FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0048, 1756 aa 1>>>pF1KB0048 1756 - 1756 aa - 1756 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8267+/-0.00122; mu= -10.0614+/- 0.074 mean_var=388.2876+/-78.638, 0's: 0 Z-trim(112.2): 50 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.065087 statistics sampled from 12922 (12970) to 12922 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16 Scan time: 4.890 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS81858.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1768) 11841 1127.6 0 CCDS42007.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1748) 11487 1094.3 0 CCDS45199.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1668) 6174 595.4 5.6e-169 CCDS73702.1 TJP1 gene_id:7082|Hs108|chr15 (1692) 6174 595.4 5.6e-169 CCDS6627.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1190) 2024 205.6 8.6e-52 CCDS55316.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1221) 2024 205.6 8.8e-52 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1180 pF1KB0 PLSYDSRPRYEQAPRASALRHEEQPAPGYDTHGRLRPEAQPHPSAGPKPAESKQYFEQYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 PLSYDSRPRYEQAPRASALRHEEQPAPGYDTHGRLRPEAQPHPSAGPKPAESKQYFEQYS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KB0 RSYEQVPPQGFTSRAGHFEPLHGAAAVPPLIPSSQHKPEALPSNTKPLPPPPTQTEEEED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 RSYEQVPPQGFTSRAGHFEPLHGAAAVPPLIPSSQHKPEALPSNTKPLPPPPTQTEEEED 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KB0 PAMKPQSVLTRVKMFENKRSASLETKKDVNDTGSFKPPEVASKPSGAPIIGPKPTSQNQF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 PAMKPQSVLTRVKMFENKRSASLETKKDVNDTGSFKPPEVASKPSGAPIIGPKPTSQNQF 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KB0 SEHDKTLYRIPEPQKPQLKPPEDIVRSNHYDPEEDEEYYRKQLSYFDRRSFENKPPAHIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 SEHDKTLYRIPEPQKPQLKPPEDIVRSNHYDPEEDEEYYRKQLSYFDRRSFENKPPAHIA 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB0 ASHLSEPAKPAHSQNQSNFSSYSSKGKPPEADGVDRSFGEKRYEPIQATPPPPPLPSQYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 ASHLSEPAKPAHSQNQSNFSSYSSKGKPPEADGVDRSFGEKRYEPIQATPPPPPLPSQYA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KB0 QPSQPVTSASLHIHSKGAHGEGNSVSLDFQNSLVSKPDPPPSQNKPATFRPPNREDTAQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 QPSQPVTSASLHIHSKGAHGEGNSVSLDFQNSLVSKPDPPPSQNKPATFRPPNREDTAQA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KB0 AFYPQKSFPDKAPVNGTEQTQKTVTPAYNRFTPKPYTSSARPFERKFESPKFNHNLLPSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 AFYPQKSFPDKAPVNGTEQTQKTVTPAYNRFTPKPYTSSARPFERKFESPKFNHNLLPSE 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB0 TAHKPDLSSKTPTSPKTLVKSHSLAQPPEFDSGVETFSIHAEKPKYQINNISTVPKAIPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 TAHKPDLSSKTPTSPKTLVKSHSLAQPPEFDSGVETFSIHAEKPKYQINNISTVPKAIPV 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KB0 SPSAVEEDEDEDGHTVVATARGIFNSNGGVLSSIETGVSIIIPQGAIPEGVEQEIYFKVC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 SPSAVEEDEDEDGHTVVATARGIFNSNGGVLSSIETGVSIIIPQGAIPEGVEQEIYFKVC 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KB0 RDNSILPPLDKEKGETLLSPLVMCGPHGLKFLKPVELRLPHCASMTPDGWSFALKSSDSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 RDNSILPPLDKEKGETLLSPLVMCGPHGLKFLKPVELRLPHCASMTPDGWSFALKSSDSS 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1730 1740 1750 pF1KB0 SGDPKTWQNKCLPGDPNYLVGANCVSVLIDHF :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 SGDPKTWQNKCLPGDPNYLVGANCVSVLIDHF 1670 1680 1690 >>CCDS6627.