Result of FASTA (ccds) for pF1KB0100
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0100, 1021 aa
  1>>>pF1KB0100 1021 - 1021 aa - 1021 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9403+/-0.000946; mu= -0.9146+/- 0.056
 mean_var=251.5374+/-53.597, 0's: 0 Z-trim(112.8): 276  B-trim: 144 in 1/53
 Lambda= 0.080867
 statistics sampled from 13247 (13543) to 13247 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.416), width:  16
 Scan time:  5.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7           (1022) 6985 829.1       0
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7          ( 729) 5012 598.8 1.3e-170
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984) 1894 235.1 5.5e-61
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3           ( 998) 1806 224.9 6.8e-58
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983) 1541 193.9 1.4e-48
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016) 1511 190.4 1.6e-47
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015) 1507 190.0 2.2e-47
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005) 1193 153.3 2.3e-36
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987) 1173 151.0 1.1e-35
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976) 1088 141.1 1.1e-32
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986) 1065 138.4 7.1e-32
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037)  898 118.9 5.4e-26
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004)  893 118.3 7.9e-26
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038)  893 118.3 8.1e-26
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987)  887 117.6 1.3e-25
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986)  882 117.1 1.9e-25
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055)  877 116.5   3e-25
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976)  837 111.8 7.2e-24
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6           ( 998)  827 110.6 1.6e-23
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1       (1008)  780 105.2 7.4e-22
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3          ( 539)  750 101.5 5.1e-21
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1          ( 495)  616 85.8 2.4e-16
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3        (1130)  599 84.1 1.8e-15
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19          ( 466)  588 82.5 2.2e-15
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19          ( 507)  588 82.6 2.4e-15
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19          ( 508)  588 82.6 2.4e-15
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15           ( 450)  534 76.2 1.7e-13


>>CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7                (1022 aa)
 initn: 5869 init1: 5869 opt: 6985  Z-score: 4418.2  bits: 829.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6985; 99.8% identity (99.9% similar) in 1022 aa overlap (1-1021:1-1022)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVSSVLALEEVLLDTTGETSEIGWLTYPPGGWDEVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVSSVLALEEVLLDTTGETSEIGWLTYPPGGWDEVS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 VLDDQRRLTRTFEACHVAGAPPGTGQDNWLQTHFVERRGAQRAHIRLHFSVRACSSLGVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLDDQRRLTRTFEACHVAGAPPGTGQDNWLQTHFVERRGAQRAHIRLHFSVRACSSLGVS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KB0 GGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSSSS-AAW
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS58 GGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSSSSSAAW
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB0 AVGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAFQDTGACLALVAVRLFSYTCPAVLRSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAFQDTGACLALVAVRLFSYTCPAVLRSF
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB0 ASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMVAVGGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMVAVGGC
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB0 RCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASS
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKASAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASS
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB0 DPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASG
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB0 GGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAI
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB0 NVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESHSFTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESHSFTLT
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB0 SETNTATVTQLSPGHIYGFQVRARTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPERLSLVIGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SETNTATVTQLSPGHIYGFQVRARTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPERLSLVIGS
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB0 ILGALAFLLLAAITVLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILGALAFLLLAAITVLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIR
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680       690       700       710         
pF1KB0 ELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGR
              670       680       690       700       710       720

     720       730       740       750       760       770         
pF1KB0 AAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGV
              730       740       750       760       770       780

     780       790       800       810       820       830         
pF1KB0 AAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARLGHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARLGHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHT
              790       800       810       820       830       840

     840       850       860       870       880       890         
pF1KB0 TSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQ
              850       860       870       880       890       900

     900       910       920       930       940       950         
pF1KB0 KDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSA
              910       920       930       940       950       960

     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KB0 IGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSV
              970       980       990      1000      1010      1020

    1020 
pF1KB0 EV
       ::
CCDS58 EV
         

>>CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7               (729 aa)
 initn: 5012 init1: 5012 opt: 5012  Z-score: 3176.3  bits: 598.8 E(32554): 1.3e-170
Smith-Waterman score: 5012; 99.9% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (293-1021:1-729)

