FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0453, 505 aa 1>>>pF1KB0453 505 - 505 aa - 505 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7762+/-0.0011; mu= 16.0429+/- 0.066 mean_var=72.0840+/-14.181, 0's: 0 Z-trim(102.9): 28 B-trim: 4 in 1/49 Lambda= 0.151062 statistics sampled from 7167 (7180) to 7167 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16 Scan time: 3.010 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 505) 3349 739.5 2e-213 CCDS31003.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 ( 471) 2977 658.4 4.8e-189 CCDS44353.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 500) 2293 509.4 3.8e-144 CCDS81439.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 514) 2292 509.2 4.5e-144 CCDS7078.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 520) 2292 509.2 4.6e-144 CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 ( 534) 2292 509.2 4.7e-144 CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 471) 2156 479.5 3.5e-135 CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 469) 2145 477.1 1.8e-134 CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 462) 2081 463.2 2.9e-130 CCDS65273.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX ( 406) 1935 431.3 9.7e-121 CCDS82769.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 ( 434) 1466 329.1 6.1e-90 >>CCDS31004.1 PFKFB2 gene_id:5208|Hs108|chr1 (505 aa) initn: 3349 init1: 3349 opt: 3349 Z-score: 3945.1 bits: 739.5 E(32554): 2e-213 Smith-Waterman score: 3349; 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74.5% identity (91.9% similar) in 447 aa overlap (34-480:31-475) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: CCDS70 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: CCDS70 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : CCDS70 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: CCDS70 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: CCDS70 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : CCDS70 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: CCDS70 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPRNYS :::::::.::.: ::::.: :::.. ... :. .:. ::::: :::.: . ..:: CCDS70 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRER-SEDAKKGPNPL-MRRNSVTPLASPEPTKKPRINS 430 440 450 460 470 490 500 pF1KB0 VGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD CCDS70 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 480 490 500 510 520 >>CCDS60479.1 PFKFB3 gene_id:5209|Hs108|chr10 (534 aa) initn: 2311 init1: 2219 opt: 2292 Z-score: 2699.7 bits: 509.2 E(32554): 4.7e-144 Smith-Waterman score: 2292; 74.5% identity (91.9% similar) in 447 aa overlap (34-480:45-489) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: CCDS60 GALPLLCQLDTFSPKATVFGVSINPACGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: CCDS60 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : CCDS60 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: CCDS60 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: CCDS60 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : CCDS60 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: CCDS60 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPRNYS :::::::.::.: ::::.: :::.. ... :. .:. ::::: :::.: . ..:: CCDS60 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRER-SEDAKKGPNPL-MRRNSVTPLASPEPTKKPRINS 440 450 460 470 480 490 490 500 pF1KB0 VGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD CCDS60 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 500 510 520 530 >>CCDS14364.1 PFKFB1 gene_id:5207|Hs108|chrX (471 aa) initn: 2134 init1: 1315 opt: 2156 Z-score: 2540.4 bits: 479.5 E(32554): 3.5e-135 Smith-Waterman score: 2156; 72.6% identity (91.6% similar) in 430 aa overlap (22-451:26-453) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSK :..... : .:::::...:.:::::::::.: CCDS14 MSPEMGELTQTRLQKIWIPHSSGSSRLQRRRGSSIPQFTNSPTMVIMVGLPARGKTYIST 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 KLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAY ::::::::::.:::::::: :::::: :::.:.:: :: ::..:::::::.::.::. : CCDS14 KLTRYLNWIGTPTKVFNLGQYRREAV-SYKNYEFFLPDNMEALQIRKQCALAALKDVHNY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 LTEENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSP :..:.:..:::::::::::::..::.::.....::::.::.:.:: .:: :: .::..:: CCDS14 LSHEEGHVAVFDATNTTRERRSLILQFAKEHGYKVFFIESICNDPGIIAENIRQVKLGSP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 DYPERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQS :: . .::.:.::::::::::.:.:.::: .. :. ::.::...:: :..::::::.::: CCDS14 DYIDCDREKVLEDFLKRIECYEVNYQPLD-EELDSHLSYIKIFDVGTRYMVNRVQDHIQS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 KIVYYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITD . ::::::::: ::.::::::::::.:. :.:::::::::::::.: :: .:.. : :.. CCDS14 RTVYYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNIRGRIGGDSGLSVRGKQYAYALANFIQSQGISS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 LKVWTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKY ::::::..::::::::.::::::::: :::::::::::::: ::...::::::::::.:: CCDS14 LKVWTSHMKRTIQTAEALGVPYEQWKALNEIDAGVCEEMTYEEIQEHYPEEFALRDQDKY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 LYRYPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCP :::: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::..::::::.:: CCDS14 RYRYPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKSSDELPYLKCP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 LHTIFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTI :::..::::::::::::.: ::::::::::.:: : CCDS14 LHTVLKLTPVAYGCKVESIYLNVEAVNTHREKPENVDITREPEEALDTVPAHY 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB0 RRPRNYSVGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD >>CCDS2771.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 (469 aa) initn: 2124 init1: 1302 opt: 2145 Z-score: 2527.5 bits: 477.1 E(32554): 1.8e-134 Smith-Waterman score: 2145; 71.8% identity (89.8% similar) in 432 aa overlap (20-451:21-451) 10 20 30 40 50 pF1KB0 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLT : : . . :. . ::: ::::::.:::::::::.::::: CCDS27 MASPRELTQNPLKKIWMPYSNGRPALHACQRGVCMTNCPTLIVMVGLPARGKTYISKKLT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB0 RYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTE ::::::::::. ::.: :::..::.:::..:: ::::..::::::::.::.::. .:.: CCDS27 RYLNWIGVPTREFNVGQYRRDVVKTYKSFEFFLPDNEEGLKIRKQCALAALRDVRRFLSE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB0 ENGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYP :.:..::::::::::::: :.::.:::..:.:::::.: ::.::::::..::..:::: CCDS27 EGGHVAVFDATNTTRERRATIFNFGEQNGYKTFFVESICVDPEVIAANIVQVKLGSPDYV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB0 ERNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIV .:. ... :::..:::::. .:. :: : :.:::.::...::: ..:::: :.:::.:: CCDS27 NRDSDEATEDFMRRIECYENSYESLDED-LDRDLSYIKIMDVGQSYVVNRVADHIQSRIV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB0 YYLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKV :::::::: ::.::::::::::.:: :.:::: ::: ::..::..: .:. .:.: :::: CCDS27 YYLMNIHVTPRSIYLCRHGESELNLKGRIGGDPGLSPRGREFAKSLAQFISDQNIKDLKV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB0 WTSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYR ::::.::::::::.:::::::::.:::::::::::::: ::. :: :::::::.:: :: CCDS27 WTSQMKRTIQTAEALGVPYEQWKVLNEIDAGVCEEMTYEEIQDNYPLEFALRDQDKYRYR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB0 YPGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHT :: ::::.:::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::.:..::::.::::: CCDS27 YPKGESYEDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVMRCLLAYFLDKAAEQLPYLKCPLHT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB0 IFKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRP ..::::::::::::.: ::: :::::::.: : CCDS27 VLKLTPVAYGCKVESIFLNVAAVNTHRDRPQNVDISRPPEEALVTVPAHQ 420 430 440 450 460 480 490 500 pF1KB0 RNYSVGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD >>CCDS82770.1 PFKFB4 gene_id:5210|Hs108|chr3 (462 aa) initn: 1507 init1: 836 opt: 2081 Z-score: 2452.2 bits: 463.2 E(32554): 2.9e-130 Smith-Waterman score: 2081; 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73.8% identity (92.1% similar) in 382 aa overlap (70-451:9-388) 40 50 60 70 80 90 pF1KB0 LIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAM :::::: :::::: :::.:.:: :: ::. 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