FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0051, 1791 aa
1>>>pF1KB0051 1791 - 1791 aa - 1791 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4040+/-0.00112; mu= 11.0230+/- 0.068
mean_var=177.1846+/-35.335, 0's: 0 Z-trim(109.1): 85 B-trim: 274 in 1/51
Lambda= 0.096352
statistics sampled from 10606 (10689) to 10606 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16
Scan time: 7.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 11879 1665.0 0
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 5678 803.0 0
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 3298 472.1 5e-132
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 3290 471.1 1.6e-131
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 2258 327.5 1.7e-88
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 1478 219.2 1e-55
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 1478 219.2 1e-55
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 1478 219.2 1.1e-55
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 1478 219.2 1.1e-55
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 1451 215.5 1.5e-54
CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266) 1428 212.2 9.9e-54
CCDS13122.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1317) 1428 212.2 1e-53
CCDS56178.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1392) 1428 212.2 1.1e-53
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 1168 176.1 9.3e-43
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 673 107.1 2.4e-22
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 673 107.1 2.4e-22
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 673 107.1 2.5e-22
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 605 97.7 2.2e-19
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 594 96.3 8.1e-19
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 594 96.3 8.2e-19
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 594 96.3 8.5e-19
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 586 95.1 1.4e-18
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 580 94.2 2.6e-18
CCDS34430.1 KIFC1 gene_id:3833|Hs108|chr6 ( 673) 557 90.9 1.7e-17
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 560 91.5 2.2e-17
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 549 90.0 6.3e-17
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 538 88.7 3.1e-16
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 538 88.7 3.2e-16
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 526 86.6 3.3e-16
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 525 86.5 3.7e-16
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 525 86.5 3.9e-16
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 525 86.5 4.3e-16
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 525 86.5 4.3e-16
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 525 86.5 4.4e-16
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 505 83.7 2.5e-15
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 489 81.4 1.1e-14
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 457 77.0 2.7e-13
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 457 77.1 2.9e-13
CCDS53776.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1674) 456 77.1 5.9e-13
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 444 75.2 8.9e-13
CCDS53774.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1621) 451 76.4 9.3e-13
CCDS53775.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1637) 451 76.4 9.3e-13
CCDS31773.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1661) 451 76.4 9.4e-13
CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 725) 444 75.2 9.5e-13
CCDS32279.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 ( 856) 433 73.8 3.1e-12
CCDS32278.1 KIF23 gene_id:9493|Hs108|chr15 ( 960) 433 73.8 3.4e-12
CCDS32685.1 KIF2B gene_id:84643|Hs108|chr17 ( 673) 426 72.7 5.1e-12
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 422 72.2 8.9e-12
CCDS58054.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1610) 415 71.4 3e-11
CCDS58055.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1623) 415 71.4 3e-11
>>CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791 aa)
initn: 11879 init1: 11879 opt: 11879 Z-score: 8927.3 bits: 1665.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11879; 99.9% identity (99.9% similar) in 1791 aa overlap (1-1791:1-1791)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDTNTVPGGPKLTNALVGMSPSSSLSALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDTNTVPGGPKLTNALVGMSPSSSLSALS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 SRAASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRAASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 MGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 SGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 FRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 EREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 RKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 AKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYWTLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYWTLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 NVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSAISGCNSYPLLNTCMSERMAALTPSPTFSSPDSDATEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSAISGCNSYPLLNTCMSERMAALTPSPTFSSPDSDATEP
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910 920 930 940 950 960
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AEEQSVGEEEEEEEEEEDEEEEDLEDDVFPEHALCDGRDPFYDRPPLFSLVGRAFVYLSN
910 920 930 940 950 960
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pF1KB0 LLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFDDQHFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFDDQHFE
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KB0 KFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADVGPSADEVNNNTCSAVPPEGLLLDSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADVGPSADEVNNNTCSAVPPEGLLLDSSE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB0 KAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVTVLQASSISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLK
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CCDS58 KAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVTVLQASSISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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CCDS58 NTGRGPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIEYIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTRPCPGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLIDPNILS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LNILSSGYIHPAQDDRTFYQFEAAWDSSMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PAVVTKDFCMVFYSRDAKLPASRSIRNLFGSGSLRASESNRVTGVYELSLCHVADAGSPG
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB0 MQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLRE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KB0 KLETAQRPVPEALSPAFSEDSESHGSSSASSPLSAEGRPSPLEAPNERQRELAVKCLRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLETAQRPVPEALSPAFSEDSESHGSSSASSPLSAEGRPSPLEAPNERQRELAVKCLRLL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB0 THTFNREYTHSHVCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 THTFNREYTHSHVCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGAT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB0 DLRTPQPCSRPASPEPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLRTPQPCSRPASPEPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKK
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB0 GYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790
pF1KB0 NTFAVCTEHRGILLQAASDKDMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRRSAQMRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTFAVCTEHRGILLQAASDKDMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRRSAQMRV
1750 1760 1770 1780 1790
>>CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690 aa)
initn: 8250 init1: 5675 opt: 5678 Z-score: 4269.1 bits: 803.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10964; 94.2% identity (94.3% similar) in 1791 aa overlap (1-1791:1-1690)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::
CCDS46 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITD---------MTNALVGMSPSSSLSALS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRAASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYWTLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCD
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::::::::::::::::::::
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::::::::
CCDS46 ----------------------------------------------------RAFVYLSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFDDQHFE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVTVLQASSISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLK
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CCDS46 NTGRGPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIEYIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPS
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CCDS46 RRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTRPCPGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLIDPNILS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 THTFNREYTHSHVCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLRTPQPCSRPASPEPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTP
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NTFAVCTEHRGILLQAASDKDMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRRSAQMRV
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::::::::::::::::.:: :.:.::...:.:.::.:.:::: :..::::.:::::::::
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: :: ..:::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:: ::::.:
CCDS11 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
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:::::::::.... . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
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::::::::: :: :::: :::::::::::::::::::::::.:.:::. :: :.. .::
CCDS11 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
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pF1KB0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::.:.: ::.:
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQS------KKRK
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.::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::::::.:
CCDS11 SDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAII
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::::: .:::::..::.:::.::.:::: : :. ..: :. : ... . .:::
CCDS11 NEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPS
360 370 380 390 400 410
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pF1KB0 SSLSALSSRAASVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRME
: . . : : : . : :::.:::.::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS11 SPTTHNGELEPSFSPNTESQI---GPEEAMERLQETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRME
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:::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::::. :
CCDS11 REALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKDGVTRVGQVD--
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pF1KB0 RRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRI
.:: :.:.::.:.::.::: . .:.::::::::::.:::::: :::: .:.:::::
CCDS11 --MDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRI
530 540 550 560 570 580
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pF1KB0 IMGKSHVFRFNHPEQARQERER--TPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRL
.:::.:::::::::::: :::: : :.::::: :::.::::.::::.: :::.::
CCDS11 VMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRL
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pF1KB0 QELEDQYRREREEATYLLEQQRL--DYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWT
:.::.:::.:.::: ::::::: : .: .. ... . . . .:. : ::
CCDS11 QDLENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTI
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pF1KB0 ERECELALWAFRKW--KWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTL
..: : . :. . ::. . : :
CCDS11 VKRCGLPSSGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHG
710 720 730 740 750 760
>>CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770 aa)
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pF1KB0 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
:.::::::::::::::::: :..:::::::.:..:.:.:::.:::.::::::::::::::
CCDS11 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB0 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
:::: .:::..:: :::.::: :::::::::::::::::::::::::::::..: ::::
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
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pF1KB0 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: .:::. :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
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pF1KB0 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
:::::::::.:: ::::.:::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::..:::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
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pF1KB0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV------SKKKKK
250 260 270 280 290
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pF1KB0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS11 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
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pF1KB0 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDTNTVPGGPKLTNALVGMSPSSSLSALS
::::: ::.::::.:::::.::: ::::::: ::. : .::. :::: .::
CCDS11 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSM--G--SLTS-----SPSSC--SLS
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pF1KB0 SRAA--SVSSLHERILFAPGSEEAIERLKETEKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALL
:... ::.:..:::. .::.:::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS11 SQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALL
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pF1KB0 AEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDI
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.::::::
CCDS11 AEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDI
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pF1KB0 VLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPCEGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKS
:::: ::::::.:::. ...:..::::::: ..::::::.:..: :::::::::::.
CCDS11 VLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKN
530 540 550 560 570 580
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pF1KB0 HVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQY
:::::::::::: :::.:: ::::.:::::.:::::::::::::::::::.::::.: :
CCDS11 HVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILY
590 600 610 620 630 640
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pF1KB0 RREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALW
..:.::: :::::::::::::.:::::...: . :::: :.:: ::..: ::: :
CCDS11 KKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQW
650 660 670 680 690 700
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pF1KB0 AFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPP
:::::: .:::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 AFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPT
710 720 730 740 750 760
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pF1KB0 EAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYWTLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIED
: : .: ::::::.::::::: ::::::::.::::.:::::::::::::.:. ::. ..
