Result of FASTA (omim) for
pF1KB0423
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0423, 474 aa
1>>>pF1KB0423 474 - 474 aa - 474 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9356+/-0.000333; mu= 1.4923+/- 0.021
mean_var=187.5331+/-38.569, 0's: 0 Z-trim(121.6): 18 B-trim: 63 in 1/55
Lambda= 0.093656
statistics sampled from 38519 (38540) to 38519 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.452), width: 16
Scan time: 10.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001120707 (OMIM: 608412) vasculin isoform 3 [Ho ( 465) 659 101.2 6.7e-21
NP_075064 (OMIM: 608412) vasculin isoform 1 [Homo ( 473) 595 92.5 2.7e-18
XP_016865248 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 473) 595 92.5 2.7e-18
XP_016865247 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 473) 595 92.5 2.7e-18
XP_016865246 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 480) 571 89.3 2.6e-17
XP_016865245 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 480) 571 89.3 2.6e-17
NP_001120708 (OMIM: 608412) vasculin isoform 2 [Ho ( 480) 571 89.3 2.6e-17
NP_001190175 (OMIM: 608412) vasculin isoform 4 [Ho ( 302) 397 65.7 2.1e-10
XP_016865244 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 493) 397 65.8 3.2e-10
NP_001317966 (OMIM: 608412) vasculin isoform 5 [Ho ( 493) 397 65.8 3.2e-10
XP_016865243 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 500) 397 65.8 3.2e-10
XP_006714736 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin is ( 500) 397 65.8 3.2e-10
>>NP_001120707 (OMIM: 608412) vasculin isoform 3 [Homo s (465 aa)
initn: 858 init1: 277 opt: 659 Z-score: 496.2 bits: 101.2 E(85289): 6.7e-21
Smith-Waterman score: 990; 40.4% identity (62.4% similar) in 505 aa overlap (1-471:1-463)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKS-------PTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGF
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NP_001 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 FNNGPLRTAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGG
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NP_001 ---------------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGY
70 80 90
120 130 140 150 160 170
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NP_001 HGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREP
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180 190 200 210 220 230
pF1KB0 CRPIGTPSGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSV
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NP_001 NHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG----
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 VPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAFTSPISVTKPVVLASGAAL
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NP_001 -PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTF----GVGNFNAFKSTAKN
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB0 SSPKESPSSTTPPIEISSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN-------RDC
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NP_001 FSPSTNSVKEQP-------RLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDD
270 280 290 300 310
350 360 370 380
pF1KB0 DKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSLEAEH
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NP_001 DSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEH
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB0 RLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSLFSPW
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NP_001 RLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPW
380 390 400 410 420 430
450 460 470
pF1KB0 R-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
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NP_001 KNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
440 450 460
>>NP_075064 (OMIM: 608412) vasculin isoform 1 [Homo sapi (473 aa)
initn: 839 init1: 277 opt: 595 Z-score: 449.4 bits: 92.5 E(85289): 2.7e-18
Smith-Waterman score: 1030; 40.6% identity (64.9% similar) in 502 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLR
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NP_075 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF-------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB0 TAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGGGTGNHRH
::. : .:. : . .::.. .: : .....:.: :. :
NP_075 --------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 WNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQPCRPIGTP
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NP_075 RSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREPNHNKSLA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 SGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSVVPSVYKN
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NP_075 AGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG-----PSVYKG
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240 250 260 270 280 290
pF1KB0 LVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPVVLASGAALSSPKE-
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NP_075 LVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKEC
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB0 SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN-------RDCDKL
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NP_075 NRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSF
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KB0 EDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSLEAEHRLL
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NP_075 NLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB0 KAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSLFSPWR-S
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NP_075 KEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNS
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KB0 TCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
: : :..:::::::.:::::
NP_075 TFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470
>>XP_016865248 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (473 aa)
initn: 839 init1: 277 opt: 595 Z-score: 449.4 bits: 92.5 E(85289): 2.7e-18
Smith-Waterman score: 1030; 40.6% identity (64.9% similar) in 502 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLR
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XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF-------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB0 TAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGGGTGNHRH
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XP_016 --------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRS
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pF1KB0 WNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQPCRPIGTP
.. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...: . .