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB0 VAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMVAVGGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLY
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75                               MVAVGGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLY
                                             10        20        30

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB0 KSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASSDPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQG
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KASAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASSDPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQG
               40        50        60        70        80        90

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB0 SALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASGGGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASGGGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTE
              100       110       120       130       140       150

            450       460       470       480       490       500  
pF1KB0 SRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASN
              160       170       180       190       200       210

            510       520       530       540       550       560  
pF1KB0 SITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESHSFTLTSETNTATVTQLSPGHIYGFQVRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESHSFTLTSETNTATVTQLSPGHIYGFQVRA
              220       230       240       250       260       270

            570       580       590       600       610       620  
pF1KB0 RTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPERLSLVIGSILGALAFLLLAAITVLAVVFQRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPERLSLVIGSILGALAFLLLAAITVLAVVFQRK
              280       290       300       310       320       330

            630       640       650       660       670       680  
pF1KB0 RRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIRELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIRELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFG
              340       350       360       370       380       390

            690       700       710       720       730       740  
pF1KB0 EVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSR
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pF1KB0 PLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVL
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pF1KB0 VNSHLVCKVARLGHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNSHLVCKVARLGHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPY
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pF1KB0 WDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKP
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pF1KB0 DTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQ
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            990      1000      1010      1020 
pF1KB0 LSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV
              700       710       720         

>>CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3               (984 aa)
 initn: 2546 init1: 729 opt: 1894  Z-score: 1208.4  bits: 235.1 E(32554): 5.5e-61
Smith-Waterman score: 3193; 48.0% identity (73.8% similar) in 1017 aa overlap (20-1015:6-978)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVSSVLALEEVLLDTTGETSEIGWLTYPPGGWDEVS
                          : .:::.:.: :.::.:.::   :.:.:: . : .::.:::
CCDS46               MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVS
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pF1KB0 VLDDQRRLTRTFEACHVAGAPPGTGQDNWLQTHFVERRGAQRAHIRLHFSVRACSSLGVS
         :..    ::...:.:   :   .:.::: : :..::::.: . ...:.:: ::::   
CCDS46 GYDENLNTIRTYQVCNVF-EP---NQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNV
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pF1KB0 GGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSSSSAAWA
        :.:.:::.::: ...   .  . . :    . :::::::::::          :.. . 
CCDS46 PGSCKETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESF----------SQVDF-
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pF1KB0 VGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAFQDTGACLALVAVRLFSYTCPAVLRSFA
             : :  ...:.. :::::::. :::.:::: :::..:..::.:   ::.....::
CCDS46 ------GGRL-MKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFA
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pF1KB0 SFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMVAVGGCR
        ::::. .:: ..::: : :::. .:: : :         : .:.:::.:.::: .: : 
CCDS46 VFPETM-TGAESTSLVIARGTCIPNAE-EVD--------VPIKLYCNGDGEWMVPIGRCT
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pF1KB0 CQPGYQPARGDKACQACPRGLYKSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASSD
       :.:::.: ... ::.::: : .:.:     :: ::. :..:  :.:.: :  :.:::. :
CCDS46 CKPGYEP-ENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEASPICTCRTGYYRADFD
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pF1KB0 PPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASGG
       :::. ::. ::.:...   :. ....:.:. ::: ::: :. .:..::.:.. ..     
CCDS46 PPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNIICKKCRADRR-----
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pF1KB0 GGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAIN
         .: :: :.:.: ::: :::: :: ...: ::.:: ...::.::::  :: ::: ...:
CCDS46 --SCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPFPPQHVSVN
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pF1KB0 VSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESHSFTLTS
       ..:.. .::.::..:::: .  :::.:::::.: :: ::::..:::.. ..: .:    :
CCDS46 ITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFNSSMARS
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pF1KB0 ETNTATVTQLSPGHIYGFQVRARTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPERLSLVIGSI
       .:::: .  : :: .:  ::::::.::.: ..::. :::: . . .:.: :.: :. :: 
CCDS46 QTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQLPLIAGSA
        490       500       510       520       530       540      

