FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0408, 803 aa 1>>>pF1KB0408 803 - 803 aa - 803 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2304+/-0.00119; mu= 5.3458+/- 0.071 mean_var=332.3315+/-70.015, 0's: 0 Z-trim(112.6): 952 B-trim: 603 in 1/51 Lambda= 0.070354 statistics sampled from 12269 (13300) to 12269 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16 Scan time: 4.630 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS165.1 ZBTB17 gene_id:7709|Hs108|chr1 ( 803) 5473 570.1 5e-162 CCDS72712.1 ZBTB17 gene_id:7709|Hs108|chr1 ( 810) 5449 567.7 2.7e-161 CCDS55576.1 ZBTB17 gene_id:7709|Hs108|chr1 ( 721) 4614 482.9 8.2e-136 CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1275 143.9 7.8e-34 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1218 138.0 4e-32 CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1208 137.1 8.5e-32 CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1202 136.3 1.1e-31 CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1202 136.5 1.3e-31 CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1202 136.5 1.4e-31 CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1201 136.4 1.4e-31 CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1197 136.0 2e-31 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1196 135.9 2e-31 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1196 135.9 2.1e-31 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1196 135.9 2.1e-31 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1196 135.9 2.2e-31 CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1191 135.5 3.6e-31 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1186 134.9 4.1e-31 CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1185 134.7 4.2e-31 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1185 134.8 4.6e-31 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1184 134.8 5.6e-31 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1184 134.8 5.6e-31 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1184 134.8 5.6e-31 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1178 133.9 6.2e-31 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1185 135.1 6.6e-31 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1185 135.1 6.7e-31 CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 1182 134.6 6.9e-31 CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 1182 134.7 7e-31 CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1176 133.9 8.8e-31 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1176 133.9 8.9e-31 CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1176 133.9 9.3e-31 CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1171 133.3 1.1e-30 CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 1170 133.2 1.2e-30 CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 1170 133.2 1.2e-30 CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 1170 133.2 1.3e-30 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1169 133.1 1.3e-30 CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1170 133.3 1.3e-30 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1176 134.2 1.3e-30 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1169 133.2 1.4e-30 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1165 132.6 1.5e-30 CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1167 132.9 1.5e-30 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1167 132.9 1.5e-30 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1167 133.0 1.6e-30 CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1165 132.7 1.7e-30 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1167 133.1 1.8e-30 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1167 133.1 1.9e-30 CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1165 132.8 2e-30 CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1163 132.5 2.1e-30 CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1165 132.9 2.1e-30 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1161 132.2 2.1e-30 CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1161 132.3 2.2e-30 >>CCDS165.1 ZBTB17 gene_id:7709|Hs108|chr1 (803 aa) initn: 5473 init1: 5473 opt: 5473 Z-score: 3022.4 bits: 570.1 E(32554): 5e-162 Smith-Waterman score: 5473; 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99.7% identity (99.9% similar) in 674 aa overlap (130-803:48-721) 100 110 120 130 140 150 pF1KB0 QMQDIITACHALKSLAEPATSPGGNAEALATEGGDKRAKEEKVATSTLSRLEQAGRSTPI . :::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 PAMPSSHLLSRLPALGEMRRPWPQKVCPVPSPGGDKRAKEEKVATSTLSRLEQAGRSTPI 20 30 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 pF1KB0 GPSRDLKEERGGQAQSAASGAEQTEKADAPREPPPVELKPDPTSGMAAAEAEAALSESSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 GPSRDLKEERGGQAQSAASGAEQTEKADAPREPPPVELKPDPTSGMAAAEAEAALSESSE 80 90 100 110 120 130 220 230 240 250 260 270 pF1KB0 QEMEVEPARKGEEEQKEQEEQEEEGAGPAEVKEEGSQLENGEAPEENENEESAGTDSGQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 QEMEVEPARKGEEEQKEQEEQEEEGAGPAEVKEEGSQLENGEAPEENENEESAGTDSGQE 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 LGSEARGLRSGTYGDRTESKAYGSVIHKCEDCGKEFTHTGNFKRHIRIHTGEKPFSCREC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 LGSEARGLRSGTYGDRTESKAYGSVIHKCEDCGKEFTHTGNFKRHIRIHTGEKPFSCREC 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 SKAFSDPAACKAHEKTHSPLKPYGCEECGKSYRLISLLNLHKKRHSGEARYRCEDCGKLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 SKAFSDPAACKAHEKTHSPLKPYGCEECGKSYRLISLLNLHKKRHSGEARYRCEDCGKLF 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 pF1KB0 TTSGNLKRHQLVHSGEKPYQCDYCGRSFSDPTSKMRHLETHDTDKEHKCPHCDKKFNQVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 TTSGNLKRHQLVHSGEKPYQCDYCGRSFSDPTSKMRHLETHDTDKEHKCPHCDKKFNQVG 320 330 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 pF1KB0 NLKAHLKIHIADGPLKCRECGKQFTTSGNLKRHLRIHSGEKPYVCIHCQRQFADPGALQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 NLKAHLKIHIADGPLKCRECGKQFTTSGNLKRHLRIHSGEKPYVCIHCQRQFADPGALQR 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 pF1KB0 HVRIHTGEKPCQCVMCGKAFTQASSLIAHVRQHTGEKPYVCERCGKRFVQSSQLANHIRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 HVRIHTGEKPCQCVMCGKAFTQASSLIAHVRQHTGEKPYVCERCGKRFVQSSQLANHIRH 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 pF1KB0 HDNIRPHKCSVCSKAFVNVGDLSKHIIIHTGEKPYLCDKCGRGFNRVDNLRSHVKTVHQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 HDNIRPHKCSVCSKAFVNVGDLSKHIIIHTGEKPYLCDKCGRGFNRVDNLRSHVKTVHQG 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 pF1KB0 KAGIKILEPEEGSEVSVVTVDDMVTLATEALAATAVTQLTVVPVGAAVTADETEVLKAEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 KAGIKILEPEEGSEVSVVTVDDMVTLATEALAATAVTQLTVVPVGAAVTADETEVLKAEI 560 570 580 590 600 610 700 710 720 730 740 750 pF1KB0 SKAVKQVQEEDPNTHILYACDSCGDKFLDANSLAQHVRIHTAQALVMFQTDADFYQQYGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 SKAVKQVQEEDPNTHILYACDSCGDKFLDANSLAQHVRIHTAQALVMFQTDADFYQQYGP 620 630 640 650 660 670 760 770 780 790 800 pF1KB0 GGTWPAGQVLQAGELVFRPRDGAEGQPALAETSPTAPECPPPAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 GGTWPAGQVLQAGELVFRPRDGAEGQPALAETSPTAPECPPPAE 680 690 700 710 720 >>CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 (616 aa) initn: 4560 init1: 1255 opt: 1275 Z-score: 720.9 bits: 143.9 E(32554): 7.8e-34 Smith-Waterman score: 1275; 49.6% identity (72.6% similar) in 343 aa overlap (302-644:253-594) 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 