XP_016 RSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREPNHNKSLA
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180 190 200 210 220 230
pF1KB0 SGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSVVPSVYKN
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XP_016 AGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG-----PSVYKG
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240 250 260 270 280 290
pF1KB0 LVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPVVLASGAALSSPKE-
:::::. ::.::. ::.. :.: :. : .::.: .. ... : .. . . .: ::
XP_016 LVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKEC
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB0 SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN-------RDCDKL
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XP_016 NRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSF
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350 360 370 380 390
pF1KB0 EDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSLEAEHRLL
. ..::: . :.:::. . :. . . . .::: :::::::::
XP_016 NLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB0 KAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSLFSPWR-S
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XP_016 KEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNS
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KB0 TCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
: : :..:::::::.:::::
XP_016 TFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470
>>XP_016865247 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (473 aa)
initn: 839 init1: 277 opt: 595 Z-score: 449.4 bits: 92.5 E(85289): 2.7e-18
Smith-Waterman score: 1030; 40.6% identity (64.9% similar) in 502 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLR
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XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF-------
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pF1KB0 TAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGGGTGNHRH
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pF1KB0 WNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQPCRPIGTP
.. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...: . .
XP_016 RSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREPNHNKSLA
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pF1KB0 SGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSVVPSVYKN
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XP_016 AGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG-----PSVYKG
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pF1KB0 LVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPVVLASGAALSSPKE-
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XP_016 LVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPSTNSVKEC
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pF1KB0 SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN-------RDCDKL
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XP_016 NRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSF
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pF1KB0 EDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSLEAEHRLL
. ..::: . :.:::. . :. . . . .::: :::::::::
XP_016 NLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLL
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pF1KB0 KAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSLFSPWR-S
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XP_016 KEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNS
390 400 410 420 430 440
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pF1KB0 TCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
: : :..:::::::.:::::
XP_016 TFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470
>>XP_016865246 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (480 aa)
initn: 857 init1: 277 opt: 571 Z-score: 431.8 bits: 89.3 E(85289): 2.6e-17
Smith-Waterman score: 1006; 40.1% identity (64.0% similar) in 509 aa overlap (1-471:1-478)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKS-------PTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGF
::::::.:::::: :: :. . . .::::.:.. :.:. :.::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 FNNGPLRTAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGG
::. : .:. : . .::.. .: : .....:.:
XP_016 ---------------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGY
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 GTGNHRHWNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQP
:. : .. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...:
XP_016 HGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 CRPIGTPSGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSV
. . .:::: ::. : . .:::::: . .: ..: .. . :.. ::.
XP_016 NHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG----
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB0 VPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPVVLASGAA
:::::.:::::. ::.::. ::.. :.: :. : .::.: .. ... : .. . .
XP_016 -PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPS
220 230 240 250 260
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pF1KB0 LSSPKE-SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN------
.: :: . :... :.. .. ::::::: ::.::::::.:: :: . :.
XP_016 TNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGS
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pF1KB0 -RDCDKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSL
.: :... ..::: . :.:::. . :. . . . .::: ::
XP_016 EKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSL
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pF1KB0 EAEHRLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSL
:::::::: ::::: ::::.: ::::::..::.. .:::..::. :::.:.. .
XP_016 EAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFK
390 400 410 420 430 440
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pF1KB0 FSPWR-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
:.::. :: : :..:::::::.:::::
XP_016 FGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470 480
>>XP_016865245 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (480 aa)
initn: 857 init1: 277 opt: 571 Z-score: 431.8 bits: 89.3 E(85289): 2.6e-17
Smith-Waterman score: 1006; 40.1% identity (64.0% similar) in 509 aa overlap (1-471:1-478)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKS-------PTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGF
::::::.:::::: :: :. . . .::::.:.. :.:. :.::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 FNNGPLRTAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGG
::. : .:. : . .::.. .: : .....:.:
XP_016 ---------------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGY
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 GTGNHRHWNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQP
:. : .. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...:
XP_016 HGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 CRPIGTPSGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSV
. . .:::: ::. : . .:::::: . .: ..: .. . :.. ::.
