FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0453, 505 aa 1>>>pF1KB0453 505 - 505 aa - 505 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2818+/-0.000441; mu= 19.2153+/- 0.028 mean_var=75.5035+/-14.664, 0's: 0 Z-trim(110.0): 48 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.147601 statistics sampled from 18277 (18313) to 18277 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16 Scan time: 7.050 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006203 (OMIM: 171835) 6-phosphofructo-2-kinase/ ( 505) 3349 723.1 4.7e-208 NP_001018063 (OMIM: 171835) 6-phosphofructo-2-kina ( 471) 2977 643.8 3.1e-184 NP_001309945 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kina ( 494) 2293 498.2 2.3e-140 NP_001138915 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kina ( 500) 2293 498.2 2.3e-140 XP_016871816 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 548) 2293 498.2 2.5e-140 NP_001300992 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kina ( 514) 2292 498.0 2.7e-140 NP_004557 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kinase/ ( 520) 2292 498.0 2.7e-140 NP_001269559 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kina ( 534) 2292 498.0 2.8e-140 XP_016871814 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 568) 2292 498.0 2.9e-140 XP_005252521 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 462) 2227 484.1 3.7e-136 NP_002616 (OMIM: 311790) 6-phosphofructo-2-kinase/ ( 471) 2156 469.0 1.3e-131 NP_004558 (OMIM: 605320) 6-phosphofructo-2-kinase/ ( 469) 2145 466.7 6.7e-131 NP_001304063 (OMIM: 605320) 6-phosphofructo-2-kina ( 498) 2139 465.4 1.7e-130 XP_016862105 (OMIM: 605320) PREDICTED: 6-phosphofr ( 457) 2136 464.7 2.5e-130 NP_001304065 (OMIM: 605320) 6-phosphofructo-2-kina ( 458) 2136 464.7 2.5e-130 XP_011532131 (OMIM: 605320) PREDICTED: 6-phosphofr ( 471) 2136 464.7 2.5e-130 XP_016862103 (OMIM: 605320) PREDICTED: 6-phosphofr ( 493) 2134 464.3 3.5e-130 XP_016862106 (OMIM: 605320) PREDICTED: 6-phosphofr ( 453) 2131 463.7 5.2e-130 NP_001304064 (OMIM: 605320) 6-phosphofructo-2-kina ( 462) 2081 453.0 8.4e-127 XP_016885067 (OMIM: 311790) PREDICTED: 6-phosphofr ( 449) 1949 424.9 2.4e-118 XP_016885065 (OMIM: 311790) PREDICTED: 6-phosphofr ( 500) 1949 424.9 2.6e-118 NP_001258734 (OMIM: 311790) 6-phosphofructo-2-kina ( 406) 1935 421.9 1.7e-117 NP_001258733 (OMIM: 311790) 6-phosphofructo-2-kina ( 449) 1838 401.3 3.1e-111 XP_005273219 (OMIM: 171835) PREDICTED: 6-phosphofr ( 263) 1761 384.7 1.8e-106 XP_016885066 (OMIM: 311790) PREDICTED: 6-phosphofr ( 468) 1688 369.3 1.3e-101 XP_011517795 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 427) 1574 345.0 2.5e-94 XP_016871817 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 533) 1574 345.1 3e-94 XP_016871818 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 501) 1547 339.3 1.5e-92 XP_016871815 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofr ( 549) 1547 339.4 1.6e-92 NP_001309946 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kina ( 337) 1488 326.7 6.8e-89 NP_001304066 (OMIM: 605320) 6-phosphofructo-2-kina ( 434) 1466 322.0 2.1e-87 XP_016862104 (OMIM: 605320) PREDICTED: 6-phosphofr ( 463) 1460 320.8 5.4e-87 NP_001304067 (OMIM: 605320) 6-phosphofructo-2-kina ( 278) 1372 301.9 1.6e-81 >>NP_006203 (OMIM: 171835) 6-phosphofructo-2-kinase/fruc (505 aa) initn: 3349 init1: 3349 opt: 3349 Z-score: 3856.2 bits: 723.1 E(85289): 4.7e-208 Smith-Waterman score: 3349; 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NP_001 PTGESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTV 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 FKLTPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPR .:::::::::.::.: ::::.: :::.. ... :. .:. ::::: :::.: . ..:: NP_001 LKLTPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRER-SEDAKKGPNPL-MRRNSVTPLASPEPTKKPR 400 410 420 430 440 450 490 500 pF1KB0 NYSVGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD NP_001 INSFEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 460 470 480 490 500 >>XP_016871816 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofructo (548 aa) initn: 2311 init1: 2219 opt: 2293 Z-score: 2640.4 bits: 498.2 E(85289): 2.5e-140 Smith-Waterman score: 2293; 73.6% identity (91.0% similar) in 455 aa overlap (26-480:5-455) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MSGASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTR : : . .:::::.:::.:::::::::.:::::: XP_016 MPFRKAC--GPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTR 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 YLNWIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEE :::::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..: XP_016 YLNWIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKE 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 NGQIAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPE .:::::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . XP_016 GGQIAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKD 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 RNRENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVY : ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.::: XP_016 CNSAEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVY 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 YLMNIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVW :::::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.:: XP_016 YLMNIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVW 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 TSQLKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRY ::::: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: ::: XP_016 TSQLKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRY 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 PGGESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTI : ::::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::. 