Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0179
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0179, 1220 aa
1>>>pF1KB0179 1220 - 1220 aa - 1220 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8676+/-0.00118; mu= 16.4816+/- 0.070
mean_var=178.7976+/-34.921, 0's: 0 Z-trim(106.4): 169 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.095917
statistics sampled from 8789 (8963) to 8789 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 5.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 8040 1126.7 0
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 7542 1057.8 0
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 2590 372.5 3.1e-102
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 2545 366.3 2.6e-100
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 2145 310.8 8.8e-84
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 1880 274.0 9e-73
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 1407 208.6 4.4e-53
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 1405 208.3 5.5e-53
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 1222 183.2 3.2e-45
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10 ( 743) 1161 174.6 8.3e-43
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2 ( 717) 999 152.1 4.5e-36
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 913 140.2 1.7e-32
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 913 140.3 1.8e-32
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 693 110.0 3.2e-23
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 610 98.6 1.1e-19
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 595 96.4 3.8e-19
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 558 91.4 1.5e-17
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 530 87.5 2.3e-16
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 518 85.9 7.7e-16
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 487 81.5 1.3e-14
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 408 70.7 2.9e-11
>>CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220 aa)
initn: 8040 init1: 8040 opt: 8040 Z-score: 6024.0 bits: 1126.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8040; 100.0% identity (100.0% similar) in 1220 aa overlap (1-1220:1-1220)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 TTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 VLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 DRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRSQSPPKDRKDRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRSQSPPKDRKDRDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 YGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 RREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 ETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQS
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CCDS11 EETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 ALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 HAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 YLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 MTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 DAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 TGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 IAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 RLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 LYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 PKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 QMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 LFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KB0 LYNRYEEPNAWRISRAFRRR
::::::::::::::::::::
CCDS11 LYNRYEEPNAWRISRAFRRR
1210 1220
>>CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181 aa)
initn: 7542 init1: 7542 opt: 7542 Z-score: 5651.7 bits: 1057.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7542; 100.0% identity (100.0% similar) in 1147 aa overlap (1-1147:1-1147)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 TTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 VLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 DRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRSQSPPKDRKDRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRSQSPPKDRKDRDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 YGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 RREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNE
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370 380 390 400 410 420
pF1KB0 ETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQS
430 440 450 460 470 480
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pF1KB0 ALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKK
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pF1KB0 HAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQ
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pF1KB0 YLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKY
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670 680 690 700 710 720
pF1KB0 MTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATL
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730 740 750 760 770 780
pF1KB0 DAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 TGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATN
790 800 810 820 830 840
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pF1KB0 IAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCY
850 860 870 880 890 900
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pF1KB0 RLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 LYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB0 PKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB0 QMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB0 LFNRQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEP
:::::::
CCDS77 LFNRQPECPKHFLPVVAVAVSLEQCLSKFEDLNKELGLVTC
1150 1160 1170 1180
>>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041 aa)
initn: 2652 init1: 1960 opt: 2590 Z-score: 1949.0 bits: 372.5 E(32554): 3.1e-102
Smith-Waterman score: 2604; 48.7% identity (75.2% similar) in 855 aa overlap (383-1199:189-1039)
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 NLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWE--IKQMIAANV
: . :. : : :: . .: :.. :.
CCDS46 ESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLER-SDKKAYEEAQKRLKMAEE
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460
pF1KB0 LSKEEFPDFDEETG--ILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPF----LRGHTKQSMDMSPIKI
: :.. ... : : . :. :::: ::..:: : : : .: . .. .
CCDS46 DRKAMVPELRKKSRREYLAKREREKLEDLEAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYK--RR
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510
pF1KB0 VKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREA---------EMDSIPMGLNKHWVDPLPD
:.. :. ... : .: .. . : : .. : ...: .
