FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0356, 1068 aa
1>>>pF1KB0356 1068 - 1068 aa - 1068 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7929+/-0.00112; mu= 19.0204+/- 0.067
mean_var=71.1310+/-14.720, 0's: 0 Z-trim(102.1): 28 B-trim: 175 in 1/49
Lambda= 0.152070
statistics sampled from 6778 (6802) to 6778 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3 (1068) 7313 1614.6 0
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CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1 (1044) 1854 416.9 1.1e-115
CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7 (1102) 1823 410.1 1.3e-113
CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1 (1634) 1249 284.3 1.5e-75
CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1445) 1115 254.9 9.6e-67
CCDS73452.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1486) 1115 254.9 9.9e-67
CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686) 1013 232.5 6e-60
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CCDS55638.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 801) 415 101.2 9.7e-21
CCDS81376.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 816) 415 101.2 9.9e-21
CCDS993.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 828) 415 101.2 1e-20
CCDS33603.2 PI4KA gene_id:5297|Hs108|chr22 (2102) 286 73.0 7.5e-12
>>CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3 (1068 aa)
initn: 7313 init1: 7313 opt: 7313 Z-score: 8662.7 bits: 1614.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7313; 100.0% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
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CCDS43 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPMD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPL
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pF1KB0 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN
1030 1040 1050 1060
>>CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3 (1070 aa)
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Smith-Waterman score: 2569; 40.7% identity (69.1% similar) in 1096 aa overlap (1-1064:7-1066)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MPPRPSSG-ELWGIHLM---PPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELF
::: .. ..:.. . : :. :::.:. . :: ::::. ::. :.
CCDS31 MCFSFIMPPAMADILDIWAVDSQIASDGSIPVDFLLPTGIYIQLEVPREATISYIKQMLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KB0 KEARKYPLHQLLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREE
:....::. .::.: .::.:. :.: : ::. ::::::::.: : : ::.. . :
CCDS31 KQVHNYPMFNLLMDIDSYMFACVNQTAVYEELEDETRRLCDVRPFLPVLKLVTRSCDPGE
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120 130 140 150 160
pF1KB0 KILNREIGFAIGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAV-DLRDLNSPHSRAMYVYPP
: :. .:: :: . ::: .:::::..:::.. . .: . .: : : . .:::
CCDS31 K-LDSKIGVLIGKGLHEFDSLKDPEVNEFRRKMRKFSEEKILSLVGL-SWMDWLKQTYPP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 NVESSPELPKHIYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKT
: : .:... .:: :..::. : .: .. ...... . : .: ::.:.
CCDS31 --EHEPSIPENLEDKLYGGKLIVA----VHFENCQDVFSFQVSPNMNPIKVNELAIQKR-
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 RSMLLSSEQLKLCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMA
. . ... . : :. :.:.: : :: . .:: :..:::.:.: .:...:.
CCDS31 --LTIHGKEDE--VSPYD--YVLQVSGRVEYVFGDHPLIQFQYIRNCVMNRALPHFILVE
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pF1KB0 KESLYSQLPMDCFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTK---SLWVINSALRIKILCATYVNV
.. .. .. ... . : :. : .:. .: :. ..: .. .. ..
CCDS31 CCKIKKMYEQEMIAIEAAINRNSSNLPLPLPPKKTRIISHVWENNNPFQIVLVKGN--KL
290 300 310 320 330 340
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pF1KB0 NIRDIDKIYVRTGIYHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPR-WNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLS
: .. :..::.:..:: : :: .. ...: .: . ::: :..:: : :::: ::::..
CCDS31 NTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTIVSSEVSGKNDHIWNEPLEFDINICDLPRMARLCFA
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440
pF1KB0 ICSV----KGRKGAK--------------EEHCPLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWP
. .: : .:..: . : :.:: : .::. : .: . :. :
CCDS31 VYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYPVAWVNTMVFDFKGQLRTGDIILHSWS
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pF1KB0 -VPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPC-LELEF-DWFSSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREA
: ::..:::.:.. .:: :. :...: . .. .: .. : :.: .: ..