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1190 aa) initn: 2402 init1: 694 opt: 2024 Z-score: 1043.3 bits: 205.6 E(32554): 8.6e-52 Smith-Waterman score: 2692; 44.0% identity (63.8% similar) in 1184 aa overlap (44-1070:66-1187) 20 30 40 50 60 70 pF1KB0 LHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSGETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDN ::::: ::::.: :::::::.::::. :.. CCDS66 LQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMED 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 VEHAFAVQQLRKSGKNAKITIRRKKKVQIPVSRPDPEPVSDNEE--DSYDEEIHDPRSGR : :.::::::::::: : :...: .:::. . . .: :...... . .:: : :: : CCDS66 VLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASP-PLDQDDRAFEVMDE--FDGRSFR 100 110 120 130 140 150 140 150 pF1KB0 SGVVNR--------RS-------EKIWPRDRSASRERSLS-------------------- :: .: :: :. :..:. ::::.:: CCDS66 SGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHART 160 170 180 190 200 210 160 pF1KB0 ------------------PRSDR-------RSVA-------------------------- : :: ::. CCDS66 RDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRG 220 230 240 250 260 270 170 180 190 pF1KB0 -------------------SSQPAK-------PTKVTLVKSRKNEEYGLRLASHIFVKEI : .:. : : :.::: ::::::::.:.:::::. CCDS66 ARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEM 280 290 300 310 320 330 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 SQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGTVTENMSLTDAKTLIERSKGKLKMVVQRDERATLLNV .. .::..:::..:::..::::::::::::::::. :::.:.:::..:: :: . ::.:. CCDS66 TRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINI 340 350 360 370 380 390 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 PDLSDSIHSANASERDDISEIQSLASDHSGRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEP-SDHSRHSP :.:.:: :: .:::::.: .:: ::..: . ::.. :: CCDS66 PSLNDS-----DSEIEDISEIES----------------NRSFSPEERRHQYSDYDYHSS 400 410 420 430 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 QQPSNGSLRSRDEE--RISKPGAVSTPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPV .. . ::.. :.:. ::. :: : . : . .: :.. : .. : :.:: . CCDS66 SEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEDPPAPQPKAA 440 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 YAQVGQPDVDLPVSPSDGVLPNSTHEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA : . : :: : ..: :. :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS66 ------PRTFLRPSPED---------EAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA 500 510 520 530 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 GVLEDSPAAKEGLEEGDQILRVNNVDFTNIIREEAVLFLLDLPKGEEVTILAQKKKDVYR :. : . : .:::.::::::.::. :: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: CCDS66 GIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYR 540 550 560 570 580 590 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 RIVESDVGDSFYIRTHFEYEKESPYGLSFNKGEVFRVVDTLYNGKLGSWLAIRIGKNHKE :. ::::.::.::: :::.: .:.:..:::::::::::.::::.:::.:::. : CCDS66 DILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGN---E 600 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 VERGIIPNKNRAEQLASVQYTLPKTAGGDRADFWRFRGLRSS-KRNLRKSREDLSAQ-PV .:.:.::::.::::.:::: . . .::::::::.:: ::. :.:::::::::.: : CCDS66 LEKGLIPNKSRAEQMASVQ-NAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSV 660 670 680 690 700 710 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 QTKFPAYERVVLREAGFLRPVTIFGPIADVAREKLAREEPDIYQIAKSEPRDAGTDQRSS .:::::::::.:::::: :::..::::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:. CCDS66 STKFPAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSE-KST 720 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 GIIRLHTIKQIIDQDKHALLDVTPNAVDRLNYAQWYPIVVFLNPDSKQGVKTMRMRLCPE :..::.:..:::.:::::::::::.::: :::.::.:::.:.::::.:::::::.:: : CCDS66 GVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPT 780 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 SRKSARKLYERSHKLRKNNHHLFTTTINLNSMNDGWYGALKEAIQQQQNQLVWVSEGKAD : ::.:::.....::.:. ::::.:::::: ::.:.:.::..::.::.. ::::::: . CCDS66 SNKSSRKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKME 840 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 850 pF1KB0 GATSDDLDLHDDRLSYLSAPGSEYSMYSTDSRHTSDYEDTDTEGGAYTDQELDETLNDEV : .: .::.:::.: :..: : ::: ::.:::: :::::::.:::: .. CCDS66 GMDDDP----EDRMSYLTAMGADY--LSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEE-- 900 910 920 930 940 860 870 880 890 900 pF1KB0 GTPPESAITRSSEPVREDSSGMHHENQTYPPYSPQAQPQPIHRIDS-------PGFKPAS : :.::::::::. :.:. : :.:: . :. :.::: CCDS66 --PLVSSITRSSEPVQ------HEESIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPAFKPEP 950 960 970 980 990 910 920 930 940 950 960 pF1KB0 QQKAEASSPVPY-LSPETNPASSTSAVNHNVNLTNVRLEEPTPA---PSTSYSPQADSLR . .. : .: . :. ::: : . : :. :. . : : CCDS66 PKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPSAVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSILKPSTP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 970 980 990 1000 1010 pF1KB0 TPSTEAAHI--MLRDQEPSLSSHVDPTKVYRKDPYPEEMMRQNHVLK------QPAVSHP : :. .. ..:. . .: . .:...: . ...:.... . . : .:: CCDS66 IPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLGKVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1020 1030 1040 1050 pF1KB0 G--------HRPD---------KEPNLTYEPQLPYVEKQASR--DLEQPTYRYESSSYTD :.:: . :. :. :: . ..: : :. :: . : .. CCDS66 DIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPPEPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSK 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB0 QFSRNYEHRLRYEDRVPMYEEQWSYYDDKQPYPSRPPFDNQHSQDLDSRQHPEESSERGY . : . ::.: CCDS66 R--GYYGQSARYRDTEL 1180 1190 >>CCDS55316.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1221 aa) initn: 2402 init1: 694 opt: 2024 Z-score: 1043.2 bits: 205.6 E(32554): 8.8e-52 Smith-Waterman score: 2692; 44.0% identity (63.8% similar) in 1184 aa overlap (44-1070:97-1218) 20 30 40 50 60 70 pF1KB0 LHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSGETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDN ::::: ::::.: :::::::.::::. :.. CCDS55 LQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMED 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 VEHAFAVQQLRKSGKNAKITIRRKKKVQIPVSRPDPEPVSDNEE--DSYDEEIHDPRSGR : :.::::::::::: : :...: .:::. . . .: :...... . .:: : :: : CCDS55 VLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASP-PLDQDDRAFEVMDE--FDGRSFR 130 140 150 160 170 180 140 150 pF1KB0 SGVVNR--------RS-------EKIWPRDRSASRERSLS-------------------- :: .: :: :. :..:. ::::.:: CCDS55 SGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHART 190 200 210 220 230 240 160 pF1KB0 ------------------PRSDR-------RSVA-------------------------- : :: ::. CCDS55 RDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRG 250 260 270 280 290 300 170 180 190 pF1KB0 -------------------SSQPAK-------PTKVTLVKSRKNEEYGLRLASHIFVKEI : .:. : : :.::: ::::::::.:.:::::. CCDS55 ARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEM 310 320 330 340 350 360 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 SQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGTVTENMSLTDAKTLIERSKGKLKMVVQRDERATLLNV .. .::..:::..:::..::::::::::::::::. :::.:.:::..:: :: . ::.:. CCDS55 TRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINI 370 380 390 400 410 420 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 