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pF1KB0 LGALAFLLLAAITVLAVVFQRKR---RGTGYTEQLQQYS----SPGLGVKYYIDPSTYED
        ....:..  .......: .:::   . . :...::.::    :::.  : :::: ::::
CCDS46 AAGVVFVV--SLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGM--KIYIDPFTYED
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pF1KB0 PCQAIRELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQ
       : .:.::.:.:.: ...:::::::.: :::: .:::.  :.::  :::..: :: .:. .
CCDS46 PNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEKQR
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pF1KB0 MTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLV
         ::..:...:::.::::.:::::::::::.:..::::: : ::::::: .:::. .:::
CCDS46 RDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLV
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pF1KB0 AMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARLGHS---------PQGPSCL
       .: ::.::.:.::. . .:::.:.:...::::.:::::. .: :         :   : :
CCDS46 GMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSL
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pF1KB0 -----LRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNAIEQEFR
            .::.:::.::. : :..:::::.::.::::::.:::::::::.:.:.:::::..:
CCDS46 GGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYR
            790       800       810       820       830       840  

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pF1KB0 LPPPPGCPPGLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPSQAL
       ::::  :: .:: :::: :::::  ::.: ..: ..:::::.: .:.. .     ::: :
CCDS46 LPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQPL
            850       860       870       880       890       900  

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pF1KB0 LTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQ
       :     ::  . . . ::::: .  :.:.:   :. ... :.:.. :::  .::::::::
CCDS46 LDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITLAGHQ
            910       920       930       940       950       960  

    1000      1010      1020 
pF1KB0 KKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV
       ::.:. :. .. .. :      
CCDS46 KKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
            970       980    

>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3                (998 aa)
 initn: 2560 init1: 813 opt: 1806  Z-score: 1152.9  bits: 224.9 E(32554): 6.8e-58
Smith-Waterman score: 3024; 47.0% identity (71.9% similar) in 1020 aa overlap (20-1021:26-998)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB0       MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVSSVLALEEVLLDTTGETSEIGWLTYPPG
                                : .::: ..  ::::.:.::   :::..: ..: .
CCDS32 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB0 GWDEVSVLDDQRRLTRTFEACHVAGAPPGTGQDNWLQTHFVERRGAQRAHIRLHFSVRAC
       ::.:::  :.     ::...:.:      ..:.:::.: :. :: .::....:.:.:: :
CCDS32 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRE----SSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDC
               70        80            90       100       110      

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pF1KB0 SSLGVSGGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSS
       .:.    :.:.:::.:.: .:.   .  :   :  . ..:::::: ::::   .      
CCDS32 NSIPNIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLD------
        120       130       140       150       160       170      

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB0 SSAAWAVGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAFQDTGACLALVAVRLFSYTCPA
                      :: ..:.: ::::::.. :::.:::: :::..:..:: :   : .
CCDS32 ---------------AG-RVNTKVRSFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCAS
                              180       190       200       210    

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB0 VLRSFASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMV
       .  .:: ::::  .::  .::: : :::. .:   : .:       : .:.:::.:.:::
CCDS32 TTAGFALFPETL-TGAEPTSLVIAPGTCIPNAV--EVSV-------PLKLYCNGDGEWMV
          220        230       240         250              260    

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB0 AVGGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGF
        ::.: :  :..::  .. :. :: : ::.. :..:: :::  :.. .::: .: : ..:
CCDS32 PVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQGEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNF
          270       280       290       300       310       320    

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB0 YRASSDPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQ
       :::.::  .. ::  :: :. .  .:. ..:.:.:  ::.:::: :::.::.::.:.:  
CCDS32 YRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLILEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHG--
          330       340       350       360       370       380    

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pF1KB0 EPASGGGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPP
          .::...: :: :.:.: ::: :::: :: .. : ::. : .:::::::::  :: ::
CCDS32 ---AGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLLAHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPP
               390       400       410       420       430         

