Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0044
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0044, 1258 aa
1>>>pF1KB0044 1258 - 1258 aa - 1258 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7520+/-0.00108; mu= 22.1054+/- 0.066
mean_var=95.8050+/-18.750, 0's: 0 Z-trim(105.7): 18 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.131033
statistics sampled from 8581 (8594) to 8581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 4.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3090.1 STAG1 gene_id:10274|Hs108|chr3 (1258) 8287 1578.0 0
CCDS14607.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX (1231) 5509 1052.8 0
CCDS43990.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX (1268) 5506 1052.3 0
CCDS34703.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7 (1225) 3660 703.3 9.8e-202
CCDS75642.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7 (1226) 3660 703.3 9.8e-202
CCDS64730.1 STAG3 gene_id:10734|Hs108|chr7 (1167) 3331 641.1 5e-183
>>CCDS3090.1 STAG1 gene_id:10274|Hs108|chr3 (1258 aa)
initn: 8287 init1: 8287 opt: 8287 Z-score: 8462.3 bits: 1578.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8287; 100.0% identity (100.0% similar) in 1258 aa overlap (1-1258:1-1258)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRI
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CCDS30 MITSELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 EAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EAGIRGAGRGRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 INFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 INFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 FIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALVNVALNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 SIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKGIFVHRY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKALQSLYTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 RELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCENVYHLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 YSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLESELHEH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 AAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAH
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CCDS30 AAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIRQAAEAH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 PPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQIPQYFD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRVDIARSQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 LIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFGNCYRLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 KTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLAVCQQCL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 SNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVMDHVFID
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 QDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYMKYYNDY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKELARRFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 LTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKLLRQDKK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 TVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSSVRNKKG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 RPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RPPLHKKRVEDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRENSRPMGDQIQEPESEH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 GSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRHAVRGLMEEDAEPIFED
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB0 VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VMMSSRSQLEDMNEEFEDTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDSAAIIEDDSGFGMPMF
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS14607.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX (1231 aa)
initn: 5622 init1: 3147 opt: 5509 Z-score: 5624.3 bits: 1052.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5782; 70.0% identity (86.7% similar) in 1275 aa overlap (1-1258:1-1231)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MITS-ELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSR
::.. :.:. . .:. .: .. ...:. : :.. :.:. :. : :: .:.:.::..
CCDS14 MIAAPEIPTDFNLLQESETHFSSDTDFEDIEGKNQ-KQGK-GK---TCKKGKKGPAEKGK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 IEAGIRGAGR-----GRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRD
: :.:. .: ::: :::: : . ::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS14 ---GGNGGGKPPSGPNRMNGHHQQNGV-ENMMLFEVVKMGKSAMQSVVDDWIESYKHDRD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 IALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKF
::::::::::::::::.:.: ::::.:::.::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS14 IALLDLINFFIQCSGCKGVVTAEMFRHMQNSEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMAGPQWKKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 RSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALV
.:.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSSFCEFIGVLVRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 NVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKG
::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS14 NVALNLSINMDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNAIFKG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 IFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKAL
.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::::: ::
CCDS14 VFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGIWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTMHDKQGEVRLKCLTAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 QSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCE
:.:: :.:: ::::::.:::::::::::::::::::.::.:.::.:..:::.:. ::::
CCDS14 QGLYYNKELNSKLELFTSRFKDRIVSMTLDKEYDVAVQAIKLLTLVLQSSEEVLTAEDCE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 NVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLHKKLFSRHDPQAEEALAKRRGRNSPNGNLIRMLVLFFLE
:::::::::::::::::::::.::::::.::. :... :::::..::.::.. ::.::::
CCDS14 NVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLYKKLFSRRDPE-EDGMMKRRGRQGPNANLVKTLVFFFLE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB0 SELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIR
:::::::::::::.:. . :::::::::. ::::::..::::..:::::::::.:.::::
CCDS14 SELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTIR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB0 QAAEAHPPVGRGTGKRVLTAKERKTQIDDRNKLTEHFIITLPMLLSKYSADAEKVANLLQ
:::: :::::::::::::::::.:::.:::.:.:: : ..::.::.:::.:::::.::::
CCDS14 QAAECHPPVGRGTGKRVLTAKEKKTQLDDRTKITELFAVALPQLLAKYSVDAEKVTNLLQ
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB0 IPQYFDLEIYSTGRMEKHLDALLKQIKFVVEKHVESDVLEACSKTYSILCSEEYTIQNRV
.:::::::::.:::.::::::::.::. .::::...:::::::::: ::.::.:: :::
CCDS14 LPQYFDLEIYTTGRLEKHLDALLRQIRNIVEKHTDTDVLEACSKTYHALCNEEFTIFNRV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB0 DIARSQLIDEFVDRFNHSVEDLLQEGEEADDDDIYNVLSTLKRLTSFHNAHDLTKWDLFG
::.:::::::..:.::. .::.:::::: :.:: :.:::::::.:.:::::::.:::::.