XP_016 NHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG----
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB0 VPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPVVLASGAA
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XP_016 -PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPS
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 LSSPKE-SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN------
.: :: . :... :.. .. ::::::: ::.::::::.:: :: . :.
XP_016 TNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGS
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380
pF1KB0 -RDCDKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSL
.: :... ..::: . :.:::. . :. . . . .::: ::
XP_016 EKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSL
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB0 EAEHRLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSL
:::::::: ::::: ::::.: ::::::..::.. .:::..::. :::.:.. .
XP_016 EAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFK
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KB0 FSPWR-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
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XP_016 FGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470 480
>>NP_001120708 (OMIM: 608412) vasculin isoform 2 [Homo s (480 aa)
initn: 857 init1: 277 opt: 571 Z-score: 431.8 bits: 89.3 E(85289): 2.6e-17
Smith-Waterman score: 1006; 40.1% identity (64.0% similar) in 509 aa overlap (1-471:1-478)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKS-------PTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGF
::::::.:::::: :: :. . . .::::.:.. :.:. :.::::::::::
NP_001 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKVLTSSLKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 FNNGPLRTAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGG
::. : .:. : . .::.. .: : .....:.:
NP_001 ---------------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGY
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 GTGNHRHWNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQP
:. : .. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...:
NP_001 HGGSSRSRSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 CRPIGTPSGVWENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHANGNKLSSV
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NP_001 NHNKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKNGTG----
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB0 VPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPVVLASGAA
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NP_001 -PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKSTAKNFSPS
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 LSSPKE-SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSEN------
.: :: . :... :.. .. ::::::: ::.::::::.:: :: . :.
NP_001 TNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHEDESRAGS
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380
pF1KB0 -RDCDKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEGEVLSHSL
.: :... ..::: . :.:::. . :. . . . .::: ::
NP_001 EKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSL
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB0 EAEHRLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQSR--SSSL
:::::::: ::::: ::::.: ::::::..::.. .:::..::. :::.:.. .
NP_001 EAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFK
390 400 410 420 430 440
450 460 470
pF1KB0 FSPWR-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
:.::. :: : :..:::::::.:::::
NP_001 FGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470 480
>>NP_001190175 (OMIM: 608412) vasculin isoform 4 [Homo s (302 aa)
initn: 518 init1: 277 opt: 397 Z-score: 307.7 bits: 65.7 E(85289): 2.1e-10
Smith-Waterman score: 629; 42.2% identity (66.7% similar) in 306 aa overlap (195-471:1-300)
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 EAGKQHQPCRPIGTPSGVWENPPSAKQPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSPGSHHAN
:::::: . .: ..: .. . :.. :
NP_001 MLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVKN
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 GNKLSSVVPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPISVTKPV
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NP_001 GTG-----PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNFNAFKST
40 50 60 70 80
290 300 310 320 330
pF1KB0 VLASGAALSSPKE-SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDRNGDFSE
. . . .: :: . :... :.. .. ::::::: ::.::::::.:: :: . :
NP_001 AKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDRVEEEHE
90 100 110 120 130 140
340 350 360 370
pF1KB0 N-------RDCDKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLALPVVEEG
. .: :... ..::: . :.:::. . :. . . .
NP_001 DESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQT
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 EVLSHSLEAEHRLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGKNGFLQS
.::: :::::::::: ::::: ::::.: ::::::..::.. .:::..::. :::.:..
NP_001 DVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKN
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470
pF1KB0 R--SSSLFSPWR-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
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NP_001 GLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
270 280 290 300
>>XP_016865244 (OMIM: 608412) PREDICTED: vasculin isofor (493 aa)
initn: 834 init1: 277 opt: 397 Z-score: 304.5 bits: 65.8 E(85289): 3.2e-10
Smith-Waterman score: 980; 39.1% identity (62.5% similar) in 522 aa overlap (1-471:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLR
::::::.:::::: :: :. . . .::::.:.. :.:. :.::::::::::
XP_016 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF-------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB0 TAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGGGTGNHRH
::. : .:. : . .::.. .: : .....:.: :. :
XP_016 --------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 WNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQPCRPIGTP
.. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...: . .
