.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (508 aa)
initn: 1407 init1: 896 opt: 2577 Z-score: 1841.7 bits: 350.3 E(32554): 2.9e-96
Smith-Waterman score: 2577; 78.8% identity (94.0% similar) in 500 aa overlap (19-512:16-508)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
: :. ...::::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.
CCDS44 MRCPKSAVTMRNEELLLSNGTANKMNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
:::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS44 ELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
::::::::.: ::::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS44 MKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::.:. ::: :::::...:.
CCDS44 TFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::.::. : :::::: :::..::.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:
CCDS44 WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN
::.. ..::: :.:.:: :..::: ..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.:::
CCDS44 AQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 -VGSLAGMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLTQQSI
...::::::::::::..::.:::..::.:::::::::::::::::::::.:.:: :::
CCDS44 NINALAGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQQQS-
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 GAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCFGFVS
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS44 -AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCFGFVS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KB0 YDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
480 490 500
>>CCDS44356.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (488 aa)
initn: 1395 init1: 764 opt: 2547 Z-score: 1820.7 bits: 346.4 E(32554): 4.3e-95
Smith-Waterman score: 2547; 79.0% identity (93.5% similar) in 495 aa overlap (28-512:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.
CCDS44 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
:::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS44 ELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
::::::::.: ::::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS44 MKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::.:. ::: :::::...:.
CCDS44 TFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::.::. : :::::: :::..::.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:
CCDS44 WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAA
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN
::.. ..::: :.:.:: :..::: ..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.:::
CCDS44 AQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 -VGSLAG----MAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNLLT
...::: :::::::::..::.:::..::.:::::::::::::::::::::.:.::
CCDS44 NINALAGTINSMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSLLQ
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 QQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSKCF
::: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::
CCDS44 QQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSKCF
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KB0 GFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
450 460 470 480
>>CCDS41488.1 CELF2 gene_id:10659|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 1395 init1: 764 opt: 2543 Z-score: 1817.8 bits: 345.9 E(32554): 6.2e-95
Smith-Waterman score: 2543; 78.7% identity (93.2% similar) in 497 aa overlap (28-512:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAFKLDFLPEMMVDHCSLNSSPVSKKMNGTLDHPDQPDLDAIKMFVGQVPRTWSEKDLR
:::.::: :::: :::::::::.::.::::.:.
CCDS41 MNGALDHSDQPDPDAIKMFVGQIPRSWSEKELK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELFEQYGAVYEINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNMKVLPGMHHPIQ
:::: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::
CCDS41 ELFEPYGAVYQINVLRDRSQNPPQSKGCCFVTFYTRKAALEAQNALHNIKTLPGMHHPIQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB0 MKPADSEKNN-VEDRKLFIGMISKKCTENDIRVMFSSFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
::::::::.: ::::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKPADSEKSNAVEDRKLFIGMVSKKCNENDIRVMFSPFGQIEECRILRGPDGLSRGCAFV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 TFTTRAMAQTAIKAMHQAQTMEGCSSPMVVKFADTQKDKEQKRMAQQLQQQMQQISAASV
::.::::::.:::::::.:::::::::.:::::::::::::.:. ::: :::::...:.
CCDS41 TFSTRAMAQNAIKAMHQSQTMEGCSSPIVVKFADTQKDKEQRRLQQQLAQQMQQLNTAT-
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 WGNLAGLNTLGPQYLALYLQLLQQTASSGNLNTLSSLHPMGGLNAMQLQNLAALAAAASA
::::.::. : :::::: :::..::.::...:... :.:.::.::::::.:::::.:
CCDS41 WGNLTGLGGLTPQYLAL----LQQATSSSNLGAFSGIQQMAGMNALQLQNLATLAAAAAA
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 AQNTPSGTNA--LTTSSSPLSVLTS--SGSSPSSSSSNSVNPIASLGALQTLAGATAGLN
::.. ..::: :.:.:: :..::: ..:.:.:... ..: ..:::.:: :::::.:::
CCDS41 AQTSATSTNANPLSTTSSALGALTSPVAASTPNSTAGAAMNSLTSLGTLQGLAGATVGLN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KB0 -VGSLA------GMAALNGGLGSSGLSNGTGSTMEALTQAYSGIQQYAAAALPTLYNQNL
...:: ::::::::::..::.:::..::.:::::::::::::::::::::.:.:
CCDS41 NINALAVAQMLSGMAALNGGLGATGLTNGTAGTMDALTQAYSGIQQYAAAALPTLYSQSL
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB0 LTQQSIGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDLLQMFMPFGNVVSAKVFIDKQTNLSK
: ::: :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::
CCDS41 LQQQS--AAGSQKEGPEGANLFIYHLPQEFGDQDILQMFMPFGNVISAKVFIDKQTNLSK
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KB0 CFGFVSYDNPVSAQAAIQSMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CFGFVSYDNPVSAQAAIQAMNGFQIGMKRLKVQLKRSKNDSKPY
450 460 470 480 490
512 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 20:21:52 2016 done: Thu Nov 3 20:21:53 2016
Total Scan time: 3.140 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]