Result of FASTA (omim) for
pF1KB0356
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0356, 1068 aa
1>>>pF1KB0356 1068 - 1068 aa - 1068 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4080+/-0.000464; mu= 21.7621+/- 0.029
mean_var=80.3502+/-16.710, 0's: 0 Z-trim(109.0): 111 B-trim: 14 in 1/49
Lambda= 0.143081
statistics sampled from 17054 (17165) to 17054 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 11.870
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006209 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,16700 (1068) 7313 1520.6 0
XP_011511196 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,16 (1068) 7313 1520.6 0
XP_006713721 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,16 (1068) 7313 1520.6 0
XP_016862108 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_011511197 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_006713722 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_005247587 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
NP_006210 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4,5- (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_011511198 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy ( 902) 2026 429.1 5.4e-119
XP_016856974 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1015) 1861 395.1 1.1e-108
XP_006710752 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1044) 1854 393.7 2.9e-108
XP_006710750 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1044) 1854 393.7 2.9e-108
NP_005017 (OMIM: 602839,615513) phosphatidylinosit (1044) 1854 393.7 2.9e-108
NP_001269356 (OMIM: 601232) phosphatidylinositol 4 (1102) 1823 387.3 2.6e-106
NP_001269355 (OMIM: 601232) phosphatidylinositol 4 (1102) 1823 387.3 2.6e-106
XP_005250500 (OMIM: 601232) PREDICTED: phosphatidy (1102) 1823 387.3 2.6e-106
NP_002640 (OMIM: 601232) phosphatidylinositol 4,5- (1102) 1823 387.3 2.6e-106
NP_001242974 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 ( 582) 1806 383.6 1.8e-105
XP_016862110 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy ( 657) 1806 383.6 2e-105
XP_016862109 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy ( 674) 1806 383.6 2e-105
XP_016856972 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1074) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856970 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856968 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856965 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856966 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856969 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856971 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856967 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856973 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1043) 1741 370.4 3.1e-101
XP_016867817 (OMIM: 601232) PREDICTED: phosphatidy (1031) 1544 329.7 5.3e-89
XP_011514618 (OMIM: 601232) PREDICTED: phosphatidy (1011) 1538 328.4 1.2e-88
XP_016856964 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1070) 1249 268.8 1.2e-70
XP_011507932 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_011507933 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
NP_002637 (OMIM: 602838) phosphatidylinositol 4-ph (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_016856962 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_005245314 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_016856963 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_005245315 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1607) 1150 248.5 2.3e-64
XP_016874968 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy ( 817) 1115 241.1 2e-62
NP_001275703 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4 (1264) 1115 241.2 2.8e-62
XP_016874966 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1270) 1115 241.2 2.8e-62
XP_016874965 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1407) 1115 241.2 3.1e-62
XP_016874964 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1437) 1115 241.2 3.1e-62
XP_011518999 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1442) 1115 241.2 3.1e-62
NP_004561 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4-ph (1445) 1115 241.2 3.1e-62
XP_016874963 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1451) 1115 241.3 3.1e-62
XP_011518998 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1475) 1115 241.3 3.2e-62
NP_001275701 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4 (1486) 1115 241.3 3.2e-62
XP_016874962 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1492) 1115 241.3 3.2e-62
>>NP_006209 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,167000,17 (1068 aa)
initn: 7313 init1: 7313 opt: 7313 Z-score: 8154.5 bits: 1520.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7313; 100.0% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
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190 200 210 220 230 240
pF1KB0 IYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLK
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPMD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGI
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHC
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN
1030 1040 1050 1060
>>XP_011511196 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,167000 (1068 aa)
initn: 7313 init1: 7313 opt: 7313 Z-score: 8154.5 bits: 1520.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7313; 100.0% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
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pF1KB0 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
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pF1KB0 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGI
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pF1KB0 YHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPL
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pF1KB0 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
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XP_011 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
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XP_011 LLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTN
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pF1KB0 QRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILK
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XP_011 QEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLW
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pF1KB0 LNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLS
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pF1KB0 IGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]