PDLSDSIHSANASERDDISEIQSLASDHSGRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEP-SDHSRHSP :.:.:: :: .:::::.: .:: ::..: . ::.. :: CCDS55 PSLNDS-----DSEIEDISEIES----------------NRSFSPEERRHQYSDYDYHSS 430 440 450 460 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 QQPSNGSLRSRDEE--RISKPGAVSTPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPV .. . ::.. :.:. ::. :: : . : . .: :.. : .. : :.:: . CCDS55 SEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEDPPAPQPKAA 470 480 490 500 510 520 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 YAQVGQPDVDLPVSPSDGVLPNSTHEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA : . : :: : ..: :. :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS55 ------PRTFLRPSPED---------EAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA 530 540 550 560 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 GVLEDSPAAKEGLEEGDQILRVNNVDFTNIIREEAVLFLLDLPKGEEVTILAQKKKDVYR :. : . : .:::.::::::.::. :: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: CCDS55 GIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYR 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 RIVESDVGDSFYIRTHFEYEKESPYGLSFNKGEVFRVVDTLYNGKLGSWLAIRIGKNHKE :. ::::.::.::: :::.: .:.:..:::::::::::.::::.:::.:::. : CCDS55 DILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGN---E 630 640 650 660 670 680 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 VERGIIPNKNRAEQLASVQYTLPKTAGGDRADFWRFRGLRSS-KRNLRKSREDLSAQ-PV .:.:.::::.::::.:::: . . .::::::::.:: ::. :.:::::::::.: : CCDS55 LEKGLIPNKSRAEQMASVQ-NAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSV 690 700 710 720 730 740 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 QTKFPAYERVVLREAGFLRPVTIFGPIADVAREKLAREEPDIYQIAKSEPRDAGTDQRSS .:::::::::.:::::: :::..::::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:. CCDS55 STKFPAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSE-KST 750 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 GIIRLHTIKQIIDQDKHALLDVTPNAVDRLNYAQWYPIVVFLNPDSKQGVKTMRMRLCPE :..::.:..:::.:::::::::::.::: :::.::.:::.:.::::.:::::::.:: : CCDS55 GVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPT 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 SRKSARKLYERSHKLRKNNHHLFTTTINLNSMNDGWYGALKEAIQQQQNQLVWVSEGKAD : ::.:::.....::.:. ::::.:::::: ::.:.:.::..::.::.. ::::::: . CCDS55 SNKSSRKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKME 870 880 890 900 910 920 800 810 820 830 840 850 pF1KB0 GATSDDLDLHDDRLSYLSAPGSEYSMYSTDSRHTSDYEDTDTEGGAYTDQELDETLNDEV : .: .::.:::.: :..: : ::: ::.:::: :::::::.:::: .. CCDS55 GMDDDP----EDRMSYLTAMGADY--LSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEE-- 930 940 950 960 970 860 870 880 890 900 pF1KB0 GTPPESAITRSSEPVREDSSGMHHENQTYPPYSPQAQPQPIHRIDS-------PGFKPAS : :.::::::::. :.:. : :.:: . :. :.::: CCDS55 --PLVSSITRSSEPVQ------HEESIRKPSPEPRAQMRRAASSDQLRDNSPPPAFKPEP 980 990 1000 1010 1020 910 920 930 940 950 960 pF1KB0 QQKAEASSPVPY-LSPETNPASSTSAVNHNVNLTNVRLEEPTPA---PSTSYSPQADSLR . .. : .: . :. ::: : . : :. :. . : : CCDS55 PKAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPSAVAGNETPGASTKGYPPPVAAKPTFGRSILKPSTP 1030 1040 1050 1060 1070 1080 970 980 990 1000 1010 pF1KB0 TPSTEAAHI--MLRDQEPSLSSHVDPTKVYRKDPYPEEMMRQNHVLK------QPAVSHP : :. .. ..:. . .: . .:...: . ...:.... . . : .:: CCDS55 IPPQEGEEVGESSEEQDNAPKSVLGKVKIFEKMDHKARLQRMQELQEAQNARIEIAQKHP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1020 1030 1040 1050 pF1KB0 G--------HRPD---------KEPNLTYEPQLPYVEKQASR--DLEQPTYRYESSSYTD :.:: . :. :. :: . ..: : :. :: . : .. CCDS55 DIYAVPIKTHKPDPGTPQHTSSRPPEPQKAPSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSK 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB0 QFSRNYEHRLRYEDRVPMYEEQWSYYDDKQPYPSRPPFDNQHSQDLDSRQHPEESSERGY . : . ::.: CCDS55 R--GYYGQSARYRDTEL 1210 1220 >>CCDS55315.