CCDS46 VRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLG
280 290 300 310 320 330
520 530 540 550 560
pF1KB0 AE----GRQIAANMRG---IGMMPNDIPEW-KKHAFGGNK------ASYGKKTQMSILEQ
: : . ::... . . .. :. . . :.. .: . . ::
CCDS46 AASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAV
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KB0 RESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRG-KIGCTQPRR
:.:::.. ..:.:. :. ..:.::. ::::::::::: ::: : :::..: ::.::::::
CCDS46 RRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRR
400 410 420 430 440 450
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CCDS46 YIRVRKAITAGYFYHTARLT-RSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTK
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CCDS46 EFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG
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CCDS33 SVQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFM
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CCDS11 GSGKTTQIPQYLYEGGISRQGIIAVTQPRRVAAISLATRVSDEKRTELGKLVGYTVRFDD
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CCDS11 VTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHERTIHTDVLFGVVKAAQKRRKE
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CCDS11 LGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPIQVFYTKQPQNDYLHAALVSVF
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CCDS11 QIHQEAPSSQDILVFLTGQEEIEAMSKTCRDIAKHLPDGCPAMLVLPLYASLPYAQQLRV
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CCDS11 FQGAPKGYRKVIISTNIAETSITITGIKYVVDTGMVKAKKYNPDSGLEVLAVQRVSKTQA
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CCDS11 FDFMSKPSPDHIQAAIAQLDLLGALEHKDDQLTLTPMGRKMAAFPLEPKFAKTILMSPKF
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CCDS11 HCTEEILTIVSLLSVDSVLHNPPSRREEVQGVRKKFISSEGDHMTLLNIYRTFKNLGGNK
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CCDS11 DWCKENFVNSKNMTLVAEVRAQLRDICLKMSMPIASSRGDVESVRRCLAHSLFMSTAELQ
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CCDS54 GFFANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAI
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CCDS54 ESAWLLELAPHFYQ--QGTHLSLKAKRAKVQDP
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CCDS13 ENS----------GTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVIVGETG
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CCDS13 CGKSTQIPQYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRFDD
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CCDS13 TVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAGLP
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CCDS13 DNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLES
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CCDS13 GNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIKHN
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CCDS13 ARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAWLL
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CCDS13 ELAPHFYQ--QGTHLSLKAKRAKVQDP
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CCDS12 SIPALADLPRTYDPRYRINLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQA
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CCDS12 FGRLAKLQ--RERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFS-
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CCDS12 --HVACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQ
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CCDS12 SNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLV
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CCDS12 FLSGMAEISA----VLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILS
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CCDS12 CFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAI
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CCDS12 LYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPF
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CCDS12 TRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLY
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CCDS76 GDAKCGKSAQVPQWCAEYCLSIHYQHGGVICTQVHKQTVVQLALRVADEMDVNIGHEVGY
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CCDS76 VIPFENCCTNETILRYCTDDMLQREMMSNPFLGSYGVIILDDIHERSIATDVLLGLLKDV
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CCDS76 LLARPELKLIINSSPHLISKLNSYYGNVPVIEVKNK-HPVEVVYLSEAQKDSFESILRLI
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CCDS76 FEIHHSGEKGDIVVFLACEQDIEKVCETVYQG-SNLNPDLGELVVVPLY---PKE-KCSL
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CCDS76 FKPLDETEKRCQVYQRRVVLTTSSGEFLIWSNSVRFVIDVGVERRKVYNPRIRANSLVMQ
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CCDS76 PISQSQAEIRKQILGSSSSGKFFCLYTEEFASKDMTPLKPAEMQEANLTSMVLFMKRIDI
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CCDS76 AGLGHCDFMNRPAPESLMQALEDLDYLAALDNDGNLSEFGIIMSEFPLDPQLSKSILASC
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CCDS76 EFDCVDEVLTIAAMVTAPNCFSHVPHGAEEAALTCWKTFLHPEGDHFTLISIYKAYQDTT
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CCDS76 LNSSSEYCVEKWCRDYFLNCSALRMADVIRAELLEIIKRIELPYAEPAFGSKENTLNIKK
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CCDS76 ALLSGYFMQIARDVDGSGNYLMLTHKQVAQLHPLSGYSITKKMPEWVLFHKFSISENNYI
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CCDS76 RITSEISPELFMQLVPQYYFSNLPPSESKDILQQVVDHLSPVSTMNKEQQMCETCPETEQ
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CCDS76 RCTLQ
740
1220 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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