CCDS11 EMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDE
770 780 790 800 810 820
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pF1KB0 CDNVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSAISGCNSYPLLNTCMSERMAALTPSPTFSSPDSDAT
...:::.::::::: ::.::::: :... :..::.: :::::::. ::: :
CCDS11 SETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSS--------PIFHGCVNERLADRTPSPTFSTADSDIT
830 840 850 860 870
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pF1KB0 EPAEEQSVGEEEEEEEEEEDEEEEDLEDDVFPEHA---LCDGRDPFYDRPPLFSLVGRAF
: :.:: ..: :. ... .: .:. :.. . ::.:::::: : : ::::::
CCDS11 ELADEQ----QDEMEDFDDEAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGHDPFYDRSPWFILVGRAF
880 890 900 910 920 930
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pF1KB0 VYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFD
::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::::::::::
CCDS11 VYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAPDYGSGIRQSGTAKISFD
940 950 960 970 980 990
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pF1KB0 DQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADVGPSADEVNNNTCSAVPPEGLL
...:.. . : :.:.::: : :::::::::::...: .:.. . . . :
CCDS11 NEYFNQSDFSS---VAMTRSGLSLEELRIVEGQGQSSEVITPPEEISRINDLDLKS-STL
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::. : ...: . .::.::..:::::::::::.: :::::::::::.::::::::
CCDS11 LDG--KMVMEGFSEEIGNHLKLGSAFTFRVTVLQASGILPEYADIFCQFNFLHRHDEAFS
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::::::.::: ::.::::::::::.:.::..:::..::::::::::::::. ... :
CCDS11 TEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIAVEITESFVDYIKTKPIVFEVFGHYQQHPLHLQGQELNS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KB0 PLRPSRRHFPRVMLLSKPVPATKLSTLTRPCPGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAV
: .: :: :: : ::::::::::.:... : ::::::.::: ::: .:.:::::
CCDS11 PPQPCRRFFPPPMPLSKPVPATKLNTMSKTSLGQSMSKYDLLVWFEISELEPTGEYIPAV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KB0 VDHRGGMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLID
::: .:.::.::::::::::::::::..:: ::...::.::::::::::: ::.::. .:
CCDS11 VDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEKGSELHWKDVRELVVGRIRNKPEVDEAAVD
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pF1KB0 PNILSLNILSSGYIHPAQDD-RTFYQFEAAWDSSMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIE
::::::.:. :.. .... ::::.:::.::::.:::::::::::: ::::::::::.:
CCDS11 A-ILSLNIISAKYLKSSHNSSRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLE
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...: ::::.::: ::::::::::. ::.:.::::: .. .::::::.::::::...
CCDS11 LDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSLRSLFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMS
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pF1KB0 DAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRH
:.::::::::::..::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: ::.:::::::
CCDS11 DTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQWELEKLELLHEVEKTRH
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pF1KB0 YLLLREKL-ETAQRPVPEALSPAFSEDSESHGSS-----------SASSPLSAEGRPS-P
.:::::.: .. . . ..:::..: . : ..: :: .: . : :
CCDS11 FLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQISTTTFESAITPSESSGYDSGD
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KB0 LEAPNERQRELAVKCLRLLTHTFNREYTHSHVCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVA
.:. .:..:::.:::.:::::::::... : :.:. :::..: . :::: : .. :
CCDS11 IESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHG--SVSDCKLSDIS-PIGRDPSESSFSSA
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pF1KB0 TLTPSSTCPSLVEGRYGATDLRTPQPCSRPASPEPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQ
::::::::::::..: .. : .::. :: .:: ::. . .: : .:
CCDS11 TLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSPCPEFEQFQIVPAVETPYLARAGKNEFL
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pF1KB0 RLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLN
: ::::.::: : .::::::::: :: :.::..::::::::...:::::: ::: ..:
CCDS11 NL-VPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIIN
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:.:::::::::::::.::::::::::.:::.:::: .::::.::::::::::::::::::
CCDS11 LSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKL
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1790
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CCDS11 SRRCPSQSKY
1770
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CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
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CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
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CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
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CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV------SKKKKK
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CCDS11 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
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::::: ::.::::.:::::.::: ::::::: ::. :. ::. :::: .::
CCDS11 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSM--GS--LTS-----SPSSC--SLS
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CCDS11 SQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALL
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CCDS11 AEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDI
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CCDS11 VLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKN
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pF1KB0 HVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWAFAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQY
:::::::::::: :::.:: ::::.:::::.:::::::::::::::::::.::::.: :
CCDS11 HVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILY
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pF1KB0 RREREEATYLLEQQRLDYESKL--EALQKQMDSRYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELA
..:.::: :::::::: .: .. ... . . .. .:. : ...: ..: :
CCDS11 KKEKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSCEESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLP
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pF1KB0 LWAFRKW--KWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPD
. .. : ::. . : :
CCDS11 SSGKKREPIKMYQIPQRRRLSKDSKWVTISDLKIQAVKEICYEVALNDFRHSRQEIEALA
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CCDS47 FWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAFQGYNACIFAYGQTGSGKSFSMMGHAE--Q
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CCDS47 LGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQSLKVREHKVL
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::::. ::.:::::..::..::. :::.:::::::::: :::::::::::.:: .: ..
