FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0207, 1023 aa 1>>>pF1KB0207 1023 - 1023 aa - 1023 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6081+/-0.00101; mu= 19.7892+/- 0.061 mean_var=66.8812+/-13.585, 0's: 0 Z-trim(103.7): 27 B-trim: 84 in 2/50 Lambda= 0.156828 statistics sampled from 7515 (7529) to 7515 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16 Scan time: 2.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34627.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (1023) 6956 1583.5 0 CCDS55107.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (1019) 6822 1553.2 0 CCDS7234.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (1010) 5380 1226.9 0 CCDS44390.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 ( 953) 5095 1162.4 0 CCDS44391.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 ( 801) 4652 1062.2 0 CCDS47580.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 ( 427) 2682 616.3 4.2e-176 CCDS7087.1 DHTKD1 gene_id:55526|Hs108|chr10 ( 919) 1554 361.3 5.5e-99 >>CCDS34627.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (1023 aa) initn: 6956 init1: 6956 opt: 6956 Z-score: 8495.3 bits: 1583.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6956; 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CCDS72 SPRFMTILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF 960 970 980 990 1000 1010 >>CCDS44390.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (953 aa) initn: 5077 init1: 4000 opt: 5095 Z-score: 6220.2 bits: 1162.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5095; 81.2% identity (95.4% similar) in 884 aa overlap (137-1020:67-949) 110 120 130 140 150 160 pF1KB0 VAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADII ..::::::::::::::::::::: ::.:.: CCDS44 PATFPSSKGGGGSSYMEEMYFAWLENPQSVHKIRGHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLI 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KB0 SSTDKLGFYGLDESDLDKVFHLPTTTFIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFIN .. :::.:: :.:.:::: :.:::::::::.:..: ::::::::: .::::::.:::::: CCDS44 TTIDKLAFYDLQEADLDKEFQLPTTTFIGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFIN 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KB0 DLEQCQWIRQKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVL :.::::::::::::::.:::..::::::::::::: :::.:: ::::::::::::::::. CCDS44 DVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKRTLLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVM 160 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 pF1KB0 IPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGD ::::::::::::: :.. ::.:::::::::::::::::.::::::::: ::::::::::: CCDS44 IPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHRGRLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGD 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 400 pF1KB0 VKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSI :::::::::.::::::.::::::::::::::::.::::.::::::::: ::..::::::: CCDS44 VKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVANPSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSI 280 290 300 310 320 330 410 420 430 440 450 460 pF1KB0 LLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVAR :.::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 LVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSYTTNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVAR 340 350 360 370 380 390 470 480 490 500 510 520 pF1KB0 VVNAPIFHVNSGDPEAVMYVCKVAAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLM ::::::::::. :::::.:::.::::::.::.:::::::::::: ::::::::::::::: CCDS44 VVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAEWRNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLM 400 410 420 430 440 450 530 540 550 560 570 580 pF1KB0 YKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQPEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLD ::::..: :::.:::. :...:.:. :.::::.:::.:::::..::::.:::::::::: CCDS44 YKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTLQEFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLD 460 470 480 490 500 510 590 600 610 620 630 640 pF1KB0 SPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTEDILTHIGNVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGEMV :::::::..::.:.::.::.::. ::.:::::.::::::.:.: :: ::::::. :..:. CCDS44 SPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPEDMLTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMT 520 530 540 550 560 570 650 660 670 680 690 700 pF1KB0 KNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHL ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::.::::: CCDS44 KNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHL 580 590 600 610 620 630 710 720 730 740 750 760 pF1KB0 WPNQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGFAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQ ::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :: CCDS44 WPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGYAMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQ 640 650 660 670 680 690 770 780 790 800 810 820 pF1KB0 AKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPDLKEANFDINQLYDCN :::::.::::::::::::::::::::::::::::: ::: :. : . . .:...:::::: CCDS44 AKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSARPERFLQMSNDDSDAYPAFTK-DFEVSQLYDCN 700 710 720 730 740 750 830 840 850 860 870 880 pF1KB0 WVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARSSFDEMLPGTHFQRVIP :.:::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:. :: :::::: CCDS44 WIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIP 760 770 780 790 800 810 890 900 910 920 930 940 pF1KB0 EDGPAAQNPENVKRLLFCTGKVYYDLTRERKARDMVGQVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQ ::: ::. ::.:.::.::::::::::..::...:. .:::::.::.:::::::. .:.. CCDS44 EDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLVKERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAE 820 830 840 850 860 870 950 960 970 980 990 1000 pF1KB0 KYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPRLRTTISRAKPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTEL :::.::::::::::::.:::::..::. : . ::.:.::.::::::::::::..:::. : CCDS44 KYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRFMTILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSL 880 890 900 910 920 930 1010 1020 pF1KB0 QRLLDTAFDLDVFKNFS ...:::::.:..:. CCDS44 KKFLDTAFNLQAFEGKTF 940 950 >>CCDS44391.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (801 aa) initn: 4634 init1: 3557 opt: 4652 Z-score: 5679.7 bits: 1062.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4652; 81.8% identity (95.6% similar) in 798 aa overlap (223-1020:1-797) 200 210 220 230 240 250 pF1KB0 FIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFETPGIMQFTNEEKR :::::.::::::::::::::.:::..:::: CCDS44 MFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKR 10 20 30 260 270 280 290 300 310 pF1KB0 TLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHR ::::::::: :::.:: ::::::::::::::::.::::::::::::: :.. ::.::::: CCDS44 TLLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHR 40 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 pF1KB0 GRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLSLVA ::::::::::::.::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::.::::::::: CCDS44 GRLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVA 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KB0 NPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIVYETFHLSDLPSY :::::::.::::.::::::::: ::..::::::::.::::::::::.::::::::::::: CCDS44 NPSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSY 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 490 pF1KB0 TTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSGDPEAVMYVCKVAAE ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::.:::.:::: CCDS44 TTNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAE 220 230 240 250 260 270 500 510 520 530 540 550 pF1KB0 WRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGVVNQ ::.::.:::::::::::: :::::::::::::::::::..: :::.:::. :...:.:. CCDS44 WRNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTL 280 290 300 310 320 330 560 570 580 590 600 610 pF1KB0 PEYEEEISKYDKICEEAFARSKDEKILHIKHWLDSPWPGFFTLDGQPRSMSCPSTGLTED :.::::.:::.:::::..::::.:::::::::::::::::..::.:.::.::.::. :: CCDS44 QEFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPED 340 350 360 370 380 390 620 630 640 650 660 670 pF1KB0 ILTHIGNVASSVPVENFTIHGGLSRILKTRGEMVKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHIR .:::::.::::::.:.: :: ::::::. :..:.::::::::::::::::::::::::.: CCDS44 MLTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVR 400 410 420 430 440 450 680 690 700 710 720 730 pF1KB0 LSGQDVERGTFSHRHHVLHDQNVDKRTCIPMNHLWPNQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGF :::::::::::::::::::::.::.:::.:::::::.::::::::::::::::::::::. CCDS44 LSGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGY 460 470 480 490 500 510 740 750 760 770 780 790 pF1KB0 AMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFICPGQAKWVRQNGIVLLLPHGMEGMGPEHSS :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::: CCDS44 AMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSS 520 530 540 550 560 570 800 810 820 830 840 850 pF1KB0 ARPERFLQMCNDDPDVLPDLKEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLPFRK ::::::::: ::: :. : . . .:...:::::::.:::::::.:.:::::::::::::: CCDS44 ARPERFLQMSNDDSDAYPAFTK-DFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRK 580 590 600 610 620 860 870 880 890 900 910 pF1KB0 PLIIFTPKSLLRHPEARSSFDEMLPGTHFQRVIPEDGPAAQNPENVKRLLFCTGKVYYDL ::::::::::::::::.::::.:. :: ::::::::: ::. ::.:.::.:::::::::: CCDS44 PLIIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDL 630 640 650 660 670 680 920 930 940 950 960 970 pF1KB0 TRERKARDMVGQVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYVKPR ..::...:. .:::::.::.:::::::. .:..:::.::::::::::::.:::::..:: CCDS44 VKERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPR 690 700 710 720 730 740 980 990 1000 1010 1020 pF1KB0 LRTTISRAKPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFDLDVFKNFS . : . ::.:.::.::::::::::::..:::. :...:::::.:..:. CCDS44 FMTILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF 750 760 770 780 790 800 >>CCDS47580.