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1157 aa) initn: 2452 init1: 694 opt: 1988 Z-score: 1025.2 bits: 202.2 E(32554): 8.7e-51 Smith-Waterman score: 2687; 44.1% identity (65.2% similar) in 1155 aa overlap (44-1070:70-1154) 20 30 40 50 60 70 pF1KB0 LHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSGETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDN ::::: ::::.: :::::::.::::. :.. CCDS55 LQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMED 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 VEHAFAVQQLRKSGKNAKITIRRKKKVQIPVSRPDPEPVSDNEE--DSYDEEIHDPRSGR : :.::::::::::: : :...: .:::. . . .: :...... . .:: : :: : CCDS55 VLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASP-PLDQDDRAFEVMDE--FDGRSFR 100 110 120 130 140 150 140 150 pF1KB0 SGVVNR--------RS-------EKIWPRDRSASRERSLS-------------------- :: .: :: :. :..:. ::::.:: CCDS55 SGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHART 160 170 180 190 200 210 160 pF1KB0 ------------------PRSDR-------RSVA-------------------------- : :: ::. CCDS55 RDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRG 220 230 240 250 260 270 170 180 190 pF1KB0 -------------------SSQPAK-------PTKVTLVKSRKNEEYGLRLASHIFVKEI : .:. : : :.::: ::::::::.:.:::::. CCDS55 ARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEM 280 290 300 310 320 330 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 SQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGTVTENMSLTDAKTLIERSKGKLKMVVQRDERATLLNV .. .::..:::..:::..::::::::::::::::. :::.:.:::..:: :: . ::.:. CCDS55 TRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINI 340 350 360 370 380 390 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 PDLSDSIHSANASERDDISEIQSLASDHSGRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEP-SDHSRHSP :.:.:: :: .:::::.: .:: ::..: . ::.. :: CCDS55 PSLNDS-----DSEIEDISEIES----------------NRSFSPEERRHQYSDYDYHSS 400 410 420 430 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 QQPSNGSLRSRDEE--RISKPGAVSTPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPV .. . ::.. :.:. ::. :: : . : . .: :.. : .. : :.:: . CCDS55 SEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEDPPAPQPKAA 440 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 YAQVGQPDVDLPVSPSDGVLPNSTHEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA : . : :: : ..: :. :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS55 ------PRTFLRPSPED---------EAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 GVLEDSPAAKEGLEEGDQILRVNNVDFTNIIREEAVLFLLDLPKGEEVTILAQKKKDVYR :. : . : .:::.::::::.::. :: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: CCDS55 GIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYR 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 RIVESDVGDSFYIRTHFEYEKESPYGLSFNKGEVFRVVDTLYNGKLGSWLAIRIGKNHKE :. ::::.::.::: :::.: .:.:..:::::::::::.::::.:::.:::. : CCDS55 DILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGN---E 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 VERGIIPNKNRAEQLASVQYTLPKTAGGDRADFWRFRGLRSS-KRNLRKSREDLSAQ-PV .:.:.::::.::::.:::: . . .::::::::.:: ::. :.:::::::::.: : CCDS55 LEKGLIPNKSRAEQMASVQ-NAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSV 660 670 680 690 700 710 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 QTKFPAYERVVLREAGFLRPVTIFGPIADVAREKLAREEPDIYQIAKSEPRDAGTDQRSS .:::::::::.:::::: :::..::::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:. CCDS55 STKFPAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSE-KST 