Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0405
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0405, 465 aa
1>>>pF1KB0405 465 - 465 aa - 465 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4465+/-0.000737; mu= 13.2210+/- 0.044
mean_var=107.4724+/-21.240, 0's: 0 Z-trim(112.4): 106 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.123716
statistics sampled from 13023 (13131) to 13023 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 465) 3242 589.1 3.3e-168
CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 399) 2599 474.3 1e-133
CCDS44945.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 412) 1293 241.2 1.6e-63
CCDS55847.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 451) 1293 241.2 1.7e-63
CCDS55848.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 545) 1293 241.3 1.9e-63
CCDS8998.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 ( 657) 1293 241.3 2.3e-63
CCDS41626.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 ( 533) 1134 212.9 6.7e-55
CCDS60746.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 ( 541) 1134 212.9 6.7e-55
CCDS7845.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11 ( 565) 1134 212.9 7e-55
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 653 126.9 3.5e-29
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 653 126.9 3.7e-29
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 657 128.1 7.8e-29
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 657 128.1 7.8e-29
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 657 128.1 8.1e-29
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 657 128.1 8.5e-29
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 653 127.3 8.8e-29
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 657 128.2 8.8e-29
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 653 127.3 9e-29
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 647 126.2 1.8e-28
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 647 126.2 2e-28
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 646 126.1 2.4e-28
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 646 126.1 2.4e-28
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 646 126.1 2.4e-28
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 646 126.1 2.5e-28
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 639 124.8 6e-28
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 639 124.8 6e-28
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 639 124.9 7.3e-28
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 639 124.9 7.4e-28
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 633 123.8 1.3e-27
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 633 123.8 1.3e-27
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 633 123.8 1.3e-27
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 633 123.8 1.3e-27
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 633 123.8 1.3e-27
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 633 123.8 1.5e-27
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 628 122.9 2.3e-27
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 628 122.9 2.3e-27
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 627 122.7 2.6e-27
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 621 121.4 3.3e-27
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 621 121.4 3.4e-27
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 615 120.5 1.1e-26
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 615 120.6 1.4e-26
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 615 120.6 1.4e-26
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 613 120.2 1.5e-26
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 614 120.5 1.9e-26
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 586 115.2 2.5e-25
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 577 113.6 7.8e-25
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1436) 579 114.1 9.7e-25
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1446) 579 114.1 9.8e-25
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 574 113.1 1.3e-24
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 574 113.1 1.5e-24
>>CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 (465 aa)
initn: 3242 init1: 3242 opt: 3242 Z-score: 3133.4 bits: 589.1 E(32554): 3.3e-168
Smith-Waterman score: 3242; 99.6% identity (99.8% similar) in 465 aa overlap (1-465:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MVGKAWPLTHSQGMGPWAPEGHRREAADPWWQRQQAREGRMQLGCAWVAARRGGGRKLAS
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVGKAWPLTHSQGTGPWAPEGHRREAADPWWQRQQAQEGRMQLGCAWVAARRGGGRKLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 WSLLSPQRQTDRQTDSWQEAAWGPQLLQQTSWLSEPPLGPAPHLSMVQAHGGRSRAQPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WSLLSPQRQTDRQTDSWQEAAWGPQLLQQTSWLSEPPLGPAPHLSMVQAHGGRSRAQPLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LSLGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREVTLHFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSLGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLGAVEPICSVNTPREVTLHFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 RTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VCLGRAQSQEDGDYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VCLGRAQSQEDGDYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 QLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 PDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB0 EVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPEEPSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPEEPSP
430 440 450 460
>>CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 (399 aa)
initn: 2597 init1: 2597 opt: 2599 Z-score: 2514.1 bits: 474.3 E(32554): 1e-133
Smith-Waterman score: 2599; 96.7% identity (98.0% similar) in 394 aa overlap (72-465:9-399)
50 60 70 80 90 100
pF1KB0 QLGCAWVAARRGGGRKLASWSLLSPQRQTDRQTDSWQEAAWGPQLLQQTSWLSEPPLGPA
::. :. : . ..:::::::::::::
CCDS14 MGASFWPIRQAREQQRRALS---FRQTSWLSEPPLGPA
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 PHLSMVQAHGGRSRAQPLTLSLGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PHLSMVQAHGGRSRAQPLTLSLGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLG
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 AVEPICSVNTPREVTLHFLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVEPICSVNTPREVTLHFLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 PGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQEDGDYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQEDGDYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTV
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 SDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQL
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB0 TIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIG
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB0 RTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPE
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 EPSP
::::
CCDS14 EPSP
>>CCDS44945.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 (412 aa)
initn: 1138 init1: 910 opt: 1293 Z-score: 1254.1 bits: 241.2 E(32554): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1293; 52.5% identity (76.1% similar) in 373 aa overlap (93-462:44-409)
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LLSPQRQTDRQTDSWQEAAWGPQLLQQTSWLSEPPLGPAPHLSMVQAHGGRSRAQPLTLS
. .: .: .:. .: :. : .