CCDS31 SFPDELEEMLNPMGTVQTNPYTENATALHVKFPENKKQPYYYPPFDKIIEKAAEIASSDS
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pF1KB0 GFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPLSEITEQEKDFLWSHRHYCVTI-PE
:..:.: .. . : :: : :::::.. :.: :..:. :. : : :.
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pF1KB0 ILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAMELLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYL
:::::::.:::. ..:::. :.. :: . :..:.:::: :::: .:: .:: :: . .
CCDS31 SLPKLLLSIKWNKLEDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLDFNYPDQYVREYAVGCL-RQM
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pF1KB0 TDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTNQRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQR
.:..:::::.::::::::: .:: : ::::..:: :.:::.:.::::.::.: .:: .
CCDS31 SDEELSQYLLQLVQVLKYEPFLDCALSRFLLERALGNRRIGQFLFWHLRSEVHIPAVSVQ
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pF1KB0 FGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILKQEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPD
::..::.:::. ..: :..::::..:: .:....: . .. . . ...
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pF1KB0 FMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKN
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CCDS31 YREALSDLQSPLNPCVILSELYVEKCKYMDSKMKPLWLVYNNK-VFGE---DSVGVIFKN
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pF1KB0 GDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLSIGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCK
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CCDS31 GDDLRQDMLTLQMLRLMDLLWKEAGLDLRMLPYGCLATGDRSGLIEVVSTSETIADIQLN
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pF1KB0 GG-LKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRSCAGYCVATFILGIGDRHNSNIM
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CCDS31 SSNVAAAAAFNKDALLNWLKEYNSGDDLDRAIEEFTLSCAGYCVASYVLGIGDRHSDNIM
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pF1KB0 VKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDFLIVISKGAQECTKTREFERFQE
:: ::::::::::.: . :.::: :::::::.:: ::. ::..: . .:..: ::..
CCDS31 VKKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFGIKRERVPFILTYDFIHVIQQG--KTGNTEKFGRFRQ
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CCDS31 CCEDAYLILRRHGNLFITLFALMLTAGLPELTSVKDIQYLKDSLALGKSEEEALKQFKQK
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pF1KB0 MNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN
...: . .::::..:. ::...
CCDS31 FDEALRESWTTKVNWMAHTVRKDYRS
1050 1060 1070
>>CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1 (1044 aa)
initn: 2277 init1: 528 opt: 1854 Z-score: 2190.2 bits: 416.9 E(32554): 1.1e-115
Smith-Waterman score: 2582; 40.3% identity (68.6% similar) in 1081 aa overlap (1-1064:1-1040)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MPPRPSSG-ELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLH
::: . :.: . ..:. :::.:. ... :.:.: :::. :...:. ::
CCDS10 MPPGVDCPMEFW-TKEENQSVVVDFLLPTGVYLNFPVSRNANLSTIKQLLWHRAQYEPLF
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pF1KB0 QLLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGF
..:. .:.:. ..: ::..:. :: :::::.. : : :... :.: .:..: .:..
CCDS10 HMLSGPEAYVFTCINQTAEQQELEDEQRRLCDVQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB0 AIGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPK
:: . ::: . ::::.::: .. . :.::. :. . .. .: .: ..: : .
CCDS10 LIGKGLHEFDSLCDPEVNDFRAKMCQFCEEAAARRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPSAQTWG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB0 HIYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQL
.: . ..: :. .......:.... :: ..: :.:::. .
CCDS10 PGTLRLPNRALLVN----VKFEGSEESFTFQVSTKDVPLALMACALRKKATV-------F
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pF1KB0 KLCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPM
. ..: : :.: : ::. .::: :..:: ::. : :.: .. . :. ..
CCDS10 RQPLVEQPEDYTLQVNGRHEYLYGSYPLCQFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDE
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pF1KB0 DCFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTG
. :. .. . : . :. ::: ... .::... .. ::.. : :. :..:
CCDS10 QSNPAPQVQKPRAKPPPIPAKKPSSVSLWSLEQPFRIELIQGSKVNADERM--KLVVQAG
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pF1KB0 IYHGGEPLCDNVNTQRVP-CSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSV-----KGR-
..::.: :: .:....: ::.: :.. :..:: : :::: ::::... .: :.:
CCDS10 LFHGNEMLCKTVSSSEVSVCSEPVWKQRLEFDINICDLPRMARLCFALYAVIEKAKKARS
350 360 370 380 390 400
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pF1KB0 --KGAKEEHCPLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWP-VPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKE
: .:. ::.::.:. :::: : : .:. : .:: :: .:::: :.. :::: .