XP_016 RSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREPNHNKSLA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210
pF1KB0 SGVW--------------------ENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSP
.::: : ::. : . .:::::: . .: ..: .. . :
XP_016 AGVWGLHAQTHTYPTKKISQAPLLEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLP
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 GSHHANGNKLSSVVPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPI
.. ::. :::::.:::::. ::.::. ::.. :.: :. : .::.: .. .
XP_016 SQPVKNGTG-----PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNF
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 SVTKPVVLASGAALSSPKE-SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDR
.. : .. . . .: :: . :... :.. .. ::::::: ::.::::::.:: ::
XP_016 NAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDR
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370
pF1KB0 NGDFSEN-------RDCDKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLAL
. :. .: :... ..::: . :.:::. . :. .
XP_016 VEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRS
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 PVVEEGEVLSHSLEAEHRLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGK
. . .::: :::::::::: ::::: ::::.: ::::::..::.. .:::..::. :
XP_016 STFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRK
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470
pF1KB0 NGFLQSR--SSSLFSPWR-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
::.:.. . :.::. :: : :..:::::::.:::::
XP_016 NGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470 480 490
>>NP_001317966 (OMIM: 608412) vasculin isoform 5 [Homo s (493 aa)
initn: 834 init1: 277 opt: 397 Z-score: 304.5 bits: 65.8 E(85289): 3.2e-10
Smith-Waterman score: 980; 39.1% identity (62.5% similar) in 522 aa overlap (1-471:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAQHDFVPAWLNFSTPQSAKSPTATFEKHGEHLPRGEGRFGVSRRRHNSSDGFFNNGPLR
::::::.:::::: :: :. . . .::::.:.. :.:. :.::::::::::
NP_001 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSSDGF-------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB0 TAGDSWHQPSLFRHDSVDSGVSKGAYAGITGNPSGWHSSSR-GHDGMSQRSGGGTGNHRH
::. : .:. : . .::.. .: : .....:.: :. :
NP_001 --------------DSA-IGRPNGGNFG-RKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 WNGSFHSRKGCAFQEKPPMEIREEKKEDKVEKLQFEEEDFPSLNPEAGKQHQPCRPIGTP
.. ::. :. ...:. . . .:::: :. ::: ::::::::: ...: . .
NP_001 RSSIFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEY--EREPNHNKSLA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210
pF1KB0 SGVW--------------------ENPPSAK-QPSKMLVIKKVSKED-PAAAFSAAFTSP
.::: : ::. : . .:::::: . .: ..: .. . :
NP_001 AGVWGLHAQTHTYPTKKISQAPLLEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLP
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 GSHHANGNKLSSVVPSVYKNLVPKPVPPPSKPNAWKANRMEHKSGSLSSSRESAF-TSPI
.. ::. :::::.:::::. ::.::. ::.. :.: :. : .::.: .. .
NP_001 SQPVKNGTG-----PSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGT-SFPHESTFGVGNF
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 SVTKPVVLASGAALSSPKE-SPSSTTPPIEI--SSSRLTKLTRRTTDRKSEFLKTLKDDR
.. : .. . . .: :: . :... :.. .. ::::::: ::.::::::.:: ::
NP_001 NAFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSEFLKALKRDR
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370
pF1KB0 NGDFSEN-------RDCDKLEDLEDNSTPE-------------PKENGEEGC-HQNGLAL
. :. .: :... ..::: . :.:::. . :. .
NP_001 VEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDENEIPQENGNASVISQQIIRS
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 PVVEEGEVLSHSLEAEHRLLKAMGWQEYPENDENCLPLTEDELKEFHMKTEQLRRNGFGK
. . .::: :::::::::: ::::: ::::.: ::::::..::.. .:::..::. :
NP_001 STFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSENDETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRK
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470
pF1KB0 NGFLQSR--SSSLFSPWR-STCKAEFEDSDTETSSSETSDDDAWK
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NP_001 NGILKNGLICDFKFGPWKNSTFKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
450 460 470 480 490
474 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:50:03 2016 done: Sat Nov 5 16:50:05 2016
Total Scan time: 10.430 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]