CCDS14 DISRSQLIDELADKFNRLLEDFLQEGEEPDEDDAYQVLSTLKRITAFHNAHDLSKWDLFA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB0 NCYRLLKTGIEHGAMPEQIVVQALQCSHYSILWQLVKITDGSPSKEDLLVLRKTVKSFLA
:.:::::::.: ::::::..::::.:: :::::.:::..: .::::: :.: .. :
CCDS14 CNYKLLKTGIENGDMPEQIVIHALQCTHYVILWQLAKITESSSTKEDLLRLKKQMRVFCQ
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB0 VCQQCLSNVNTPVKEQAFMLLCDLLMIFSHQLMTGGREGLQPLVFNPDTGLQSELLSFVM
.::. :.:::: :::::: .:::.:::::::.:.:::. :.:::..::..::::::::..
CCDS14 ICQHYLTNVNTTVKEQAFTILCDILMIFSHQIMSGGRDMLEPLVYTPDSSLQSELLSFIL
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB0 DHVFIDQDEENQSMEGDEEDEANKIEALHKRRNLLAAFSKLIIYDIVDMHAAADIFKHYM
:::::.::..:.: .:..::::.::::::::::::::: :::.: .:.:..::::::.::
CCDS14 DHVFIEQDDDNNSADGQQEDEASKIEALHKRRNLLAAFCKLIVYTVVEMNTAADIFKQYM
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB0 KYYNDYGDIIKETLSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNELVQEQGPNLDRTSAHVSGIKE
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::.: :.::.:. :::::
CCDS14 KYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIKE
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB0 LARRFALTFGLDQIKTREAVATLHKDGIEFAFKYQNQKGQEYPPPNLAFLEVLSEFSSKL
:::::::::::::.:::::.: ::::::::::: : .:. .:: :::::..::::::::
CCDS14 LARRFALTFGLDQLKTREAIAMLHKDGIEFAFKEPNPQGESHPPLNLAFLDILSEFSSKL
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB0 LRQDKKTVHSYLEKFLTEQMMERREDVWLPLISYRNSLVTGGEDDRMSVNSGSSSSKTSS
:::::.::. :::::.: :: :::::::::.::::::..::.:: ::: :: :: . :.
CCDS14 LRQDKRTVYVYLEKFMTFQMSLRREDVWLPLMSYRNSLLAGGDDDTMSVISGISS-RGST
1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB0 VRNKKGRPPLHKKRV----------EDESLDNTWLNRTDTMIQTPGPLPAPQLTSTVLRE
::.::..: :..: :. : :. ::.: .:. .:: . .::::::..::
CCDS14 VRSKKSKPSTGKRKVVEGMQLSLTEESSSSDSMWLSREQTL-HTPVMMQTPQLTSTIMRE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB0 NSRPMGDQIQEPESEHGSEPDFLHNPQMQISWLGQPKLEDLNRKDRTGMNYMKVRTGVRH
.: .::. .:. :: : : ::. .
CCDS14 PKR------LRPED------SFMSVYPMQTEHHQTPL--DYNRRGTS-------------
1130 1140 1150 1160
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB0 AVRGLMEEDAEPIFEDVMMSSRSQLEDMNEEFE-DTMVIDLPPSRNRRERAELRPDFFDS
:::.: ::: :::::::....::.:: .. ::: ::::::.:::::.::.:::::
CCDS14 ----LMEDDEEPIVEDVMMSSEGRIEDLNEGMDFDTMDIDLPPSKNRRERTELKPDFFDP
1170 1180 1190 1200 1210
1250
pF1KB0 AAIIEDDSGFGMPMF
:.:. :.: .:. ::
CCDS14 ASIM-DESVLGVSMF
1220 1230
>>CCDS43990.1 STAG2 gene_id:10735|Hs108|chrX (1268 aa)
initn: 5622 init1: 3147 opt: 5506 Z-score: 5621.1 bits: 1052.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5898; 70.3% identity (88.5% similar) in 1285 aa overlap (1-1258:1-1268)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MITS-ELPVLQDSTNETTAHSDAGSELEETEVKGKRKRGRPGRPPSTNKKPRKSPGEKSR
::.. :.:. . .:. .: .. ...:. : :.. :.:. :. : :: .:.:.::..