CCDS10 TKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELLNPTGTVRSNPNTD
410 420 430 440 450 460
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pF1KB0 TPCLELEFDWFSSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNE---LREN
. : . .:. . : . . : . .:.: .: . :.
CCDS10 SAAALL--------ICLPE---VAPHPVYYPALEKIL---------ELGRHSECVHVTEE
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.. ::. : : .:. :.:::..:. :: .:: : .::: .:::....::::
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CCDS10 KNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKT
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CCDS10 LMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVS
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pF1KB0 QHALN
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CCDS10 KDNRQ
1040
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CCDS57 EFTRRGLVTPRMAEVASRD---PKLYAMH---PWVTSKP-LPEYLWKKIANNCIFIVI--
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CCDS57 REVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSDENVRAIAVQKLES-LEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPY
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CCDS57 LNHWLKEKSPTEEKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNLFHIDFG
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CCDS57 HILGNYKSFLGINKERVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSP--HFQKFQDICVKAYLALRHHT
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CCDS14 LFHLIVWDQQICFPVQVNRLPRETLLCATLYALPIPPPGSSSEANKQRRVPEALGWVTTP
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CCDS14 ADKKRLWEKRYYCHSEVSSLPLVLASAPSWE-WACLPDIYVLLKQWTHMNHQDALGLLHA
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CCDS14 RGRGMVEMIPNAETLRKIQVEHGVTGS--FKDRPLADWLQKHNPGEDEYEKAVENFIYSC
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CCDS14 AGCCVATYVLGICDRHNDNIMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQM-FGNIKRDRAPFVFTSDM
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CCDS14 AYVINGGDKPSSR---FHDFVDLCCQAYNLIRKHTHLFLNLLGLMLSCGIPELSDLEDLK
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CCDS14 YVYDALRPQDTEANATTYFTRLI-ESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTGSDDRLTLSFAS
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CCDS14 RTHTLKSSGRISDVFLCRHEKIFHPNKGYIYVVKVMRENTHEATYIQRTFEEFQELHNKL
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CCDS44 CNSFYADFQPVNVPRCTSYLNPGLPSHLSFTVYAAHNIPETWVHRINFPLEIKSLPRESM
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CCDS44 LTVKLFGIAC---ATNNANLLAWTCLPLFPKEKSIL-GSMLFSMTLQSEPPVEMITP-GV
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CCDS44 W--DVSQPSP-VTLQID-------FPA-------TGWEYMKPDSEE-------NRSNLEE
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CCDS44 PLKECIKHIARLSQKQTPLL-LSEEKKRYLWFYRFYCNNENCSLPLVLGSAPGWDERT-V
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CCDS44 SEMHTILRRWTFSQPLEALGLLTSSFPDQEIRKVAVQQLDN-LLNDELLEYLPQLVQAVK
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CCDS44 FEWNLESPLVQLLLHRSLQSIQVAHRLYWLLKNAENEAYFKSWYQKLLAALQFCAG---K
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CCDS44 ALNDEFSKEQKLIKILGDIGERVKSASDHQRQEVLKKEIGRLEEFFQDVNTCHLPLNPAL
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pF1KB0 QLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRI
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CCDS44 CIKGIDHDACSYFTSNALPLKITFINANPMG----KNISIIFKAGDDLRQDMLVLQLIQV
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CCDS44 MDNIWLQEGLDMQMIIYRCLSTGKDQGLVQMVPDAVTLAKIHRHSGLIGPLKEN--TIKK
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CCDS44 WFSQHNHLKADYEKALRNFFYSCAGWCVVTFILGVCDRHNDNIMLTKSGHMFHIDFGKFL
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CCDS44 GHAQTFGGIKRDRAPFIFTSEMEYFITEGGKN---PQHFQDFVELCCRAYNIIRKHSQLL
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CCDS11 IDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIV
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CCDS11 ECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAV
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CCDS11 QRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSD-VELIPLPLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMP
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