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74.5% identity (91.9% similar) in 447 aa overlap (34-480:31-475) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: NP_004 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: NP_004 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : NP_004 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: NP_004 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: NP_004 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : NP_004 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: NP_004 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPRNYS :::::::.::.: ::::.: :::.. ... :. .:. ::::: :::.: . ..:: NP_004 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRER-SEDAKKGPNPL-MRRNSVTPLASPEPTKKPRINS 430 440 450 460 470 490 500 pF1KB0 VGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD NP_004 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQNMKGSRSSADSSRKH 480 490 500 510 520 >>NP_001269559 (OMIM: 605319) 6-phosphofructo-2-kinase/f (534 aa) initn: 2311 init1: 2219 opt: 2292 Z-score: 2639.4 bits: 498.0 E(85289): 2.8e-140 Smith-Waterman score: 2292; 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74.5% identity (91.9% similar) in 447 aa overlap (34-480:31-475) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: XP_016 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: XP_016 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : XP_016 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: XP_016 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: XP_016 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : XP_016 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: XP_016 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPRNYS :::::::.::.: ::::.: :::.. ... :. .:. ::::: :::.: . ..:: XP_016 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRER-SEDAKKGPNPL-MRRNSVTPLASPEPTKKPRINS 430 440 450 460 470 490 500 pF1KB0 VGSRPLKPLSPLRAQDMQEGAD XP_016 FEEHVASTSAALPSCLPPEVPTQLPGQELKSGIPGRDPEPPVQPPEGQSILWIPREVTVA 480 490 500 510 520 530 >>XP_005252521 (OMIM: 605319) PREDICTED: 6-phosphofructo (462 aa) initn: 2252 init1: 2224 opt: 2227 Z-score: 2565.5 bits: 484.1 E(85289): 3.7e-136 Smith-Waterman score: 2227; 76.8% identity (93.1% similar) in 418 aa overlap (34-451:31-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 ASSSEQNNNSYETKTPNLRMSEKKCSWASYMTNSPTLIVMIGLPARGKTYVSKKLTRYLN .:::::.:::.:::::::::.::::::::: XP_005 MPLELTQSRVQKIWVPVDHRPSLPRSCGPKLTNSPTVIVMVGLPARGKTYISKKLTRYLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 WIGVPTKVFNLGVYRREAVKSYKSYDFFRHDNEEAMKIRKQCALVALEDVKAYLTEENGQ ::::::::::.: :::::::.:.::.::: :::::::.::::::.::.:::.::..:.:: XP_005 WIGVPTKVFNVGEYRREAVKQYSSYNFFRPDNEEAMKVRKQCALAALRDVKSYLAKEGGQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB0 IAVFDATNTTRERRDMILNFAEQNSFKVFFVESVCDDPDVIAANILEVKVSSPDYPERNR :::::::::::::: :::.::..:.::.::.::::::: :.:.::.:::.::::: . : XP_005 IAVFDATNTTRERRHMILHFAKENDFKAFFIESVCDDPTVVASNIMEVKISSPDYKDCNS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB0 ENVMEDFLKRIECYKVTYRPLDPDNYDKDLSFIKVINVGQRFLVNRVQDYIQSKIVYYLM ..:.::.::: ::...:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::.:::.:::::: XP_005 AEAMDDFMKRISCYEASYQPLDPDKCDRDLSLIKVIDVGRRFLVNRVQDHIQSRIVYYLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB0 NIHVQPRTIYLCRHGESEFNLLGKIGGDSGLSVRGKQFAQALRKFLEEQEITDLKVWTSQ ::::::::::::::::.: :: :.:::::::: :::.::.:: ::.:::.. ::.::::: XP_005 NIHVQPRTIYLCRHGENEHNLQGRIGGDSGLSSRGKKFASALSKFVEEQNLKDLRVWTSQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LKRTIQTAESLGVPYEQWKILNEIDAGVCEEMTYAEIEKRYPEEFALRDQEKYLYRYPGG :: ::::::.: .:::::: :::::::::::.:: ::. ::::.:::.:.:: :::: : XP_005 LKSTIQTAEALRLPYEQWKALNEIDAGVCEELTYEEIRDTYPEEYALREQDKYYYRYPTG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 ESYQDLVQRLEPVIMELERQGNVLVISHQAVMRCLLAYFLDKGADELPYLRCPLHTIFKL :::::::::::::::::::: ::::: ::::.::::::::::.:.:.:::.:::::..:: XP_005 ESYQDLVQRLEPVIMELERQENVLVICHQAVLRCLLAYFLDKSAEEMPYLKCPLHTVLKL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 TPVAYGCKVETIKLNVEAVNTHRDKPTNNFPKNQTPVRMRRNSFTPLSSSNTIRRPRNYS :::::::.::.: ::::.: :::.. : XP_005 TPVAYGCRVESIYLNVESVCTHRERSENMKGSRSSADSSRKH 430 440 450 460 505 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 16:56:23 2016 done: Sat Nov 5 16:56:24 2016 Total Scan time: 7.050 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]