CCDS43 MIAAPEIPTDFNLLQESETHFSSDTDFEDIEGKNQ-KQGK-GK---TCKKGKKGPAEKGK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 IEAGIRGAGR-----GRANGHPQQNGEGEPVTLFEVVKLGKSAMQSVVDDWIESYKQDRD
: :.:. .: ::: :::: : . ::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS43 ---GGNGGGKPPSGPNRMNGHHQQNGV-ENMMLFEVVKMGKSAMQSVVDDWIESYKHDRD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 IALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMPGPQWKKF
::::::::::::::::.:.: ::::.:::.::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS43 IALLDLINFFIQCSGCKGVVTAEMFRHMQNSEIIRKMTEEFDEDSGDYPLTMAGPQWKKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 RSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALV
.:.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSSFCEFIGVLVRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQVRAFRHTSTLAAMKLMTALV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 NVALNLSIHQDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNSIFKG
::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS43 NVALNLSINMDNTQRQYEAERNKMIGKRANERLELLLQKRKELQENQDEIENMMNAIFKG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 IFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGVWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTLHDRQGEVRLKCLKAL
.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::::: ::
CCDS43 VFVHRYRDAIAEIRAICIEEIGIWMKMYSDAFLNDSYLKYVGWTMHDKQGEVRLKCLTAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 QSLYTNRELFPKLELFTNRFKDRIVSMTLDKEYDVAVEAIRLVTLILHGSEEALSNEDCE
:.:: :.:: ::::::.:::::::::::::::::::.::.:.::.:..:::.:. ::::
CCDS43 QGLYYNKELNSKLELFTSRFKDRIVSMTLDKEYDVAVQAIKLLTLVLQSSEEVLTAEDCE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
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:::::::::::::::::::::.::::::.::. :... :::::..::.::.. ::.::::
CCDS43 NVYHLVYSAHRPVAVAAGEFLYKKLFSRRDPE-EDGMMKRRGRQGPNANLVKTLVFFFLE
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pF1KB0 SELHEHAAYLVDSLWESSQELLKDWECMTELLLEEPVQGEEAMSDRQESALIELMVCTIR
:::::::::::::.:. . :::::::::. ::::::..::::..:::::::::.:.::::
CCDS43 SELHEHAAYLVDSMWDCATELLKDWECMNSLLLEEPLSGEEALTDRQESALIEIMLCTIR
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:::: :::::::::::::::::.:::.:::.:.:: : ..::.::.:::.:::::.::::
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::.:::::::..:.::. .::.:::::: :.:: :.:::::::.:.:::::::.:::::.
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:.:::::::.: ::::::..::::.:: :::::.:::..: .::::: :.: .. :
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:::::.::..:.: .:..::::.::::::::::::::: :::.: .:.:..::::::.::
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:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..::.: :.::.:. :::::
CCDS43 KYYNDYGDIIKETMSKTRQIDKIQCAKTLILSLQQLFNEMIQENGYNFDRSSSTFSGIKE
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::.::..: :..: :. : :. ::.: .:. .:: . .::::::..::
CCDS43 VRSKKSKPSTGKRKVVEGMQLSLTEESSSSDSMWLSREQTL-HTPVMMQTPQLTSTIMRE
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CCDS43 PKRLRPEDSFMSVYPMQTEHHQTPLDY----NTQVTWMLAQRQQEEARQQQERAAMSYVK
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CCDS34 SIPPTPTLTSTAVK-SRQPLWG-LKEMEEEDGSELDFAQGQPVAGTERSRFLGPQYFQTP
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CCDS34 HNPSGPGLGNQLMRLS-------LMEEDEE---EELEIQDES-----NEERQDT---DMQ
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CCDS34 AS-SYSSTSERGLDLLDSTELDIEDF
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10 20 30
pF1KB0 MITSELPVLQDSTNETTAHS------DAGSELEETEVKGK
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pF1KB0 KSAMQSVVDDWIESYKQDRDIALLDLINFFIQCSGCRGTVRIEMFRNMQNAEIIRKMTEE
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CCDS75 KSDMQSLVDEWLDSYKQDQDAGFLELVNFFIQSCGCKGIVTPEMFKKMSNSEIIQHLTEQ
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pF1KB0 FDEDSGDYPLTMPGPQWKKFRSNFCEFIGVLIRQCQYSIIYDEYMMDTVISLLTGLSDSQ
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CCDS75 FNEDSGDYPLIAPGPSWKKFQGSFCEFVRTLVCQCQYSLLYDGFPMDDLISLLTGLSDSQ
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CCDS75 REQRQSPGAQRTFFQLLLSFFVESELHDHAAYLVDSLWDCAGARLKDWEGLTSLLLEK--
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CCDS75 --DQNLGDVQESTLIEILVSSARQASEGHPPVGRVTGRKGLTSKERKTQADDRVKLTEHL
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CCDS75 IPLLPQLLAKFSADAEKVTPLLQLLSCFDLHIYCTGRLEKHLELFLQQLQEVVVKHAEPA
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CCDS75 AATLKRLSAFYNTHDLTRWELYEPCCQLLQKAVDTGEVPHQVILPALTLVYFSILWTLTH
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CCDS75 ISKSDASQKQLSSLRDRMVAFCELCQSCLSDVDTEIQEQAFVLLSDLLLIFSPQMIVGGR
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CCDS75 DFLRPLVFFPEATLQSELASFLMDHVFIQPGDLGS---GDSQEDHLQIERLHQRRRLLAG
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CCDS75 FCKLLLYGVLEMDAASDVFKHYNKFYNDYGDIIKETLTRARQIDRSHCSRILLLSLKQLY
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