720 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 GIIRLHTIKQIIDQDKHALLDVTPNAVDRLNYAQWYPIVVFLNPDSKQGVKTMRMRLCPE :..::.:..:::.:::::::::::.::: :::.::.:::.:.::::.:::::::.:: : CCDS55 GVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPT 780 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 SRKSARKLYERSHKLRKNNHHLFTTTINLNSMNDGWYGALKEAIQQQQNQLVWVSEGKAD : ::.:::.....::.:. ::::.:::::: ::.:.:.::..::.::.. ::::::: . CCDS55 SNKSSRKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKME 840 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 850 pF1KB0 GATSDDLDLHDDRLSYLSAPGSEYSMYSTDSRHTSDYEDTDTEGGAYTDQELDETLNDEV : .: .::.:::.: :..: : ::: ::.:::: :::::::.:::: .. CCDS55 GMDDDP----EDRMSYLTAMGADY--LSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEE-- 900 910 920 930 940 860 870 880 890 900 910 pF1KB0 GTPPESAITRSSEPVREDSSGMHHENQTYP---PYSPQAQPQPIHRIDSPGFKPASQQKA : :.::::::::... . ......: : ...:. . ..:: . . CCDS55 --PLVSSITRSSEPVQHEEAKTQNKEESYDFSKSYEYKSNPSAVAGNETPGASTKGYPPP 950 960 970 980 990 1000 920 930 940 950 960 pF1KB0 EASSPV---PYLSPETN-PASSTSAVNHNVNLTNVRLEEPTPAPSTSYSPQADSLRTPST :..:. :.: : : . :... :: ::. : .. .. . CCDS55 VAAKPTFGRSILKPSTPIPPQEGEEVGESS-------EEQDNAPK-SVLGKVKIFEKMDH 1010 1020 1030 1040 1050 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB0 EAAHIMLRDQEPSLSSHVDPTKVYRKDPYPEEMMRQNHVLKQPAVSHPGHRPDKEPNLTY .: ... . . ..... . .: : . ..: .: . : : .. :. CCDS55 KARLQRMQELQEAQNARIE---IAQKHPDIYAVPIKTH---KPDPGTPQHTSSRPPEPQK 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB0 EPQLPYVEKQASR--DLEQPTYRYESSSYTDQFSRNYEHRLRYEDRVPMYEEQWSYYDDK :. :: . ..: : :. :: . : .. . : . ::.: CCDS55 APSRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKR--GYYGQSARYRDTEL 1120 1130 1140 1150 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB0 QPYPSRPPFDNQHSQDLDSRQHPEESSERGYFPRFEEPAPLSYDSRPRYEQAPRASALRH >>CCDS55317.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1020 aa) initn: 2360 init1: 694 opt: 1961 Z-score: 1012.4 bits: 199.7 E(32554): 4.5e-50 Smith-Waterman score: 2637; 48.1% identity (67.4% similar) in 1006 aa overlap (44-930:43-983) 20 30 40 50 60 70 pF1KB0 LHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSGETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDN ::::: ::::.: :::::::.::::. :.. CCDS55 LQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMED 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 VEHAFAVQQLRKSGKNAKITIRRKKKVQIPVSRPDPEPVSDNEE--DSYDEEIHDPRSGR : :.::::::::::: : :...: .:::. . . .: :...... . .:: : :: : CCDS55 VLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASP-PLDQDDRAFEVMDE--FDGRSFR 80 90 100 110 120 140 150 pF1KB0 SGVVNR--------RS-------EKIWPRDRSASRERSLS-------------------- :: .: :: :. :..:. ::::.:: CCDS55 SGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHART 130 140 150 160 170 180 160 pF1KB0 ------------------PRSDR-------RSVA-------------------------- : :: ::. CCDS55 RDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRG 190 200 210 220 230 240 170 180 190 pF1KB0 -------------------SSQPAK-------PTKVTLVKSRKNEEYGLRLASHIFVKEI : .:. : : :.::: ::::::::.:.:::::. CCDS55 ARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEM 250 260 270 280 290 300 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 SQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGTVTENMSLTDAKTLIERSKGKLKMVVQRDERATLLNV .. .::..:::..:::..::::::::::::::::. :::.:.:::..:: :: . ::.:. CCDS55 TRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINI 310 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 PDLSDSIHSANASERDDISEIQSLASDHSGRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEP-SDHSRHSP :.:.:: :: .:::::.: .:: ::..: . ::.. :: CCDS55 PSLNDS-----DSEIEDISEIES----------------NRSFSPEERRHQYSDYDYHSS 370 380 390 400 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 QQPSNGSLRSRDEE--RISKPGAVSTPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPV .. . ::.. :.:. ::. :: : . : . .: :.. : .. : :.:: . CCDS55 SEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEDPPAPQPKAA 410 420 430 440 450 460 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 YAQVGQPDVDLPVSPSDGVLPNSTHEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA : . : :: : ..: :. :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS55 ------PRTFLRPSPED---------EAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 GVLEDSPAAKEGLEEGDQILRVNNVDFTNIIREEAVLFLLDLPKGEEVTILAQKKKDVYR :. : . : .:::.::::::.::. :: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: CCDS55 GIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYR 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 RIVESDVGDSFYIRTHFEYEKESPYGLSFNKGEVFRVVDTLYNGKLGSWLAIRIGKNHKE :. ::::.::.::: :::.: .:.:..:::::::::::.::::.:::.:::. : CCDS55 DILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGN---E 580 590 600 610 620 630 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 VERGIIPNKNRAEQLASVQYTLPKTAGGDRADFWRFRGLRSS-KRNLRKSREDLSAQ-PV .:.:.::::.::::.:::: . . .::::::::.:: ::. :.:::::::::.: : CCDS55 LEKGLIPNKSRAEQMASVQ-NAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSV 640 650 660 670 680 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 QTKFPAYERVVLREAGFLRPVTIFGPIADVAREKLAREEPDIYQIAKSEPRDAGTDQRSS .:::::::::.:::::: :::..::::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:. CCDS55 STKFPAYERVLLREAGFKRPVVLFGPIADIAMEKLANELPDWFQTAKTEPKDAGSE-KST 690 700 710 720 730 740 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 GIIRLHTIKQIIDQDKHALLDVTPNAVDRLNYAQWYPIVVFLNPDSKQGVKTMRMRLCPE :..::.:..:::.:::::::::::.::: :::.::.:::.:.::::.:::::::.:: : CCDS55 GVVRLNTVRQIIEQDKHALLDVTPKAVDLLNYTQWFPIVIFFNPDSRQGVKTMRQRLNPT 750 760 770 780 790 800 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 SRKSARKLYERSHKLRKNNHHLFTTTINLNSMNDGWYGALKEAIQQQQNQLVWVSEGKAD : ::.:::.....::.:. ::::.:::::: ::.:.:.::..::.::.. ::::::: . CCDS55 SNKSSRKLFDQANKLKKTCAHLFTATINLNSANDSWFGSLKDTIQHQQGEAVWVSEGKME 810 820 830 840 850 860 800 810 820 830 840 850 pF1KB0 GATSDDLDLHDDRLSYLSAPGSEYSMYSTDSRHTSDYEDTDTEGGAYTDQELDETLNDEV : .: .::.:::.: :..: : ::: ::.:::: :::::::.:::: .. CCDS55 GMDDDP----EDRMSYLTAMGADY--LSCDSRLISDFEDTDGEGGAYTDNELDEPAEE-- 870 880 890 900 910 920 860 870 880 890 900 910 pF1KB0 GTPPESAITRSSEPVREDSSGMHHENQTYPPYSPQAQPQPIHRIDSPGFKPASQQKAEAS : :.::::::::... . : .: : : :. : :.. :.. . CCDS55 --PLVSSITRSSEPVQHEEIEI---AQKHPDI--YAVPIKTHKPD-----PGTPQHTSSR 930 940 950 960 920 930 940 950 960 970 pF1KB0 SPVPYLSPETNPASSTSAVNHNVNLTNVRLEEPTPAPSTSYSPQADSLRTPSTEAAHIML : : .: . : ..: CCDS55 PPEPQKAP-SRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL 970 980 990 1000 1010 1020 >>CCDS6628.1 TJP2 gene_id:9414|Hs108|chr9 (1043 aa) initn: 2360 init1: 694 opt: 1961 Z-score: 1012.2 bits: 199.7 E(32554): 4.6e-50 Smith-Waterman score: 2637; 48.1% identity (67.4% similar) in 1006 aa overlap (44-930:66-1006) 20 30 40 50 60 70 pF1KB0 LHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSGETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDN ::::: ::::.: :::::::.::::. :.. CCDS66 LQKDSKRGFGIAVSGGRDNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDRVVMVNGTPMED 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB0 VEHAFAVQQLRKSGKNAKITIRRKKKVQIPVSRPDPEPVSDNEE--DSYDEEIHDPRSGR : :.::::::::::: : :...: .:::. . . .: :...... . .:: : :: : CCDS66 VLHSFAVQQLRKSGKVAAIVVKRPRKVQVAALQASP-PLDQDDRAFEVMDE--FDGRSFR 100 110 120 130 140 150 140 150 pF1KB0 SGVVNR--------RS-------EKIWPRDRSASRERSLS-------------------- :: .: :: :. :..:. ::::.:: CCDS66 SGYSERSRLNSHGGRSRSWEDSPERGRPHERARSRERDLSRDRSRGRSLERGLDQDHART 160 170 180 190 200 210 160 pF1KB0 ------------------PRSDR-------RSVA-------------------------- : :: ::. CCDS66 RDRSRGRSLERGLDHDFGPSRDRDRDRSRGRSIDQDYERAYHRAYDPDYERAYSPEYRRG 220 230 240 250 260 270 170 180 190 pF1KB0 -------------------SSQPAK-------PTKVTLVKSRKNEEYGLRLASHIFVKEI : .:. : : :.::: ::::::::.:.:::::. CCDS66 ARHDARSRGPRSRSREHPHSRSPSPEPRGRPGPIGVLLMKSRANEEYGLRLGSQIFVKEM 280 290 300 310 320 330 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 SQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGTVTENMSLTDAKTLIERSKGKLKMVVQRDERATLLNV .. .::..:::..:::..::::::::::::::::. :::.:.:::..:: :: . ::.:. CCDS66 TRTGLATKDGNLHEGDIILKINGTVTENMSLTDARKLIEKSRGKLQLVVLRDSQQTLINI 340 350 360 370 380 390 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 PDLSDSIHSANASERDDISEIQSLASDHSGRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEP-SDHSRHSP :.:.:: :: .:::::.: .:: ::..: . ::.. :: CCDS66 PSLNDS-----DSEIEDISEIES----------------NRSFSPEERRHQYSDYDYHSS 400 410 420 430 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 QQPSNGSLRSRDEE--RISKPGAVSTPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPV .. . ::.. :.:. ::. :: : . : . .: :.. : .. : :.:: . CCDS66 SEKLKERPSSREDTPSRLSRMGATPTPFKSTGDIAGTVVPETNKEPRYQEDPPAPQPKAA 440 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 YAQVGQPDVDLPVSPSDGVLPNSTHEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA : . : :: : ..: :. :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS66 ------PRTFLRPSPED---------EAIYGPNTKMVRFKKGDSVGLRLAGGNDVGIFVA 500 510 520 530 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 GVLEDSPAAKEGLEEGDQILRVNNVDFTNIIREEAVLFLLDLPKGEEVTILAQKKKDVYR :. : . : .:::.::::::.::. :: ...::.:::.::..:::: ::::::.. :::: CCDS66 GIQEGTSAEQEGLQEGDQILKVNTQDFRGLVREDAVLYLLEIPKGEMVTILAQSRADVYR 540 550 560 570 580 590 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 RIVESDVGDSFYIRTHFEYEKESPYGLSFNKGEVFRVVDTLYNGKLGSWLAIRIGKNHKE :. ::::.::.::: :::.: .:.:..:::::::::::.::::.:::.:::. : CCDS66 DILACGRGDSFFIRSHFECEKETPQSLAFTRGEVFRVVDTLYDGKLGNWLAVRIGN---E 600 610 620 630 640 650 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 VERGIIPNKNRAEQLASVQYTLPKTAGGDRADFWRFRGLRSS-KRNLRKSREDLSAQ-PV .:.:.::::.::::.:::: . . .::::::::.:: ::. :.:::::::::.: : CCDS66 LEKGLIPNKSRAEQMASVQ-NAQRDNAGDRADFWRMRGQRSGVKKNLRKSREDLTAVVSV 660 670 680 690 700 710 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 QTKFPAYERVVLREAGFLRPVTIFGPIADVAREKLAREEPDIYQIAKSEPRDAGTDQRSS .:::::::::.:::::: :::..::::::.: :::: : :: .: ::.::.:::.. .:. 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CCDS66 --PLVSSITRSSEPVQHEEIEI---AQKHPDI--YAVPIKTHKPD-----PGTPQHTSSR 950 960 970 980 990 920 930 940 950 960 970 pF1KB0 SPVPYLSPETNPASSTSAVNHNVNLTNVRLEEPTPAPSTSYSPQADSLRTPSTEAAHIML : : .: . : ..: CCDS66 PPEPQKAP-SRPYQDTRGSYGSDAEEEEYRQQLSEHSKRGYYGQSARYRDTEL 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS32873.2 TJP3 gene_id:27134|Hs108|chr19 (919 aa) initn: 2193 init1: 559 opt: 756 Z-score: 401.5 bits: 86.5 E(32554): 4.8e-16 Smith-Waterman score: 2261; 44.4% identity (68.2% similar) in 922 aa overlap (1-874:1-854) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MEETAIWEQHTVTLHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSGETSIVISDVLKGGPAEGQLQEN ::: .::::::.:: . : ::::::::::: : .: :.:.:::. ::::::.:: . 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