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pF1KB0 QAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESH
       . ::.:..:.. .:: ::...  : ...:.:.::  :.. :: ::::...:....:  . 
CCDS32 RYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPPERPNGVILDYEMKYFEKSEGIAS
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         :.::. :.. .  : :   :  ::::::.::.: :.  . :.:  . :  ..:: :.:
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        :..::  ..:.:..  :..:.:.:  ::.: :.   :::.:::: .::.  : :::: :
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       :::: .:.::.:.:.: . .:::::::.: :::: .:::.  ::::  :::..: .: .:
CCDS32 YEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKQPGRREVFVAIKTLKVGYTE
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         .  ::..:...:::.::::.:::::::::::.:.::::::   ::::::  .:::. .
CCDS32 RQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFMENCALDSFLRLNDGQFTVI
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       :::.: ::.::.:.::: . .:::.:.:...::::.:::::. .: :      :. :   
CCDS32 QLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDPSDPTYT
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       : :     .::.:::.::. : :..:::::.::.::::::::::::::::.:.:.::.::
CCDS32 SSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVINAVEQ
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pF1KB0 EFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPS
       ..:::::  :: .:: :::: : .::  ::.:.:.: ..::.::.  .:.. ..     :
CCDS32 DYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNAASLKVIASAQSGMS
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pF1KB0 QALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLA
       : ::  .. :.  . .   ::.:: .  :...: . :. .:. :::.. :::  .:.:::
CCDS32 QPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFDLVAQMTAEDLLRIGVTLA
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pF1KB0 GHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV
       :::::.:  :: .. .. :   :.:
CCDS32 GHQKKILSSIQDMRLQMNQTLPVQV
           980       990        

>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3                (983 aa)
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pF1KB0 MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVS-SVL---------ALEEV-LLDTTGETSEIGWL
                      : :.: .:::.: :::           .:: :::.    .:.::.
CCDS29                MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWI
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       .::  ::.:.: .:..    ::...:.:       .:.:::.:..: : .::. ...:.:
CCDS29 SYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDH----SQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKF
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pF1KB0 SVRACSSLGVSGGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSS
       ..: :.:. .  :::.:::.::: ....    :   ... ...::.::::::::: . . 
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pF1KB0 YTCPAVLRSFASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGE
         :: .....: ::.:    .   ::: . :.:: ... :::         :::..:. :
CCDS29 KKCPFTVKNLAMFPDTVPMDS--QSLVEVRGSCVNNSK-EED---------PPRMYCSTE
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pF1KB0 GKWMVAVGGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCP
       :.:.: .: : :. ::.  ::   ::::  :.::.  ::  :. :: .: . . ..  : 
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pF1KB0 CLEGFYRASSDPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKE
       : ....::..:::   :: :::.:...  ... ....: :  : . ::: :. ::..::.
CCDS29 CENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKK
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       :    .        :. :  .:.: ::: :::.. : :  : ::. : .:..::::::::
CCDS29 CGWNIKQ-------CEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSEL
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pF1KB0 SPDPPQAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQA
       :  : : ::....:.. .:: : ....   . :::..:: .:.. :: ::::...::.. 
CCDS29 SSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQ
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       :.:.    : .. ...:...:.:  :: ::.:::::::.:  . :  :.: :..   :  
CCDS29 EQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSIS--
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pF1KB0 PERLSLVIGSILGALAFLLLAAIT-VLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGL---GVKYY
        :  ..:. .: .:.:..::...  ::   :   .   :  :.  ....  :   :.. :
CCDS29 GESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTY
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pF1KB0 IDPSTYEDPCQAIRELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALW
       .:: ::::: ::..:.:.:.: . :.:..:.:.: :::: .:::.  ...: .:::..: 
CCDS29 VDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLK
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pF1KB0 AGGAESLQMTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREG
       .: .:. .  :::.:...:::.::::.:::::::::.:.:..::.:: : ::::::....
CCDS29 VGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDA
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pF1KB0 QFSSLQLVAMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARLGHS------PQ
       ::. .:::.: ::.:..:.:::....:::.:.:...:.::.:::::. .: :      :.
CCDS29 QFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPE
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pF1KB0 ------GPSCLLRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNA
             : .  .::..::.::. : :..:::::.::..::::::::::::.::.:.:..:
CCDS29 AAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKA
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pF1KB0 IEQEFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGE
       ... .:::::  :: .:. :::: :::::  ::.:.:.:. .::.::.: .:.   . . 
CCDS29 VDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAA
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pF1KB0 RPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGI
       :::. ::    .:.  . .   ::...     .. :.     . . .:..: .:.  .:.
CCDS29 RPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGV
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pF1KB0 TLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV
       :..: :::..  :. :. .  ..: : :
CCDS29 TVVGPQKKIISSIKALETQ-SKNGPVPV
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>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4               (1016 aa)
 initn: 2335 init1: 678 opt: 1511  Z-score: 966.7  bits: 190.4 E(32554): 1.6e-47
Smith-Waterman score: 2608; 39.7% identity (69.4% similar) in 1037 aa overlap (6-1013:26-1009)