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (427 aa) initn: 2710 init1: 2682 opt: 2682 Z-score: 3275.2 bits: 616.3 E(32554): 4.2e-176 Smith-Waterman score: 2682; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYSAPVAAEPFLSGTSSNYVEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MFHLRTCAAKLRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYSAPVAAEPFLSGTSSNYVEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 MYCAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLPLSRGSLAAVAHAQSLVEAQPNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MYCAWLENPKSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLPLSRGSLAAVAHAQSLVEAQPNV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 DKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLDES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 DKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLDES 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 DLDKVFHLPTTTFIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 DLDKVFHLPTTTFIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFET 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 PGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 PGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSEN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 GVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 GVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 VTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVMSILLHGDAAFAGQGIV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VTDRNITLSLVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVRPRERRARQIVKAPCSS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 YETFHLSDLPSYTTHGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNSGDP CCDS47 MEFRSPT >>CCDS7087.1 DHTKD1 gene_id:55526|Hs108|chr10 (919 aa) initn: 1842 init1: 554 opt: 1554 Z-score: 1890.6 bits: 361.3 E(32554): 5.5e-99 Smith-Waterman score: 2007; 38.9% identity (66.8% similar) in 923 aa overlap (115-1014:42-918) 90 100 110 120 130 140 pF1KB0 AGAPPGTAYQSPLPLSRGSLAAVAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIRAYQIRGHHV : : ... :: .. :. .: .::.. CCDS70 GLGRALPLFWRGYQTERGVYGYRPRKPESREPQGALERPPVDH-GLARLVTVYCEHGHKA 20 30 40 50 60 70 150 160 170 180 190 200 pF1KB0 AQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLDESDLDKVFHLPTTTFIGGQESALPLR :...:: .: :.. :: . .: .. :. :: .: .:..: . CCDS70 AKINPLFTGQALLEN-VPE----------IQALVQT-LQGPFHTAGLLNMGKEEASL--E 80 90 100 110 210 220 230 240 250 260 pF1KB0 EIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFETPGIMQFTNEEKRTLLARLVRSTRF :.. :.. :: .:..: ... .. .:. ..:: ::.::.. : ...: .: CCDS70 EVLVYLNQIYCGQISIETSQLQSQDEKDWFAKRFEELQKETFTTEERKHLSKLMLESQEF 120 130 140 150 160 170 270 280 290 300 310 320 pF1KB0 EEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGMPHRGRLNVLANVIRK ..:: :.:. ::.: :: : .. .. .. :. .:. ::.:::::::::.:..... 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CCDS70 AVLGFEYGMSIESPKLLPLWEAQFGDFFNGAQIIFDTFISGGEAKWLLQSGIVILLPHGY 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 840 pF1KB0 EGMGPEHSSARPERFLQMCNDDPDVLPDLKEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLR .: ::.::: : ::::::: : : . : . . : ::. .::...::.:: CCDS70 DGAGPDHSSCRIERFLQMC--------DSAEEGVDGDTV---NMFVVHPTTPAQYFHLLR 710 720 730 740 750 850 860 870 880 890 900 pF1KB0 RQILLPFRKPLIIFTPKSLLRHPEARSSFDEMLPGTHFQRVIPEDGPAAQNPENVKRLLF ::.. ::::::. .:: ::: : : :...:: ::: :. :: : .. .:..:: :.: CCDS70 RQMVRNFRKPLIVASPKMLLRLPAAVSTLQEMAPGTTFNPVI---GDSSVDPKKVKTLVF 760 770 780 790 800 910 920 930 940 950 960 pF1KB0 CTGKVYYDLTRERKARDMVGQ-VAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNA-ELAWCQEEHK :.:: .:.:...:.. . :: :.:.: :::.: : .:..:: .. . : ::: . CCDS70 CSGKHFYSLVKQRESLGAKKHDFAIIRVEELCPFPLDSLQQEMSKYKHVKDHIWSQEEPQ 810 820 830 840 850 860 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB0 NQGYYDYVKPRLRTTISRAKPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFDLDVFKN :.: ...:.::.. . : . .:: : .::.: .:: . . .: .: CCDS70 NMGPWSFVSPRFEKQL--ACKLRLVGRPPLPVPAVGIGTVHLHQHEDILAKTFA 870 880 890 900 910 pF1KB0 FS 1023 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 11:44:07 2016 done: Thu Nov 3 11:44:07 2016 Total Scan time: 2.980 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]