CCDS44 LRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPKVLNVVVDPQG---RGAPEIKA
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLGAVEPICSVNTPRE-VTLHFLR
:. . : : : : . :::::::::.: ::. ::: .::. :. :::: :....:.
CCDS44 TTATSVCPSPFKM---KPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLGNIEPFVSIPTPREKVAMEYLQ
80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRV
.:.. ::: :. : . :. ::..:: :::.:...::: :..:.::::::::: :::
CCDS44 SASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPNPLSRV
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290
pF1KB0 CLGRAQSQEDG--DYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVML
:: : .. :. ::::::::::.::::..::::::: :::.:::.:::::. .:::.
CCDS44 CL-RPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQMVWQEDSPVIVMI
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 TQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSA
:.:.: .:::: ::: .. :: .. . ...:: .::.:.:... . . ::: ...
CCDS44 TKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHVKHYWYTS
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 WPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKAR
::::.::.:: :::.:. .:::. .. ::.::::::::::::::::: ::::::: .
CCDS44 WPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGPVVVHCSAGIGRTGCFIATSIGCQQLKEE
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
pF1KB0 GEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPEEPSP
: :: :.::::::.:::::.::.:::.:.::.: :: ..: :
CCDS44 GVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
370 380 390 400 410
>>CCDS55847.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 (451 aa)
initn: 1138 init1: 910 opt: 1293 Z-score: 1253.6 bits: 241.2 E(32554): 1.7e-63
Smith-Waterman score: 1293; 52.5% identity (76.1% similar) in 373 aa overlap (93-462:83-448)
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LLSPQRQTDRQTDSWQEAAWGPQLLQQTSWLSEPPLGPAPHLSMVQAHGGRSRAQPLTLS
. .: .: .:. .: :. : .
CCDS55 LRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPKVLNVVVDPQG---RGAPEIKA
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLGAVEPICSVNTPRE-VTLHFLR
:. . : : : : . :::::::::.: ::. ::: .::. :. :::: :....:.
CCDS55 TTATSVCPSPFKM---KPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLGNIEPFVSIPTPREKVAMEYLQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRV
.:.. ::: :. : . :. ::..:: :::.:...::: :..:.::::::::: :::
CCDS55 SASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPNPLSRV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB0 CLGRAQSQEDG--DYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVML
:: : .. :. ::::::::::.::::..::::::: :::.:::.:::::. .:::.
CCDS55 CL-RPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQMVWQEDSPVIVMI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 TQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSA
:.:.: .:::: ::: .. :: .. . ...:: .::.:.:... . . ::: ...
CCDS55 TKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHVKHYWYTS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 WPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKAR
::::.::.:: :::.:. .:::. .. ::.::::::::::::::::: ::::::: .