AGTDSGQELGSEARGLRSGTYGDRTESKAYGSVIHKCEDCGKEFTHTGNFKRHIRIHTGE : .:::.::: :...... : :::::: CCDS59 HTEEKPYKCEEYGKAFNQSSNYTTHKVTHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTIHKRIHTGE 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 KPFSCRECSKAFSDPAACKAHEKTHSPLKPYGCEECGKSYRLISLLNLHKKRHSGEARYR :: .:.::.::::.:.: :.. : ::: ::::::.. : :. ::. :::: :. CCDS59 KPCKCEECGKAFSQPSALTIHKRMHIGEKPYKCEECGKAFVWSSTLTRHKRLHSGEKPYK 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 pF1KB0 CEDCGKLFTTSGNLKRHQLVHSGEKPYQCDYCGRSFSDPTSKMRHLETHDTDKEHKCPHC ::.:.: :. :.: :...:.:::::.:. ::..: :.. .: . : .: .:: .: CCDS59 CEECAKAFSQFGHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFIWPSTLTKHKRIHTGEKPYKCEEC 350 360 370 380 390 400 460 470 480 490 500 510 pF1KB0 DKKFNQVGNLKAHLKIHIADGPLKCRECGKQFTTSGNLKRHLRIHSGEKPYVCIHCQRQF : :.. .:: : :: .. : ::.:::: : :.:: .: .::. :::: : .:.. : CCDS59 GKAFHRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSNLTEHKKIHTREKPYKCEECSKAF 410 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KB0 ADPGALQRHVRIHTGEKPCQCVMCGKAFTQASSLIAHVRQHTGEKPYVCERCGKRFVQSS . .:: : :.:::::: .: :::::.:.:.: :: ::::::: ::.::: :. :: CCDS59 SRSSALTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFILSS 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 pF1KB0 QLANHIRHHDNIRPHKCSVCSKAFVNVGDLSKHIIIHTGEKPYLCDKCGRGFNRVDNLRS :..: : : . .:.:: :.:.: . ..:: : ::::::::: :..::..::: .:: . CCDS59 TLSKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFNQSSNLSTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLST 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 690 pF1KB0 HVKTVHQGKAGIKILEPEEGSEVSVVTVDDMVTLATEALAATAVTQLTVVPVGAAVTADE : : .: :. : CCDS59 H-KIIHTGEKPYKCDECGKSFIWSSTLFKHKRIHT 590 600 610 >>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 (544 aa) initn: 4195 init1: 1208 opt: 1218 Z-score: 690.3 bits: 138.0 E(32554): 4e-32 Smith-Waterman score: 1218; 46.2% identity (72.1% similar) in 344 aa overlap (307-650:156-498) 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 GQELGSEARGLRSGTYGDRTESKAYGSVIHKCEDCGKEFTHTGNFKRHIRIHTGEKPFSC ::..::: ::..... .: : ::::.:..: CCDS27 LHQWETSNIQTNDISDQSKCPTLCTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGERPYTC 130 140 150 160 170 180 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 RECSKAFSDPAACKAHEKTHSPLKPYGCEECGKSYRLISLLNLHKKRHSGEARYRCEDCG .::.:::: . :.. :. .::::::.:::..: :.:. :.. :.:: :.:..:: CCDS27 EECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPYKCNECG 190 200 210 220 230 240 400 410 420 430 440 450 pF1KB0 KLFTTSGNLKRHQLVHSGEKPYQCDYCGRSFSDPTSKMRHLETHDTDKEHKCPHCDKKFN . : . ..: .:: .:.:::::.:. ::..:.. : ..: . : .: . : .: ..: CCDS27 NSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSECGSSFR 250 260 270 280 290 300 460 470 480 490 500 510 pF1KB0 QVGNLKAHLKIHIADGPLKCRECGKQFTTSGNLKRHLRIHSGEKPYVCIHCQRQFADPGA . .:: : .:: .. : :: :::: : :..::..: ::::::::: : .: . : . . 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CCDS27 HTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKFFRHSSVLFRHQKLHSGD 490 500 510 520 530 540 >>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa) initn: 3198 init1: 1184 opt: 1208 Z-score: 684.3 bits: 137.1 E(32554): 8.5e-32 Smith-Waterman score: 1208; 44.4% identity (69.1% similar) in 369 aa overlap (302-670:226-593) 280 290 300 310 320 330 pF1KB0 AGTDSGQELGSEARGLRSGTYGDRTESKAYGSVIHKCEDCGKEFTHTGNFKRHIRIHTGE : .:::.::: :....:. .: .::::: CCDS32 HTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGE 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 pF1KB0 KPFSCRECSKAFSDPAACKAHEKTHSPLKPYGCEECGKSYRLISLLNLHKKRHSGEARYR ::..:.::.:.:. .. .:. :. ::: :.::::.. : :. :.: :.:: :. 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