Result of FASTA (ccds) for pF1KB0045
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0045, 1433 aa
  1>>>pF1KB0045 1433 - 1433 aa - 1433 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3624+/-0.00124; mu= 0.2707+/- 0.074
 mean_var=274.1061+/-55.506, 0's: 0 Z-trim(110.3): 72  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.077467
 statistics sampled from 11473 (11529) to 11473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.354), width:  16
 Scan time:  4.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS75407.1 NUP153 gene_id:9972|Hs108|chr6         (1433) 9365 1061.5       0
CCDS4541.1 NUP153 gene_id:9972|Hs108|chr6          (1475) 5698 651.7 4.6e-186
CCDS64359.1 NUP153 gene_id:9972|Hs108|chr6         (1506) 5698 651.7 4.7e-186
CCDS2079.1 RANBP2 gene_id:5903|Hs108|chr2          (3224)  538 75.2 3.4e-12


>>CCDS75407.1 NUP153 gene_id:9972|Hs108|chr6              (1433 aa)
 initn: 9365 init1: 9365 opt: 9365  Z-score: 5669.0  bits: 1061.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9365; 100.0% identity (100.0% similar) in 1433 aa overlap (1-1433:1-1433)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 KNEDVCSCSTDTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KNEDVCSCSTDTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 NYPDVLTRPSLHRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NYPDVLTRPSLHRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 ISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 PSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 YGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 YPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPIT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 SSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 PPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 SSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 SGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 VSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 SSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 SGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 INPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 INPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 SNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB0 FTCKTSEAKKEEMPATKGGFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FTCKTSEAKKEEMPATKGGFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB0 DNEEPKCQPVFSFGNSEQTKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DNEEPKCQPVFSFGNSEQTKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTAD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB0 QGAAKPVFSFLNNSSSSSSTPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QGAAKPVFSFLNNSSSSSSTPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB0 TAESSTSQSLLFSQDSKLATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TAESSTSQSLLFSQDSKLATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB0 SFVFGTGPSAPSASPAFGANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SFVFGTGPSAPSASPAFGANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTF
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB0 GTVSSSSQPPVFGQQPSQSAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GTVSSSSQPPVFGQQPSQSAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430   
pF1KB0 TPAASAQPSGSGGFPFNQSPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TPAASAQPSGSGGFPFNQSPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK
             1390      1400      1410      1420      1430   

>>CCDS4541.1 NUP153 gene_id:9972|Hs108|chr6               (1475 aa)
 initn: 5632 init1: 5632 opt: 5698  Z-score: 3453.9  bits: 651.7 E(32554): 4.6e-186
Smith-Waterman score: 9204; 97.1% identity (97.1% similar) in 1465 aa overlap (11-1433:11-1475)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFN
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MASGAGGVGGGGGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 KNEDVCSCSTDTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KNEDVCSCSTDTSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 NYPDVLTRPSLHRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NYPDVLTRPSLHRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 ISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ISTTSGFSSRASDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 PSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSLGNSSILKTSQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 YGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YGVTSSTARRILQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 YPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPPVQRLMTPKPVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RESGFSYPNFSLPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEEEMEVPVLPKISLPIT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 SSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSSTGSPMFKFSSPIVKSTEANVL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570                              
pF1KB0 PPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSS---------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS45 PPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTVNSTNCKKTPPEDCEGPFRPA
              550       560       570       580       590       600

                          580       590       600       610        
pF1KB0 ---------------GFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGS
                      :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRPAISSFSSSGIGFGESLKAGS
              610       620       630       640       650       660

      620       630       640       650       660       670        
pF1KB0 SWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNKSGKTTLSASGTGFGDKFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETPNKSGKTTLSASGTGFGDKFK
              670       680       690       700       710       720

      680       690       700       710       720       730        
pF1KB0 PVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETMTASSSSCTVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTLTVVSESAETMTASSSSCTVT
              730       740       750       760       770       780

      740       750       760       770       780       790        
pF1KB0 TGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEKPGSSVPASSSSTVPVSLPSG
              790       800       810       820       830       840

      800       810       820       830       840       850        
pF1KB0 GSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTKSGFKGFDTSSSSSNSAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPGTKSGFKGFDTSSSSSNSAAS
              850       860       870       880       890       900

      860       870       880       890       900       910        
pF1KB0 SSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEGFKFSKPIGDFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDSGSINPMSEGFKFSKPIGDFK
              910       920       930       940       950       960

      920       930       940       950       960       970        
pF1KB0 FGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQFGVSNLGQEEKKEELPKSSSA
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KB0 GFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAPFTCKTSEAKKEEMPATKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASVAPFTCKTSEAKKEEMPATKG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

     1040      1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KB0 GFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKADNEEPKCQPVFSFGNSEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFSFGNVEPASLPSASVFVLGRTEEKQQEPVTSTSLVFGKKADNEEPKCQPVFSFGNSEQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

     1100      1110      1120      1130      1140      1150        
pF1KB0 TKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTADQGAAKPVFSFLNNSSSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TKDENSSKSTFSFSMTKPSEKESEQPAKATFAFGAQTSTTADQGAAKPVFSFLNNSSSSS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

