Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0047
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0047, 2007 aa
1>>>pF1KB0047 2007 - 2007 aa - 2007 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1244+/-0.00186; mu= -19.0358+/- 0.109
mean_var=682.7503+/-148.688, 0's: 0 Z-trim(107.3): 339 B-trim: 490 in 1/52
Lambda= 0.049084
statistics sampled from 9229 (9499) to 9229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 7.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 12740 919.9 0
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 8385 611.5 1.1e-173
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 8385 611.5 1.1e-173
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 6426 472.8 6.1e-132
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 6329 465.9 7.1e-130
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1979) 6329 465.9 7.1e-130
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 6265 461.4 1.6e-128
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 6265 461.4 1.6e-128
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 6225 458.6 1.2e-127
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 5391 399.5 7.1e-110
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 5391 399.5 7.1e-110
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 2735 211.4 2.9e-53
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 2730 211.1 3.7e-53
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 2729 211.0 3.9e-53
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 2729 211.0 3.9e-53
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 2724 210.6 4.9e-53
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 2702 209.1 1.5e-52
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 2685 207.9 3.4e-52
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 2651 205.5 1.8e-51
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 2646 205.1 2.3e-51
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 2333 183.0 1.1e-44
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1281 108.4 2.7e-22
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1244 105.8 1.7e-21
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1198 102.6 1.6e-20
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1136 98.1 3.2e-19
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 1134 98.0 3.4e-19
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1027 90.7 1.2e-16
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1001 88.4 1.7e-16
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 999 88.2 1.7e-16
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1001 88.4 1.7e-16
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1001 88.4 1.8e-16
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 999 88.2 1.8e-16
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 963 85.7 1e-15
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 955 85.1 1.6e-15
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 933 83.6 4.6e-15
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 921 82.7 8.4e-15
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 923 83.1 1.3e-14
CCDS45641.1 MYO18A gene_id:399687|Hs108|chr17 (2039) 907 82.0 2.8e-14
CCDS45642.1 MYO18A gene_id:399687|Hs108|chr17 (2054) 905 81.9 3.1e-14
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 871 79.2 9.8e-14
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 871 79.2 9.9e-14
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 871 79.2 1e-13
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 864 78.9 2.3e-13
CCDS999.1 CGN gene_id:57530|Hs108|chr1 (1203) 851 77.8 2.9e-13
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 813 74.8 8.9e-13
CCDS10161.1 CGNL1 gene_id:84952|Hs108|chr15 (1302) 815 75.3 1.8e-12
CCDS54507.1 MYO18B gene_id:84700|Hs108|chr22 (2567) 788 73.6 1.1e-11
CCDS82703.1 MYO18B gene_id:84700|Hs108|chr22 (2568) 788 73.6 1.1e-11
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 741 70.2 9e-11
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 741 70.2 9e-11
>>CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007 aa)
initn: 12740 init1: 12740 opt: 12740 Z-score: 4898.6 bits: 919.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12740; 100.0% identity (100.0% similar) in 2007 aa overlap (1-2007:1-2007)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQRTGLEDPERYLFVDRAVIYNPATQADWTAKKLVWIPSERHGFEAASIKEERGDEVMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAQRTGLEDPERYLFVDRAVIYNPATQADWTAKKLVWIPSERHGFEAASIKEERGDEVMV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ELAENGKKAMVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKDRYYSGLIYTYSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELAENGKKAMVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKDRYYSGLIYTYSGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 FCVVINPYKNLPIYSENIIEMYRGKKRHEMPPHIYAISESAYRCMLQDREDQSILCTGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FCVVINPYKNLPIYSENIIEMYRGKKRHEMPPHIYAISESAYRCMLQDREDQSILCTGES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKGRKDHNIPQESPKPVKHQGELERQLLQANPILESFGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAVRQAKDERTFHIFYQLLSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGEHLKSDLLLEGFNNYRFLSNGYIPIPGQQDKDNFQETMEAMHIMGFSHEEILSMLKVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 SSVLQFGNISFKKERNTDQASMPENTVAQKLCHLLGMNVMEFTRAILTPRIKVGRDYVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSVLQFGNISFKKERNTDQASMPENTVAQKLCHLLGMNVMEFTRAILTPRIKVGRDYVQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AQTKEQADFAVEALAKATYERLFRWLVHRINKALDRTKRQGASFIGILDIAGFEIFELNS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIERPANPPG
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLALLDEECWFPKATDKTFVEKLVQEQGSHSKFQKPRQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WLMKNMDPLNDNVATLLHQSSDRFVAELWKDEIQNIQRASFYDSVSGLHEPPVDRIVGLD
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QVTGMTETAFGSAYKTKKGMFRTVGQLYKESLTKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MIRALELDPNLYRIGQSKIFFRAGVLAHLEEERDLKITDIIIFFQAVCRGYLARKAFAKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QQQLSALKVLQRNCAAYLKLRHWQWWRVFTKVKPLLQVTRQEEELQAKDEELLKVKEKQT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KVEGELEEMERKHQQLLEEKNILAEQLQAETELFAEAEEMRARLAAKKQELEEILHDLES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RVEEEEERNQILQNEKKKMQAHIQDLEEQLDEEEGARQKLQLEKVTAEAKIKKMEEEILL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEDQNSKFIKEKKLMEDRIAECSSQLAEEEEKAKNLAKIRNKQEVMISDLEERLKKEEKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQELEKAKRKLDGETTDLQDQIAELQAQIDELKLQLAKKEEELQGALARGDDETLHKNNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKVVRELQAQIAELQEDFESEKASRNKAEKQKRDLSEELEALKTELEDTLDTTAAQQELR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKREQEVAELKKALEEETKNHEAQIQDMRQRHATALEELSEQLEQAKRFKANLEKNKQGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ETDNKELACEVKVLQQVKAESEHKRKKLDAQVQELHAKVSEGDRLRVELAEKASKLQNEL