CCDS55 WPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGPVVVHCSAGIGRTGCFIATSIGCQQLKEE
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB0 GEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPEEPSP
: :: :.::::::.:::::.::.:::.:.::.: :: ..: :
CCDS55 GVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
410 420 430 440 450
>>CCDS55848.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12 (545 aa)
initn: 1138 init1: 910 opt: 1293 Z-score: 1252.4 bits: 241.3 E(32554): 1.9e-63
Smith-Waterman score: 1293; 52.5% identity (76.1% similar) in 373 aa overlap (93-462:177-542)
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LLSPQRQTDRQTDSWQEAAWGPQLLQQTSWLSEPPLGPAPHLSMVQAHGGRSRAQPLTLS
. .: .: .:. .: :. : .
CCDS55 LRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPKVLNVVVDPQG---RGAPEIKA
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALMLDVRSLGAVEPICSVNTPRE-VTLHFLR
:. . : : : : . :::::::::.: ::. ::: .::. :. :::: :....:.
CCDS55 TTATSVCPSPFKM---KPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLGNIEPFVSIPTPREKVAMEYLQ
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 TAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRV
.:.. ::: :. : . :. ::..:: :::.:...::: :..:.::::::::: :::
CCDS55 SASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPNPLSRV
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290
pF1KB0 CLGRAQSQEDG--DYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVML
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330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
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CCDS55 TKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHVKHYWYTS
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360 370 380 390 400 410
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420 430 440 450 460
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pF1KB0 TAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRV
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CCDS89 SASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTILPNPLSRV
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pF1KB0 CLGRAQSQEDG--DYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVML
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CCDS89 CL-RPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQMVWQEDSPVIVMI
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pF1KB0 TQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSA
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CCDS89 TKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHVKHYWYTS
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CCDS89 GVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
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CCDS41 TPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDP
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pF1KB0 PMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPE
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340 350 360 370 380 390
pF1KB0 YTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAA-HPGPIVV
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CCDS41 YRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIV
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pF1KB0 HCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLAL
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460
pF1KB0 YAGQLPEEPSP
: :: .. ::
CCDS41 YEKQLSHQ-SPE
530
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pF1KB0 SLGAVEP-ICSVNTPREVTLH-FLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSP
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CCDS60 TPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDP
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pF1KB0 YTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAA-HPGPIVV
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CCDS60 YRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIV
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pF1KB0 YAGQLPEEPSP
: :: .. ::
CCDS60 YEKQLSHQ-SPE
540
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pF1KB0 SLGAVEP-ICSVNTPREVTLH-FLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSP
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CCDS78 TPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDP
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 EDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQED-GDYINANYIRGYDGKEKVYIATQG
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CCDS78 KEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQG
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 PMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPE
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CCDS78 PIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTED
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 YTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAA-HPGPIVV
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CCDS78 YRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIV
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 HCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLAL
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CCDS78 HCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSL
500 510 520 530 540 550
460
pF1KB0 YAGQLPEEPSP
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CCDS78 YEKQLSHQ-SPE
560
>>CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (377 aa)
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pF1KB0 PREVTLHFLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYK
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CCDS53 KKRKLTNPVQLDDFDAYIKDMAKDSDYKFSLQFEELKLIGLDIPHFAADLPLNRCKNRYT
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pF1KB0 TILPNPQSRVCLGRAQSQEDGDYINANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQE
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CCDS53 NILPYDFSRVRLVSMNEEEGADYINANYIPGYNSPQE-YIATQGPLPETRNDFWKMVLQQ
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CCDS53 KSQIIVMLTQCNEKRRVKCDHYWPFTEEPIAYGDITVEMISEEEQDDWACRHFRINYADE
190 200 210 220 230 240
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pF1KB0 RRSVKHILFSAWPDHQTP--ESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIGRTGCF
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CCDS53 MQDVMHFNYTAWPDHGVPTANAAESILQFVHMVRQ--QATKSKGPMIIHCSAGVGRTGTF
250 260 270 280 290 300
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pF1KB0 IATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALYAGQLPEEPSP
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CCDS53 IALDRLLQHIRDHEFVDILGLVSEMRSYRMSMVQTEEQYIFIHQCVQLMWMKKKQQFCIS
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CCDS53 DVIYENVSKS
370
465 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:50:42 2016 done: Sat Nov 5 11:50:43 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]