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                                :.  :   :     ::. ::. ..:        .:
CCDS75 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
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pF1KB0 V-LLDTTGETSEIGWLTYPPGGWDEVSVLDDQRRLTRTFEACHVAGAPPGTGQDNWLQTH
       : :::.    ...::...: .::.:.. .:..    .:...:.:       .:.::: : 
CCDS75 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVME----QNQNNWLLTS
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pF1KB0 FVERRGAQRAHIRLHFSVRACSSLGVSGGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWT
       ..  .::.:  :.:.:..: :.::  . :::.:::..:: .... ..     . . ... 
CCDS75 WISNEGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNG----RNIKENQYI
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pF1KB0 KVDTIAADESFPSSSSSSSSSSSAAWAVGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAF
       :.:::::::::   .                  :.:. ..::.. :. :::...:::.::
CCDS75 KIDTIAADESFTELD-----------------LGDRV-MKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAF
            180                        190        200       210    

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pF1KB0 QDTGACLALVAVRLFSYTCPAVLRSFASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGV
       ::.:::.:::.::..   ::.:.: .: ::.:  .:: ...:. . :.:: :.  .:   
CCDS75 QDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDT-ITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDE---
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              ::..::..::.:.: .: : :. ::.   :  .::.:  :..:.:     :. 
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       :: .:.. . :.  : : . ..:  ::::   :: :::::..   .:. ....:.:  : 
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        :: ::.:...:... .. :...  ..:: : :.  :.:. .: ::.:::::::.: .. 
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       .  :.: : .  .:.   .. ..  :.  ... .:::.  :..:... .:   ::..  :
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       : .:::.  :.::  :::..: .: .:. .  :::.:...:::.::::..::::::::.:
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       .:..::.:: : ::.::.. .:::. .:::.: ::..:.:.:::....:::.:.:...:.
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       ::.:::::. .: :      :.      : .  .::.:::.::  : :..:::::.::.:
CCDS75 NSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVM
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       :::.::::::::.:..:.:..:.:. .::: :  :: .:. :::: :::.:  ::.::..
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       :  .::.::.:..:..  . . : :. :     :      :   :: :: .  : . : .
CCDS75 VNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFME
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CCDS35 WISNEGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNG----RNIKENQYI
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       :.:::::::::   .                  :.:. ..::.. :. :::...:::.::
CCDS35 KIDTIAADESFTELD-----------------LGDRV-MKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAF
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CCDS35 QDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDT-ITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDE---
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CCDS35 VMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILI
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CCDS35 NGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL 
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>>CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1                 (1005 aa)
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CCDS22         MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAH
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       ::: .. .:.. .  .:...:.:  .:   .:.:::.: .: : ::.:.. ...:..: :
CCDS22 GWDSINEVDESFQPIHTYQVCNVM-SP---NQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDC
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       .:.    :::.:::.::: ....    :  .: . ... :.::::::::: ...      
CCDS22 NSMPGVLGTCKETFNLYYLESDR----DLGASTQESQFLKIDTIAADESFTGAD------
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CCDS22 -----------LGVRR-LKLNTEVRSVGPLSKRGFYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPA
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       ..:..:.: :. ..:: ..::: . : :: :.: :.:          :...:..::.:.:
CCDS22 MVRNLAAFSEA-VTGADSSSLVEVRGQCVRHSE-ERD---------TPKMYCSAEGEWLV