CCDS47 GPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIIITQTLYDLQS
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CCDS47 GNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSLADQAAGKGK
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.: :.:::::::::::..::::::.:.:.:..::: ::.:::::::::::::.:
CCDS47 SK------FVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRAKRI
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CCDS47 VNHAVVNEDPNAKVIRELREEVEKLREQL-------------------------------
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. : ::.... .: .: .::::: :: ..: :.::.:: :::: ..
CCDS47 QRQLESMGISLEMSGIKVG----DDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDH-TRVG---ADT
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::: : : :. .:: . : : ::: : :.: . ::: : . : :.::.
CCDS47 SQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD----VTLTPKENARSCVNGTLVCSTTQLWHGDRIL
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:..: ::.: :.. :. :.: : .:. .:: .. ::: :.. :
CCDS47 WGNNHFFRINLPKRKRRDWLKDFEKETGPPEHDLDAASEASSEPDYNYEFAQMEVIMKT-
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CCDS47 LNSNDPVQNVVQVLEKQYLEEKRSA---LEEQRLMYERELEQLRQQLSPDRQPQSSGPDR
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. ...: ::.:.. :: ::. ....::. : ...::: .. :..
CCDS47 LAYSSQTAQQKVTQWAEERDEL----FRQ----SLAKLREQLVKANTLVREANFLAEEMS
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: ...: :: : ::. .: . .: ...: .:. ::.:
CCDS47 KLTDYQV-----TLQIP---------AANLSANRKRGAIVSEPAIQVRRKGKSTQVWTIE
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::...: ::..:.. : .: : :::::. :.: . .
CCDS47 KLENKLIDMRDLYQEWKE---KVPEAKRLYGKRGDPFYEAQENHNLIGVANV--------
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CCDS47 FLECLFCDVKLQYAVPIISQQGEVAGRLHVEVMRVTGAVPERVVEDDSSENSSESGSL--
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CCDS47 -EVVDSSGEIIHR--VKKLTCRVKIKEATGL-PLNLSN---FVFCQYTFWDQCESTVAAP
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CCDS47 VVDPEVPSP-----QSKDAQYTVTFSHCKDY------VVNVT-----EEFLEFI------
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CCDS47 SD-GALAIEVWGHRCAGNGSSIWEVDSLHAKTRTLHDRWNEVTRRIEMWISILELNELGE
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CCDS47 YAAVELHQAKDVNT--GGIF-QLRQGHSRRVQVTVKPVQHSGTLPLM----VEAILSVSI
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CCDS47 GCVTARSTKLQ----RGLDSYQEEDLN--CVRERWSDALIKRREY-----LDEQIK--KV
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:. :. . . .:. . : :. .:: . : : . .. :.. .:
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CCDS47 VLFLDLNADDLS---ANEQLVG-----PHA--SGVN-SILPKEHGSQFFYLPIIKHSDDE
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CCDS47 AA--------NIYNKQSFTQSLKRRISLKNIFYSCGVTYEIVSNIPKATEEIED------
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CCDS47 --RETLALLAARSENEGTSDGETYIEKYTRGVLQVENILSLERLRQAVTVKEALSTKARH
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. ..:: . :. ::. ::. .: : . :. . . : : : .
CCDS47 IRRSLST-----PNVHNVSSSRPDLSGFDEDDKGWPENQLDMSDYSSSYQDVACYGTLPR
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:. ... :.: . :.
CCDS47 DSPRR--NKEGCTSETPHALTVSPFKAFSPQPPKFFKPLMPVKEEHKKRIALEARPLLSQ
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CCDS47 DSPRR--NKEGCTSETPHALT-VSPFKAFSPQ-PPKFFKPLMPVKEEHKKRIALEARPLL
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CCDS47 SQESMPPPQAHNPGCIVPSGSNGSSMPVEHNSKR----EKKIDSEEEENELEAINRKLIS
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CCDS47 SQPYVPVEFADFSVYNASLENREWFSSKVDLSNSRVLEKEVSRSPTTSSITSGYFSHSAS
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CCDS55 ILWGNNHFFRLNLPKKKKKAEREDEDQDPSMKNENSSEQLDVDGDSSSEVSSEVNFNYEY
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]