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CCDS58 DNVSTLLEEAEKKGIKFAKDAASLESQLQDTQELLQEETRQKLNLSSRIRQLEEEKNSLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQQEEEEEARKNLEKQVLALQSQLADTKKKVDDDLGTIESLEEAKKKLLKDAEALSQRLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKALAYDKLEKTKNRLQQELDDLTVDLDHQRQVASNLEKKQKKFDQLLAEEKSISARYAE
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CCDS58 ERDRAEAEAREKETKALSLARALEEALEAKEEFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEKSKRALEQQVEEMRTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KKRLLIKQVRELEAELEDERKQRALAVASKKKMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LQAQMKDYQRELEEARASRDEIFAQSKESEKKLKSLEAEILQLQEELASSERARRHAEQE
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1750 1760 1770 1780 1790 1800
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDELADEITNSASGKSALLDEKRRLEARIAQLEEELEEEQSNMELLNDRFRKTTLQVDTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NAELAAERSAAQKSDNARQQLERQNKELKAKLQELEGAVKSKFKATISALEAKIGQLEEQ
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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pF1KB0 LEQEAKERAAANKLVRRTEKKLKEIFMQVEDERRHADQYKEQMEKANARMKQLKRQLEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEQEAKERAAANKLVRRTEKKLKEIFMQVEDERRHADQYKEQMEKANARMKQLKRQLEEA
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pF1KB0 EEEATRANASRRKLQRELDDATEANEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EEEATRANASRRKLQRELDDATEANEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHLE
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000
pF1KB0 GASLELSDDDTESKTSDVNETQPPQSE
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GASLELSDDDTESKTSDVNETQPPQSE
1990 2000
>>CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976 aa)
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Smith-Waterman score: 12444; 98.5% identity (98.5% similar) in 2007 aa overlap (1-2007:1-1976)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQRTGLEDPERYLFVDRAVIYNPATQADWTAKKLVWIPSERHGFEAASIKEERGDEVMV
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CCDS11 MAQRTGLEDPERYLFVDRAVIYNPATQADWTAKKLVWIPSERHGFEAASIKEERGDEVMV
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CCDS11 GASLELSDDDTESKTSDVNETQPPQSE
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CCDS73 EEEATRANASRRKLQRELDDATEANEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHLE
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CCDS73 GASLELSDDDTESKTSDVNETQPPQSE
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CCDS13 AAENRLTEMETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRARLTAKKQELEEICHDLEA
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:::::::: : :: :::::: .::.:::::.:::.:::::::::::.:::.::.::: ..
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::::: :. :::::.:::::: ...:.:::::.:.:::..::.:.::.::::::..:::
CCDS13 LEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQ
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::::::..:::.:..:::.:::::::::: :::.::::::::::.:::: ..:. .:: :
CCDS13 RQELEKTRRKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEEAAQKNMA
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:: .:::..::.:::::.:::.:::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::
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CCDS13 SKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTL
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CCDS13 ENERGELANEVKVLLQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVEL
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CCDS13 DNVTGLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQVEDEKNSFR
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CCDS13 EQLEEEEEAKHNLEKQIATLHAQVADMKKKMEDSVGCLETAEEVKRKLQKDLEGLSQRHE
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CCDS13 ERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHE
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CCDS13 LQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQE
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CCDS13 RDELADEIANS-SGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELEEEQGNTELINDRLKKANLQIDQ
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CCDS13 INTDLNLERSHAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASITALEAKIAQLEE
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CCDS13 QLDNETKERQAACKQVRRTEKKLKDVLLQVDDERRNAEQYKDQADKASTRLKQLKRQLEE
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pF1KB0 AEEEATRANASRRKLQRELDDATEANEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHL
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CCDS13 AEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNKLRRGD-LPFVVPRRMARK---
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pF1KB0 EGASLELSDDDTESKTSDVNETQPPQSE
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CCDS13 -GAG-DGSDEEVDGK-ADGAEAKPAE
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CCDS10 ELVENGKKVTVGKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLRERYFSGLIYTYSGL
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CCDS10 FCVVVNPYKHLPIYSEKIVDMYKGKKRHEMPPHIYAIADTAYRSMLQDREDQSILCTGES
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CCDS10 GAGKTENTKKVIQYLAVVASSHKGKKDTSIT----------GELEKQLLQANPILEAFGN
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CCDS10 AKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAIRQARDERTFHIFYYMIAG
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CCDS10 AKEKMRSDLLLEGFNNYTFLSNGFVPIPAAQDDEMFQETVEAMAIMGFSEEEQLSILKVV
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CCDS10 AQTKEQADFAVEALAKATYERLFRWILTRVNKALDKTHRQGASFLGILDIAGFEIFEVNS
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CCDS10 VLALLDEECWFPKATDKSFVEKLCTEQGSHPKFQKPKQLKDKTEFSIIHYAGKVDYNASA
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CCDS10 SNELATERSTAQKNESARQQLERQNKELRSKLHEMEGAVKSKFKSTIAALEAKIAQLEEQ
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CCDS10 VEQEAREKQAATKSLKQKDKKLKEILLQVEDERKMAEQYKEQAEKGNARVKQLKRQLEEA
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CCDS10 VEQEAREKQAATKSLKQKDKKLKEILLQVEDERKMAEQYKEQAEKGNARVKQLKRQLEEA
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CCDS10 EEESQRINANRRKLQRELDEATESNEAMGREVNALKSKLR-GPPPQETSQ
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2000 2010 2020 2030
>>CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995 aa)
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