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        .: : :. ::.  :   :: ::  :.:::. :.  :. :: .::.  ::: .: :  ..
CCDS22 PIGKCVCSAGYEERR--DACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSAAPAAQACHCDLSY
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       :::. ::: . :: ::::: .:   :.:... :.:  : . :::.:. .:.::..:    
CCDS22 YRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDITYNAVCRRC----
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CCDS22 -PWAL--SRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSDLSPEPR
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pF1KB0 QAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESH
       .::..:..:.. .:: : :..:   ...:... : .:.: :: ::.:...::.. .. . 
CCDS22 RAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQERAGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYEIKYYEKDKEMQS
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         :: . :. :::. :.::  : :::::::.:: : ..  .  .:   :.   .   :  
CCDS22 YSTLKAVTTRATVSGLKPGTRYVFQVRARTSAGCGRFSQAMEVET---GKPRPRYDTRTI
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CCDS22 PGQRDVPVAIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYM
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CCDS22 ENGSLDTFLRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDSNLVCKV
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       . .: :      :.      : .  .::.:::.::    ...:::::::..::::..:::
CCDS22 SDFGLSRVLEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGE
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CCDS22 RPYWNMTNRDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVLDALI
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pF1KB0 RKPDTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLD-----------SPQAWLSAIGLECYQDN
       :.:..:.: .  .. :      : :.   :.:           .   ::..: .  :.:.
CCDS22 RSPESLRATATVSRCP------PPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDSIRMGRYRDH
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pF1KB0 FSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQ-QGSVEV 
       :.  :  ... : ... .:. :::::: :::::.:  :: .. .: . ::     
CCDS22 FAAGGYSSLGMVLRMNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGPRRHL
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CCDS57                  MELRVLLCWASLAAALEETLLNTKLETADLKWVTFPQVDGQWE
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CCDS57 ELSGLDEEQHSVRTYEVCDVQRAP---GQAHWLRTGWVPRRGAVHVYATLRFTMLECLSL
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pF1KB0 GVSGGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSSSSA
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CCDS57 PRAGRSCKETFTVFYYESDADTATALTPAWMENPYIKVDTVAAEHL--------TRKRPG
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CCDS57 AEATG----------KVNVKTLRLGPLSKAGFYLAFQDQGACMALLSLHLFYKKCAQLTV
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       ... ::::         .: ..:.::. : :        : :  : :.:  .:.:    :
CCDS57 NLTRFPETVPR----ELVVPVAGSCVVDAVP--------APGPSPSLYCREDGQWAEQPV
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        :: : ::.. :.:.  :.:: .: .:  .:.. :.:::: ::. . .. :: :  :..:
CCDS57 TGCSCAPGFEAAEGNTKCRACAQGTFKPLSGEGSCQPCPANSHSNTIGSAVCQCRVGYFR
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pF1KB0 ASSDPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEP
       : .::  :::: :::::. .  ...::.: :.:  : : ::: :: . . :.::.    :
CCDS57 ARTDPRGAPCTTPPSAPRSVVSRLNGSSLHLEWSAPLESGGREDLTYALRCRECR----P
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CCDS57 ----GGSCAPCGGDLTFDPGPRDLVEPWVVVRGLRPDFTYTFEVTALNGVSSLATGPVPF
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         .::.:..::: ::  . .:.:.: .:....:  :   .: .:::...:... ::  : 
CCDS57 EPVNVTTDREVPPAVSDI-RVTRSSPSSLSLAWAVPRAPSGAVLDYEVKYHEKGAEGPSS
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CCDS57 VRFLKTSENRAELRGLKRGASYLVQVRARSEAGYGPFGQEHHSQT--QLDESEGWREQLA
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pF1KB0 LVIGS-ILGALAFLLLAAITVLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYED
       :. :. ..:..  :.. ...:: .  : . : . :...  ::   : :.: :::: ::::
CCDS57 LIAGTAVVGVVLVLVVIVVAVLCLRKQSNGREAEYSDKHGQYLI-GHGTKVYIDPFTYED
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CCDS57 PNEAVREFAKEIDVSYVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKAPGKKESCVAIKTLKGGYTERQR
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CCDS57 REFLSEASIMGQFEHPNIIRLEGVVTNSMPVMILTEFMENGALDSFLRLNDGQFTVIQLV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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