     1160      1170      1180      1190      1200      1210        
pF1KB0 STPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGNTAESSTSQSLLFSQDSKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STPATSAGGGIFGSSTSSSNPPVATFVFGQSSNPVSSSAFGNTAESSTSQSLLFSQDSKL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

     1220      1230      1240      1250      1260      1270        
pF1KB0 ATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGSSFVFGTGPSAPSASPAFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATTSSTGTAVTPFVFGPGASSNNTTTSGFGFGATTTSSSAGSSFVFGTGPSAPSASPAFG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

     1280      1290      1300      1310      1320      1330        
pF1KB0 ANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTFGTVSSSSQPPVFGQQPSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ANQTPTFGQSQGASQPNPPGFGSISSSTALFPTGSQPAPPTFGTVSSSSQPPVFGQQPSQ
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

     1340      1350      1360      1370      1380      1390        
pF1KB0 SAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSSTPAASAQPSGSGGFPFNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SAFGSGTTPNSSSAFQFGSSTTNFNFTNNSPSGVFTFGANSSTPAASAQPSGSGGFPFNQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

     1400      1410      1420      1430   
pF1KB0 SPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPAAFTVGSNGKNVFSSSGTSFSGRKIKTAVRRRK
             1450      1460      1470     

>>CCDS64359.1 NUP153 gene_id:9972|Hs108|chr6              (1506 aa)
 initn: 8721 init1: 5632 opt: 5698  Z-score: 3453.8  bits: 651.7 E(32554): 4.7e-186
Smith-Waterman score: 8903; 95.0% identity (95.0% similar) in 1465 aa overlap (42-1433:42-1506)

              20        30        40        50        60        70 
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                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GGGKIRTRRCHQGPIKPYQQGRQQHQGILSRVTESVKNIVPGWLQRYFNKNEDVCSCSTD
              20        30        40        50        60        70 

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TSEVPRWPENKEDHLVYADEESSNITDGRITPEPAVSNTEEPSTTSTASNYPDVLTRPSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HRSHLNFSMLESPALHCQPSTSSAFPIGSSGFSLVKEIKDSTSQHDDDNISTTSGFSSRA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SDKDITVSKNTSLPPLWSPEAERSHSLSQHTATSSKKPAFNLSAFGTLSPSLGNSSILKT
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pF1KB0 SQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SQLGDSPFYPGKTTYGGAAAAVRQSKLRNTPYQAPVRRQMKAKQLSAQSYGVTSSTARRI
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pF1KB0 LQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQYPPVQRLMTPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQSLEKMSSPLADAKRIPSIVSSPLNSPLDRSGIDITDFQAKREKVDSQYPPVQRLMTPK
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pF1KB0 PVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQRESGFSYPNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PVSIATNRSVYFKPSLTPSGEFRKTNQRIDNKCSTGYEKNMTPGQNREQRESGFSYPNFS
             380       390       400       410       420       430 

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pF1KB0 LPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEE--------------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::                          
CCDS64 LPAANGLSSGVGGGGGKMRRERTRFVASKPLEEERQGLTVLPKLISSSCAQAIIPSWPLK
             440       450       460       470       480       490 

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pF1KB0 -----EMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSST
            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VLRLQEMEVPVLPKISLPITSSSLPTFNFSSPEITTSSPSPINSSQALTNKVQMTSPSST
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pF1KB0 GSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSS-------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       
CCDS64 GSPMFKFSSPIVKSTEANVLPPSSIGFTFSVPVAKTAELSGSSSTLEPIISSSAHHVTTV
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                                              580       590        
pF1KB0 -----------------------------------GFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRP
                                          :::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NSTNCKKTPPEDCEGPFRPAEILKEGSVLDILKSPGFASPKIDSVAAQPTATSPVVYTRP
             620       630       640       650       660       670 

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB0 AISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AISSFSSSGIGFGESLKAGSSWQCDTCLLQNKVTDNKCIACQAAKLSPRDTAKQTGIETP
             680       690       700       710       720       730 

      660       670       680       690       700       710        
pF1KB0 NKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NKSGKTTLSASGTGFGDKFKPVIGTWDCDTCLVQNKPEAIKCVACETPKPGTCVKRALTL
             740       750       760       770       780       790 

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pF1KB0 TVVSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TVVSESAETMTASSSSCTVTTGTLGFGDKFKRPIGSWECSVCCVSNNAEDNKCVSCMSEK
             800       810       820       830       840       850 

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pF1KB0 PGSSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PGSSVPASSSSTVPVSLPSGGSLGLEKFKKPEGSWDCELCLVQNKADSTKCLACESAKPG
             860       870       880       890       900       910 

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pF1KB0 TKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TKSGFKGFDTSSSSSNSAASSSFKFGVSSSSSGPSQTLTSTGNFKFGDQGGFKIGVSSDS
             920       930       940       950       960       970 

      900       910       920       930       940       950        
pF1KB0 GSINPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSINPMSEGFKFSKPIGDFKFGVSSESKPEEVKKDSKNDNFKFGLSSGLSNPVSLTPFQF
             980       990      1000      1010      1020      1030 

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KB0 GVSNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GVSNLGQEEKKEELPKSSSAGFSFGTGVINSTPAPANTIVTSENKSSFNLGTIETKSASV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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